MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015865	TCT	2	6	351570	351575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581427
6502	NC_015865	CGA	2	6	351650	351655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581427
6503	NC_015865	TCG	2	6	351809	351814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581427
6504	NC_015865	GAG	2	6	351826	351831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581427
6505	NC_015865	GA	3	6	351895	351900	50 %	0 %	50 %	0 %	341581428
6506	NC_015865	GTT	2	6	351911	351916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581428
6507	NC_015865	GAG	2	6	351917	351922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581428
6508	NC_015865	AGG	2	6	352020	352025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581428
6509	NC_015865	CTT	2	6	352051	352056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581428
6510	NC_015865	GCTGGA	2	12	352062	352073	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	341581428
6511	NC_015865	A	6	6	352106	352111	100 %	0 %	0 %	0 %	341581428
6512	NC_015865	GGC	2	6	352162	352167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581428
6513	NC_015865	GAA	2	6	352170	352175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581428
6514	NC_015865	AAG	2	6	352199	352204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581428
6515	NC_015865	CAA	2	6	352237	352242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581428
6516	NC_015865	ATA	2	6	352286	352291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581428
6517	NC_015865	AGG	2	6	352389	352394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581428
6518	NC_015865	CG	3	6	352447	352452	0 %	0 %	50 %	50 %	341581428
6519	NC_015865	GCG	3	9	352450	352458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581428
6520	NC_015865	GGAG	2	8	352464	352471	25 %	0 %	75 %	0 %	341581428
6521	NC_015865	GAG	2	6	352499	352504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581428
6522	NC_015865	GTC	2	6	352505	352510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581428
6523	NC_015865	CGA	2	6	352630	352635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581428
6524	NC_015865	G	6	6	352676	352681	0 %	0 %	100 %	0 %	341581428
6525	NC_015865	ACG	2	6	352718	352723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581429
6526	NC_015865	GGA	2	6	352758	352763	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581429
6527	NC_015865	GGT	2	6	352770	352775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581429
6528	NC_015865	AGGG	2	8	352786	352793	25 %	0 %	75 %	0 %	341581429
6529	NC_015865	TTC	2	6	352885	352890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581429
6530	NC_015865	TGG	2	6	352946	352951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581429
6531	NC_015865	TCC	3	9	352958	352966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581429
6532	NC_015865	C	6	6	352965	352970	0 %	0 %	0 %	100 %	341581429
6533	NC_015865	ACC	2	6	353098	353103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581429
6534	NC_015865	GAA	2	6	353118	353123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581429
6535	NC_015865	CTG	2	6	353128	353133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581429
6536	NC_015865	GGTC	2	8	353181	353188	0 %	25 %	50 %	25 %	341581429
6537	NC_015865	GGA	2	6	353220	353225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581429
6538	NC_015865	CTC	2	6	353239	353244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581429
6539	NC_015865	CTC	2	6	353263	353268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581429
6540	NC_015865	ATT	2	6	353563	353568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581429
6541	NC_015865	CCG	2	6	353591	353596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581429
6542	NC_015865	AAG	2	6	353599	353604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581429
6543	NC_015865	GAA	2	6	353626	353631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581429
6544	NC_015865	ACA	2	6	353675	353680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581429
6545	NC_015865	ACCA	2	8	353707	353714	50 %	0 %	0 %	50 %	341581430
6546	NC_015865	GA	3	6	353721	353726	50 %	0 %	50 %	0 %	341581430
6547	NC_015865	GAT	2	6	353777	353782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581430
6548	NC_015865	AG	3	6	353866	353871	50 %	0 %	50 %	0 %	341581430
6549	NC_015865	AAG	2	6	353894	353899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581430
6550	NC_015865	TAC	3	9	353996	354004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581430
6551	NC_015865	AGGG	2	8	354011	354018	25 %	0 %	75 %	0 %	341581430
6552	NC_015865	TC	3	6	354091	354096	0 %	50 %	0 %	50 %	341581431
6553	NC_015865	CAG	2	6	354127	354132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581431
6554	NC_015865	ACG	2	6	354194	354199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581431
6555	NC_015865	TGA	2	6	354255	354260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581431
6556	NC_015865	TCT	2	6	354270	354275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581431
6557	NC_015865	CCAT	2	8	354308	354315	25 %	25 %	0 %	50 %	341581431
6558	NC_015865	AGG	2	6	354329	354334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581431
6559	NC_015865	CAG	2	6	354407	354412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6560	NC_015865	CGC	2	6	354413	354418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581432
6561	NC_015865	CCTC	2	8	354447	354454	0 %	25 %	0 %	75 %	341581432
6562	NC_015865	ACC	2	6	354474	354479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581432
6563	NC_015865	CGC	2	6	354481	354486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581432
6564	NC_015865	CTC	2	6	354512	354517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6565	NC_015865	TCT	2	6	354520	354525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581432
6566	NC_015865	TCG	2	6	354549	354554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6567	NC_015865	CCT	2	6	354592	354597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6568	NC_015865	GTT	2	6	354629	354634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581432
6569	NC_015865	CGA	2	6	354661	354666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6570	NC_015865	TGA	2	6	354724	354729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581432
6571	NC_015865	CTT	2	6	354779	354784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581432
6572	NC_015865	TCC	2	6	354825	354830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6573	NC_015865	CT	3	6	354861	354866	0 %	50 %	0 %	50 %	341581432
6574	NC_015865	TAT	2	6	354881	354886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581432
6575	NC_015865	CTC	2	6	354887	354892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6576	NC_015865	CGT	2	6	354907	354912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6577	NC_015865	GAA	2	6	354914	354919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581432
6578	NC_015865	CTT	2	6	354920	354925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581432
6579	NC_015865	CTC	2	6	354926	354931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6580	NC_015865	CCG	2	6	354960	354965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581432
6581	NC_015865	CGT	2	6	355033	355038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6582	NC_015865	GAC	2	6	355043	355048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6583	NC_015865	CCT	2	6	355084	355089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6584	NC_015865	CAC	2	6	355136	355141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581432
6585	NC_015865	CTT	2	6	355147	355152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581432
6586	NC_015865	CGT	2	6	355186	355191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6587	NC_015865	CTG	2	6	355194	355199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6588	NC_015865	TCT	2	6	355255	355260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581432
6589	NC_015865	GC	3	6	355320	355325	0 %	0 %	50 %	50 %	341581432
6590	NC_015865	ACA	2	6	355356	355361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581432
6591	NC_015865	GAT	2	6	355373	355378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581432
6592	NC_015865	GTC	2	6	355397	355402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581432
6593	NC_015865	CCT	2	6	355432	355437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581432
6594	NC_015865	TGG	2	6	355446	355451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581432
6595	NC_015865	CT	3	6	355462	355467	0 %	50 %	0 %	50 %	341581432
6596	NC_015865	TGA	2	6	355569	355574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581433
6597	NC_015865	CGC	2	6	355596	355601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581433
6598	NC_015865	GCCGTA	2	12	355741	355752	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581433
6599	NC_015865	TGA	2	6	355758	355763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581433
6600	NC_015865	CCTGG	2	10	355802	355811	0 %	20 %	40 %	40 %	341581433
6601	NC_015865	CGA	2	6	355884	355889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581433
6602	NC_015865	GCG	2	6	356000	356005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581433
6603	NC_015865	TAT	2	6	356020	356025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581433
6604	NC_015865	CGC	2	6	356080	356085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581433
6605	NC_015865	GCC	2	6	356126	356131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581433
6606	NC_015865	GGC	2	6	356158	356163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581433
6607	NC_015865	CAC	2	6	356212	356217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581433
6608	NC_015865	CTT	2	6	356305	356310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581433
6609	NC_015865	AGG	2	6	356319	356324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581433
6610	NC_015865	GAC	2	6	356440	356445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581433
6611	NC_015865	GCC	2	6	356452	356457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581433
6612	NC_015865	AGA	2	6	356484	356489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581433
6613	NC_015865	CTT	2	6	356542	356547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581433
6614	NC_015865	ACT	2	6	356810	356815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581434
6615	NC_015865	TCA	2	6	356834	356839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581434
6616	NC_015865	TGG	2	6	356882	356887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581434
6617	NC_015865	TAC	2	6	356908	356913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581434
6618	NC_015865	TCA	2	6	356993	356998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581434
6619	NC_015865	CGG	2	6	357024	357029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581434
6620	NC_015865	GAA	2	6	357045	357050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581434
6621	NC_015865	ACG	2	6	357062	357067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581434
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