MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25502	NC_015865	CCAG	2	8	1338922	1338929	25 %	0 %	25 %	50 %	341582480
25503	NC_015865	GC	3	6	1339066	1339071	0 %	0 %	50 %	50 %	341582480
25504	NC_015865	CCT	2	6	1339163	1339168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582480
25505	NC_015865	CGG	2	6	1339265	1339270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582480
25506	NC_015865	GAG	2	6	1339305	1339310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582480
25507	NC_015865	AGT	2	6	1339352	1339357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582480
25508	NC_015865	TCG	2	6	1339384	1339389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582480
25509	NC_015865	CAC	2	6	1339440	1339445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582480
25510	NC_015865	TCC	2	6	1339454	1339459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582480
25511	NC_015865	TGG	2	6	1339530	1339535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582481
25512	NC_015865	ACG	2	6	1339550	1339555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582481
25513	NC_015865	AAG	2	6	1339556	1339561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582481
25514	NC_015865	ACG	3	9	1339580	1339588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582481
25515	NC_015865	GAG	2	6	1339627	1339632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582481
25516	NC_015865	GCC	2	6	1339642	1339647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582481
25517	NC_015865	GCTC	2	8	1339815	1339822	0 %	25 %	25 %	50 %	341582481
25518	NC_015865	CCT	2	6	1339929	1339934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582481
25519	NC_015865	CTC	2	6	1339946	1339951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582481
25520	NC_015865	CCA	2	6	1340014	1340019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582481
25521	NC_015865	GAA	2	6	1340035	1340040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582481
25522	NC_015865	GC	3	6	1340041	1340046	0 %	0 %	50 %	50 %	341582481
25523	NC_015865	GAG	2	6	1340107	1340112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582481
25524	NC_015865	GTA	2	6	1340194	1340199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582481
25525	NC_015865	GGA	2	6	1340214	1340219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582481
25526	NC_015865	CCTTCG	2	12	1340259	1340270	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341582481
25527	NC_015865	GTA	3	9	1340281	1340289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582481
25528	NC_015865	TCG	2	6	1340291	1340296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582481
25529	NC_015865	TTG	2	6	1340402	1340407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582481
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25531	NC_015865	GC	3	6	1340467	1340472	0 %	0 %	50 %	50 %	341582481
25532	NC_015865	GGA	2	6	1340647	1340652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582482
25533	NC_015865	GGA	2	6	1340710	1340715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582482
25534	NC_015865	CGA	2	6	1340773	1340778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582482
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25537	NC_015865	CTTCC	2	10	1340934	1340943	0 %	40 %	0 %	60 %	341582482
25538	NC_015865	GAG	2	6	1340983	1340988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582482
25539	NC_015865	AT	3	6	1341024	1341029	50 %	50 %	0 %	0 %	341582482
25540	NC_015865	TTC	2	6	1341140	1341145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582482
25541	NC_015865	CTCC	2	8	1341172	1341179	0 %	25 %	0 %	75 %	341582482
25542	NC_015865	ACC	2	6	1341204	1341209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582482
25543	NC_015865	CGG	2	6	1341265	1341270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582482
25544	NC_015865	CCA	2	6	1341444	1341449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582482
25545	NC_015865	AGGA	2	8	1341514	1341521	50 %	0 %	50 %	0 %	341582482
25546	NC_015865	CTT	2	6	1341550	1341555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582482
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25549	NC_015865	CGG	2	6	1341676	1341681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582482
25550	NC_015865	GTC	2	6	1341777	1341782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582483
25551	NC_015865	CT	3	6	1341857	1341862	0 %	50 %	0 %	50 %	341582483
25552	NC_015865	CTG	2	6	1341868	1341873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582483
25553	NC_015865	ATG	2	6	1341883	1341888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582483
25554	NC_015865	TCG	2	6	1341943	1341948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582483
25555	NC_015865	CTC	2	6	1341951	1341956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582483
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25557	NC_015865	CG	3	6	1341989	1341994	0 %	0 %	50 %	50 %	341582483
25558	NC_015865	TCT	2	6	1342007	1342012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582483
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25583	NC_015865	CGA	2	6	1342938	1342943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582484
25584	NC_015865	GCC	2	6	1342975	1342980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582484
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25587	NC_015865	CTC	2	6	1343053	1343058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582484
25588	NC_015865	ATG	2	6	1343111	1343116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582484
25589	NC_015865	CCG	2	6	1343150	1343155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582484
25590	NC_015865	CCG	2	6	1343216	1343221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582484
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25598	NC_015865	GAAGC	2	10	1343563	1343572	40 %	0 %	40 %	20 %	341582484
25599	NC_015865	ATC	2	6	1343585	1343590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582484
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25601	NC_015865	GTG	2	6	1343660	1343665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582484
25602	NC_015865	ATG	2	6	1343687	1343692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582484
25603	NC_015865	TGT	2	6	1343763	1343768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582484
25604	NC_015865	CGA	2	6	1343772	1343777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582484
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25606	NC_015865	CGA	2	6	1343817	1343822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582484
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25614	NC_015865	ACC	2	6	1344664	1344669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582485
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25962	NC_015865	GCG	2	6	1363060	1363065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582506
25963	NC_015865	TGG	2	6	1363121	1363126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582506
25964	NC_015865	GCATCG	2	12	1363145	1363156	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341582506
25965	NC_015865	TCA	2	6	1363184	1363189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582506
25966	NC_015865	CTA	2	6	1363203	1363208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582506
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25974	NC_015865	CGG	2	6	1363341	1363346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582506
25975	NC_015865	TAC	2	6	1363375	1363380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582506
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25981	NC_015865	CCTC	2	8	1363622	1363629	0 %	25 %	0 %	75 %	341582506
25982	NC_015865	CTG	2	6	1363654	1363659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582506
25983	NC_015865	TC	3	6	1363701	1363706	0 %	50 %	0 %	50 %	341582506
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25989	NC_015865	TTA	2	6	1363945	1363950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582507
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25992	NC_015865	TCG	2	6	1364148	1364153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582507
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