MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015714	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	338705983
2	NC_015714	A	6	6	250	255	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
3	NC_015714	C	6	6	280	285	0 %	0 %	0 %	100 %	338705983
4	NC_015714	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	338705983
5	NC_015714	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
6	NC_015714	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705983
7	NC_015714	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705983
8	NC_015714	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
9	NC_015714	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705983
10	NC_015714	A	9	9	628	636	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
11	NC_015714	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
12	NC_015714	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	338705983
13	NC_015714	T	7	7	678	684	0 %	100 %	0 %	0 %	338705983
14	NC_015714	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705983
15	NC_015714	A	9	9	742	750	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
16	NC_015714	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
17	NC_015714	A	7	7	886	892	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
18	NC_015714	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705983
19	NC_015714	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
20	NC_015714	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	338705983
21	NC_015714	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
22	NC_015714	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
23	NC_015714	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705983
24	NC_015714	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705983
25	NC_015714	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	338705983
26	NC_015714	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705983
27	NC_015714	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705983
28	NC_015714	A	6	6	1310	1315	100 %	0 %	0 %	0 %	338705983
29	NC_015714	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	338705983
30	NC_015714	AAG	2	6	1661	1666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
31	NC_015714	A	8	8	1711	1718	100 %	0 %	0 %	0 %	338705984
32	NC_015714	T	6	6	1727	1732	0 %	100 %	0 %	0 %	338705984
33	NC_015714	GCT	2	6	1747	1752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705984
34	NC_015714	ACG	2	6	1840	1845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
35	NC_015714	T	6	6	1847	1852	0 %	100 %	0 %	0 %	338705984
36	NC_015714	TGT	2	6	1869	1874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
37	NC_015714	CAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705984
38	NC_015714	GAA	2	6	1915	1920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
39	NC_015714	CAAA	2	8	1940	1947	75 %	0 %	0 %	25 %	338705984
40	NC_015714	AGG	2	6	2010	2015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705984
41	NC_015714	TC	3	6	2018	2023	0 %	50 %	0 %	50 %	338705984
42	NC_015714	AGA	2	6	2082	2087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
43	NC_015714	ATT	2	6	2140	2145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705984
44	NC_015714	TA	3	6	2176	2181	50 %	50 %	0 %	0 %	338705984
45	NC_015714	A	7	7	2183	2189	100 %	0 %	0 %	0 %	338705984
46	NC_015714	GCA	2	6	2301	2306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
47	NC_015714	T	8	8	2314	2321	0 %	100 %	0 %	0 %	338705984
48	NC_015714	TCT	2	6	2338	2343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705984
49	NC_015714	ATC	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705984
50	NC_015714	GTT	2	6	2454	2459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
51	NC_015714	TTA	2	6	2486	2491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705984
52	NC_015714	CAG	2	6	2497	2502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705984
53	NC_015714	TTG	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705984
54	NC_015714	GAA	2	6	2563	2568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
55	NC_015714	CTAT	2	8	2613	2620	25 %	50 %	0 %	25 %	338705984
56	NC_015714	GAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705984
57	NC_015714	AGG	2	6	2654	2659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705984
58	NC_015714	CAT	2	6	2730	2735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705984
59	NC_015714	AT	3	6	2820	2825	50 %	50 %	0 %	0 %	338705985
60	NC_015714	T	8	8	2838	2845	0 %	100 %	0 %	0 %	338705985
61	NC_015714	TGC	2	6	2896	2901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705985
62	NC_015714	CA	3	6	3005	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	338705985
63	NC_015714	A	6	6	3034	3039	100 %	0 %	0 %	0 %	338705985
64	NC_015714	A	7	7	3059	3065	100 %	0 %	0 %	0 %	338705985
65	NC_015714	A	7	7	3073	3079	100 %	0 %	0 %	0 %	338705985
66	NC_015714	CAG	2	6	3088	3093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705985
67	NC_015714	T	6	6	3110	3115	0 %	100 %	0 %	0 %	338705985
68	NC_015714	CTT	2	6	3160	3165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705985
69	NC_015714	AACAAA	2	12	3232	3243	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	338705985
70	NC_015714	AG	3	6	3248	3253	50 %	0 %	50 %	0 %	338705985
71	NC_015714	TAT	2	6	3374	3379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705985
72	NC_015714	CTC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705985
73	NC_015714	GAG	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705985
74	NC_015714	GGTT	2	8	3588	3595	0 %	50 %	50 %	0 %	338705985
75	NC_015714	GAT	2	6	3668	3673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705985
76	NC_015714	ATG	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705985
77	NC_015714	A	6	6	3789	3794	100 %	0 %	0 %	0 %	338705985
78	NC_015714	AAT	2	6	3831	3836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338705985
79	NC_015714	AT	3	6	3878	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	338705986
80	NC_015714	GT	3	6	3930	3935	0 %	50 %	50 %	0 %	338705986
81	NC_015714	AAAG	2	8	4040	4047	75 %	0 %	25 %	0 %	338705986
82	NC_015714	CGT	2	6	4081	4086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705986
83	NC_015714	GTAC	2	8	4105	4112	25 %	25 %	25 %	25 %	338705986
84	NC_015714	GAA	2	6	4248	4253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705986
85	NC_015714	GAA	2	6	4395	4400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
86	NC_015714	AGAA	2	8	4444	4451	75 %	0 %	25 %	0 %	338705987
87	NC_015714	GGA	2	6	4559	4564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
88	NC_015714	CGTC	2	8	4651	4658	0 %	25 %	25 %	50 %	338705987
89	NC_015714	TCAT	2	8	4708	4715	25 %	50 %	0 %	25 %	338705987
90	NC_015714	CGAAG	2	10	4772	4781	40 %	0 %	40 %	20 %	338705987
91	NC_015714	A	6	6	4817	4822	100 %	0 %	0 %	0 %	338705987
92	NC_015714	TTC	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
93	NC_015714	TCT	2	6	4898	4903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
94	NC_015714	TTG	2	6	5122	5127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705987
95	NC_015714	ATT	2	6	5175	5180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
96	NC_015714	TAC	2	6	5207	5212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
97	NC_015714	ACG	2	6	5278	5283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705987
98	NC_015714	GTA	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
99	NC_015714	GTGC	2	8	5541	5548	0 %	25 %	50 %	25 %	338705987
100	NC_015714	ATC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
101	NC_015714	TTTGAC	2	12	5643	5654	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	338705987
102	NC_015714	GCAGGC	2	12	5660	5671	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	338705987
103	NC_015714	TCT	2	6	5757	5762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705987
104	NC_015714	GGA	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
105	NC_015714	TTAC	2	8	5772	5779	25 %	50 %	0 %	25 %	338705987
106	NC_015714	GTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705987
107	NC_015714	AAGA	2	8	5808	5815	75 %	0 %	25 %	0 %	338705987
108	NC_015714	GAT	2	6	5844	5849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
109	NC_015714	AGA	2	6	5894	5899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
110	NC_015714	GGA	2	6	5991	5996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705987
111	NC_015714	GGC	2	6	6020	6025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338705987
112	NC_015714	TTA	2	6	6034	6039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
113	NC_015714	GGGC	2	8	6093	6100	0 %	0 %	75 %	25 %	338705987
114	NC_015714	GACG	2	8	6182	6189	25 %	0 %	50 %	25 %	338705987
115	NC_015714	GA	3	6	6215	6220	50 %	0 %	50 %	0 %	338705987
116	NC_015714	TAA	2	6	6227	6232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338705987
117	NC_015714	ACT	2	6	6279	6284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705987
118	NC_015714	CG	3	6	6307	6312	0 %	0 %	50 %	50 %	338705987
119	NC_015714	TAT	2	6	6314	6319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
120	NC_015714	TTA	2	6	6391	6396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705987
121	NC_015714	GAGG	2	8	6428	6435	25 %	0 %	75 %	0 %	338705987
122	NC_015714	AAC	2	6	6523	6528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338705987
123	NC_015714	AGA	2	6	6616	6621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705987
124	NC_015714	AC	3	6	6625	6630	50 %	0 %	0 %	50 %	338705987
125	NC_015714	GTGTAT	2	12	6686	6697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	338705987
126	NC_015714	GT	3	6	6729	6734	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
127	NC_015714	GTG	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338705987
128	NC_015714	GCGT	2	8	6766	6773	0 %	25 %	50 %	25 %	338705987
129	NC_015714	GT	3	6	6772	6777	0 %	50 %	50 %	0 %	338705987
130	NC_015714	TAG	3	9	6799	6807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705987
131	NC_015714	TGT	2	6	6874	6879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705988
132	NC_015714	GAG	2	6	6937	6942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705988
133	NC_015714	ATT	2	6	6972	6977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338705988
134	NC_015714	T	6	6	7077	7082	0 %	100 %	0 %	0 %	338705989
135	NC_015714	AGTT	2	8	7083	7090	25 %	50 %	25 %	0 %	338705989
136	NC_015714	GGA	2	6	7136	7141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338705989
137	NC_015714	CTT	2	6	7142	7147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705989
138	NC_015714	ATCGG	2	10	7148	7157	20 %	20 %	40 %	20 %	338705989
139	NC_015714	GAT	2	6	7189	7194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
140	NC_015714	TTAC	2	8	7268	7275	25 %	50 %	0 %	25 %	338705989
141	NC_015714	TTGC	2	8	7318	7325	0 %	50 %	25 %	25 %	338705989
142	NC_015714	GA	3	6	7437	7442	50 %	0 %	50 %	0 %	338705989
143	NC_015714	GTCA	2	8	7489	7496	25 %	25 %	25 %	25 %	338705989
144	NC_015714	ACT	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705989
145	NC_015714	GC	3	6	7549	7554	0 %	0 %	50 %	50 %	338705989
146	NC_015714	TGA	2	6	7619	7624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
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149	NC_015714	A	6	6	7744	7749	100 %	0 %	0 %	0 %	338705989
150	NC_015714	TCA	2	6	7802	7807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338705989
151	NC_015714	TTG	2	6	7813	7818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705989
152	NC_015714	AAG	2	6	7915	7920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705989
153	NC_015714	TTAAAT	2	12	7966	7977	50 %	50 %	0 %	0 %	338705989
154	NC_015714	GAT	2	6	8050	8055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705989
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156	NC_015714	TCT	2	6	8403	8408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
157	NC_015714	ATTGAA	2	12	8549	8560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	338705990
158	NC_015714	GGTT	2	8	8563	8570	0 %	50 %	50 %	0 %	338705990
159	NC_015714	AT	4	8	8574	8581	50 %	50 %	0 %	0 %	338705990
160	NC_015714	TGT	2	6	8678	8683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705990
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162	NC_015714	A	7	7	8738	8744	100 %	0 %	0 %	0 %	338705990
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170	NC_015714	CCT	2	6	9036	9041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338705990
171	NC_015714	ACG	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
172	NC_015714	CCGT	2	8	9127	9134	0 %	25 %	25 %	50 %	338705990
173	NC_015714	TCT	2	6	9148	9153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
174	NC_015714	CGA	2	6	9175	9180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338705990
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178	NC_015714	CTT	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705990
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255	NC_015714	CA	5	10	13280	13289	50 %	0 %	0 %	50 %	338705993
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257	NC_015714	TGA	2	6	13360	13365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338705993
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259	NC_015714	CGG	2	6	13486	13491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338705993
260	NC_015714	AGA	2	6	13493	13498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338705993
261	NC_015714	GC	3	6	13575	13580	0 %	0 %	50 %	50 %	338705993
262	NC_015714	CT	4	8	13624	13631	0 %	50 %	0 %	50 %	338705993
263	NC_015714	GTTT	2	8	13642	13649	0 %	75 %	25 %	0 %	338705993
264	NC_015714	TCT	2	6	13688	13693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338705993
265	NC_015714	GAAG	2	8	13700	13707	50 %	0 %	50 %	0 %	338705993
266	NC_015714	ACAT	2	8	13735	13742	50 %	25 %	0 %	25 %	338705993
267	NC_015714	GTC	2	6	13813	13818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705993
268	NC_015714	GTT	2	6	14040	14045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338705994
269	NC_015714	T	6	6	14044	14049	0 %	100 %	0 %	0 %	338705994
270	NC_015714	GCT	2	6	14052	14057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338705994
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277	NC_015714	CG	3	6	14345	14350	0 %	0 %	50 %	50 %	338705994
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