MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_015865	CCT	3	9	822292	822300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15502	NC_015865	TCG	2	6	822339	822344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581943
15503	NC_015865	CTTC	2	8	822398	822405	0 %	50 %	0 %	50 %	341581943
15504	NC_015865	GC	3	6	822488	822493	0 %	0 %	50 %	50 %	341581944
15505	NC_015865	CCA	2	6	822555	822560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581944
15506	NC_015865	CTT	2	6	822603	822608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581944
15507	NC_015865	CGG	2	6	822624	822629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581944
15508	NC_015865	CAG	2	6	822637	822642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581944
15509	NC_015865	CCG	2	6	822713	822718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581944
15510	NC_015865	CTCG	2	8	822760	822767	0 %	25 %	25 %	50 %	341581944
15511	NC_015865	CGG	2	6	822786	822791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581944
15512	NC_015865	T	6	6	822855	822860	0 %	100 %	0 %	0 %	341581944
15513	NC_015865	CTC	2	6	823054	823059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581944
15514	NC_015865	GAG	2	6	823085	823090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581944
15515	NC_015865	CCT	2	6	823221	823226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581944
15516	NC_015865	CCT	2	6	823242	823247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581944
15517	NC_015865	CTC	2	6	823277	823282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581944
15518	NC_015865	GCAT	2	8	823324	823331	25 %	25 %	25 %	25 %	341581944
15519	NC_015865	TGT	2	6	823353	823358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581944
15520	NC_015865	TGC	2	6	823531	823536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581945
15521	NC_015865	GAG	2	6	823575	823580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581945
15522	NC_015865	GAG	2	6	823677	823682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581945
15523	NC_015865	CAT	2	6	823754	823759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581945
15524	NC_015865	CGA	2	6	823780	823785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581945
15525	NC_015865	TAC	2	6	823803	823808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581945
15526	NC_015865	GCC	2	6	823892	823897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581945
15527	NC_015865	GA	3	6	823944	823949	50 %	0 %	50 %	0 %	341581945
15528	NC_015865	CCT	2	6	824035	824040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
15529	NC_015865	CTC	2	6	824067	824072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
15530	NC_015865	TCC	2	6	824098	824103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
15531	NC_015865	TCC	2	6	824125	824130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581945
15532	NC_015865	GCT	2	6	824218	824223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581945
15533	NC_015865	CGA	2	6	824237	824242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581945
15534	NC_015865	AG	3	6	824401	824406	50 %	0 %	50 %	0 %	341581946
15535	NC_015865	ACCGCT	2	12	824440	824451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581946
15536	NC_015865	GGT	2	6	824470	824475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581946
15537	NC_015865	CGG	2	6	824507	824512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
15538	NC_015865	CCT	2	6	824537	824542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581946
15539	NC_015865	G	6	6	824550	824555	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
15540	NC_015865	GC	3	6	824611	824616	0 %	0 %	50 %	50 %	341581946
15541	NC_015865	GGA	2	6	824650	824655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581946
15542	NC_015865	GCTCA	2	10	824727	824736	20 %	20 %	20 %	40 %	341581946
15543	NC_015865	GAG	2	6	824804	824809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581946
15544	NC_015865	GGGT	2	8	824868	824875	0 %	25 %	75 %	0 %	341581946
15545	NC_015865	GAT	2	6	824981	824986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581946
15546	NC_015865	CGT	2	6	825041	825046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
15547	NC_015865	GCG	2	6	825147	825152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
15548	NC_015865	CTC	2	6	825180	825185	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581946
15549	NC_015865	GAGG	2	8	825203	825210	25 %	0 %	75 %	0 %	341581946
15550	NC_015865	G	6	6	825281	825286	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
15551	NC_015865	GAAG	2	8	825290	825297	50 %	0 %	50 %	0 %	341581946
15552	NC_015865	GCT	2	6	825314	825319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
15553	NC_015865	TGC	2	6	825373	825378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
15554	NC_015865	CCT	2	6	825394	825399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581946
15555	NC_015865	CGT	2	6	825506	825511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
15556	NC_015865	CGG	2	6	825517	825522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
15557	NC_015865	ATC	2	6	825560	825565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581946
15558	NC_015865	GCG	2	6	825579	825584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581946
15559	NC_015865	G	6	6	825609	825614	0 %	0 %	100 %	0 %	341581946
15560	NC_015865	CTG	2	6	825624	825629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581946
15561	NC_015865	GAA	2	6	825728	825733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581947
15562	NC_015865	GTG	2	6	825744	825749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581947
15563	NC_015865	CGA	2	6	825805	825810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581947
15564	NC_015865	GAG	2	6	825821	825826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581947
15565	NC_015865	ATA	2	6	825881	825886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581947
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15567	NC_015865	CCCT	2	8	825933	825940	0 %	25 %	0 %	75 %	341581947
15568	NC_015865	CGGG	2	8	826078	826085	0 %	0 %	75 %	25 %	341581947
15569	NC_015865	GCCT	2	8	826105	826112	0 %	25 %	25 %	50 %	341581947
15570	NC_015865	CGG	2	6	826144	826149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581947
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15572	NC_015865	G	6	6	826636	826641	0 %	0 %	100 %	0 %	341581947
15573	NC_015865	CCCTGA	2	12	826699	826710	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581947
15574	NC_015865	CTT	2	6	826766	826771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581947
15575	NC_015865	CGGG	2	8	826783	826790	0 %	0 %	75 %	25 %	341581947
15576	NC_015865	TCC	2	6	826806	826811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581947
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15580	NC_015865	CG	3	6	826915	826920	0 %	0 %	50 %	50 %	341581947
15581	NC_015865	ACC	2	6	826959	826964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581947
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15586	NC_015865	CTTT	2	8	827201	827208	0 %	75 %	0 %	25 %	341581948
15587	NC_015865	CG	3	6	827393	827398	0 %	0 %	50 %	50 %	341581948
15588	NC_015865	CCT	2	6	827404	827409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581948
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15591	NC_015865	CGA	2	6	827605	827610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581948
15592	NC_015865	CTTT	2	8	827624	827631	0 %	75 %	0 %	25 %	341581948
15593	NC_015865	CCT	2	6	827632	827637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581948
15594	NC_015865	GCC	2	6	827687	827692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581948
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15599	NC_015865	TC	3	6	828191	828196	0 %	50 %	0 %	50 %	341581948
15600	NC_015865	TC	4	8	828202	828209	0 %	50 %	0 %	50 %	341581948
15601	NC_015865	TCA	2	6	828309	828314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581949
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15604	NC_015865	CCCT	2	8	828459	828466	0 %	25 %	0 %	75 %	341581949
15605	NC_015865	GAG	2	6	828479	828484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581949
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15607	NC_015865	GAG	2	6	828503	828508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581949
15608	NC_015865	TCC	2	6	828656	828661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581950
15609	NC_015865	CCT	2	6	828774	828779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581950
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15729	NC_015865	AC	3	6	835935	835940	50 %	0 %	0 %	50 %	341581952
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15739	NC_015865	GGC	2	6	836318	836323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581953
15740	NC_015865	GAT	2	6	836391	836396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581953
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15742	NC_015865	GTG	2	6	836453	836458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581953
15743	NC_015865	TAT	2	6	836501	836506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581953
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15745	NC_015865	ATC	2	6	836565	836570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581953
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15767	NC_015865	CTG	2	6	837380	837385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581954
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15972	NC_015865	CAGC	2	8	848107	848114	25 %	0 %	25 %	50 %	341581962
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15974	NC_015865	ACG	2	6	848220	848225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581962
15975	NC_015865	GGC	2	6	848249	848254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581962
15976	NC_015865	CCA	2	6	848293	848298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581962
15977	NC_015865	TGA	2	6	848392	848397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581962
15978	NC_015865	C	6	6	848448	848453	0 %	0 %	0 %	100 %	341581962
15979	NC_015865	GAA	2	6	848607	848612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581962
15980	NC_015865	GTT	2	6	848697	848702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581963
15981	NC_015865	CTT	2	6	848727	848732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
15982	NC_015865	CTCC	2	8	848832	848839	0 %	25 %	0 %	75 %	341581963
15983	NC_015865	GTTGAC	2	12	848883	848894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581963
15984	NC_015865	CGA	2	6	848918	848923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581963
15985	NC_015865	CT	3	6	848942	848947	0 %	50 %	0 %	50 %	341581963
15986	NC_015865	TTC	2	6	849001	849006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581963
15987	NC_015865	GCT	2	6	849020	849025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
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15989	NC_015865	ATG	2	6	849100	849105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581963
15990	NC_015865	CTG	2	6	849196	849201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
15991	NC_015865	CTC	2	6	849294	849299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581963
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15995	NC_015865	CTG	2	6	849484	849489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
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15999	NC_015865	CTG	2	6	849750	849755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581963
16000	NC_015865	GAA	2	6	849758	849763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581963

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