MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermococcus sp. 4557 chromosome

Total Repeats: 38337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015865	TCT	3	9	244085	244093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
4502	NC_015865	GCCCC	2	10	244096	244105	0 %	0 %	20 %	80 %	341581323
4503	NC_015865	GC	3	6	244112	244117	0 %	0 %	50 %	50 %	341581323
4504	NC_015865	CAT	2	6	244145	244150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581323
4505	NC_015865	GTT	2	6	244197	244202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581323
4506	NC_015865	CTC	2	6	244227	244232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4507	NC_015865	CTT	2	6	244245	244250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
4508	NC_015865	TCGCC	2	10	244256	244265	0 %	20 %	20 %	60 %	341581323
4509	NC_015865	CCT	2	6	244328	244333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4510	NC_015865	GGT	2	6	244422	244427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581323
4511	NC_015865	CCT	2	6	244436	244441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4512	NC_015865	CTC	2	6	244475	244480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4513	NC_015865	CCT	2	6	244547	244552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4514	NC_015865	GAG	2	6	244581	244586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581323
4515	NC_015865	TGA	2	6	244589	244594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581323
4516	NC_015865	CCT	2	6	244619	244624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4517	NC_015865	CTT	2	6	244824	244829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
4518	NC_015865	TCC	2	6	244883	244888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4519	NC_015865	CGG	2	6	244949	244954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581323
4520	NC_015865	TCG	2	6	245017	245022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581323
4521	NC_015865	CAG	2	6	245040	245045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581323
4522	NC_015865	GAG	2	6	245046	245051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581323
4523	NC_015865	CTT	2	6	245094	245099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581323
4524	NC_015865	CTC	2	6	245115	245120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581323
4525	NC_015865	TCC	2	6	245278	245283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4526	NC_015865	TCG	2	6	245365	245370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4527	NC_015865	GTC	2	6	245460	245465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4528	NC_015865	CTG	2	6	245470	245475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4529	NC_015865	CGA	2	6	245573	245578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4530	NC_015865	GCG	2	6	245579	245584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
4531	NC_015865	CGT	2	6	245636	245641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4532	NC_015865	CCA	2	6	245721	245726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581324
4533	NC_015865	GGT	2	6	245765	245770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
4534	NC_015865	CGT	2	6	245825	245830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4535	NC_015865	GGCG	2	8	245832	245839	0 %	0 %	75 %	25 %	341581324
4536	NC_015865	GAG	2	6	245919	245924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581324
4537	NC_015865	CGG	2	6	245972	245977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
4538	NC_015865	TCC	2	6	246016	246021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4539	NC_015865	GTC	2	6	246138	246143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4540	NC_015865	CGC	2	6	246155	246160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
4541	NC_015865	CCA	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581324
4542	NC_015865	TTG	2	6	246250	246255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581324
4543	NC_015865	CTTC	2	8	246270	246277	0 %	50 %	0 %	50 %	341581324
4544	NC_015865	CG	3	6	246279	246284	0 %	0 %	50 %	50 %	341581324
4545	NC_015865	CTC	2	6	246333	246338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4546	NC_015865	CTT	2	6	246357	246362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
4547	NC_015865	GAA	2	6	246363	246368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581324
4548	NC_015865	TGG	2	6	246458	246463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
4549	NC_015865	GGT	2	6	246467	246472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
4550	NC_015865	GGCT	2	8	246521	246528	0 %	25 %	50 %	25 %	341581324
4551	NC_015865	CTT	2	6	246537	246542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
4552	NC_015865	CTT	2	6	246570	246575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581324
4553	NC_015865	TCC	2	6	246597	246602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4554	NC_015865	GCCT	2	8	246610	246617	0 %	25 %	25 %	50 %	341581324
4555	NC_015865	TCG	2	6	246632	246637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4556	NC_015865	TC	3	6	246651	246656	0 %	50 %	0 %	50 %	341581324
4557	NC_015865	CTC	2	6	246696	246701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4558	NC_015865	GGT	2	6	246726	246731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	341581324
4559	NC_015865	CGG	2	6	246749	246754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581324
4560	NC_015865	TCG	2	6	246772	246777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4561	NC_015865	TGA	3	9	246779	246787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581324
4562	NC_015865	TCG	2	6	246799	246804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4563	NC_015865	GAT	2	6	246816	246821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581324
4564	NC_015865	GCC	2	6	246888	246893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
4565	NC_015865	ATC	2	6	246973	246978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581324
4566	NC_015865	TCG	2	6	247018	247023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581324
4567	NC_015865	CGC	2	6	247049	247054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581324
4568	NC_015865	CTC	2	6	247074	247079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4569	NC_015865	CCT	2	6	247100	247105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581324
4570	NC_015865	CTT	2	6	247417	247422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581325
4571	NC_015865	ACG	3	9	247439	247447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581325
4572	NC_015865	TGA	2	6	247473	247478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581325
4573	NC_015865	CT	3	6	247513	247518	0 %	50 %	0 %	50 %	341581325
4574	NC_015865	CTC	2	6	247546	247551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581325
4575	NC_015865	GAC	2	6	247645	247650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581325
4576	NC_015865	TGT	2	6	247707	247712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581325
4577	NC_015865	TCCTG	2	10	247722	247731	0 %	40 %	20 %	40 %	341581325
4578	NC_015865	CCA	2	6	247860	247865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581325
4579	NC_015865	CACCGT	2	12	247978	247989	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	341581325
4580	NC_015865	CGC	2	6	248031	248036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	341581325
4581	NC_015865	CCTG	2	8	248121	248128	0 %	25 %	25 %	50 %	341581325
4582	NC_015865	AACT	2	8	248182	248189	50 %	25 %	0 %	25 %	341581325
4583	NC_015865	GAA	2	6	248387	248392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581326
4584	NC_015865	AGT	2	6	248399	248404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581326
4585	NC_015865	CAG	2	6	248461	248466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581326
4586	NC_015865	TGA	2	6	248496	248501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581326
4587	NC_015865	AGGCC	2	10	248502	248511	20 %	0 %	40 %	40 %	341581326
4588	NC_015865	AACGG	2	10	248549	248558	40 %	0 %	40 %	20 %	341581326
4589	NC_015865	AGA	2	6	248613	248618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581326
4590	NC_015865	CCA	2	6	248632	248637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	341581326
4591	NC_015865	AGC	2	6	248643	248648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581326
4592	NC_015865	AAGAGG	2	12	248690	248701	50 %	0 %	50 %	0 %	341581326
4593	NC_015865	ATG	2	6	248907	248912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	341581327
4594	NC_015865	GAG	2	6	248971	248976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581327
4595	NC_015865	GCTTCG	2	12	249087	249098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581327
4596	NC_015865	AGG	2	6	249128	249133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581327
4597	NC_015865	CTA	2	6	249286	249291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581327
4598	NC_015865	GAG	2	6	249305	249310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581327
4599	NC_015865	ACG	2	6	249393	249398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581327
4600	NC_015865	AAG	2	6	249440	249445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581327
4601	NC_015865	C	6	6	249464	249469	0 %	0 %	0 %	100 %	341581327
4602	NC_015865	G	6	6	249471	249476	0 %	0 %	100 %	0 %	341581327
4603	NC_015865	CGA	2	6	249526	249531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581327
4604	NC_015865	C	6	6	249659	249664	0 %	0 %	0 %	100 %	341581328
4605	NC_015865	CGG	2	6	249670	249675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581328
4606	NC_015865	TC	3	6	249682	249687	0 %	50 %	0 %	50 %	341581328
4607	NC_015865	TGT	2	6	249691	249696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581328
4608	NC_015865	T	6	6	249812	249817	0 %	100 %	0 %	0 %	341581328
4609	NC_015865	TCC	2	6	249846	249851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581328
4610	NC_015865	CCCG	2	8	249853	249860	0 %	0 %	25 %	75 %	341581328
4611	NC_015865	TCC	2	6	249879	249884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581328
4612	NC_015865	CTT	2	6	249886	249891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581328
4613	NC_015865	CAG	2	6	249923	249928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581328
4614	NC_015865	CCGA	2	8	250005	250012	25 %	0 %	25 %	50 %	341581328
4615	NC_015865	GAA	2	6	250031	250036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	341581328
4616	NC_015865	CCGC	2	8	250059	250066	0 %	0 %	25 %	75 %	341581328
4617	NC_015865	CCT	2	6	250168	250173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581328
4618	NC_015865	TGCC	2	8	250392	250399	0 %	25 %	25 %	50 %	341581328
4619	NC_015865	TGGA	2	8	250456	250463	25 %	25 %	50 %	0 %	341581328
4620	NC_015865	TCT	2	6	250611	250616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581329
4621	NC_015865	CCT	2	6	250731	250736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581329
4622	NC_015865	ATC	2	6	250754	250759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581329
4623	NC_015865	CGG	2	6	251022	251027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581330
4624	NC_015865	CTG	2	6	251031	251036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581330
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4626	NC_015865	TAC	2	6	251110	251115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581330
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4658	NC_015865	GC	3	6	252939	252944	0 %	0 %	50 %	50 %	341581331
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4855	NC_015865	GAAG	2	8	262445	262452	50 %	0 %	50 %	0 %	341581339
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4863	NC_015865	GCGA	2	8	262789	262796	25 %	0 %	50 %	25 %	341581339
4864	NC_015865	TTC	2	6	262804	262809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581339
4865	NC_015865	TCA	2	6	262880	262885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581339
4866	NC_015865	GCTCAA	2	12	262890	262901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	341581339
4867	NC_015865	CAT	2	6	262908	262913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581339
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4984	NC_015865	ATC	2	6	269306	269311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	341581346
4985	NC_015865	TTCC	2	8	269320	269327	0 %	50 %	0 %	50 %	341581346
4986	NC_015865	GGA	2	6	269506	269511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581347
4987	NC_015865	GA	3	6	269541	269546	50 %	0 %	50 %	0 %	341581347
4988	NC_015865	GCT	2	6	269559	269564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	341581347
4989	NC_015865	CGG	2	6	269615	269620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581347
4990	NC_015865	CTC	2	6	269767	269772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	341581347
4991	NC_015865	GAG	2	6	269785	269790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581347
4992	NC_015865	GGTCT	2	10	269815	269824	0 %	40 %	40 %	20 %	341581347
4993	NC_015865	GACGTT	2	12	269830	269841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	341581347
4994	NC_015865	GCG	2	6	269888	269893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	341581347
4995	NC_015865	GAAG	2	8	269922	269929	50 %	0 %	50 %	0 %	341581347
4996	NC_015865	AGC	2	6	269966	269971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	341581347
4997	NC_015865	GATG	2	8	269984	269991	25 %	25 %	50 %	0 %	341581347
4998	NC_015865	GAG	3	9	270190	270198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	341581348
4999	NC_015865	CTT	2	6	270234	270239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	341581348
5000	NC_015865	TGT	2	6	270324	270329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	341581348

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