MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_015865	GCC	2	6	428696	428701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581508
8002	NC_015865	CTC	2	6	428724	428729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581508
8003	NC_015865	CCT	2	6	428789	428794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581508
8004	NC_015865	TCG	2	6	428830	428835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581508
8005	NC_015865	GC	3	6	428936	428941	0 %	0 %	50 %	50 %	341581508
8006	NC_015865	CAA	2	6	429010	429015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581508
8007	NC_015865	CTC	2	6	429063	429068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581508
8008	NC_015865	GCG	2	6	429076	429081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581508
8009	NC_015865	TGA	2	6	429163	429168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581508
8010	NC_015865	CGAG	2	8	429255	429262	25 %	0 %	50 %	25 %	341581509
8011	NC_015865	GCT	2	6	429318	429323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581509
8012	NC_015865	GAG	3	9	429520	429528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581509
8013	NC_015865	GGA	2	6	429553	429558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581509
8014	NC_015865	GAGC	2	8	429586	429593	25 %	0 %	50 %	25 %	341581509
8015	NC_015865	ATG	2	6	429603	429608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581509
8016	NC_015865	ACG	2	6	429678	429683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581509
8017	NC_015865	TCAA	2	8	429698	429705	50 %	25 %	0 %	25 %	341581509
8018	NC_015865	ACCT	2	8	429776	429783	25 %	25 %	0 %	50 %	341581509
8019	NC_015865	CTG	2	6	429785	429790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581509
8020	NC_015865	ATA	2	6	429842	429847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581509
8021	NC_015865	GAA	2	6	429928	429933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581509
8022	NC_015865	GAA	2	6	429985	429990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581509
8023	NC_015865	AAG	2	6	430097	430102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581509
8024	NC_015865	CCT	2	6	430186	430191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581509
8025	NC_015865	GCT	2	6	430201	430206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581509
8026	NC_015865	GTG	2	6	430210	430215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581509
8027	NC_015865	CGT	2	6	430435	430440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581510
8028	NC_015865	GCG	2	6	430476	430481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581510
8029	NC_015865	GAG	2	6	430523	430528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581510
8030	NC_015865	GGT	2	6	430632	430637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581510
8031	NC_015865	ATT	2	6	430645	430650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581511
8032	NC_015865	ACT	2	6	430706	430711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581511
8033	NC_015865	CGG	2	6	430836	430841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581511
8034	NC_015865	CTA	2	6	430842	430847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581511
8035	NC_015865	GGA	2	6	430857	430862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8036	NC_015865	TGA	2	6	430976	430981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581511
8037	NC_015865	CTT	2	6	431061	431066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581511
8038	NC_015865	CCAGG	2	10	431067	431076	20 %	0 %	40 %	40 %	341581511
8039	NC_015865	CGA	2	6	431117	431122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581511
8040	NC_015865	GAG	3	9	431290	431298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8041	NC_015865	CCG	2	6	431338	431343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581511
8042	NC_015865	GAG	2	6	431448	431453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8043	NC_015865	GAA	2	6	431472	431477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581511
8044	NC_015865	GAG	2	6	431500	431505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8045	NC_015865	GAC	2	6	431515	431520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581511
8046	NC_015865	TCG	2	6	431531	431536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581511
8047	NC_015865	GAG	2	6	431590	431595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8048	NC_015865	GGCC	2	8	431604	431611	0 %	0 %	50 %	50 %	341581511
8049	NC_015865	GA	3	6	431647	431652	50 %	0 %	50 %	0 %	341581511
8050	NC_015865	GC	3	6	431670	431675	0 %	0 %	50 %	50 %	341581511
8051	NC_015865	TCG	2	6	431687	431692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581511
8052	NC_015865	GAT	2	6	431712	431717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581511
8053	NC_015865	ACG	3	9	431741	431749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581511
8054	NC_015865	TCC	2	6	431750	431755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581511
8055	NC_015865	CGG	2	6	431775	431780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581511
8056	NC_015865	GAG	2	6	431797	431802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581511
8057	NC_015865	TCC	2	6	431804	431809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581511
8058	NC_015865	GAA	2	6	431837	431842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581512
8059	NC_015865	AGG	2	6	431881	431886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581512
8060	NC_015865	GCG	3	9	431914	431922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581512
8061	NC_015865	GTC	2	6	431988	431993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8062	NC_015865	GCT	2	6	432004	432009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8063	NC_015865	AC	3	6	432043	432048	50 %	0 %	0 %	50 %	341581512
8064	NC_015865	AAG	2	6	432111	432116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581512
8065	NC_015865	GTC	3	9	432117	432125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8066	NC_015865	CGGTGA	2	12	432131	432142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341581512
8067	NC_015865	GGC	2	6	432156	432161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581512
8068	NC_015865	CGC	2	6	432176	432181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581512
8069	NC_015865	GAG	2	6	432182	432187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581512
8070	NC_015865	CAA	2	6	432215	432220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581512
8071	NC_015865	CGG	2	6	432239	432244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581512
8072	NC_015865	ACG	2	6	432258	432263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8073	NC_015865	ACC	2	6	432282	432287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581512
8074	NC_015865	GCC	3	9	432336	432344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581512
8075	NC_015865	GAGC	2	8	432346	432353	25 %	0 %	50 %	25 %	341581512
8076	NC_015865	ACC	2	6	432369	432374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581512
8077	NC_015865	AAAG	2	8	432404	432411	75 %	0 %	25 %	0 %	341581512
8078	NC_015865	TCG	2	6	432436	432441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8079	NC_015865	GGT	2	6	432511	432516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581512
8080	NC_015865	CAG	2	6	432539	432544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581512
8081	NC_015865	GGA	2	6	432563	432568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581512
8082	NC_015865	AG	4	8	432606	432613	50 %	0 %	50 %	0 %	341581512
8083	NC_015865	CAC	2	6	432623	432628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581512
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8085	NC_015865	AGGTT	2	10	432696	432705	20 %	40 %	40 %	0 %	341581513
8086	NC_015865	AGG	2	6	432715	432720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581513
8087	NC_015865	GCC	3	9	432758	432766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581513
8088	NC_015865	CGT	2	6	432781	432786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581513
8089	NC_015865	GGC	2	6	432818	432823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581513
8090	NC_015865	ATA	2	6	432842	432847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581513
8091	NC_015865	ACG	2	6	432864	432869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581513
8092	NC_015865	TCG	2	6	432894	432899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581513
8093	NC_015865	GAGG	2	8	432940	432947	25 %	0 %	75 %	0 %	341581513
8094	NC_015865	GAG	2	6	433025	433030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581513
8095	NC_015865	GAA	2	6	433099	433104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581513
8096	NC_015865	GAG	2	6	433115	433120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581513
8097	NC_015865	AGG	3	9	433127	433135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581513
8098	NC_015865	GAG	2	6	433187	433192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581513
8099	NC_015865	CGGT	2	8	433217	433224	0 %	25 %	50 %	25 %	341581514
8100	NC_015865	TGA	2	6	433245	433250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581514
8101	NC_015865	GCG	2	6	433264	433269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581514
8102	NC_015865	CGAG	2	8	433316	433323	25 %	0 %	50 %	25 %	341581514
8103	NC_015865	TGG	2	6	433355	433360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581514
8104	NC_015865	GGC	2	6	433401	433406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581514
8105	NC_015865	ATA	2	6	433408	433413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581514
8106	NC_015865	TGTCGT	2	12	433515	433526	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	341581514
8107	NC_015865	GCG	2	6	433538	433543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581514
8108	NC_015865	AGG	2	6	433652	433657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581514
8109	NC_015865	GGT	2	6	433710	433715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581514
8110	NC_015865	TCT	2	6	433716	433721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581514
8111	NC_015865	GAG	3	9	433813	433821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581514
8112	NC_015865	CCG	2	6	433861	433866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581514
8113	NC_015865	ACG	2	6	433916	433921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581514
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8115	NC_015865	GGA	2	6	434004	434009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581514
8116	NC_015865	ACG	2	6	434021	434026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581514
8117	NC_015865	CGA	2	6	434037	434042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581514
8118	NC_015865	CGG	2	6	434084	434089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581514
8119	NC_015865	CTTCGA	2	12	434160	434171	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	341581514
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8121	NC_015865	ACC	2	6	434240	434245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581514
8122	NC_015865	GGC	2	6	434299	434304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581514
8123	NC_015865	GTG	2	6	434338	434343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581514
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8125	NC_015865	CG	3	6	434461	434466	0 %	0 %	50 %	50 %	341581515
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8238	NC_015865	CTC	2	6	439634	439639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581521
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8242	NC_015865	GAA	2	6	439934	439939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581522
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8486	NC_015865	AGG	2	6	453597	453602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581538
8487	NC_015865	AGC	2	6	453699	453704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581538
8488	NC_015865	AGG	2	6	453730	453735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581538
8489	NC_015865	GCTCCA	2	12	453890	453901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581539
8490	NC_015865	CTT	2	6	453915	453920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581539
8491	NC_015865	CAT	2	6	453926	453931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581539
8492	NC_015865	GTA	2	6	453945	453950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581539
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8494	NC_015865	CTC	2	6	454006	454011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581539
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