MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015865	CCA	2	6	589087	589092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581700
11002	NC_015865	ATC	2	6	589113	589118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581700
11003	NC_015865	CATGGA	2	12	589169	589180	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581700
11004	NC_015865	GCG	2	6	589213	589218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581700
11005	NC_015865	CGA	2	6	589223	589228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581700
11006	NC_015865	AAGG	2	8	589245	589252	50 %	0 %	50 %	0 %	341581700
11007	NC_015865	TCG	2	6	589436	589441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581701
11008	NC_015865	GGC	2	6	589452	589457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581701
11009	NC_015865	ACG	2	6	589489	589494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581701
11010	NC_015865	TCA	2	6	589529	589534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581701
11011	NC_015865	AGA	2	6	589643	589648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581701
11012	NC_015865	CGAC	2	8	589649	589656	25 %	0 %	25 %	50 %	341581701
11013	NC_015865	CTC	2	6	589714	589719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581701
11014	NC_015865	CGT	2	6	589776	589781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581701
11015	NC_015865	AGG	2	6	589849	589854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581701
11016	NC_015865	GAGG	2	8	589905	589912	25 %	0 %	75 %	0 %	341581701
11017	NC_015865	TCG	2	6	589979	589984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581701
11018	NC_015865	CCCT	2	8	589997	590004	0 %	25 %	0 %	75 %	341581701
11019	NC_015865	GAGC	2	8	590172	590179	25 %	0 %	50 %	25 %	341581701
11020	NC_015865	CGG	2	6	590201	590206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581701
11021	NC_015865	GCT	2	6	590211	590216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581701
11022	NC_015865	CTT	2	6	590341	590346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581702
11023	NC_015865	ACG	2	6	590414	590419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581702
11024	NC_015865	TTG	2	6	590429	590434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581702
11025	NC_015865	AACGAG	2	12	590503	590514	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341581702
11026	NC_015865	CGA	2	6	590572	590577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581702
11027	NC_015865	GAC	2	6	590584	590589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581702
11028	NC_015865	GCC	2	6	590617	590622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581702
11029	NC_015865	GCC	2	6	590711	590716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581702
11030	NC_015865	TTC	2	6	590778	590783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581702
11031	NC_015865	GAA	2	6	590899	590904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581702
11032	NC_015865	ATT	2	6	590927	590932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581702
11033	NC_015865	GA	3	6	591276	591281	50 %	0 %	50 %	0 %	341581703
11034	NC_015865	CACT	2	8	591285	591292	25 %	25 %	0 %	50 %	341581703
11035	NC_015865	CCT	2	6	591353	591358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581703
11036	NC_015865	GGT	2	6	591398	591403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581703
11037	NC_015865	TCA	2	6	591436	591441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581703
11038	NC_015865	GCC	2	6	591470	591475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581703
11039	NC_015865	CGG	2	6	591530	591535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581703
11040	NC_015865	GGA	2	6	591548	591553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581703
11041	NC_015865	TGA	2	6	591581	591586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581703
11042	NC_015865	TGA	2	6	591610	591615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581703
11043	NC_015865	GAC	2	6	591657	591662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581703
11044	NC_015865	TGGT	2	8	591667	591674	0 %	50 %	50 %	0 %	341581703
11045	NC_015865	CTG	2	6	591690	591695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581703
11046	NC_015865	GCT	2	6	591704	591709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581703
11047	NC_015865	CTG	2	6	591714	591719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581703
11048	NC_015865	GGGT	2	8	591721	591728	0 %	25 %	75 %	0 %	341581703
11049	NC_015865	CAT	2	6	591805	591810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581704
11050	NC_015865	GCT	2	6	591844	591849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581704
11051	NC_015865	CAC	2	6	591931	591936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581704
11052	NC_015865	GGT	2	6	591946	591951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581704
11053	NC_015865	ATA	2	6	591977	591982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581704
11054	NC_015865	AAG	2	6	592028	592033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581704
11055	NC_015865	GCG	2	6	592143	592148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581704
11056	NC_015865	TGA	2	6	592188	592193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581704
11057	NC_015865	GAT	2	6	592253	592258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581704
11058	NC_015865	CTT	3	9	592333	592341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581704
11059	NC_015865	TGG	2	6	592358	592363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581704
11060	NC_015865	TCG	2	6	592368	592373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581704
11061	NC_015865	ATT	2	6	592374	592379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581704
11062	NC_015865	ATG	2	6	592502	592507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581704
11063	NC_015865	CAT	2	6	592543	592548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581704
11064	NC_015865	GGA	2	6	592549	592554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581704
11065	NC_015865	TTC	3	9	592589	592597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581704
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11068	NC_015865	CCG	2	6	592671	592676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581704
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11071	NC_015865	TGG	2	6	592836	592841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581704
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11082	NC_015865	GTC	2	6	593263	593268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581705
11083	NC_015865	CCG	2	6	593291	593296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581705
11084	NC_015865	GAG	2	6	593330	593335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581705
11085	NC_015865	AGCAT	2	10	593339	593348	40 %	20 %	20 %	20 %	341581705
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11089	NC_015865	GGC	2	6	593695	593700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581706
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11100	NC_015865	GCC	2	6	594211	594216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581706
11101	NC_015865	CA	3	6	594289	594294	50 %	0 %	0 %	50 %	341581706
11102	NC_015865	TTCT	2	8	594313	594320	0 %	75 %	0 %	25 %	341581706
11103	NC_015865	CCT	2	6	594339	594344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581706
11104	NC_015865	GGC	2	6	594345	594350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581706
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11106	NC_015865	GTT	2	6	594376	594381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581706
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11108	NC_015865	GTCAG	2	10	594591	594600	20 %	20 %	40 %	20 %	341581706
11109	NC_015865	GCG	2	6	594602	594607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581706
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11119	NC_015865	CTA	2	6	595305	595310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581706
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11121	NC_015865	GGA	2	6	595527	595532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581707
11122	NC_015865	GA	3	6	595543	595548	50 %	0 %	50 %	0 %	341581707
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11227	NC_015865	GTC	2	6	601856	601861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581713
11228	NC_015865	CCTACA	2	12	601896	601907	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	341581713
11229	NC_015865	GCTC	2	8	601951	601958	0 %	25 %	25 %	50 %	341581713
11230	NC_015865	AGG	2	6	601962	601967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581713
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11232	NC_015865	AGCG	2	8	602092	602099	25 %	0 %	50 %	25 %	341581713
11233	NC_015865	AGG	2	6	602120	602125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581713
11234	NC_015865	GAA	2	6	602140	602145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581713
11235	NC_015865	ATC	2	6	602180	602185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581713
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11237	NC_015865	GGT	2	6	602233	602238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581713
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11240	NC_015865	C	6	6	602308	602313	0 %	0 %	0 %	100 %	341581713
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11478	NC_015865	GAG	2	6	614738	614743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11479	NC_015865	GAG	2	6	614762	614767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581728
11480	NC_015865	CCT	2	6	614797	614802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581728
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