MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24001	NC_015865	GTAG	2	8	1264729	1264736	25 %	25 %	50 %	0 %	341582406
24002	NC_015865	CGA	2	6	1264761	1264766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582406
24003	NC_015865	AGCG	2	8	1264771	1264778	25 %	0 %	50 %	25 %	341582406
24004	NC_015865	TGA	2	6	1264821	1264826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582406
24005	NC_015865	AT	3	6	1264918	1264923	50 %	50 %	0 %	0 %	341582406
24006	NC_015865	CTC	2	6	1264954	1264959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582406
24007	NC_015865	TCT	2	6	1265018	1265023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582406
24008	NC_015865	CGA	2	6	1265109	1265114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582406
24009	NC_015865	CGT	2	6	1265130	1265135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582406
24010	NC_015865	CAA	2	6	1265193	1265198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582406
24011	NC_015865	GTA	2	6	1265218	1265223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582406
24012	NC_015865	CTT	2	6	1265272	1265277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582406
24013	NC_015865	CCG	2	6	1265351	1265356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582406
24014	NC_015865	GAA	2	6	1265413	1265418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582406
24015	NC_015865	TCCA	2	8	1265444	1265451	25 %	25 %	0 %	50 %	341582406
24016	NC_015865	GTG	2	6	1265482	1265487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582406
24017	NC_015865	CAT	2	6	1265491	1265496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582406
24018	NC_015865	GGCT	2	8	1265561	1265568	0 %	25 %	50 %	25 %	341582406
24019	NC_015865	CGG	2	6	1265587	1265592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582406
24020	NC_015865	CGC	2	6	1265601	1265606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582406
24021	NC_015865	CGA	2	6	1265643	1265648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582406
24022	NC_015865	CGT	2	6	1265655	1265660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582406
24023	NC_015865	GAA	2	6	1265716	1265721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582406
24024	NC_015865	CTT	2	6	1265758	1265763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582406
24025	NC_015865	CGG	2	6	1265803	1265808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582406
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24027	NC_015865	CTC	2	6	1266029	1266034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582407
24028	NC_015865	CCA	2	6	1266076	1266081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582407
24029	NC_015865	CGC	2	6	1266093	1266098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582407
24030	NC_015865	CAT	2	6	1266101	1266106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582407
24031	NC_015865	TCC	2	6	1266201	1266206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582407
24032	NC_015865	GAGC	2	8	1266215	1266222	25 %	0 %	50 %	25 %	341582407
24033	NC_015865	TCC	2	6	1266240	1266245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582407
24034	NC_015865	ATC	2	6	1266273	1266278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582407
24035	NC_015865	A	6	6	1266527	1266532	100 %	0 %	0 %	0 %	341582408
24036	NC_015865	AGAA	2	8	1266607	1266614	75 %	0 %	25 %	0 %	341582408
24037	NC_015865	CTGC	2	8	1266620	1266627	0 %	25 %	25 %	50 %	341582408
24038	NC_015865	GAG	2	6	1266682	1266687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582408
24039	NC_015865	CTGC	2	8	1266708	1266715	0 %	25 %	25 %	50 %	341582408
24040	NC_015865	A	6	6	1266726	1266731	100 %	0 %	0 %	0 %	341582408
24041	NC_015865	GGA	2	6	1266732	1266737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582408
24042	NC_015865	TCC	2	6	1266744	1266749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582408
24043	NC_015865	CTG	2	6	1266757	1266762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582408
24044	NC_015865	TAT	2	6	1266775	1266780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582408
24045	NC_015865	GA	3	6	1266812	1266817	50 %	0 %	50 %	0 %	341582408
24046	NC_015865	TGG	2	6	1266896	1266901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582408
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24049	NC_015865	CA	3	6	1267030	1267035	50 %	0 %	0 %	50 %	341582408
24050	NC_015865	GGT	2	6	1267059	1267064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582408
24051	NC_015865	CTGGA	2	10	1267099	1267108	20 %	20 %	40 %	20 %	341582408
24052	NC_015865	GAG	2	6	1267171	1267176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582408
24053	NC_015865	CTGGCG	2	12	1267231	1267242	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	341582409
24054	NC_015865	GAG	2	6	1267271	1267276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582409
24055	NC_015865	GGA	2	6	1267278	1267283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582409
24056	NC_015865	GAA	2	6	1267318	1267323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582409
24057	NC_015865	CTG	2	6	1267557	1267562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582410
24058	NC_015865	TAG	2	6	1267570	1267575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582410
24059	NC_015865	CGG	2	6	1267576	1267581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582410
24060	NC_015865	CCA	2	6	1267600	1267605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582410
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24062	NC_015865	CAA	2	6	1267652	1267657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582410
24063	NC_015865	GAA	2	6	1267785	1267790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582410
24064	NC_015865	GAA	2	6	1267827	1267832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582410
24065	NC_015865	TGA	2	6	1267913	1267918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582410
24066	NC_015865	GAG	2	6	1267998	1268003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582410
24067	NC_015865	GAAATG	2	12	1268066	1268077	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	341582410
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24071	NC_015865	GGCT	2	8	1268142	1268149	0 %	25 %	50 %	25 %	341582410
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24099	NC_015865	ATA	2	6	1269636	1269641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341582410
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24105	NC_015865	GAATA	2	10	1270231	1270240	60 %	20 %	20 %	0 %	341582410
24106	NC_015865	TCT	2	6	1270294	1270299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582410
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24108	NC_015865	CA	4	8	1270435	1270442	50 %	0 %	0 %	50 %	341582410
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24116	NC_015865	T	6	6	1270800	1270805	0 %	100 %	0 %	0 %	341582411
24117	NC_015865	TA	3	6	1270825	1270830	50 %	50 %	0 %	0 %	341582411
24118	NC_015865	ATT	2	6	1270933	1270938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582411
24119	NC_015865	TAC	2	6	1270976	1270981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582411
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24123	NC_015865	ATTG	2	8	1271101	1271108	25 %	50 %	25 %	0 %	341582411
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24223	NC_015865	TCCG	2	8	1277099	1277106	0 %	25 %	25 %	50 %	341582420
24224	NC_015865	GTC	2	6	1277112	1277117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582420
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24228	NC_015865	TC	3	6	1277235	1277240	0 %	50 %	0 %	50 %	341582420
24229	NC_015865	TCC	2	6	1277266	1277271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582420
24230	NC_015865	TCA	2	6	1277429	1277434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582421
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24232	NC_015865	TCA	2	6	1277579	1277584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582421
24233	NC_015865	CCG	2	6	1277600	1277605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582421
24234	NC_015865	CGG	2	6	1277630	1277635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582421
24235	NC_015865	GGT	2	6	1277649	1277654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582421
24236	NC_015865	CGG	2	6	1277660	1277665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582421
24237	NC_015865	TTC	2	6	1277716	1277721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582421
24238	NC_015865	TCC	2	6	1277932	1277937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582421
24239	NC_015865	AGG	2	6	1277941	1277946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582421
24240	NC_015865	ATG	2	6	1277980	1277985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582421
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24243	NC_015865	CGT	2	6	1278127	1278132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
24244	NC_015865	ATT	2	6	1278176	1278181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582422
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24250	NC_015865	AGG	2	6	1278659	1278664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582422
24251	NC_015865	CGAGAC	2	12	1278667	1278678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582422
24252	NC_015865	CGC	2	6	1278711	1278716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582422
24253	NC_015865	TGAGGA	2	12	1278741	1278752	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341582422
24254	NC_015865	CGT	2	6	1278762	1278767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
24255	NC_015865	CGA	2	6	1278768	1278773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582422
24256	NC_015865	CGG	2	6	1278777	1278782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582422
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24259	NC_015865	TCG	2	6	1278855	1278860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582422
24260	NC_015865	TCA	2	6	1278864	1278869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582422
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24332	NC_015865	CGT	2	6	1282254	1282259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582425
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24335	NC_015865	GCGA	2	8	1282312	1282319	25 %	0 %	50 %	25 %	341582425
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24341	NC_015865	CGG	2	6	1282662	1282667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582426
24342	NC_015865	AGGA	2	8	1282691	1282698	50 %	0 %	50 %	0 %	341582426
24343	NC_015865	GAG	3	9	1282709	1282717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582426
24344	NC_015865	CAG	2	6	1282726	1282731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582426
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24346	NC_015865	AAAC	2	8	1282831	1282838	75 %	0 %	0 %	25 %	341582426
24347	NC_015865	AGGG	2	8	1282894	1282901	25 %	0 %	75 %	0 %	341582426
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24453	NC_015865	TTA	2	6	1288878	1288883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582430
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24463	NC_015865	TCT	2	6	1289436	1289441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582430
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