MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_015865	TCG	2	6	561548	561553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581666
10502	NC_015865	TCC	2	6	561590	561595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581666
10503	NC_015865	CT	3	6	561609	561614	0 %	50 %	0 %	50 %	341581666
10504	NC_015865	TCA	2	6	561692	561697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581667
10505	NC_015865	TCCC	2	8	561730	561737	0 %	25 %	0 %	75 %	341581667
10506	NC_015865	GTA	2	6	561825	561830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581667
10507	NC_015865	CGT	2	6	561851	561856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
10508	NC_015865	TCC	2	6	561883	561888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
10509	NC_015865	TCG	2	6	561919	561924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
10510	NC_015865	CTC	2	6	562017	562022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
10511	NC_015865	GTCAT	2	10	562117	562126	20 %	40 %	20 %	20 %	341581667
10512	NC_015865	CTC	2	6	562134	562139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581667
10513	NC_015865	TCG	2	6	562141	562146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581667
10514	NC_015865	TAT	2	6	562155	562160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581667
10515	NC_015865	ACT	2	6	562790	562795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581668
10516	NC_015865	GGTT	2	8	562798	562805	0 %	50 %	50 %	0 %	341581668
10517	NC_015865	GCC	2	6	562856	562861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581668
10518	NC_015865	GAAGCA	2	12	562876	562887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	341581668
10519	NC_015865	GGAA	2	8	562904	562911	50 %	0 %	50 %	0 %	341581668
10520	NC_015865	AGG	2	6	562919	562924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581668
10521	NC_015865	GCG	2	6	562956	562961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581668
10522	NC_015865	CGG	2	6	562972	562977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581668
10523	NC_015865	AGG	2	6	563112	563117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581669
10524	NC_015865	GCA	2	6	563166	563171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581669
10525	NC_015865	ATG	2	6	563277	563282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581670
10526	NC_015865	GAG	2	6	563309	563314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
10527	NC_015865	GAG	2	6	563318	563323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
10528	NC_015865	AGA	2	6	563380	563385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581670
10529	NC_015865	GAG	2	6	563583	563588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
10530	NC_015865	TTG	2	6	563596	563601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581670
10531	NC_015865	ACC	2	6	563604	563609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581670
10532	NC_015865	CGG	2	6	563666	563671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581670
10533	NC_015865	GCTC	2	8	563695	563702	0 %	25 %	25 %	50 %	341581670
10534	NC_015865	ACA	2	6	563722	563727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581670
10535	NC_015865	GGA	2	6	563846	563851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581670
10536	NC_015865	GAG	2	6	563930	563935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581671
10537	NC_015865	GGA	2	6	563991	563996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581671
10538	NC_015865	TCC	2	6	564009	564014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581671
10539	NC_015865	TAA	2	6	564030	564035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581671
10540	NC_015865	GGA	2	6	564310	564315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
10541	NC_015865	CCT	2	6	564330	564335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
10542	NC_015865	TCC	2	6	564368	564373	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
10543	NC_015865	AGG	2	6	564396	564401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
10544	NC_015865	CTC	2	6	564466	564471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581672
10545	NC_015865	GCG	2	6	564571	564576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581672
10546	NC_015865	GGA	2	6	564612	564617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581672
10547	NC_015865	ATT	2	6	564720	564725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581672
10548	NC_015865	CGC	2	6	564729	564734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581672
10549	NC_015865	TCG	2	6	564770	564775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581672
10550	NC_015865	CAA	2	6	564816	564821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581672
10551	NC_015865	ATA	2	6	564928	564933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581672
10552	NC_015865	G	6	6	564966	564971	0 %	0 %	100 %	0 %	341581672
10553	NC_015865	CAG	3	9	565130	565138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
10554	NC_015865	CAG	2	6	565154	565159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
10555	NC_015865	AAG	2	6	565193	565198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581673
10556	NC_015865	CAAGGC	2	12	565276	565287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581673
10557	NC_015865	GAG	2	6	565292	565297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581673
10558	NC_015865	GAA	2	6	565354	565359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581673
10559	NC_015865	CAC	2	6	565384	565389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581673
10560	NC_015865	GAG	2	6	565513	565518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581674
10561	NC_015865	CGA	2	6	565629	565634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581674
10562	NC_015865	GA	3	6	565696	565701	50 %	0 %	50 %	0 %	341581674
10563	NC_015865	GAG	2	6	565720	565725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581674
10564	NC_015865	GA	3	6	565741	565746	50 %	0 %	50 %	0 %	341581674
10565	NC_015865	GCT	2	6	565857	565862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581675
10566	NC_015865	ATA	2	6	565882	565887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581675
10567	NC_015865	GTG	2	6	565996	566001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581675
10568	NC_015865	GAG	2	6	566053	566058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581675
10569	NC_015865	GGGA	2	8	566108	566115	25 %	0 %	75 %	0 %	341581675
10570	NC_015865	CTG	2	6	566147	566152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581676
10571	NC_015865	GCC	2	6	566177	566182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581676
10572	NC_015865	GA	3	6	566195	566200	50 %	0 %	50 %	0 %	341581676
10573	NC_015865	CTC	2	6	566261	566266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581676
10574	NC_015865	CAG	2	6	566386	566391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581676
10575	NC_015865	GAA	3	9	566429	566437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581676
10576	NC_015865	GGA	2	6	566494	566499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581676
10577	NC_015865	ATGAA	2	10	566501	566510	60 %	20 %	20 %	0 %	341581676
10578	NC_015865	CTTC	2	8	566532	566539	0 %	50 %	0 %	50 %	341581677
10579	NC_015865	CCA	2	6	566574	566579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581677
10580	NC_015865	CTCGG	2	10	566599	566608	0 %	20 %	40 %	40 %	341581677
10581	NC_015865	AATC	2	8	566633	566640	50 %	25 %	0 %	25 %	341581677
10582	NC_015865	TCC	2	6	566680	566685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581677
10583	NC_015865	CCCGTT	2	12	566713	566724	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	341581677
10584	NC_015865	GA	3	6	566725	566730	50 %	0 %	50 %	0 %	341581677
10585	NC_015865	CG	3	6	566807	566812	0 %	0 %	50 %	50 %	341581677
10586	NC_015865	ACC	2	6	566834	566839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581677
10587	NC_015865	AT	3	6	566870	566875	50 %	50 %	0 %	0 %	341581677
10588	NC_015865	CT	3	6	566966	566971	0 %	50 %	0 %	50 %	341581677
10589	NC_015865	CGA	2	6	567102	567107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581677
10590	NC_015865	AGG	2	6	567175	567180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581677
10591	NC_015865	CAT	2	6	567183	567188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581677
10592	NC_015865	CGT	2	6	567261	567266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581677
10593	NC_015865	GAA	2	6	567276	567281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581677
10594	NC_015865	GCC	2	6	567400	567405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581677
10595	NC_015865	AGA	2	6	567419	567424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581677
10596	NC_015865	CGA	2	6	567429	567434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581677
10597	NC_015865	GAGG	2	8	567474	567481	25 %	0 %	75 %	0 %	341581677
10598	NC_015865	TTGA	2	8	567482	567489	25 %	50 %	25 %	0 %	341581677
10599	NC_015865	CGC	2	6	567516	567521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581678
10600	NC_015865	GCG	2	6	567639	567644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581678
10601	NC_015865	GGAA	2	8	567656	567663	50 %	0 %	50 %	0 %	341581678
10602	NC_015865	AGG	2	6	567675	567680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581678
10603	NC_015865	GCT	2	6	567697	567702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581678
10604	NC_015865	AAG	2	6	567800	567805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581678
10605	NC_015865	GAG	2	6	567813	567818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581678
10606	NC_015865	AAG	2	6	567825	567830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581678
10607	NC_015865	TTC	2	6	568239	568244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581679
10608	NC_015865	TCC	2	6	568367	568372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581679
10609	NC_015865	CTA	2	6	568399	568404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581679
10610	NC_015865	TGG	2	6	568419	568424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581679
10611	NC_015865	GGCT	2	8	568566	568573	0 %	25 %	50 %	25 %	341581679
10612	NC_015865	ACA	2	6	568578	568583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581679
10613	NC_015865	GAAG	2	8	568591	568598	50 %	0 %	50 %	0 %	341581679
10614	NC_015865	AG	3	6	568597	568602	50 %	0 %	50 %	0 %	341581679
10615	NC_015865	TAC	2	6	568640	568645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581679
10616	NC_015865	GTATG	2	10	568703	568712	20 %	40 %	40 %	0 %	341581679
10617	NC_015865	TATGTC	2	12	568718	568729	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	341581679
10618	NC_015865	GGA	2	6	568757	568762	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581679
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10620	NC_015865	TTA	2	6	568846	568851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581679
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10977	NC_015865	CTA	2	6	587733	587738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581699
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