MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_015865	CTC	2	6	1218774	1218779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582359
23002	NC_015865	TCC	2	6	1218787	1218792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582359
23003	NC_015865	TGACCT	2	12	1218824	1218835	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341582359
23004	NC_015865	CCCTGA	2	12	1218845	1218856	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582359
23005	NC_015865	CCA	2	6	1218926	1218931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582359
23006	NC_015865	AGT	2	6	1218965	1218970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582359
23007	NC_015865	CTC	3	9	1219002	1219010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582359
23008	NC_015865	TCC	2	6	1219087	1219092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582359
23009	NC_015865	TTTG	2	8	1219134	1219141	0 %	75 %	25 %	0 %	341582359
23010	NC_015865	TCG	2	6	1219391	1219396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582360
23011	NC_015865	ACTG	2	8	1219452	1219459	25 %	25 %	25 %	25 %	341582360
23012	NC_015865	G	6	6	1219628	1219633	0 %	0 %	100 %	0 %	341582360
23013	NC_015865	GCG	2	6	1219642	1219647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582360
23014	NC_015865	GA	3	6	1219651	1219656	50 %	0 %	50 %	0 %	341582360
23015	NC_015865	AGG	2	6	1219664	1219669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582360
23016	NC_015865	GAACG	2	10	1219719	1219728	40 %	0 %	40 %	20 %	341582360
23017	NC_015865	GGAG	2	8	1219799	1219806	25 %	0 %	75 %	0 %	341582360
23018	NC_015865	TCC	2	6	1219847	1219852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582360
23019	NC_015865	CCG	2	6	1219913	1219918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582360
23020	NC_015865	GA	3	6	1220046	1220051	50 %	0 %	50 %	0 %	341582360
23021	NC_015865	GGA	2	6	1220073	1220078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582360
23022	NC_015865	GCACT	2	10	1220095	1220104	20 %	20 %	20 %	40 %	341582360
23023	NC_015865	CGG	2	6	1220109	1220114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582360
23024	NC_015865	CTG	2	6	1220116	1220121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582360
23025	NC_015865	CGG	2	6	1220327	1220332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582360
23026	NC_015865	AAAG	2	8	1220360	1220367	75 %	0 %	25 %	0 %	341582360
23027	NC_015865	GAG	2	6	1220473	1220478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582360
23028	NC_015865	GTC	2	6	1220494	1220499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582360
23029	NC_015865	GGA	2	6	1220556	1220561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582360
23030	NC_015865	TCC	2	6	1220656	1220661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582361
23031	NC_015865	GCC	2	6	1220697	1220702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582361
23032	NC_015865	GCG	2	6	1220713	1220718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582361
23033	NC_015865	GAAC	2	8	1220756	1220763	50 %	0 %	25 %	25 %	341582361
23034	NC_015865	ACC	2	6	1220779	1220784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582361
23035	NC_015865	CTG	2	6	1220812	1220817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582361
23036	NC_015865	CCT	2	6	1220825	1220830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582361
23037	NC_015865	AGG	2	6	1220935	1220940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582361
23038	NC_015865	AGG	2	6	1220956	1220961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582361
23039	NC_015865	AGA	2	6	1220966	1220971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582361
23040	NC_015865	CTC	2	6	1220985	1220990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582361
23041	NC_015865	AG	3	6	1221023	1221028	50 %	0 %	50 %	0 %	341582361
23042	NC_015865	AGG	2	6	1221046	1221051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582361
23043	NC_015865	CCATGA	2	12	1221113	1221124	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341582361
23044	NC_015865	CTC	2	6	1221145	1221150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582361
23045	NC_015865	GAA	2	6	1221282	1221287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582361
23046	NC_015865	TC	3	6	1221312	1221317	0 %	50 %	0 %	50 %	341582361
23047	NC_015865	GAG	2	6	1221363	1221368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582361
23048	NC_015865	AGA	2	6	1221392	1221397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582361
23049	NC_015865	CTC	2	6	1221496	1221501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582361
23050	NC_015865	TC	3	6	1221567	1221572	0 %	50 %	0 %	50 %	341582362
23051	NC_015865	TCG	2	6	1221661	1221666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582362
23052	NC_015865	AGG	2	6	1221667	1221672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582362
23053	NC_015865	CTCGTC	2	12	1221690	1221701	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341582362
23054	NC_015865	CTT	2	6	1221732	1221737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582362
23055	NC_015865	CAG	2	6	1221921	1221926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582362
23056	NC_015865	CGA	2	6	1222001	1222006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582362
23057	NC_015865	ACC	2	6	1222021	1222026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582362
23058	NC_015865	CGT	2	6	1222064	1222069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582362
23059	NC_015865	GTA	2	6	1222086	1222091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582362
23060	NC_015865	ACG	3	9	1222183	1222191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582362
23061	NC_015865	CCT	2	6	1222282	1222287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582363
23062	NC_015865	CAG	2	6	1222298	1222303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582363
23063	NC_015865	CCA	2	6	1222357	1222362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582363
23064	NC_015865	AT	3	6	1222433	1222438	50 %	50 %	0 %	0 %	341582363
23065	NC_015865	CTCG	2	8	1222448	1222455	0 %	25 %	25 %	50 %	341582363
23066	NC_015865	GGA	2	6	1222532	1222537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582363
23067	NC_015865	TGT	2	6	1222555	1222560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582363
23068	NC_015865	ATC	2	6	1222586	1222591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582363
23069	NC_015865	CCT	2	6	1222609	1222614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582363
23070	NC_015865	GCG	2	6	1222662	1222667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582363
23071	NC_015865	GGCC	2	8	1222699	1222706	0 %	0 %	50 %	50 %	341582363
23072	NC_015865	CGA	2	6	1222791	1222796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582364
23073	NC_015865	CGA	2	6	1222830	1222835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582364
23074	NC_015865	TGA	2	6	1222953	1222958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582364
23075	NC_015865	AGGT	2	8	1223135	1223142	25 %	25 %	50 %	0 %	341582364
23076	NC_015865	TCT	2	6	1223151	1223156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582364
23077	NC_015865	TCA	2	6	1223169	1223174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582364
23078	NC_015865	TCG	2	6	1223222	1223227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582364
23079	NC_015865	CGA	3	9	1223229	1223237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582364
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23081	NC_015865	TCC	2	6	1223324	1223329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582364
23082	NC_015865	CTC	2	6	1223371	1223376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582364
23083	NC_015865	AGC	2	6	1223411	1223416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582364
23084	NC_015865	CTC	2	6	1223419	1223424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582364
23085	NC_015865	ATC	2	6	1223480	1223485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582364
23086	NC_015865	TCC	2	6	1223513	1223518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582364
23087	NC_015865	CGT	2	6	1223538	1223543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582364
23088	NC_015865	GAG	2	6	1223578	1223583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582364
23089	NC_015865	GGT	2	6	1223602	1223607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582364
23090	NC_015865	ACCA	2	8	1223629	1223636	50 %	0 %	0 %	50 %	341582364
23091	NC_015865	CTG	2	6	1223647	1223652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582364
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23093	NC_015865	CT	3	6	1223730	1223735	0 %	50 %	0 %	50 %	341582364
23094	NC_015865	CTT	2	6	1223749	1223754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582364
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23098	NC_015865	GCTCCT	2	12	1223851	1223862	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341582365
23099	NC_015865	CGG	2	6	1223912	1223917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582365
23100	NC_015865	TGA	2	6	1223920	1223925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582365
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23102	NC_015865	GA	3	6	1223991	1223996	50 %	0 %	50 %	0 %	341582365
23103	NC_015865	GTA	2	6	1224026	1224031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582365
23104	NC_015865	TCT	2	6	1224034	1224039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582365
23105	NC_015865	CGA	2	6	1224055	1224060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582365
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23107	NC_015865	TGA	2	6	1224124	1224129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582365
23108	NC_015865	GA	3	6	1224138	1224143	50 %	0 %	50 %	0 %	341582365
23109	NC_015865	CTT	2	6	1224152	1224157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582365
23110	NC_015865	CTT	2	6	1224161	1224166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582365
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23112	NC_015865	TGA	2	6	1224175	1224180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582365
23113	NC_015865	CGT	2	6	1224209	1224214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582365
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23115	NC_015865	AGG	2	6	1224249	1224254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582365
23116	NC_015865	ATG	2	6	1224264	1224269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582365
23117	NC_015865	GCT	2	6	1224274	1224279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582365
23118	NC_015865	AGG	2	6	1224396	1224401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582365
23119	NC_015865	ATC	2	6	1224411	1224416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582365
23120	NC_015865	TCT	2	6	1224478	1224483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582365
23121	NC_015865	TGC	2	6	1224550	1224555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582365
23122	NC_015865	CGGTG	2	10	1224572	1224581	0 %	20 %	60 %	20 %	341582365
23123	NC_015865	GAGG	2	8	1224605	1224612	25 %	0 %	75 %	0 %	341582365
23124	NC_015865	CTT	2	6	1224656	1224661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582365
23125	NC_015865	GAC	2	6	1224692	1224697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582365
23126	NC_015865	TTG	2	6	1224702	1224707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582365
23127	NC_015865	CCT	2	6	1224774	1224779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582366
23128	NC_015865	CGA	2	6	1224836	1224841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582366
23129	NC_015865	CGGG	2	8	1224857	1224864	0 %	0 %	75 %	25 %	341582366
23130	NC_015865	CAC	2	6	1224871	1224876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341582366
23131	NC_015865	GTC	2	6	1224889	1224894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582366
23132	NC_015865	GCC	2	6	1224895	1224900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582366
23133	NC_015865	CGG	2	6	1224938	1224943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582366
23134	NC_015865	GGC	2	6	1225092	1225097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582366
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23136	NC_015865	CATC	2	8	1225158	1225165	25 %	25 %	0 %	50 %	341582366
23137	NC_015865	CAG	2	6	1225179	1225184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341582366
23138	NC_015865	GATGAG	2	12	1225224	1225235	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	341582366
23139	NC_015865	CAT	2	6	1225278	1225283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582366
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23142	NC_015865	GTC	2	6	1225479	1225484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582366
23143	NC_015865	GTT	2	6	1225563	1225568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582366
23144	NC_015865	ATG	2	6	1225639	1225644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582366
23145	NC_015865	CGC	2	6	1225731	1225736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341582366
23146	NC_015865	TGG	3	9	1225754	1225762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341582366
23147	NC_015865	ATG	2	6	1225879	1225884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582366
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23149	NC_015865	GGGT	2	8	1225957	1225964	0 %	25 %	75 %	0 %	341582366
23150	NC_015865	GTA	2	6	1225983	1225988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582366
23151	NC_015865	TGT	2	6	1226024	1226029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582366
23152	NC_015865	CGG	2	6	1226037	1226042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341582366
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23155	NC_015865	TTG	2	6	1226105	1226110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341582366
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23167	NC_015865	GAG	2	6	1226465	1226470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341582367
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23227	NC_015865	GTC	2	6	1228597	1228602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582369
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23230	NC_015865	GTA	2	6	1228752	1228757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582369
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23346	NC_015865	CTT	2	6	1233885	1233890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582374
23347	NC_015865	CTC	2	6	1233937	1233942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582374
23348	NC_015865	CTG	2	6	1233994	1233999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582374
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23352	NC_015865	TCT	2	6	1234136	1234141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341582374
23353	NC_015865	TCG	2	6	1234142	1234147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582374
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23357	NC_015865	CAT	2	6	1234297	1234302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582375
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23363	NC_015865	ATC	2	6	1234544	1234549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582375
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23441	NC_015865	GACCTC	2	12	1237865	1237876	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341582378
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23449	NC_015865	TTCAAC	2	12	1238291	1238302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341582378
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23451	NC_015865	GAA	2	6	1238470	1238475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341582379
23452	NC_015865	TCG	2	6	1238492	1238497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341582379
23453	NC_015865	TGA	2	6	1238508	1238513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341582379
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23457	NC_015865	TCGT	2	8	1238714	1238721	0 %	50 %	25 %	25 %	341582379
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23461	NC_015865	CTC	2	6	1238902	1238907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341582379
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