MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_015865	CAA	2	6	720972	720977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581837
13502	NC_015865	GAG	2	6	721069	721074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581837
13503	NC_015865	GGT	2	6	721107	721112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581837
13504	NC_015865	CGT	2	6	721122	721127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581837
13505	NC_015865	CCG	2	6	721133	721138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581837
13506	NC_015865	TCG	2	6	721166	721171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581837
13507	NC_015865	TCA	2	6	721262	721267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581837
13508	NC_015865	GGTC	2	8	721317	721324	0 %	25 %	50 %	25 %	341581837
13509	NC_015865	CGA	2	6	721383	721388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581837
13510	NC_015865	CAG	2	6	721411	721416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581837
13511	NC_015865	CAT	2	6	721482	721487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581837
13512	NC_015865	GAA	2	6	721509	721514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581837
13513	NC_015865	GGCT	2	8	721527	721534	0 %	25 %	50 %	25 %	341581837
13514	NC_015865	CGA	2	6	721623	721628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581837
13515	NC_015865	AGG	2	6	721685	721690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581837
13516	NC_015865	GAG	2	6	721699	721704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581837
13517	NC_015865	GAA	2	6	721711	721716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581837
13518	NC_015865	GAG	2	6	721717	721722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581837
13519	NC_015865	GAA	2	6	721723	721728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581837
13520	NC_015865	AGG	2	6	721742	721747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581837
13521	NC_015865	GC	3	6	721766	721771	0 %	0 %	50 %	50 %	341581837
13522	NC_015865	CTG	2	6	721882	721887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581838
13523	NC_015865	CGC	2	6	721893	721898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581838
13524	NC_015865	GAG	2	6	721915	721920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581838
13525	NC_015865	GCC	2	6	721987	721992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581838
13526	NC_015865	CGA	2	6	722010	722015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581838
13527	NC_015865	GCC	2	6	722029	722034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581838
13528	NC_015865	GCC	2	6	722044	722049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581838
13529	NC_015865	GTTGCC	2	12	722053	722064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581838
13530	NC_015865	GCT	2	6	722065	722070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581838
13531	NC_015865	GCC	2	6	722095	722100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581838
13532	NC_015865	AGG	2	6	722111	722116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581838
13533	NC_015865	AAGAGG	2	12	722117	722128	50 %	0 %	50 %	0 %	341581838
13534	NC_015865	GAG	3	9	722137	722145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581838
13535	NC_015865	ATG	2	6	722867	722872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581839
13536	NC_015865	GAAA	2	8	722893	722900	75 %	0 %	25 %	0 %	341581839
13537	NC_015865	GGGA	2	8	722960	722967	25 %	0 %	75 %	0 %	341581839
13538	NC_015865	GAC	2	6	723074	723079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581839
13539	NC_015865	AGC	2	6	723104	723109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581839
13540	NC_015865	AGGG	2	8	723116	723123	25 %	0 %	75 %	0 %	341581839
13541	NC_015865	CTGG	2	8	723153	723160	0 %	25 %	50 %	25 %	341581839
13542	NC_015865	GAA	2	6	723325	723330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581839
13543	NC_015865	GGAA	2	8	723511	723518	50 %	0 %	50 %	0 %	341581840
13544	NC_015865	GCG	2	6	723584	723589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581840
13545	NC_015865	TA	3	6	723616	723621	50 %	50 %	0 %	0 %	341581840
13546	NC_015865	GAA	2	6	723645	723650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581840
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13549	NC_015865	GAG	2	6	723771	723776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581841
13550	NC_015865	GAGC	2	8	724038	724045	25 %	0 %	50 %	25 %	341581842
13551	NC_015865	GTT	2	6	724093	724098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581842
13552	NC_015865	CTT	2	6	724107	724112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581842
13553	NC_015865	GAG	2	6	724117	724122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581842
13554	NC_015865	CCT	2	6	724152	724157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581842
13555	NC_015865	TCG	2	6	724178	724183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581842
13556	NC_015865	GGC	2	6	724186	724191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581842
13557	NC_015865	TCAA	2	8	724223	724230	50 %	25 %	0 %	25 %	341581842
13558	NC_015865	GAG	2	6	724264	724269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581842
13559	NC_015865	CTC	2	6	724282	724287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581842
13560	NC_015865	CTC	2	6	724327	724332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581842
13561	NC_015865	CGTT	2	8	724431	724438	0 %	50 %	25 %	25 %	341581842
13562	NC_015865	GCT	2	6	724478	724483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581842
13563	NC_015865	ACT	2	6	724484	724489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581842
13564	NC_015865	CAA	2	6	724632	724637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581842
13565	NC_015865	CTA	2	6	724692	724697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581842
13566	NC_015865	CTC	2	6	724753	724758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581842
13567	NC_015865	ACA	2	6	724772	724777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581842
13568	NC_015865	GCGG	2	8	724860	724867	0 %	0 %	75 %	25 %	341581842
13569	NC_015865	GGA	2	6	724935	724940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581842
13570	NC_015865	TGA	2	6	724964	724969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581842
13571	NC_015865	ACT	2	6	725006	725011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581842
13572	NC_015865	GC	3	6	725038	725043	0 %	0 %	50 %	50 %	341581842
13573	NC_015865	GAG	2	6	725065	725070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581842
13574	NC_015865	GAA	2	6	725073	725078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581842
13575	NC_015865	GAA	2	6	725167	725172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581842
13576	NC_015865	GAG	2	6	725179	725184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581842
13577	NC_015865	CA	3	6	725194	725199	50 %	0 %	0 %	50 %	341581842
13578	NC_015865	CTG	2	6	725217	725222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581842
13579	NC_015865	ATA	2	6	725429	725434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581843
13580	NC_015865	GCCT	2	8	725445	725452	0 %	25 %	25 %	50 %	341581843
13581	NC_015865	TCA	2	6	725477	725482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581843
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13584	NC_015865	GTC	2	6	725663	725668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581843
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13586	NC_015865	CAC	2	6	725725	725730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581844
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13588	NC_015865	TTG	2	6	725846	725851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581844
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13590	NC_015865	TCT	2	6	725895	725900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581844
13591	NC_015865	AGA	2	6	725930	725935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581844
13592	NC_015865	GGC	2	6	726042	726047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581844
13593	NC_015865	CGG	2	6	726077	726082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581844
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13598	NC_015865	GAG	2	6	726211	726216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581844
13599	NC_015865	AAG	2	6	726220	726225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581844
13600	NC_015865	CGTTC	2	10	726285	726294	0 %	40 %	20 %	40 %	341581844
13601	NC_015865	TCG	3	9	726308	726316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581844
13602	NC_015865	CGG	2	6	726453	726458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581844
13603	NC_015865	AAG	2	6	726547	726552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581844
13604	NC_015865	TCA	2	6	726638	726643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581844
13605	NC_015865	AAGGCA	2	12	726655	726666	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341581844
13606	NC_015865	AGG	2	6	726680	726685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581844
13607	NC_015865	CCAG	2	8	726713	726720	25 %	0 %	25 %	50 %	341581844
13608	NC_015865	GAG	2	6	726781	726786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581844
13609	NC_015865	ATA	2	6	726790	726795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581844
13610	NC_015865	CAG	2	6	726805	726810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581844
13611	NC_015865	CGAG	2	8	726818	726825	25 %	0 %	50 %	25 %	341581844
13612	NC_015865	CTC	3	9	726883	726891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581844
13613	NC_015865	GGC	2	6	726941	726946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581844
13614	NC_015865	CGT	2	6	726972	726977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581844
13615	NC_015865	TCA	2	6	726989	726994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581844
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13617	NC_015865	TCG	2	6	727040	727045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581844
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13619	NC_015865	GGA	2	6	727196	727201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581845
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13978	NC_015865	A	6	6	744224	744229	100 %	0 %	0 %	0 %	341581857
13979	NC_015865	CTG	2	6	744252	744257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581857
13980	NC_015865	GA	3	6	744389	744394	50 %	0 %	50 %	0 %	341581858
13981	NC_015865	TGGAG	2	10	744478	744487	20 %	20 %	60 %	0 %	341581858
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13983	NC_015865	TCG	2	6	744585	744590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581858
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