MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_015865	CCT	2	6	1364494	1364499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582507
26002	NC_015865	CCT	2	6	1364599	1364604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582507
26003	NC_015865	TCT	2	6	1364620	1364625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582507
26004	NC_015865	ATC	2	6	1364643	1364648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582507
26005	NC_015865	ACC	2	6	1364685	1364690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582507
26006	NC_015865	GAA	2	6	1364708	1364713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582507
26007	NC_015865	CGT	2	6	1364732	1364737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582507
26008	NC_015865	ATC	2	6	1364748	1364753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582507
26009	NC_015865	GC	3	6	1364758	1364763	0 %	0 %	50 %	50 %	341582507
26010	NC_015865	GCTTC	2	10	1364800	1364809	0 %	40 %	20 %	40 %	341582507
26011	NC_015865	TC	3	6	1364808	1364813	0 %	50 %	0 %	50 %	341582507
26012	NC_015865	TCG	2	6	1364853	1364858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582507
26013	NC_015865	CCTTT	2	10	1364923	1364932	0 %	60 %	0 %	40 %	341582507
26014	NC_015865	TTC	2	6	1364993	1364998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582507
26015	NC_015865	TGA	2	6	1365058	1365063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582507
26016	NC_015865	GATG	2	8	1365200	1365207	25 %	25 %	50 %	0 %	341582508
26017	NC_015865	CGA	2	6	1365220	1365225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582508
26018	NC_015865	GTA	2	6	1365254	1365259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582508
26019	NC_015865	GAC	2	6	1365275	1365280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582508
26020	NC_015865	TCA	2	6	1365318	1365323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582508
26021	NC_015865	GTA	2	6	1365338	1365343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582508
26022	NC_015865	GGC	2	6	1365371	1365376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582508
26023	NC_015865	TCG	2	6	1365393	1365398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582508
26024	NC_015865	GTA	2	6	1365464	1365469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582508
26025	NC_015865	ACC	2	6	1365498	1365503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582508
26026	NC_015865	CTT	2	6	1365796	1365801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582509
26027	NC_015865	GTT	2	6	1365823	1365828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582509
26028	NC_015865	CGT	2	6	1365882	1365887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582509
26029	NC_015865	CT	3	6	1365998	1366003	0 %	50 %	0 %	50 %	341582509
26030	NC_015865	CTT	2	6	1366174	1366179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582509
26031	NC_015865	CTC	2	6	1366228	1366233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582509
26032	NC_015865	GAGC	2	8	1366237	1366244	25 %	0 %	50 %	25 %	341582509
26033	NC_015865	CGG	2	6	1366248	1366253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582509
26034	NC_015865	GCG	2	6	1366323	1366328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582509
26035	NC_015865	GTG	2	6	1366336	1366341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582509
26036	NC_015865	ATG	2	6	1366481	1366486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582509
26037	NC_015865	ATC	2	6	1366610	1366615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582510
26038	NC_015865	A	6	6	1366627	1366632	100 %	0 %	0 %	0 %	341582510
26039	NC_015865	CAG	2	6	1366646	1366651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582510
26040	NC_015865	GA	3	6	1366652	1366657	50 %	0 %	50 %	0 %	341582510
26041	NC_015865	GGAA	2	8	1366680	1366687	50 %	0 %	50 %	0 %	341582510
26042	NC_015865	ATG	2	6	1366803	1366808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582510
26043	NC_015865	ATG	2	6	1366824	1366829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582510
26044	NC_015865	CCA	2	6	1367028	1367033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582512
26045	NC_015865	AGG	2	6	1367090	1367095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582512
26046	NC_015865	AG	3	6	1367227	1367232	50 %	0 %	50 %	0 %	341582512
26047	NC_015865	GAA	3	9	1367242	1367250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582512
26048	NC_015865	CT	3	6	1367263	1367268	0 %	50 %	0 %	50 %	341582512
26049	NC_015865	AT	3	6	1367299	1367304	50 %	50 %	0 %	0 %	341582512
26050	NC_015865	ACGA	2	8	1367327	1367334	50 %	0 %	25 %	25 %	341582512
26051	NC_015865	CAG	2	6	1367357	1367362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582512
26052	NC_015865	AG	3	6	1367395	1367400	50 %	0 %	50 %	0 %	341582512
26053	NC_015865	GT	3	6	1367418	1367423	0 %	50 %	50 %	0 %	341582512
26054	NC_015865	A	6	6	1367478	1367483	100 %	0 %	0 %	0 %	341582512
26055	NC_015865	ATAG	2	8	1367547	1367554	50 %	25 %	25 %	0 %	341582512
26056	NC_015865	GAA	2	6	1367563	1367568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582512
26057	NC_015865	GAG	2	6	1367593	1367598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582512
26058	NC_015865	ACC	2	6	1367651	1367656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582513
26059	NC_015865	AAC	2	6	1367670	1367675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582513
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26061	NC_015865	ACGT	2	8	1367742	1367749	25 %	25 %	25 %	25 %	341582513
26062	NC_015865	AAAG	2	8	1367765	1367772	75 %	0 %	25 %	0 %	341582513
26063	NC_015865	AGG	2	6	1367796	1367801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582513
26064	NC_015865	GA	3	6	1367803	1367808	50 %	0 %	50 %	0 %	341582513
26065	NC_015865	AAT	2	6	1367857	1367862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582513
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26067	NC_015865	AAGG	2	8	1368080	1368087	50 %	0 %	50 %	0 %	341582513
26068	NC_015865	A	6	6	1368100	1368105	100 %	0 %	0 %	0 %	341582513
26069	NC_015865	AAC	2	6	1368116	1368121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582513
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26072	NC_015865	AGAA	2	8	1368263	1368270	75 %	0 %	25 %	0 %	341582513
26073	NC_015865	CTTG	2	8	1368387	1368394	0 %	50 %	25 %	25 %	341582514
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26075	NC_015865	CTGT	2	8	1368530	1368537	0 %	50 %	25 %	25 %	341582514
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26088	NC_015865	TCT	2	6	1369037	1369042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582514
26089	NC_015865	CCAT	2	8	1369098	1369105	25 %	25 %	0 %	50 %	341582514
26090	NC_015865	CTGG	2	8	1369116	1369123	0 %	25 %	50 %	25 %	341582514
26091	NC_015865	A	6	6	1369146	1369151	100 %	0 %	0 %	0 %	341582514
26092	NC_015865	ACC	2	6	1369160	1369165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582514
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26095	NC_015865	CCCA	2	8	1369692	1369699	25 %	0 %	0 %	75 %	341582515
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26099	NC_015865	CATAGG	2	12	1369875	1369886	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341582515
26100	NC_015865	G	6	6	1369913	1369918	0 %	0 %	100 %	0 %	341582515
26101	NC_015865	TCC	2	6	1369970	1369975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582515
26102	NC_015865	CTC	2	6	1370008	1370013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582515
26103	NC_015865	TGC	2	6	1370048	1370053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582515
26104	NC_015865	GA	3	6	1370057	1370062	50 %	0 %	50 %	0 %	341582515
26105	NC_015865	CCCGA	2	10	1370077	1370086	20 %	0 %	20 %	60 %	341582515
26106	NC_015865	GAA	2	6	1370115	1370120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582515
26107	NC_015865	AGG	2	6	1370159	1370164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582515
26108	NC_015865	GAT	2	6	1370169	1370174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582515
26109	NC_015865	GAG	2	6	1370322	1370327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582516
26110	NC_015865	CGT	2	6	1370364	1370369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582516
26111	NC_015865	AG	3	6	1370505	1370510	50 %	0 %	50 %	0 %	341582516
26112	NC_015865	CGA	2	6	1370511	1370516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582516
26113	NC_015865	CTC	2	6	1370551	1370556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582516
26114	NC_015865	TGC	2	6	1370621	1370626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582516
26115	NC_015865	CCT	2	6	1370720	1370725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582517
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26117	NC_015865	GCTG	2	8	1370825	1370832	0 %	25 %	50 %	25 %	341582517
26118	NC_015865	GAC	2	6	1370871	1370876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582517
26119	NC_015865	ATC	2	6	1370986	1370991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582517
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26231	NC_015865	CAT	2	6	1377253	1377258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582522
26232	NC_015865	GTC	2	6	1377269	1377274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582522
26233	NC_015865	AGG	2	6	1377398	1377403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582522
26234	NC_015865	TAC	2	6	1377466	1377471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582523
26235	NC_015865	AAG	2	6	1377490	1377495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582523
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26237	NC_015865	GGA	2	6	1377690	1377695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582523
26238	NC_015865	CCG	2	6	1377746	1377751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582523
26239	NC_015865	TCC	2	6	1377762	1377767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582523
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26245	NC_015865	GTCG	2	8	1377927	1377934	0 %	25 %	50 %	25 %	341582523
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26250	NC_015865	CTA	2	6	1378098	1378103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582523
26251	NC_015865	CGA	2	6	1378107	1378112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582523
26252	NC_015865	GAACGG	2	12	1378113	1378124	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341582523
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26301	NC_015865	GTC	2	6	1379988	1379993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582524
26302	NC_015865	AT	3	6	1380021	1380026	50 %	50 %	0 %	0 %	341582524
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26317	NC_015865	GGCC	2	8	1380949	1380956	0 %	0 %	50 %	50 %	341582526
26318	NC_015865	TCG	2	6	1380969	1380974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582526
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26322	NC_015865	TAC	2	6	1381232	1381237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582526
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26330	NC_015865	ACCA	2	8	1381520	1381527	50 %	0 %	0 %	50 %	341582526
26331	NC_015865	GCG	3	9	1381533	1381541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582526
26332	NC_015865	TCC	2	6	1381566	1381571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582526
26333	NC_015865	GAA	2	6	1381579	1381584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582526
26334	NC_015865	AAG	2	6	1381664	1381669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582526
26335	NC_015865	GAT	2	6	1381673	1381678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582526
26336	NC_015865	AG	3	6	1381718	1381723	50 %	0 %	50 %	0 %	341582526
26337	NC_015865	CAA	2	6	1381795	1381800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582526
26338	NC_015865	AGGC	2	8	1381825	1381832	25 %	0 %	50 %	25 %	341582526
26339	NC_015865	CGG	2	6	1381858	1381863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582526
26340	NC_015865	CCA	2	6	1381926	1381931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582526
26341	NC_015865	CTC	3	9	1381934	1381942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582526
26342	NC_015865	ACG	2	6	1382015	1382020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582526
26343	NC_015865	TGA	2	6	1382068	1382073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582526
26344	NC_015865	GGA	2	6	1382107	1382112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582526
26345	NC_015865	AAC	2	6	1382162	1382167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582526
26346	NC_015865	CTT	2	6	1382174	1382179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582526
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26348	NC_015865	GGA	2	6	1382194	1382199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582526
26349	NC_015865	TGG	2	6	1382201	1382206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582526
26350	NC_015865	TGG	2	6	1382217	1382222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582526
26351	NC_015865	GGA	2	6	1382275	1382280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582526
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26465	NC_015865	CAT	2	6	1388853	1388858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582530
26466	NC_015865	CTC	2	6	1388898	1388903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582530
26467	NC_015865	CAT	2	6	1388991	1388996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582530
26468	NC_015865	ACA	2	6	1389059	1389064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582530
26469	NC_015865	ATC	2	6	1389070	1389075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582530
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26472	NC_015865	TCC	2	6	1389172	1389177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582530
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26475	NC_015865	GGA	2	6	1389231	1389236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582530
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26480	NC_015865	CTT	3	9	1389291	1389299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582531
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26492	NC_015865	GGA	2	6	1389724	1389729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
26493	NC_015865	TCA	2	6	1389737	1389742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582531
26494	NC_015865	CGG	2	6	1389759	1389764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582531
26495	NC_015865	ACG	2	6	1389785	1389790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
26496	NC_015865	CGA	3	9	1389870	1389878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582531
26497	NC_015865	GCTC	2	8	1390031	1390038	0 %	25 %	25 %	50 %	341582531
26498	NC_015865	CG	3	6	1390060	1390065	0 %	0 %	50 %	50 %	341582531
26499	NC_015865	GAG	2	6	1390096	1390101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531
26500	NC_015865	GGA	2	6	1390104	1390109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582531

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