MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015865	GCT	2	6	535522	535527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10002	NC_015865	ATA	2	6	535529	535534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581634
10003	NC_015865	TCG	2	6	535554	535559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10004	NC_015865	GCG	2	6	535665	535670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581634
10005	NC_015865	CCT	2	6	535717	535722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581634
10006	NC_015865	AGA	2	6	535794	535799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581634
10007	NC_015865	GCC	2	6	535838	535843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
10008	NC_015865	TCC	2	6	535887	535892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581634
10009	NC_015865	CGC	2	6	535894	535899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
10010	NC_015865	GCC	2	6	535922	535927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581634
10011	NC_015865	CGT	2	6	535948	535953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10012	NC_015865	AC	3	6	535981	535986	50 %	0 %	0 %	50 %	341581634
10013	NC_015865	TGC	2	6	536043	536048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581634
10014	NC_015865	GCT	2	6	536193	536198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
10015	NC_015865	ATC	2	6	536200	536205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581635
10016	NC_015865	AG	3	6	536263	536268	50 %	0 %	50 %	0 %	341581635
10017	NC_015865	CAT	2	6	536277	536282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581635
10018	NC_015865	TCG	2	6	536429	536434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
10019	NC_015865	TGA	2	6	536498	536503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581635
10020	NC_015865	CTT	2	6	536550	536555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581635
10021	NC_015865	ATG	2	6	536590	536595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581635
10022	NC_015865	AGG	2	6	536602	536607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
10023	NC_015865	CATC	2	8	536714	536721	25 %	25 %	0 %	50 %	341581635
10024	NC_015865	GACC	2	8	536865	536872	25 %	0 %	25 %	50 %	341581635
10025	NC_015865	CTT	2	6	536886	536891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581635
10026	NC_015865	GCG	2	6	536894	536899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
10027	NC_015865	TCC	2	6	536927	536932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581635
10028	NC_015865	CGC	2	6	536964	536969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581635
10029	NC_015865	ACC	2	6	536987	536992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581635
10030	NC_015865	CGT	2	6	537033	537038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
10031	NC_015865	AGG	2	6	537065	537070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
10032	NC_015865	CTC	2	6	537093	537098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581635
10033	NC_015865	ATA	2	6	537226	537231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581635
10034	NC_015865	GGC	2	6	537265	537270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
10035	NC_015865	CCG	2	6	537337	537342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581635
10036	NC_015865	CAA	2	6	537606	537611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581635
10037	NC_015865	CGG	2	6	537633	537638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581635
10038	NC_015865	ACT	2	6	537641	537646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581635
10039	NC_015865	GAG	2	6	537802	537807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
10040	NC_015865	GAA	2	6	537825	537830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581635
10041	NC_015865	GGA	2	6	537915	537920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581635
10042	NC_015865	CAGG	2	8	537936	537943	25 %	0 %	50 %	25 %	341581635
10043	NC_015865	TGC	2	6	537992	537997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581635
10044	NC_015865	G	6	6	538013	538018	0 %	0 %	100 %	0 %	341581635
10045	NC_015865	CTTCAT	2	12	538089	538100	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	341581636
10046	NC_015865	GA	3	6	538108	538113	50 %	0 %	50 %	0 %	341581636
10047	NC_015865	CTC	2	6	538183	538188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
10048	NC_015865	AAG	2	6	538192	538197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581636
10049	NC_015865	CTC	2	6	538267	538272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
10050	NC_015865	CCT	2	6	538335	538340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581636
10051	NC_015865	CGG	2	6	538397	538402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
10052	NC_015865	TGG	2	6	538430	538435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581636
10053	NC_015865	CAG	2	6	538519	538524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581636
10054	NC_015865	GCT	2	6	538554	538559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581636
10055	NC_015865	CAT	2	6	538620	538625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581636
10056	NC_015865	CGG	2	6	538634	538639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
10057	NC_015865	CGG	2	6	538668	538673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
10058	NC_015865	CGG	2	6	538752	538757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
10059	NC_015865	GCT	2	6	538776	538781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581636
10060	NC_015865	GGC	2	6	538854	538859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581636
10061	NC_015865	TTC	2	6	538864	538869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581636
10062	NC_015865	AAT	2	6	538893	538898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581636
10063	NC_015865	TG	3	6	538914	538919	0 %	50 %	50 %	0 %	341581636
10064	NC_015865	GAA	2	6	538942	538947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581637
10065	NC_015865	GAA	2	6	539014	539019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581637
10066	NC_015865	GCG	2	6	539052	539057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581637
10067	NC_015865	GCC	2	6	539068	539073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581637
10068	NC_015865	AAT	2	6	539110	539115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581637
10069	NC_015865	TCA	2	6	539151	539156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581637
10070	NC_015865	GTTAC	2	10	539160	539169	20 %	40 %	20 %	20 %	341581637
10071	NC_015865	GAT	2	6	539206	539211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581637
10072	NC_015865	GTG	2	6	539285	539290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581637
10073	NC_015865	AGC	2	6	539292	539297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581637
10074	NC_015865	AAT	2	6	539368	539373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581637
10075	NC_015865	AG	3	6	539392	539397	50 %	0 %	50 %	0 %	341581637
10076	NC_015865	TAC	2	6	539441	539446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581637
10077	NC_015865	GAA	2	6	539449	539454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581637
10078	NC_015865	AGG	2	6	539498	539503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581637
10079	NC_015865	TGGC	2	8	539504	539511	0 %	25 %	50 %	25 %	341581637
10080	NC_015865	GAG	2	6	539539	539544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
10081	NC_015865	GAG	2	6	539551	539556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
10082	NC_015865	AGG	2	6	539567	539572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
10083	NC_015865	AGG	2	6	539609	539614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
10084	NC_015865	CGAG	2	8	539732	539739	25 %	0 %	50 %	25 %	341581638
10085	NC_015865	CTC	2	6	539752	539757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581638
10086	NC_015865	CGT	2	6	539766	539771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581638
10087	NC_015865	AGG	2	6	539783	539788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581638
10088	NC_015865	GAGG	2	8	539922	539929	25 %	0 %	75 %	0 %	341581638
10089	NC_015865	TTC	2	6	539938	539943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581638
10090	NC_015865	ATA	2	6	539947	539952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581638
10091	NC_015865	AGGA	2	8	540019	540026	50 %	0 %	50 %	0 %	341581638
10092	NC_015865	ACG	2	6	540080	540085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581638
10093	NC_015865	TGAGG	2	10	540109	540118	20 %	20 %	60 %	0 %	341581638
10094	NC_015865	TTC	2	6	540215	540220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581639
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10097	NC_015865	TCC	2	6	540309	540314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581639
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10100	NC_015865	GAG	2	6	540608	540613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
10101	NC_015865	GGC	2	6	540620	540625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581639
10102	NC_015865	GGA	2	6	540653	540658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
10103	NC_015865	AGG	2	6	540662	540667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
10104	NC_015865	CGA	2	6	540742	540747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581639
10105	NC_015865	ACG	2	6	540867	540872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581639
10106	NC_015865	AGGA	2	8	540875	540882	50 %	0 %	50 %	0 %	341581639
10107	NC_015865	AGG	2	6	540933	540938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
10108	NC_015865	AGG	2	6	540965	540970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581639
10109	NC_015865	AGC	2	6	541002	541007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581639
10110	NC_015865	GCC	2	6	541081	541086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581639
10111	NC_015865	CGT	2	6	541141	541146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581639
10112	NC_015865	GAGCCA	2	12	541192	541203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581639
10113	NC_015865	CCG	2	6	541286	541291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581639
10114	NC_015865	TGA	2	6	541304	541309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581639
10115	NC_015865	GTC	2	6	541342	541347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581640
10116	NC_015865	GAG	2	6	541351	541356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581640
10117	NC_015865	AAG	2	6	541369	541374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581640
10118	NC_015865	AAG	2	6	541414	541419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581640
10119	NC_015865	GC	3	6	541658	541663	0 %	0 %	50 %	50 %	341581640
10120	NC_015865	ACT	2	6	541679	541684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581640
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10133	NC_015865	GAAG	2	8	541977	541984	50 %	0 %	50 %	0 %	341581640
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10351	NC_015865	GAG	2	6	553168	553173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581652
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10476	NC_015865	CTC	2	6	559717	559722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581662
10477	NC_015865	TTC	2	6	559953	559958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581663
10478	NC_015865	ATG	2	6	559965	559970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581663
10479	NC_015865	CAG	2	6	560060	560065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581663
10480	NC_015865	ACG	2	6	560109	560114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581663
10481	NC_015865	CTTC	2	8	560140	560147	0 %	50 %	0 %	50 %	341581663
10482	NC_015865	GTC	2	6	560192	560197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581663
10483	NC_015865	CCTT	2	8	560257	560264	0 %	50 %	0 %	50 %	341581663
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10499	NC_015865	CCGT	2	8	561509	561516	0 %	25 %	25 %	50 %	341581666
10500	NC_015865	ATG	2	6	561530	561535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581666

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