MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015714	TTCC	2	8	721976	721983	0 %	50 %	0 %	50 %	338706618
14002	NC_015714	TCC	2	6	722032	722037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706618
14003	NC_015714	GCA	2	6	722096	722101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706618
14004	NC_015714	TTG	2	6	722148	722153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706618
14005	NC_015714	TTC	2	6	722159	722164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706618
14006	NC_015714	GAG	2	6	722180	722185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706618
14007	NC_015714	CTT	2	6	722207	722212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706618
14008	NC_015714	GTC	2	6	722234	722239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706618
14009	NC_015714	TGA	2	6	722245	722250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706618
14010	NC_015714	TGTA	2	8	722259	722266	25 %	50 %	25 %	0 %	338706618
14011	NC_015714	GA	3	6	722276	722281	50 %	0 %	50 %	0 %	338706618
14012	NC_015714	GAA	2	6	722336	722341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706618
14013	NC_015714	CCT	2	6	722347	722352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706618
14014	NC_015714	CGCT	2	8	722373	722380	0 %	25 %	25 %	50 %	338706618
14015	NC_015714	ACC	2	6	722430	722435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706618
14016	NC_015714	TGG	2	6	722442	722447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706618
14017	NC_015714	GAG	2	6	722453	722458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706618
14018	NC_015714	CTT	2	6	722459	722464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706618
14019	NC_015714	CGTCC	2	10	722513	722522	0 %	20 %	20 %	60 %	338706618
14020	NC_015714	GAC	2	6	722528	722533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706618
14021	NC_015714	AGT	2	6	722587	722592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706618
14022	NC_015714	AGC	2	6	722672	722677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706619
14023	NC_015714	GCT	2	6	722691	722696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706619
14024	NC_015714	C	6	6	722721	722726	0 %	0 %	0 %	100 %	338706619
14025	NC_015714	ACC	2	6	722728	722733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706619
14026	NC_015714	AAG	2	6	722818	722823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706619
14027	NC_015714	CTC	2	6	722825	722830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706619
14028	NC_015714	ATA	2	6	722881	722886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706619
14029	NC_015714	CAC	2	6	722913	722918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706619
14030	NC_015714	CAA	2	6	723068	723073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706620
14031	NC_015714	AGA	2	6	723113	723118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706620
14032	NC_015714	CAT	2	6	723188	723193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706620
14033	NC_015714	GCAC	2	8	723237	723244	25 %	0 %	25 %	50 %	338706620
14034	NC_015714	TTC	2	6	723266	723271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706620
14035	NC_015714	CAA	2	6	723314	723319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706620
14036	NC_015714	TCA	2	6	723409	723414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706620
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14040	NC_015714	TTA	2	6	723573	723578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706620
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14043	NC_015714	GCC	2	6	723834	723839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706620
14044	NC_015714	TTC	2	6	723920	723925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706620
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14049	NC_015714	ATG	2	6	724157	724162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706620
14050	NC_015714	GC	4	8	724296	724303	0 %	0 %	50 %	50 %	338706620
14051	NC_015714	C	6	6	724326	724331	0 %	0 %	0 %	100 %	338706620
14052	NC_015714	TGGCA	2	10	724482	724491	20 %	20 %	40 %	20 %	338706620
14053	NC_015714	A	6	6	724541	724546	100 %	0 %	0 %	0 %	338706620
14054	NC_015714	CG	3	6	724561	724566	0 %	0 %	50 %	50 %	338706620
14055	NC_015714	CCA	2	6	724599	724604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706620
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14057	NC_015714	A	7	7	724930	724936	100 %	0 %	0 %	0 %	338706621
14058	NC_015714	CG	3	6	724949	724954	0 %	0 %	50 %	50 %	338706621
14059	NC_015714	AC	3	6	724970	724975	50 %	0 %	0 %	50 %	338706621
14060	NC_015714	CAT	2	6	725059	725064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706621
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14062	NC_015714	CAGCAT	2	12	725173	725184	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	338706621
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14065	NC_015714	GA	3	6	725399	725404	50 %	0 %	50 %	0 %	338706621
14066	NC_015714	AAT	2	6	725441	725446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338706621
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14069	NC_015714	TGC	2	6	725524	725529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706622
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14071	NC_015714	CATG	2	8	725594	725601	25 %	25 %	25 %	25 %	338706622
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14075	NC_015714	CCAG	2	8	725773	725780	25 %	0 %	25 %	50 %	338706622
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14085	NC_015714	TTC	2	6	726195	726200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706622
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14087	NC_015714	T	6	6	726283	726288	0 %	100 %	0 %	0 %	338706622
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14094	NC_015714	AATT	2	8	726641	726648	50 %	50 %	0 %	0 %	338706622
14095	NC_015714	CGG	2	6	726677	726682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706622
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14099	NC_015714	TATTT	2	10	727015	727024	20 %	80 %	0 %	0 %	338706622
14100	NC_015714	AT	3	6	727048	727053	50 %	50 %	0 %	0 %	338706622
14101	NC_015714	AATG	2	8	727059	727066	50 %	25 %	25 %	0 %	338706622
14102	NC_015714	TCC	2	6	727108	727113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706622
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14105	NC_015714	CGT	2	6	727270	727275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706622
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14120	NC_015714	ATCC	2	8	727977	727984	25 %	25 %	0 %	50 %	338706622
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14122	NC_015714	ACT	2	6	728035	728040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706622
14123	NC_015714	AGC	2	6	728128	728133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706622
14124	NC_015714	T	6	6	728225	728230	0 %	100 %	0 %	0 %	338706622
14125	NC_015714	AGA	2	6	728232	728237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706622
14126	NC_015714	TTC	3	9	728290	728298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706622
14127	NC_015714	CAG	2	6	728310	728315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706622
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14131	NC_015714	TCT	2	6	728423	728428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706622
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14137	NC_015714	CAAGA	2	10	728558	728567	60 %	0 %	20 %	20 %	338706622
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14153	NC_015714	GCG	2	6	729315	729320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706623
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14358	NC_015714	TGC	2	6	739753	739758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706633
14359	NC_015714	CGTG	2	8	739762	739769	0 %	25 %	50 %	25 %	338706633
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14362	NC_015714	AC	3	6	740060	740065	50 %	0 %	0 %	50 %	338706634
14363	NC_015714	CAC	2	6	740086	740091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706634
14364	NC_015714	C	6	6	740104	740109	0 %	0 %	0 %	100 %	338706634
14365	NC_015714	GC	4	8	740136	740143	0 %	0 %	50 %	50 %	338706634
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14490	NC_015714	TGG	2	6	746743	746748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706639
14491	NC_015714	TAT	2	6	746771	746776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706639
14492	NC_015714	T	6	6	746805	746810	0 %	100 %	0 %	0 %	338706639
14493	NC_015714	TTTCA	2	10	746945	746954	20 %	60 %	0 %	20 %	338706639
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