MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_015865	GTC	2	6	1240280	1240285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582380
23502	NC_015865	TC	3	6	1240298	1240303	0 %	50 %	0 %	50 %	341582380
23503	NC_015865	CCTG	2	8	1240335	1240342	0 %	25 %	25 %	50 %	341582380
23504	NC_015865	CTC	2	6	1240515	1240520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23505	NC_015865	TCA	2	6	1240537	1240542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582381
23506	NC_015865	TCT	2	6	1240592	1240597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582381
23507	NC_015865	CAT	2	6	1240686	1240691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582381
23508	NC_015865	CTT	2	6	1240701	1240706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582381
23509	NC_015865	CGG	2	6	1240707	1240712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582381
23510	NC_015865	CTG	2	6	1240743	1240748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23511	NC_015865	ATC	2	6	1240765	1240770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582381
23512	NC_015865	AGGG	2	8	1240803	1240810	25 %	0 %	75 %	0 %	341582381
23513	NC_015865	CCT	2	6	1240850	1240855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23514	NC_015865	GGA	2	6	1240859	1240864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582381
23515	NC_015865	CCA	2	6	1240917	1240922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582381
23516	NC_015865	CCT	3	9	1240983	1240991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23517	NC_015865	AGA	2	6	1241015	1241020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582381
23518	NC_015865	GAC	2	6	1241025	1241030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23519	NC_015865	GAC	2	6	1241046	1241051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23520	NC_015865	GCG	2	6	1241075	1241080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582381
23521	NC_015865	CTC	2	6	1241196	1241201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23522	NC_015865	TCG	2	6	1241258	1241263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23523	NC_015865	CGT	2	6	1241282	1241287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23524	NC_015865	CTC	2	6	1241436	1241441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23525	NC_015865	CGC	2	6	1241471	1241476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582381
23526	NC_015865	ACG	2	6	1241488	1241493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23527	NC_015865	GAA	2	6	1241592	1241597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582381
23528	NC_015865	CGG	2	6	1241637	1241642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582381
23529	NC_015865	ACGG	2	8	1241670	1241677	25 %	0 %	50 %	25 %	341582381
23530	NC_015865	GGT	2	6	1241684	1241689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582381
23531	NC_015865	CTC	2	6	1241700	1241705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23532	NC_015865	CTT	2	6	1241721	1241726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582381
23533	NC_015865	CCT	2	6	1241741	1241746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582381
23534	NC_015865	CAA	2	6	1241777	1241782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582381
23535	NC_015865	TC	3	6	1241783	1241788	0 %	50 %	0 %	50 %	341582381
23536	NC_015865	GAT	2	6	1241823	1241828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582381
23537	NC_015865	AAC	2	6	1241841	1241846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341582381
23538	NC_015865	CGC	2	6	1241858	1241863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582381
23539	NC_015865	CTT	2	6	1241907	1241912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582381
23540	NC_015865	CGT	2	6	1241999	1242004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23541	NC_015865	GAT	2	6	1242135	1242140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582381
23542	NC_015865	TCG	2	6	1242202	1242207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23543	NC_015865	CGA	2	6	1242209	1242214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582381
23544	NC_015865	CCT	2	6	1242282	1242287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582382
23545	NC_015865	GAT	2	6	1242348	1242353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582382
23546	NC_015865	TAT	2	6	1242408	1242413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341582382
23547	NC_015865	CT	3	6	1242591	1242596	0 %	50 %	0 %	50 %	341582383
23548	NC_015865	TGA	2	6	1242613	1242618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582383
23549	NC_015865	GCG	2	6	1242676	1242681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582383
23550	NC_015865	CCT	2	6	1242778	1242783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582383
23551	NC_015865	TGA	2	6	1242796	1242801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582383
23552	NC_015865	TGG	2	6	1242814	1242819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582383
23553	NC_015865	GTC	2	6	1242848	1242853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582383
23554	NC_015865	CCG	2	6	1242885	1242890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582383
23555	NC_015865	CGG	2	6	1242916	1242921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582383
23556	NC_015865	CTC	2	6	1242989	1242994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582383
23557	NC_015865	TCC	2	6	1243011	1243016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582383
23558	NC_015865	AGC	2	6	1243038	1243043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582383
23559	NC_015865	CTC	2	6	1243121	1243126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582383
23560	NC_015865	ACG	2	6	1243146	1243151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582383
23561	NC_015865	TCC	2	6	1243158	1243163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582383
23562	NC_015865	GAC	2	6	1243259	1243264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582383
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23565	NC_015865	GGA	2	6	1243330	1243335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582383
23566	NC_015865	ATC	2	6	1243341	1243346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582383
23567	NC_015865	CT	3	6	1243369	1243374	0 %	50 %	0 %	50 %	341582383
23568	NC_015865	CT	3	6	1243383	1243388	0 %	50 %	0 %	50 %	341582383
23569	NC_015865	CGT	2	6	1243399	1243404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582383
23570	NC_015865	GA	3	6	1243410	1243415	50 %	0 %	50 %	0 %	341582383
23571	NC_015865	AGT	2	6	1243423	1243428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582383
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23574	NC_015865	CCCA	2	8	1243596	1243603	25 %	0 %	0 %	75 %	341582383
23575	NC_015865	AG	3	6	1243674	1243679	50 %	0 %	50 %	0 %	341582384
23576	NC_015865	CT	3	6	1243715	1243720	0 %	50 %	0 %	50 %	341582384
23577	NC_015865	ACG	2	6	1243772	1243777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582384
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23580	NC_015865	GAG	2	6	1243876	1243881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582384
23581	NC_015865	TC	3	6	1243891	1243896	0 %	50 %	0 %	50 %	341582384
23582	NC_015865	ACG	3	9	1243907	1243915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582384
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23584	NC_015865	CTC	2	6	1243975	1243980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582384
23585	NC_015865	TGA	2	6	1244016	1244021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582384
23586	NC_015865	CCT	2	6	1244022	1244027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582384
23587	NC_015865	CTC	2	6	1244035	1244040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582384
23588	NC_015865	CTT	2	6	1244056	1244061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582384
23589	NC_015865	GGCG	2	8	1244073	1244080	0 %	0 %	75 %	25 %	341582384
23590	NC_015865	CTA	2	6	1244085	1244090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582384
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23592	NC_015865	TCT	2	6	1244181	1244186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582384
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23597	NC_015865	CGA	2	6	1244358	1244363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582385
23598	NC_015865	GCG	2	6	1244393	1244398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582385
23599	NC_015865	GAT	2	6	1244401	1244406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582385
23600	NC_015865	GAT	2	6	1244461	1244466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582385
23601	NC_015865	GAG	2	6	1244518	1244523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582385
23602	NC_015865	TGT	2	6	1244541	1244546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582385
23603	NC_015865	TGC	2	6	1244550	1244555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582385
23604	NC_015865	GCC	2	6	1244575	1244580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582385
23605	NC_015865	TA	3	6	1244630	1244635	50 %	50 %	0 %	0 %	341582385
23606	NC_015865	TTC	2	6	1244681	1244686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582385
23607	NC_015865	CGA	2	6	1244697	1244702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582385
23608	NC_015865	GCT	2	6	1244711	1244716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582385
23609	NC_015865	CCT	2	6	1244819	1244824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582386
23610	NC_015865	GCC	2	6	1244983	1244988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582386
23611	NC_015865	TGA	2	6	1245069	1245074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582386
23612	NC_015865	GAA	2	6	1245148	1245153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582386
23613	NC_015865	CAG	2	6	1245166	1245171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582386
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