MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015865	CGAC	2	8	296321	296328	25 %	0 %	25 %	50 %	341581369
5502	NC_015865	C	6	6	296414	296419	0 %	0 %	0 %	100 %	341581369
5503	NC_015865	CGG	2	6	296484	296489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581369
5504	NC_015865	GGAA	2	8	296510	296517	50 %	0 %	50 %	0 %	341581369
5505	NC_015865	AGG	2	6	296575	296580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581369
5506	NC_015865	TAC	3	9	296647	296655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581369
5507	NC_015865	GA	3	6	296716	296721	50 %	0 %	50 %	0 %	341581369
5508	NC_015865	ACC	2	6	296783	296788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581369
5509	NC_015865	ATG	2	6	296823	296828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581370
5510	NC_015865	TCC	2	6	296867	296872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581370
5511	NC_015865	CCAC	2	8	296888	296895	25 %	0 %	0 %	75 %	341581370
5512	NC_015865	ATT	2	6	296920	296925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581370
5513	NC_015865	CTC	2	6	296945	296950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581370
5514	NC_015865	CCAG	2	8	297053	297060	25 %	0 %	25 %	50 %	341581371
5515	NC_015865	CTTC	2	8	297077	297084	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
5516	NC_015865	CTT	2	6	297093	297098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
5517	NC_015865	CT	3	6	297183	297188	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
5518	NC_015865	CAA	2	6	297215	297220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	341581371
5519	NC_015865	CTTT	2	8	297228	297235	0 %	75 %	0 %	25 %	341581371
5520	NC_015865	TCC	2	6	297275	297280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
5521	NC_015865	CTC	2	6	297423	297428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
5522	NC_015865	TGAG	2	8	297431	297438	25 %	25 %	50 %	0 %	341581371
5523	NC_015865	GTA	2	6	297489	297494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581371
5524	NC_015865	ACT	2	6	297541	297546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581371
5525	NC_015865	CGT	2	6	297627	297632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581371
5526	NC_015865	TCC	2	6	297659	297664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
5527	NC_015865	CAG	2	6	297696	297701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581371
5528	NC_015865	TCG	2	6	297712	297717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581371
5529	NC_015865	GAA	2	6	297720	297725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581371
5530	NC_015865	TTC	2	6	297736	297741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
5531	NC_015865	CCTGA	2	10	297774	297783	20 %	20 %	20 %	40 %	341581371
5532	NC_015865	CGTC	2	8	297803	297810	0 %	25 %	25 %	50 %	341581371
5533	NC_015865	GAA	2	6	297852	297857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581371
5534	NC_015865	CT	3	6	298019	298024	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
5535	NC_015865	TCT	2	6	298048	298053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
5536	NC_015865	GGA	2	6	298106	298111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581371
5537	NC_015865	CT	3	6	298156	298161	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
5538	NC_015865	AGT	2	6	298205	298210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581371
5539	NC_015865	CTT	2	6	298267	298272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581371
5540	NC_015865	TC	3	6	298315	298320	0 %	50 %	0 %	50 %	341581371
5541	NC_015865	CTC	2	6	298332	298337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581371
5542	NC_015865	CT	3	6	298430	298435	0 %	50 %	0 %	50 %	341581372
5543	NC_015865	GCA	2	6	298446	298451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581372
5544	NC_015865	GGC	2	6	298484	298489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581372
5545	NC_015865	CG	3	6	298515	298520	0 %	0 %	50 %	50 %	341581372
5546	NC_015865	CTT	2	6	298540	298545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581372
5547	NC_015865	CCA	2	6	298604	298609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581372
5548	NC_015865	GAT	2	6	298723	298728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581372
5549	NC_015865	CTT	2	6	298768	298773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581372
5550	NC_015865	GCA	2	6	298787	298792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581372
5551	NC_015865	ACC	2	6	298862	298867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581372
5552	NC_015865	ACC	2	6	298877	298882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581372
5553	NC_015865	T	7	7	298911	298917	0 %	100 %	0 %	0 %	341581372
5554	NC_015865	GTC	2	6	298930	298935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581372
5555	NC_015865	CTC	2	6	299081	299086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581372
5556	NC_015865	CGG	2	6	299133	299138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581372
5557	NC_015865	CAG	2	6	299200	299205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581372
5558	NC_015865	CGC	2	6	299239	299244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581372
5559	NC_015865	TAT	2	6	299254	299259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	341581372
5560	NC_015865	CTTGAA	2	12	299272	299283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341581372
5561	NC_015865	CCT	2	6	299319	299324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581372
5562	NC_015865	GAA	2	6	299392	299397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581372
5563	NC_015865	GTGA	2	8	299422	299429	25 %	25 %	50 %	0 %	341581372
5564	NC_015865	AGG	2	6	299612	299617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581372
5565	NC_015865	GTG	2	6	299630	299635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581372
5566	NC_015865	GTC	2	6	299659	299664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581372
5567	NC_015865	CCG	2	6	299720	299725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581373
5568	NC_015865	AGT	2	6	299763	299768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581373
5569	NC_015865	TG	4	8	299775	299782	0 %	50 %	50 %	0 %	341581373
5570	NC_015865	CCA	2	6	299847	299852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581373
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5573	NC_015865	TCC	2	6	300049	300054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581373
5574	NC_015865	GAGG	2	8	300055	300062	25 %	0 %	75 %	0 %	341581373
5575	NC_015865	CGA	2	6	300129	300134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581373
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5577	NC_015865	TCC	2	6	300207	300212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581373
5578	NC_015865	CGC	2	6	300216	300221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581373
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5582	NC_015865	TCC	2	6	300408	300413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581373
5583	NC_015865	GTC	2	6	300449	300454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581373
5584	NC_015865	GTGC	2	8	300472	300479	0 %	25 %	50 %	25 %	341581373
5585	NC_015865	TCC	2	6	300491	300496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581373
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5587	NC_015865	CTC	2	6	300571	300576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581373
5588	NC_015865	TGAACT	2	12	300618	300629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	341581373
5589	NC_015865	CGT	2	6	300675	300680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581373
5590	NC_015865	CGTGAC	2	12	300790	300801	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	341581373
5591	NC_015865	TCC	2	6	301427	301432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581374
5592	NC_015865	CGGC	2	8	301435	301442	0 %	0 %	50 %	50 %	341581374
5593	NC_015865	TTC	2	6	301456	301461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581374
5594	NC_015865	CGATG	2	10	301476	301485	20 %	20 %	40 %	20 %	341581374
5595	NC_015865	TGG	2	6	301630	301635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581374
5596	NC_015865	GAG	2	6	301675	301680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581374
5597	NC_015865	CTT	2	6	301710	301715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581374
5598	NC_015865	TCC	2	6	301768	301773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581374
5599	NC_015865	GTC	2	6	301833	301838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581374
5600	NC_015865	ACGG	2	8	301958	301965	25 %	0 %	50 %	25 %	341581375
5601	NC_015865	TCC	2	6	302053	302058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581375
5602	NC_015865	CCA	2	6	302077	302082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581375
5603	NC_015865	GGA	2	6	302111	302116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581375
5604	NC_015865	CTT	2	6	302135	302140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581375
5605	NC_015865	TCG	2	6	302158	302163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581375
5606	NC_015865	GAG	2	6	302190	302195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581375
5607	NC_015865	GCG	2	6	302293	302298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581375
5608	NC_015865	CGG	2	6	302318	302323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581375
5609	NC_015865	CTC	2	6	302379	302384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581375
5610	NC_015865	GAG	2	6	302460	302465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581375
5611	NC_015865	GTCAAG	2	12	302598	302609	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	341581375
5612	NC_015865	GAGG	2	8	302633	302640	25 %	0 %	75 %	0 %	341581375
5613	NC_015865	GC	3	6	302696	302701	0 %	0 %	50 %	50 %	341581375
5614	NC_015865	TGG	2	6	302707	302712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581375
5615	NC_015865	ATA	2	6	302727	302732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	341581375
5616	NC_015865	CGA	2	6	302813	302818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581375
5617	NC_015865	CGA	2	6	302831	302836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581375
5618	NC_015865	GAA	2	6	302861	302866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581375
5619	NC_015865	AGC	2	6	302878	302883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581375
5620	NC_015865	GCG	2	6	302993	302998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581376
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5622	NC_015865	AGG	2	6	303067	303072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581376
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5741	NC_015865	GTT	2	6	310120	310125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581383
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5865	NC_015865	CGG	2	6	316521	316526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581394
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5982	NC_015865	GGC	2	6	323305	323310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581398
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5987	NC_015865	GAA	2	6	323545	323550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581399
5988	NC_015865	GCGT	2	8	323561	323568	0 %	25 %	50 %	25 %	341581399
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5991	NC_015865	TGG	2	6	323633	323638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581399
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