MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_015865	TCG	2	6	849776	849781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
16002	NC_015865	GCA	2	6	849833	849838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
16003	NC_015865	ATG	3	9	849868	849876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
16004	NC_015865	CTT	2	6	849939	849944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
16005	NC_015865	GGC	2	6	849957	849962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581963
16006	NC_015865	AGG	2	6	850012	850017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
16007	NC_015865	C	6	6	850042	850047	0 %	0 %	0 %	100 %	341581963
16008	NC_015865	GGA	2	6	850115	850120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
16009	NC_015865	TCC	2	6	850124	850129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
16010	NC_015865	GAC	2	6	850200	850205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
16011	NC_015865	CTT	2	6	850278	850283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
16012	NC_015865	GACG	2	8	850305	850312	25 %	0 %	50 %	25 %	341581963
16013	NC_015865	TCCGCC	2	12	850336	850347	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341581963
16014	NC_015865	TCC	2	6	850369	850374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
16015	NC_015865	GAG	2	6	850389	850394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581963
16016	NC_015865	CCTCG	2	10	850536	850545	0 %	20 %	20 %	60 %	341581963
16017	NC_015865	TTA	2	6	850562	850567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581963
16018	NC_015865	GTA	2	6	850583	850588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
16019	NC_015865	CGA	2	6	850595	850600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
16020	NC_015865	TC	3	6	850604	850609	0 %	50 %	0 %	50 %	341581963
16021	NC_015865	AGA	2	6	850637	850642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581964
16022	NC_015865	TCC	2	6	850652	850657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581964
16023	NC_015865	TGG	2	6	850731	850736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581964
16024	NC_015865	CGG	2	6	850839	850844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581964
16025	NC_015865	ACC	2	6	850926	850931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581964
16026	NC_015865	GGCCAG	2	12	851089	851100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	341581964
16027	NC_015865	GTC	2	6	851104	851109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581964
16028	NC_015865	AGA	2	6	851115	851120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581964
16029	NC_015865	TACA	2	8	851196	851203	50 %	25 %	0 %	25 %	341581964
16030	NC_015865	ATA	2	6	851369	851374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581965
16031	NC_015865	CTC	2	6	851375	851380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581965
16032	NC_015865	GCC	2	6	851386	851391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581965
16033	NC_015865	CTA	2	6	851455	851460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
16034	NC_015865	CCA	2	6	851545	851550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
16035	NC_015865	TGA	2	6	851556	851561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581965
16036	NC_015865	GAAGCG	2	12	851661	851672	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	341581965
16037	NC_015865	CAC	2	6	851683	851688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
16038	NC_015865	ATA	2	6	851723	851728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581965
16039	NC_015865	CGA	2	6	851734	851739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581965
16040	NC_015865	TCAG	2	8	851747	851754	25 %	25 %	25 %	25 %	341581965
16041	NC_015865	CAT	2	6	851761	851766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
16042	NC_015865	CAC	2	6	851821	851826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581965
16043	NC_015865	GAA	2	6	851884	851889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581965
16044	NC_015865	TCC	2	6	851913	851918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581965
16045	NC_015865	GAG	3	9	852017	852025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
16046	NC_015865	TAC	2	6	852026	852031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
16047	NC_015865	GAC	2	6	852098	852103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581965
16048	NC_015865	TGG	2	6	852104	852109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581965
16049	NC_015865	ACG	2	6	852123	852128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581965
16050	NC_015865	ATCAAA	2	12	852161	852172	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	341581965
16051	NC_015865	GGA	2	6	852196	852201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
16052	NC_015865	GGA	2	6	852211	852216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
16053	NC_015865	TCG	2	6	852252	852257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581965
16054	NC_015865	TCG	2	6	852273	852278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581965
16055	NC_015865	GGC	2	6	852367	852372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581965
16056	NC_015865	TAC	2	6	852383	852388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581965
16057	NC_015865	GAG	2	6	852445	852450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
16058	NC_015865	GAT	2	6	852475	852480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581965
16059	NC_015865	GAG	2	6	852494	852499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581965
16060	NC_015865	GAA	2	6	852533	852538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581966
16061	NC_015865	T	6	6	852582	852587	0 %	100 %	0 %	0 %	341581966
16062	NC_015865	CTA	2	6	852608	852613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581966
16063	NC_015865	TCC	2	6	852625	852630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581966
16064	NC_015865	AAT	2	6	852824	852829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581966
16065	NC_015865	GAATCT	2	12	852890	852901	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341581966
16066	NC_015865	CTT	2	6	852957	852962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581967
16067	NC_015865	CGT	2	6	852986	852991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16068	NC_015865	CGA	2	6	853007	853012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16069	NC_015865	GGC	2	6	853017	853022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581967
16070	NC_015865	TCT	2	6	853085	853090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581967
16071	NC_015865	TGG	2	6	853106	853111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581967
16072	NC_015865	AGT	2	6	853124	853129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
16073	NC_015865	CCG	2	6	853174	853179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581967
16074	NC_015865	ATG	2	6	853201	853206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
16075	NC_015865	TCG	2	6	853231	853236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16076	NC_015865	GGT	2	6	853245	853250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581967
16077	NC_015865	CGA	2	6	853271	853276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16078	NC_015865	TGA	2	6	853310	853315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
16079	NC_015865	CTCGAG	2	12	853350	853361	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581967
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16082	NC_015865	TCG	2	6	853438	853443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581967
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16084	NC_015865	CGA	2	6	853493	853498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16085	NC_015865	CTC	2	6	853512	853517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581967
16086	NC_015865	GTA	2	6	853536	853541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
16087	NC_015865	ACGG	2	8	853614	853621	25 %	0 %	50 %	25 %	341581967
16088	NC_015865	CGA	2	6	853658	853663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16089	NC_015865	GGC	2	6	853678	853683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581967
16090	NC_015865	TGA	2	6	853691	853696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
16091	NC_015865	TCC	2	6	853715	853720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581967
16092	NC_015865	CAT	2	6	853743	853748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581967
16093	NC_015865	TGA	2	6	853808	853813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581967
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16095	NC_015865	TA	3	6	853830	853835	50 %	50 %	0 %	0 %	341581967
16096	NC_015865	ATA	2	6	853888	853893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581967
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16098	NC_015865	ACC	2	6	854001	854006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581967
16099	NC_015865	CGT	2	6	854069	854074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16100	NC_015865	CTT	2	6	854115	854120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581967
16101	NC_015865	GCT	2	6	854174	854179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581967
16102	NC_015865	TTC	2	6	854992	854997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581968
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16104	NC_015865	TGG	2	6	855124	855129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581968
16105	NC_015865	ACTG	2	8	855159	855166	25 %	25 %	25 %	25 %	341581968
16106	NC_015865	CTA	2	6	855180	855185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581968
16107	NC_015865	TTC	2	6	855265	855270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581968
16108	NC_015865	TCC	2	6	855326	855331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581968
16109	NC_015865	ATG	2	6	855388	855393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581968
16110	NC_015865	CTC	2	6	855397	855402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581968
16111	NC_015865	CAT	2	6	855414	855419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581968
16112	NC_015865	CGC	2	6	855546	855551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581968
16113	NC_015865	TTC	2	6	855565	855570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581968
16114	NC_015865	CTCG	2	8	855576	855583	0 %	25 %	25 %	50 %	341581968
16115	NC_015865	ATC	2	6	855592	855597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581968
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16117	NC_015865	GTC	2	6	855682	855687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581968
16118	NC_015865	TGG	2	6	855690	855695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581968
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16224	NC_015865	AGCTCG	2	12	860313	860324	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581973
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