MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_015865	CTTTC	2	10	795985	795994	0 %	60 %	0 %	40 %	341581913
15003	NC_015865	TGT	2	6	796038	796043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581913
15004	NC_015865	GTC	2	6	796046	796051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581913
15005	NC_015865	TCG	2	6	796131	796136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581913
15006	NC_015865	TCG	2	6	796139	796144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581913
15007	NC_015865	ATC	2	6	796169	796174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581913
15008	NC_015865	GAG	2	6	796261	796266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581913
15009	NC_015865	C	6	6	796290	796295	0 %	0 %	0 %	100 %	341581913
15010	NC_015865	TC	3	6	796387	796392	0 %	50 %	0 %	50 %	341581913
15011	NC_015865	TCG	2	6	796415	796420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581913
15012	NC_015865	TC	3	6	796446	796451	0 %	50 %	0 %	50 %	341581913
15013	NC_015865	GGT	2	6	796489	796494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581913
15014	NC_015865	GTA	2	6	796585	796590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581913
15015	NC_015865	CGA	2	6	796602	796607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581913
15016	NC_015865	GA	3	6	796843	796848	50 %	0 %	50 %	0 %	341581914
15017	NC_015865	ATG	2	6	796850	796855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581914
15018	NC_015865	TCA	2	6	796926	796931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581914
15019	NC_015865	ATC	2	6	796970	796975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581914
15020	NC_015865	ATC	2	6	797003	797008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581914
15021	NC_015865	GAG	2	6	797020	797025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581914
15022	NC_015865	GA	3	6	797027	797032	50 %	0 %	50 %	0 %	341581914
15023	NC_015865	ATG	2	6	797126	797131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581914
15024	NC_015865	GAG	2	6	797149	797154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581914
15025	NC_015865	GGA	2	6	797184	797189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581914
15026	NC_015865	ACG	2	6	797240	797245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581914
15027	NC_015865	CGA	2	6	797247	797252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581914
15028	NC_015865	TCCC	2	8	797268	797275	0 %	25 %	0 %	75 %	341581914
15029	NC_015865	GAGCG	2	10	797308	797317	20 %	0 %	60 %	20 %	341581914
15030	NC_015865	AGC	2	6	797342	797347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581914
15031	NC_015865	TGA	2	6	797385	797390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581914
15032	NC_015865	AGG	2	6	797414	797419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581914
15033	NC_015865	TCG	2	6	797469	797474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581914
15034	NC_015865	CAT	2	6	797518	797523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581914
15035	NC_015865	GAT	2	6	797599	797604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581914
15036	NC_015865	ATGT	2	8	797618	797625	25 %	50 %	25 %	0 %	341581914
15037	NC_015865	TCT	2	6	797628	797633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581914
15038	NC_015865	AGG	2	6	797712	797717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581915
15039	NC_015865	CAC	2	6	797720	797725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581915
15040	NC_015865	TC	3	6	797793	797798	0 %	50 %	0 %	50 %	341581915
15041	NC_015865	CTTCCA	2	12	797981	797992	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	341581915
15042	NC_015865	CGGGG	2	10	798056	798065	0 %	0 %	80 %	20 %	341581916
15043	NC_015865	CACC	2	8	798118	798125	25 %	0 %	0 %	75 %	341581916
15044	NC_015865	TCA	2	6	798181	798186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581916
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15053	NC_015865	CGC	2	6	798659	798664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581916
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15055	NC_015865	CTT	2	6	798707	798712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581916
15056	NC_015865	CCG	2	6	798742	798747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581916
15057	NC_015865	AGC	2	6	798765	798770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581916
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15060	NC_015865	GAT	2	6	799039	799044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581917
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15063	NC_015865	CAT	2	6	799114	799119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581917
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15065	NC_015865	CTA	2	6	799207	799212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581917
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15072	NC_015865	T	7	7	799867	799873	0 %	100 %	0 %	0 %	341581918
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15239	NC_015865	CTC	2	6	809882	809887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581929
15240	NC_015865	GAA	2	6	809927	809932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581929
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15252	NC_015865	GCGA	2	8	810328	810335	25 %	0 %	50 %	25 %	341581930
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15342	NC_015865	GA	3	6	814806	814811	50 %	0 %	50 %	0 %	341581935
15343	NC_015865	ACT	2	6	814825	814830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581935
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15346	NC_015865	AG	3	6	814931	814936	50 %	0 %	50 %	0 %	341581935
15347	NC_015865	CGT	2	6	814988	814993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581935
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15476	NC_015865	GTG	2	6	820679	820684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581942
15477	NC_015865	ACTTT	2	10	820803	820812	20 %	60 %	0 %	20 %	341581942
15478	NC_015865	C	6	6	820881	820886	0 %	0 %	0 %	100 %	341581942
15479	NC_015865	CCT	2	6	820896	820901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581942
15480	NC_015865	TCC	2	6	821068	821073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15481	NC_015865	GAT	2	6	821086	821091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581943
15482	NC_015865	AAC	2	6	821120	821125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581943
15483	NC_015865	AGAA	2	8	821187	821194	75 %	0 %	25 %	0 %	341581943
15484	NC_015865	GAA	2	6	821204	821209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581943
15485	NC_015865	TCC	2	6	821335	821340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15486	NC_015865	CCA	2	6	821368	821373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581943
15487	NC_015865	GTA	3	9	821381	821389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581943
15488	NC_015865	CG	3	6	821459	821464	0 %	0 %	50 %	50 %	341581943
15489	NC_015865	CCTC	2	8	821719	821726	0 %	25 %	0 %	75 %	341581943
15490	NC_015865	GC	3	6	821732	821737	0 %	0 %	50 %	50 %	341581943
15491	NC_015865	GGA	2	6	821761	821766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581943
15492	NC_015865	CTC	2	6	821822	821827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15493	NC_015865	AGG	2	6	821841	821846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581943
15494	NC_015865	TCC	2	6	821869	821874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15495	NC_015865	TCC	2	6	821902	821907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15496	NC_015865	CTC	2	6	821945	821950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581943
15497	NC_015865	C	6	6	821950	821955	0 %	0 %	0 %	100 %	341581943
15498	NC_015865	GAC	2	6	822101	822106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581943
15499	NC_015865	CGT	2	6	822232	822237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581943
15500	NC_015865	GCCC	2	8	822266	822273	0 %	0 %	25 %	75 %	341581943

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