MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015714	CGT	2	6	82398	82403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706052
1502	NC_015714	CGT	2	6	82410	82415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706052
1503	NC_015714	CGCA	2	8	82420	82427	25 %	0 %	25 %	50 %	338706052
1504	NC_015714	T	7	7	82679	82685	0 %	100 %	0 %	0 %	338706053
1505	NC_015714	ACG	2	6	82785	82790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706053
1506	NC_015714	GTG	3	9	82809	82817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706053
1507	NC_015714	T	7	7	82880	82886	0 %	100 %	0 %	0 %	338706053
1508	NC_015714	GAT	3	9	82907	82915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706053
1509	NC_015714	GTG	3	9	82923	82931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706053
1510	NC_015714	TG	3	6	83063	83068	0 %	50 %	50 %	0 %	338706053
1511	NC_015714	TTGC	2	8	83097	83104	0 %	50 %	25 %	25 %	338706053
1512	NC_015714	GCG	2	6	83139	83144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706053
1513	NC_015714	TCC	2	6	83227	83232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706053
1514	NC_015714	TGG	2	6	83282	83287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706053
1515	NC_015714	GAG	2	6	83432	83437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706053
1516	NC_015714	T	7	7	83500	83506	0 %	100 %	0 %	0 %	338706054
1517	NC_015714	CT	3	6	83569	83574	0 %	50 %	0 %	50 %	338706054
1518	NC_015714	CTT	2	6	83590	83595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706054
1519	NC_015714	GCC	2	6	83624	83629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706054
1520	NC_015714	T	6	6	83637	83642	0 %	100 %	0 %	0 %	338706054
1521	NC_015714	CAA	2	6	83647	83652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706054
1522	NC_015714	CAT	2	6	83682	83687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706054
1523	NC_015714	TGG	2	6	83713	83718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706054
1524	NC_015714	GGT	2	6	83735	83740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706054
1525	NC_015714	GCA	2	6	83760	83765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706054
1526	NC_015714	ATGCA	2	10	83770	83779	40 %	20 %	20 %	20 %	338706054
1527	NC_015714	GTT	2	6	83819	83824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706054
1528	NC_015714	CCG	2	6	83841	83846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706054
1529	NC_015714	TG	3	6	83870	83875	0 %	50 %	50 %	0 %	338706054
1530	NC_015714	TG	3	6	83951	83956	0 %	50 %	50 %	0 %	338706054
1531	NC_015714	TTG	2	6	83971	83976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706054
1532	NC_015714	TGGA	2	8	84013	84020	25 %	25 %	50 %	0 %	338706054
1533	NC_015714	GAT	2	6	84032	84037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706054
1534	NC_015714	GGT	2	6	84080	84085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706054
1535	NC_015714	CACTTT	2	12	84172	84183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	338706054
1536	NC_015714	GTG	2	6	84196	84201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706054
1537	NC_015714	GCA	3	9	84222	84230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706054
1538	NC_015714	GCG	3	9	84267	84275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706054
1539	NC_015714	TGG	3	9	84283	84291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706054
1540	NC_015714	GA	4	8	84469	84476	50 %	0 %	50 %	0 %	338706055
1541	NC_015714	A	6	6	84551	84556	100 %	0 %	0 %	0 %	338706055
1542	NC_015714	T	6	6	84577	84582	0 %	100 %	0 %	0 %	338706055
1543	NC_015714	GC	3	6	84745	84750	0 %	0 %	50 %	50 %	338706055
1544	NC_015714	ATC	2	6	84794	84799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706055
1545	NC_015714	GTTA	2	8	84916	84923	25 %	50 %	25 %	0 %	338706055
1546	NC_015714	GGA	2	6	84932	84937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706055
1547	NC_015714	CT	3	6	84968	84973	0 %	50 %	0 %	50 %	338706055
1548	NC_015714	GA	3	6	85008	85013	50 %	0 %	50 %	0 %	338706055
1549	NC_015714	A	7	7	85034	85040	100 %	0 %	0 %	0 %	338706055
1550	NC_015714	TGC	2	6	85111	85116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1551	NC_015714	AGC	2	6	85137	85142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1552	NC_015714	TGC	2	6	85165	85170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1553	NC_015714	ATG	2	6	85190	85195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706055
1554	NC_015714	AAT	2	6	85223	85228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706055
1555	NC_015714	TCTA	2	8	85322	85329	25 %	50 %	0 %	25 %	338706055
1556	NC_015714	GAA	2	6	85354	85359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706055
1557	NC_015714	TGC	2	6	85369	85374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1558	NC_015714	AAAG	2	8	85480	85487	75 %	0 %	25 %	0 %	338706055
1559	NC_015714	G	6	6	85487	85492	0 %	0 %	100 %	0 %	338706055
1560	NC_015714	CGT	2	6	85593	85598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1561	NC_015714	GCA	2	6	85642	85647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706055
1562	NC_015714	CAGA	2	8	85674	85681	50 %	0 %	25 %	25 %	338706055
1563	NC_015714	CGTGAA	2	12	85793	85804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	338706055
1564	NC_015714	AAG	2	6	85893	85898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706055
1565	NC_015714	A	8	8	85989	85996	100 %	0 %	0 %	0 %	338706056
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1567	NC_015714	GCA	2	6	86024	86029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706056
1568	NC_015714	CAA	2	6	86039	86044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706056
1569	NC_015714	T	6	6	86055	86060	0 %	100 %	0 %	0 %	338706056
1570	NC_015714	GC	3	6	86087	86092	0 %	0 %	50 %	50 %	338706056
1571	NC_015714	GGAT	2	8	86115	86122	25 %	25 %	50 %	0 %	338706056
1572	NC_015714	ACG	2	6	86124	86129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706056
1573	NC_015714	GGT	2	6	86324	86329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706056
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1575	NC_015714	A	6	6	86390	86395	100 %	0 %	0 %	0 %	338706056
1576	NC_015714	GC	3	6	86400	86405	0 %	0 %	50 %	50 %	338706056
1577	NC_015714	CCAT	2	8	86422	86429	25 %	25 %	0 %	50 %	338706056
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1581	NC_015714	ACC	2	6	86598	86603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706056
1582	NC_015714	AGG	2	6	86609	86614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706056
1583	NC_015714	ATG	2	6	86629	86634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706056
1584	NC_015714	GCA	2	6	86643	86648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706056
1585	NC_015714	GCACC	2	10	86710	86719	20 %	0 %	20 %	60 %	338706056
1586	NC_015714	AGC	2	6	86774	86779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706056
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1588	NC_015714	CG	4	8	86826	86833	0 %	0 %	50 %	50 %	338706056
1589	NC_015714	GCC	2	6	86838	86843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706056
1590	NC_015714	T	7	7	86874	86880	0 %	100 %	0 %	0 %	338706056
1591	NC_015714	ATTTGT	2	12	86914	86925	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	338706056
1592	NC_015714	ATT	2	6	86975	86980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706056
1593	NC_015714	T	6	6	87036	87041	0 %	100 %	0 %	0 %	338706056
1594	NC_015714	TG	3	6	87052	87057	0 %	50 %	50 %	0 %	338706056
1595	NC_015714	ACGCTT	2	12	87102	87113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338706056
1596	NC_015714	GTG	2	6	87165	87170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706056
1597	NC_015714	CGCAC	2	10	87171	87180	20 %	0 %	20 %	60 %	338706056
1598	NC_015714	AT	4	8	87203	87210	50 %	50 %	0 %	0 %	338706056
1599	NC_015714	GC	3	6	87233	87238	0 %	0 %	50 %	50 %	338706057
1600	NC_015714	CG	3	6	87273	87278	0 %	0 %	50 %	50 %	338706057
1601	NC_015714	TGC	2	6	87288	87293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1602	NC_015714	CT	3	6	87310	87315	0 %	50 %	0 %	50 %	338706057
1603	NC_015714	GCA	2	6	87341	87346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1604	NC_015714	GGT	2	6	87412	87417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706057
1605	NC_015714	TGA	2	6	87454	87459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706057
1606	NC_015714	TGG	2	6	87489	87494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706057
1607	NC_015714	CA	3	6	87615	87620	50 %	0 %	0 %	50 %	338706057
1608	NC_015714	CTC	2	6	87628	87633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706057
1609	NC_015714	ACT	2	6	87657	87662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706057
1610	NC_015714	GCT	2	6	87719	87724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1611	NC_015714	GCA	2	6	87802	87807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1612	NC_015714	GGC	2	6	87862	87867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706057
1613	NC_015714	CGC	2	6	87982	87987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706057
1614	NC_015714	TGTT	2	8	88005	88012	0 %	75 %	25 %	0 %	338706057
1615	NC_015714	GATC	2	8	88048	88055	25 %	25 %	25 %	25 %	338706057
1616	NC_015714	ATGG	2	8	88164	88171	25 %	25 %	50 %	0 %	338706057
1617	NC_015714	AT	3	6	88233	88238	50 %	50 %	0 %	0 %	338706057
1618	NC_015714	TG	3	6	88314	88319	0 %	50 %	50 %	0 %	338706057
1619	NC_015714	AGGA	2	8	88320	88327	50 %	0 %	50 %	0 %	338706057
1620	NC_015714	TCG	2	6	88333	88338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1621	NC_015714	GCA	2	6	88367	88372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706057
1622	NC_015714	GC	3	6	88499	88504	0 %	0 %	50 %	50 %	338706057
1623	NC_015714	TCA	2	6	88563	88568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706057
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1625	NC_015714	T	6	6	88598	88603	0 %	100 %	0 %	0 %	338706057
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