MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_015865	TCC	2	6	666543	666548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581783
12503	NC_015865	AAG	2	6	666560	666565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581783
12504	NC_015865	ATA	2	6	667428	667433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581784
12505	NC_015865	GAG	3	9	667476	667484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581784
12506	NC_015865	GAG	2	6	667503	667508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581784
12507	NC_015865	ATA	2	6	667554	667559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581784
12508	NC_015865	AGG	2	6	667624	667629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581784
12509	NC_015865	ACG	2	6	667633	667638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581784
12510	NC_015865	ACG	2	6	667684	667689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581784
12511	NC_015865	CA	3	6	667690	667695	50 %	0 %	0 %	50 %	341581784
12512	NC_015865	CTC	2	6	667704	667709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581784
12513	NC_015865	AGG	2	6	667783	667788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581784
12514	NC_015865	GAT	2	6	667808	667813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581784
12515	NC_015865	ATC	2	6	667884	667889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581784
12516	NC_015865	AAGG	2	8	667896	667903	50 %	0 %	50 %	0 %	341581784
12517	NC_015865	GGC	2	6	667953	667958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581784
12518	NC_015865	CGC	2	6	667969	667974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581784
12519	NC_015865	ATCCC	2	10	667987	667996	20 %	20 %	0 %	60 %	341581784
12520	NC_015865	AGCA	2	8	668033	668040	50 %	0 %	25 %	25 %	341581784
12521	NC_015865	GTC	2	6	668067	668072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581784
12522	NC_015865	TTC	2	6	668148	668153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581784
12523	NC_015865	CCG	2	6	668259	668264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581784
12524	NC_015865	GGC	2	6	668285	668290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581784
12525	NC_015865	CTA	2	6	668369	668374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581784
12526	NC_015865	CAC	2	6	668445	668450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581784
12527	NC_015865	GAG	2	6	668472	668477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581784
12528	NC_015865	TAT	2	6	668545	668550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581785
12529	NC_015865	CCTC	2	8	668556	668563	0 %	25 %	0 %	75 %	341581785
12530	NC_015865	GAA	2	6	668598	668603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581785
12531	NC_015865	GTA	2	6	668722	668727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581785
12532	NC_015865	CCGC	2	8	668740	668747	0 %	0 %	25 %	75 %	341581785
12533	NC_015865	TGA	2	6	668759	668764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581785
12534	NC_015865	CGGC	2	8	668822	668829	0 %	0 %	50 %	50 %	341581785
12535	NC_015865	TCC	2	6	668852	668857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581785
12536	NC_015865	CCCCT	2	10	668884	668893	0 %	20 %	0 %	80 %	341581785
12537	NC_015865	CA	3	6	668906	668911	50 %	0 %	0 %	50 %	341581785
12538	NC_015865	CCT	2	6	668959	668964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581785
12539	NC_015865	CAT	2	6	668970	668975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581785
12540	NC_015865	CGA	2	6	669024	669029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581785
12541	NC_015865	TGCCCC	2	12	669051	669062	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	341581785
12542	NC_015865	CTC	2	6	669127	669132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581785
12543	NC_015865	GAGAA	2	10	669134	669143	60 %	0 %	40 %	0 %	341581785
12544	NC_015865	CAG	2	6	669202	669207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581785
12545	NC_015865	GTT	2	6	669211	669216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581785
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12547	NC_015865	ATT	2	6	669317	669322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581785
12548	NC_015865	CGT	2	6	669330	669335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581785
12549	NC_015865	CGA	2	6	669499	669504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581786
12550	NC_015865	TTG	2	6	669603	669608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581786
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12552	NC_015865	TAT	2	6	669677	669682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581786
12553	NC_015865	GGCC	2	8	669724	669731	0 %	0 %	50 %	50 %	341581786
12554	NC_015865	CTC	2	6	669803	669808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581786
12555	NC_015865	CTC	2	6	669831	669836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581786
12556	NC_015865	GCC	2	6	669841	669846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581786
12557	NC_015865	GC	3	6	669862	669867	0 %	0 %	50 %	50 %	341581786
12558	NC_015865	TCC	2	6	669873	669878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581786
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12562	NC_015865	CTCC	2	8	670249	670256	0 %	25 %	0 %	75 %	341581787
12563	NC_015865	GCC	2	6	670258	670263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581787
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12569	NC_015865	CTC	2	6	670705	670710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581787
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12581	NC_015865	GAAG	2	8	671223	671230	50 %	0 %	50 %	0 %	341581787
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12602	NC_015865	GTC	2	6	672565	672570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581789
12603	NC_015865	CGGCG	2	10	672721	672730	0 %	0 %	60 %	40 %	341581789
12604	NC_015865	CGT	2	6	672738	672743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581789
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12606	NC_015865	GCCT	2	8	672845	672852	0 %	25 %	25 %	50 %	341581789
12607	NC_015865	GC	3	6	672902	672907	0 %	0 %	50 %	50 %	341581789
12608	NC_015865	GGAC	2	8	672930	672937	25 %	0 %	50 %	25 %	341581789
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12614	NC_015865	GGA	2	6	673160	673165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581789
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12618	NC_015865	GTC	2	6	673297	673302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581789
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12977	NC_015865	TAA	2	6	692912	692917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581810
12978	NC_015865	ACC	2	6	692957	692962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581810
12979	NC_015865	TGC	2	6	692969	692974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581810
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12981	NC_015865	TCT	2	6	693134	693139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581810
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