MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_015865	ACT	2	6	1291397	1291402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582431
24502	NC_015865	GGC	2	6	1291411	1291416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582431
24503	NC_015865	GACACC	2	12	1291426	1291437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	341582431
24504	NC_015865	TCG	2	6	1291451	1291456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24505	NC_015865	CTGAC	2	10	1291475	1291484	20 %	20 %	20 %	40 %	341582431
24506	NC_015865	GGT	2	6	1291506	1291511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582431
24507	NC_015865	CTC	2	6	1291609	1291614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582431
24508	NC_015865	GGT	2	6	1291652	1291657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582431
24509	NC_015865	CGT	2	6	1291707	1291712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24510	NC_015865	GAG	2	6	1291717	1291722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582431
24511	NC_015865	CAA	2	6	1291749	1291754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582431
24512	NC_015865	GTC	2	6	1291777	1291782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24513	NC_015865	TGGG	2	8	1291783	1291790	0 %	25 %	75 %	0 %	341582431
24514	NC_015865	CGA	2	6	1291815	1291820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24515	NC_015865	CTC	2	6	1291938	1291943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582431
24516	NC_015865	GAC	2	6	1291978	1291983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24517	NC_015865	TTCAAG	2	12	1292002	1292013	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341582431
24518	NC_015865	GGA	2	6	1292161	1292166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582431
24519	NC_015865	GCC	3	9	1292197	1292205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582431
24520	NC_015865	GAA	2	6	1292295	1292300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582431
24521	NC_015865	CGA	2	6	1292418	1292423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24522	NC_015865	TCG	2	6	1292438	1292443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24523	NC_015865	CCG	2	6	1292462	1292467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582431
24524	NC_015865	ACT	2	6	1292495	1292500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582431
24525	NC_015865	ACA	2	6	1292519	1292524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582431
24526	NC_015865	CGT	2	6	1292541	1292546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24527	NC_015865	TAC	2	6	1292605	1292610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582431
24528	NC_015865	GGA	2	6	1292685	1292690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582431
24529	NC_015865	CCT	2	6	1292733	1292738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582431
24530	NC_015865	ATAG	2	8	1292767	1292774	50 %	25 %	25 %	0 %	341582431
24531	NC_015865	AAG	2	6	1292830	1292835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582431
24532	NC_015865	GGA	2	6	1292904	1292909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582431
24533	NC_015865	CGA	2	6	1292949	1292954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24534	NC_015865	ACG	2	6	1293035	1293040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24535	NC_015865	ACC	2	6	1293064	1293069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582431
24536	NC_015865	CCT	2	6	1293080	1293085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582431
24537	NC_015865	CGG	2	6	1293123	1293128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582431
24538	NC_015865	ACC	2	6	1293133	1293138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582431
24539	NC_015865	CAG	2	6	1293171	1293176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24540	NC_015865	TCT	2	6	1293200	1293205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582431
24541	NC_015865	TTC	2	6	1293217	1293222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582431
24542	NC_015865	ACG	2	6	1293272	1293277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582431
24543	NC_015865	GAG	2	6	1293292	1293297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582431
24544	NC_015865	GTGG	2	8	1293303	1293310	0 %	25 %	75 %	0 %	341582431
24545	NC_015865	GA	3	6	1293398	1293403	50 %	0 %	50 %	0 %	341582431
24546	NC_015865	CCAGG	2	10	1293493	1293502	20 %	0 %	40 %	40 %	341582431
24547	NC_015865	CCA	3	9	1293626	1293634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582432
24548	NC_015865	GTC	2	6	1293651	1293656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582432
24549	NC_015865	GCC	2	6	1293829	1293834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582432
24550	NC_015865	ACCG	2	8	1293867	1293874	25 %	0 %	25 %	50 %	341582432
24551	NC_015865	GAA	2	6	1293888	1293893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582432
24552	NC_015865	AGG	2	6	1293908	1293913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582432
24553	NC_015865	TGT	2	6	1294046	1294051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582432
24554	NC_015865	CTC	2	6	1294059	1294064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582432
24555	NC_015865	TAT	2	6	1294065	1294070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582432
24556	NC_015865	GAC	2	6	1294086	1294091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582432
24557	NC_015865	GGT	2	6	1294145	1294150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582432
24558	NC_015865	TCG	3	9	1294311	1294319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582433
24559	NC_015865	GTC	2	6	1294351	1294356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582433
24560	NC_015865	TCA	2	6	1294379	1294384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582433
24561	NC_015865	TTA	2	6	1294452	1294457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582433
24562	NC_015865	CTT	2	6	1294498	1294503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582433
24563	NC_015865	TGG	2	6	1294515	1294520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582433
24564	NC_015865	ATC	2	6	1294639	1294644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582433
24565	NC_015865	TCA	2	6	1294680	1294685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582433
24566	NC_015865	CGA	2	6	1294692	1294697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582433
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24568	NC_015865	TCC	2	6	1294785	1294790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582433
24569	NC_015865	GTC	2	6	1294858	1294863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582433
24570	NC_015865	ATGG	2	8	1294965	1294972	25 %	25 %	50 %	0 %	341582434
24571	NC_015865	GGA	2	6	1295055	1295060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582434
24572	NC_015865	G	6	6	1295075	1295080	0 %	0 %	100 %	0 %	341582434
24573	NC_015865	ATA	2	6	1295109	1295114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582434
24574	NC_015865	G	6	6	1295128	1295133	0 %	0 %	100 %	0 %	341582434
24575	NC_015865	ATA	2	6	1295160	1295165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582434
24576	NC_015865	CTG	2	6	1295193	1295198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582434
24577	NC_015865	G	6	6	1295203	1295208	0 %	0 %	100 %	0 %	341582434
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24583	NC_015865	GGT	2	6	1295466	1295471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582435
24584	NC_015865	CGG	2	6	1295546	1295551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582435
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24587	NC_015865	TCG	2	6	1295638	1295643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582435
24588	NC_015865	GCC	2	6	1295656	1295661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582435
24589	NC_015865	G	6	6	1295719	1295724	0 %	0 %	100 %	0 %	341582435
24590	NC_015865	GGT	2	6	1295819	1295824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582435
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24594	NC_015865	ATA	2	6	1295923	1295928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582435
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24600	NC_015865	CGG	2	6	1296140	1296145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582435
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24606	NC_015865	GAGC	2	8	1296444	1296451	25 %	0 %	50 %	25 %	341582436
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24612	NC_015865	GCG	2	6	1296568	1296573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582436
24613	NC_015865	GA	4	8	1296629	1296636	50 %	0 %	50 %	0 %	341582436
24614	NC_015865	CTT	2	6	1296659	1296664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582436
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24616	NC_015865	ACT	2	6	1296855	1296860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582436
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24723	NC_015865	ACC	2	6	1302178	1302183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582441
24724	NC_015865	CTGGGG	2	12	1302186	1302197	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	341582441
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24729	NC_015865	AAGC	2	8	1302384	1302391	50 %	0 %	25 %	25 %	341582441
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24731	NC_015865	CGA	2	6	1302540	1302545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582441
24732	NC_015865	GAA	2	6	1302711	1302716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582442
24733	NC_015865	GAC	2	6	1302768	1302773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582442
24734	NC_015865	GAAG	2	8	1302879	1302886	50 %	0 %	50 %	0 %	341582442
24735	NC_015865	CGT	2	6	1302906	1302911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582442
24736	NC_015865	CTC	2	6	1302928	1302933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582442
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24738	NC_015865	AGGA	2	8	1303000	1303007	50 %	0 %	50 %	0 %	341582442
24739	NC_015865	GTCTAC	2	12	1303027	1303038	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341582442
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24749	NC_015865	CTC	2	6	1303525	1303530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582443
24750	NC_015865	CAA	2	6	1303539	1303544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582443
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24964	NC_015865	TTC	2	6	1313491	1313496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582452
24965	NC_015865	GGA	2	6	1313528	1313533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582452
24966	NC_015865	CGGCC	2	10	1313534	1313543	0 %	0 %	40 %	60 %	341582452
24967	NC_015865	CTGG	2	8	1313786	1313793	0 %	25 %	50 %	25 %	341582452
24968	NC_015865	TGC	2	6	1313794	1313799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582452
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24970	NC_015865	CGG	2	6	1313882	1313887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582452
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24972	NC_015865	CTG	2	6	1313976	1313981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582452
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24975	NC_015865	GGA	2	6	1314109	1314114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582453
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24992	NC_015865	GAG	2	6	1314905	1314910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582453
24993	NC_015865	CGAG	2	8	1314958	1314965	25 %	0 %	50 %	25 %	341582453
24994	NC_015865	CGA	2	6	1314994	1314999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582453
24995	NC_015865	GA	3	6	1315003	1315008	50 %	0 %	50 %	0 %	341582453
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24997	NC_015865	CG	3	6	1315175	1315180	0 %	0 %	50 %	50 %	341582454
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