MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_015865	AGA	2	6	1315396	1315401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582454
25003	NC_015865	GAG	2	6	1315437	1315442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582454
25004	NC_015865	GAA	2	6	1315451	1315456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582454
25005	NC_015865	TTC	3	9	1315565	1315573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582454
25006	NC_015865	TCC	2	6	1315657	1315662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582454
25007	NC_015865	GAA	2	6	1315706	1315711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582454
25008	NC_015865	CCT	2	6	1315727	1315732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582454
25009	NC_015865	TCT	2	6	1315742	1315747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582454
25010	NC_015865	CGA	2	6	1315778	1315783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582454
25011	NC_015865	A	7	7	1315785	1315791	100 %	0 %	0 %	0 %	341582454
25012	NC_015865	ATT	2	6	1315827	1315832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582454
25013	NC_015865	AAG	2	6	1316073	1316078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582454
25014	NC_015865	ACA	2	6	1316131	1316136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582454
25015	NC_015865	GAG	2	6	1316177	1316182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582454
25016	NC_015865	AGG	2	6	1316242	1316247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582454
25017	NC_015865	ACG	2	6	1316269	1316274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582454
25018	NC_015865	ACGG	2	8	1316382	1316389	25 %	0 %	50 %	25 %	341582454
25019	NC_015865	ATA	2	6	1316397	1316402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582454
25020	NC_015865	TCC	2	6	1316416	1316421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582454
25021	NC_015865	GGA	2	6	1316448	1316453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582454
25022	NC_015865	GAG	2	6	1316458	1316463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582454
25023	NC_015865	AAG	2	6	1316466	1316471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582455
25024	NC_015865	GA	3	6	1316515	1316520	50 %	0 %	50 %	0 %	341582455
25025	NC_015865	CAG	2	6	1316535	1316540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582455
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25031	NC_015865	AAT	2	6	1316958	1316963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582456
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25035	NC_015865	GAGGGA	2	12	1317099	1317110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582456
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25039	NC_015865	GAAG	2	8	1317544	1317551	50 %	0 %	50 %	0 %	341582457
25040	NC_015865	GGA	2	6	1317571	1317576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582457
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25045	NC_015865	GAACG	2	10	1317900	1317909	40 %	0 %	40 %	20 %	341582458
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25062	NC_015865	CCTC	2	8	1318731	1318738	0 %	25 %	0 %	75 %	341582459
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25088	NC_015865	CCAG	2	8	1319597	1319604	25 %	0 %	25 %	50 %	341582459
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25115	NC_015865	AG	3	6	1321156	1321161	50 %	0 %	50 %	0 %	341582461
25116	NC_015865	C	6	6	1321167	1321172	0 %	0 %	0 %	100 %	341582461
25117	NC_015865	TGG	2	6	1321182	1321187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582461
25118	NC_015865	GCC	2	6	1321223	1321228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582461
25119	NC_015865	TAC	2	6	1321244	1321249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582461
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25122	NC_015865	ACC	2	6	1321700	1321705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582461
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25229	NC_015865	TTCC	2	8	1326707	1326714	0 %	50 %	0 %	50 %	341582466
25230	NC_015865	GAG	2	6	1326794	1326799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582467
25231	NC_015865	CGT	2	6	1326895	1326900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582467
25232	NC_015865	CTATCT	2	12	1326985	1326996	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341582467
25233	NC_015865	TCC	2	6	1327005	1327010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25234	NC_015865	CCT	2	6	1327066	1327071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25235	NC_015865	CGA	2	6	1327090	1327095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582467
25236	NC_015865	CCT	2	6	1327096	1327101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25237	NC_015865	TCC	2	6	1327131	1327136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25238	NC_015865	TTC	2	6	1327137	1327142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582467
25239	NC_015865	TATCTC	2	12	1327163	1327174	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341582467
25240	NC_015865	CCT	2	6	1327252	1327257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25241	NC_015865	GCCT	2	8	1327329	1327336	0 %	25 %	25 %	50 %	341582467
25242	NC_015865	GAACTC	2	12	1327433	1327444	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341582467
25243	NC_015865	TCT	2	6	1327450	1327455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582467
25244	NC_015865	TGAAC	2	10	1327504	1327513	40 %	20 %	20 %	20 %	341582467
25245	NC_015865	CAGG	2	8	1327576	1327583	25 %	0 %	50 %	25 %	341582467
25246	NC_015865	TCC	2	6	1327584	1327589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25247	NC_015865	CCTT	2	8	1327660	1327667	0 %	50 %	0 %	50 %	341582467
25248	NC_015865	TCC	2	6	1327704	1327709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582467
25249	NC_015865	CGT	2	6	1327796	1327801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582468
25250	NC_015865	TGA	2	6	1327811	1327816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582468
25251	NC_015865	GTGA	2	8	1327817	1327824	25 %	25 %	50 %	0 %	341582468
25252	NC_015865	TCC	2	6	1327876	1327881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582468
25253	NC_015865	GGA	2	6	1327919	1327924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582468
25254	NC_015865	CGCCTC	2	12	1327978	1327989	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341582468
25255	NC_015865	AGAA	2	8	1328014	1328021	75 %	0 %	25 %	0 %	341582468
25256	NC_015865	GCCA	2	8	1328050	1328057	25 %	0 %	25 %	50 %	341582468
25257	NC_015865	GAT	2	6	1328109	1328114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582468
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25259	NC_015865	TCC	2	6	1328186	1328191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582469
25260	NC_015865	CCTC	2	8	1328367	1328374	0 %	25 %	0 %	75 %	341582469
25261	NC_015865	TCC	2	6	1328402	1328407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582469
25262	NC_015865	GCGCC	2	10	1328520	1328529	0 %	0 %	40 %	60 %	341582469
25263	NC_015865	GAGG	2	8	1328558	1328565	25 %	0 %	75 %	0 %	341582469
25264	NC_015865	GGC	2	6	1328566	1328571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582469
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25266	NC_015865	CGG	2	6	1328619	1328624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582469
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25268	NC_015865	GGAA	2	8	1328659	1328666	50 %	0 %	50 %	0 %	341582469
25269	NC_015865	GTA	2	6	1328692	1328697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582469
25270	NC_015865	AGG	2	6	1328801	1328806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582469
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25277	NC_015865	AGG	2	6	1329214	1329219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582470
25278	NC_015865	ACGGA	2	10	1329247	1329256	40 %	0 %	40 %	20 %	341582470
25279	NC_015865	TCC	2	6	1329286	1329291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582470
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25286	NC_015865	G	6	6	1329400	1329405	0 %	0 %	100 %	0 %	341582470
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25289	NC_015865	GAA	2	6	1329428	1329433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582470
25290	NC_015865	CGT	2	6	1329473	1329478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582470
25291	NC_015865	TAC	2	6	1329516	1329521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582470
25292	NC_015865	GGA	2	6	1329530	1329535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582470
25293	NC_015865	CAT	2	6	1329566	1329571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582471
25294	NC_015865	TCC	2	6	1329681	1329686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582471
25295	NC_015865	CGTC	2	8	1329754	1329761	0 %	25 %	25 %	50 %	341582471
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25297	NC_015865	TGTCGG	2	12	1330114	1330125	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	341582472
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25300	NC_015865	CCG	2	6	1330196	1330201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582472
25301	NC_015865	GAG	2	6	1330340	1330345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582472
25302	NC_015865	ACC	2	6	1330365	1330370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582472
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25304	NC_015865	AGC	2	6	1330497	1330502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582473
25305	NC_015865	CTG	2	6	1330519	1330524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582473
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25309	NC_015865	GAA	2	6	1330709	1330714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582473
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25311	NC_015865	GAT	3	9	1330832	1330840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582473
25312	NC_015865	CAT	2	6	1330841	1330846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582473
25313	NC_015865	AT	3	6	1330853	1330858	50 %	50 %	0 %	0 %	341582473
25314	NC_015865	TTCCTG	2	12	1330869	1330880	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	341582473
25315	NC_015865	CTT	2	6	1330919	1330924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582473
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25318	NC_015865	GCA	2	6	1331053	1331058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582473
25319	NC_015865	TC	3	6	1331060	1331065	0 %	50 %	0 %	50 %	341582473
25320	NC_015865	CGC	2	6	1331138	1331143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582473
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25322	NC_015865	GAG	2	6	1331177	1331182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582473
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25326	NC_015865	ATT	2	6	1331375	1331380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582474
25327	NC_015865	ATC	2	6	1331381	1331386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582474
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25329	NC_015865	CTG	2	6	1331663	1331668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582474
25330	NC_015865	TCT	2	6	1331685	1331690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582474
25331	NC_015865	AGG	2	6	1331718	1331723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582474
25332	NC_015865	CTC	2	6	1331758	1331763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582474
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25334	NC_015865	TC	3	6	1331869	1331874	0 %	50 %	0 %	50 %	341582474
25335	NC_015865	AGA	2	6	1331925	1331930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582474
25336	NC_015865	AGG	2	6	1331987	1331992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582474
25337	NC_015865	G	6	6	1332061	1332066	0 %	0 %	100 %	0 %	341582474
25338	NC_015865	AGTA	2	8	1332067	1332074	50 %	25 %	25 %	0 %	341582474
25339	NC_015865	GAG	2	6	1332113	1332118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582474
25340	NC_015865	TCTT	2	8	1332194	1332201	0 %	75 %	0 %	25 %	341582474
25341	NC_015865	GAT	2	6	1332211	1332216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582474
25342	NC_015865	CTC	2	6	1332217	1332222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582474
25343	NC_015865	CCA	2	6	1332362	1332367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582474
25344	NC_015865	TGA	2	6	1332387	1332392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582474
25345	NC_015865	CTGC	2	8	1332438	1332445	0 %	25 %	25 %	50 %	341582475
25346	NC_015865	TCT	2	6	1332473	1332478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582475
25347	NC_015865	AGC	2	6	1332481	1332486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582475
25348	NC_015865	CCT	2	6	1332488	1332493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582475
25349	NC_015865	TCCAGC	2	12	1332592	1332603	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582475
25350	NC_015865	GTG	2	6	1332624	1332629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582475
25351	NC_015865	TTG	2	6	1332706	1332711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582475
25352	NC_015865	CTT	2	6	1332777	1332782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582475
25353	NC_015865	CTG	2	6	1332784	1332789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582475
25354	NC_015865	ACCTG	2	10	1332794	1332803	20 %	20 %	20 %	40 %	341582475
25355	NC_015865	ATG	2	6	1332805	1332810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582475
25356	NC_015865	CATC	2	8	1332913	1332920	25 %	25 %	0 %	50 %	341582475
25357	NC_015865	CGA	2	6	1332977	1332982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582475
25358	NC_015865	GTC	2	6	1333023	1333028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582475
25359	NC_015865	CGG	2	6	1333059	1333064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582475
25360	NC_015865	TGA	2	6	1333127	1333132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582475
25361	NC_015865	CGCT	2	8	1333135	1333142	0 %	25 %	25 %	50 %	341582475
25362	NC_015865	CGG	2	6	1333143	1333148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582475
25363	NC_015865	GAGT	2	8	1333161	1333168	25 %	25 %	50 %	0 %	341582475
25364	NC_015865	GTG	2	6	1333174	1333179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582475
25365	NC_015865	CGA	2	6	1333205	1333210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582475
25366	NC_015865	AGG	2	6	1333255	1333260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582475
25367	NC_015865	TGA	2	6	1333292	1333297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582475
25368	NC_015865	ATG	2	6	1333303	1333308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582475
25369	NC_015865	CTT	2	6	1333320	1333325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582475
25370	NC_015865	CGG	2	6	1333365	1333370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582475
25371	NC_015865	TGG	2	6	1333373	1333378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582475
25372	NC_015865	AGG	2	6	1333414	1333419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582475
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25374	NC_015865	TCC	2	6	1333436	1333441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582475
25375	NC_015865	GAT	2	6	1333467	1333472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582475
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25377	NC_015865	TGT	2	6	1333553	1333558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582475
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25381	NC_015865	CCT	2	6	1333725	1333730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582475
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25383	NC_015865	CTC	2	6	1333809	1333814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582475
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25386	NC_015865	CGGCTT	2	12	1334001	1334012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582475
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25420	NC_015865	CGAGCA	2	12	1335417	1335428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582477
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25423	NC_015865	GCG	2	6	1335515	1335520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582477
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25439	NC_015865	TTCT	2	8	1336400	1336407	0 %	75 %	0 %	25 %	341582477
25440	NC_015865	TGA	2	6	1336446	1336451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582477
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25444	NC_015865	CTT	2	6	1336645	1336650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582477
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25447	NC_015865	GAA	2	6	1336949	1336954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582478
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25452	NC_015865	GA	3	6	1337134	1337139	50 %	0 %	50 %	0 %	341582478
25453	NC_015865	GAGG	2	8	1337168	1337175	25 %	0 %	75 %	0 %	341582478
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25455	NC_015865	GTC	2	6	1337205	1337210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582479
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25459	NC_015865	AAAG	2	8	1337338	1337345	75 %	0 %	25 %	0 %	341582479
25460	NC_015865	CCGC	2	8	1337371	1337378	0 %	0 %	25 %	75 %	341582479
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