MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_015865	GA	3	6	615591	615596	50 %	0 %	50 %	0 %	341581728
11502	NC_015865	TCG	2	6	615612	615617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581728
11503	NC_015865	GAG	3	9	615623	615631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11504	NC_015865	GAA	2	6	615637	615642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
11505	NC_015865	GC	3	6	615664	615669	0 %	0 %	50 %	50 %	341581728
11506	NC_015865	GAGG	2	8	615670	615677	25 %	0 %	75 %	0 %	341581728
11507	NC_015865	GAG	2	6	615695	615700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11508	NC_015865	AGG	2	6	615704	615709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11509	NC_015865	ACG	2	6	615915	615920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
11510	NC_015865	CGA	2	6	615925	615930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581728
11511	NC_015865	GAG	2	6	615938	615943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11512	NC_015865	GCC	2	6	615974	615979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581728
11513	NC_015865	GTG	2	6	615989	615994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581728
11514	NC_015865	AAG	2	6	616010	616015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
11515	NC_015865	G	6	6	616053	616058	0 %	0 %	100 %	0 %	341581728
11516	NC_015865	AGG	2	6	616092	616097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11517	NC_015865	GAG	2	6	616103	616108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11518	NC_015865	GCC	2	6	616145	616150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581728
11519	NC_015865	GAG	2	6	616160	616165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11520	NC_015865	CTC	2	6	616178	616183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581728
11521	NC_015865	ATA	2	6	616205	616210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581728
11522	NC_015865	TCA	2	6	616239	616244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581728
11523	NC_015865	GGGCA	2	10	616279	616288	20 %	0 %	60 %	20 %	341581728
11524	NC_015865	CGGA	2	8	616311	616318	25 %	0 %	50 %	25 %	341581728
11525	NC_015865	GCTC	2	8	616329	616336	0 %	25 %	25 %	50 %	341581728
11526	NC_015865	GAA	2	6	616342	616347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581728
11527	NC_015865	GAGCT	2	10	616355	616364	20 %	20 %	40 %	20 %	341581728
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11529	NC_015865	CTA	2	6	616436	616441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581729
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11532	NC_015865	AGC	2	6	616664	616669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581729
11533	NC_015865	AGG	3	9	616690	616698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581729
11534	NC_015865	GGA	2	6	616794	616799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581729
11535	NC_015865	ACG	2	6	616831	616836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581729
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11537	NC_015865	TGC	3	9	616870	616878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581729
11538	NC_015865	AGG	2	6	616902	616907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581729
11539	NC_015865	CAT	2	6	616999	617004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581730
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11541	NC_015865	CG	4	8	617038	617045	0 %	0 %	50 %	50 %	341581730
11542	NC_015865	TC	3	6	617059	617064	0 %	50 %	0 %	50 %	341581730
11543	NC_015865	CTGA	2	8	617123	617130	25 %	25 %	25 %	25 %	341581730
11544	NC_015865	CTG	2	6	617144	617149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581730
11545	NC_015865	GTC	2	6	617152	617157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581730
11546	NC_015865	TCTA	2	8	617229	617236	25 %	50 %	0 %	25 %	341581730
11547	NC_015865	CCCG	2	8	617274	617281	0 %	0 %	25 %	75 %	341581730
11548	NC_015865	AGGA	2	8	617313	617320	50 %	0 %	50 %	0 %	341581730
11549	NC_015865	CTC	2	6	617330	617335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581730
11550	NC_015865	CTG	2	6	617387	617392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581730
11551	NC_015865	GGCCA	2	10	617459	617468	20 %	0 %	40 %	40 %	341581730
11552	NC_015865	TCA	3	9	617583	617591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581730
11553	NC_015865	AAG	2	6	617609	617614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581730
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11555	NC_015865	GCC	2	6	617669	617674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581731
11556	NC_015865	TAT	2	6	617710	617715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581731
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11560	NC_015865	TCC	2	6	617809	617814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581731
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11565	NC_015865	CG	3	6	618081	618086	0 %	0 %	50 %	50 %	341581731
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11569	NC_015865	CTC	2	6	618205	618210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581731
11570	NC_015865	CTCG	2	8	618229	618236	0 %	25 %	25 %	50 %	341581731
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11602	NC_015865	G	6	6	620533	620538	0 %	0 %	100 %	0 %	341581733
11603	NC_015865	CAA	2	6	620587	620592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581733
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11612	NC_015865	AGGA	2	8	621208	621215	50 %	0 %	50 %	0 %	341581734
11613	NC_015865	AGGA	2	8	621232	621239	50 %	0 %	50 %	0 %	341581734
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11621	NC_015865	GGAGC	2	10	621445	621454	20 %	0 %	60 %	20 %	341581734
11622	NC_015865	G	6	6	621462	621467	0 %	0 %	100 %	0 %	341581734
11623	NC_015865	GAAG	2	8	621477	621484	50 %	0 %	50 %	0 %	341581734
11624	NC_015865	GGA	2	6	621572	621577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581734
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11977	NC_015865	TCC	2	6	639233	639238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581754
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11979	NC_015865	CACC	2	8	639312	639319	25 %	0 %	0 %	75 %	341581754
11980	NC_015865	TCCTG	2	10	639366	639375	0 %	40 %	20 %	40 %	341581754
11981	NC_015865	CTC	2	6	639451	639456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581754
11982	NC_015865	GAA	2	6	639480	639485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581754
11983	NC_015865	T	6	6	639497	639502	0 %	100 %	0 %	0 %	341581754
11984	NC_015865	TTC	2	6	639509	639514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581754
11985	NC_015865	TTC	2	6	639522	639527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581754
11986	NC_015865	CTA	2	6	639676	639681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581755
11987	NC_015865	GGAGA	2	10	639738	639747	40 %	0 %	60 %	0 %	341581755
11988	NC_015865	GAG	2	6	639928	639933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581755
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11990	NC_015865	CAGC	2	8	639956	639963	25 %	0 %	25 %	50 %	341581755
11991	NC_015865	TCT	2	6	639988	639993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581755
11992	NC_015865	AAC	2	6	640034	640039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581755
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11994	NC_015865	GGAAG	2	10	640222	640231	40 %	0 %	60 %	0 %	341581756
11995	NC_015865	CGA	2	6	640235	640240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581756
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11997	NC_015865	CGA	2	6	640289	640294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581756
11998	NC_015865	GTC	2	6	640296	640301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581756
11999	NC_015865	AGC	2	6	640383	640388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581756
12000	NC_015865	AGA	2	6	640426	640431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581756

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