MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema paraluiscuniculi Cuniculi A chromosome

Total Repeats: 22113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015714	GCTT	2	8	520335	520342	0 %	50 %	25 %	25 %	338706449
10002	NC_015714	CGC	2	6	520399	520404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706449
10003	NC_015714	GGC	2	6	520411	520416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706449
10004	NC_015714	GGT	2	6	520447	520452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706449
10005	NC_015714	GAG	2	6	520571	520576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706449
10006	NC_015714	GCC	2	6	520700	520705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706449
10007	NC_015714	AGG	2	6	520719	520724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706449
10008	NC_015714	GAC	2	6	520781	520786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706449
10009	NC_015714	ATGA	2	8	520811	520818	50 %	25 %	25 %	0 %	338706449
10010	NC_015714	AGCA	2	8	520883	520890	50 %	0 %	25 %	25 %	338706449
10011	NC_015714	CAG	2	6	520897	520902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706449
10012	NC_015714	G	6	6	521412	521417	0 %	0 %	100 %	0 %	338706450
10013	NC_015714	CCTG	3	12	521542	521553	0 %	25 %	25 %	50 %	338706450
10014	NC_015714	TAC	2	6	521578	521583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706450
10015	NC_015714	TGGAGA	2	12	521589	521600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	338706450
10016	NC_015714	CCT	2	6	521707	521712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338706450
10017	NC_015714	GAG	2	6	521921	521926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706450
10018	NC_015714	TGG	2	6	522010	522015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706450
10019	NC_015714	GAA	2	6	522016	522021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706450
10020	NC_015714	T	6	6	522027	522032	0 %	100 %	0 %	0 %	338706450
10021	NC_015714	A	6	6	522149	522154	100 %	0 %	0 %	0 %	338706450
10022	NC_015714	G	6	6	522207	522212	0 %	0 %	100 %	0 %	338706450
10023	NC_015714	CCA	2	6	522232	522237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338706450
10024	NC_015714	ATG	2	6	522249	522254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706450
10025	NC_015714	GTT	2	6	522262	522267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706450
10026	NC_015714	CTG	2	6	522286	522291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706450
10027	NC_015714	AGGA	2	8	522339	522346	50 %	0 %	50 %	0 %	338706450
10028	NC_015714	TGAG	2	8	522362	522369	25 %	25 %	50 %	0 %	338706450
10029	NC_015714	GAG	3	9	522367	522375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706451
10030	NC_015714	GAA	2	6	522397	522402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706451
10031	NC_015714	TCG	2	6	522426	522431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706451
10032	NC_015714	GAG	2	6	522511	522516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706451
10033	NC_015714	T	6	6	522525	522530	0 %	100 %	0 %	0 %	338706451
10034	NC_015714	CTTTT	2	10	522570	522579	0 %	80 %	0 %	20 %	338706452
10035	NC_015714	CTG	2	6	522646	522651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706452
10036	NC_015714	GC	3	6	522734	522739	0 %	0 %	50 %	50 %	338706452
10037	NC_015714	CG	5	10	522810	522819	0 %	0 %	50 %	50 %	338706452
10038	NC_015714	GTGCG	2	10	522863	522872	0 %	20 %	60 %	20 %	338706452
10039	NC_015714	CGA	2	6	522888	522893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706452
10040	NC_015714	AAC	3	9	522899	522907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706452
10041	NC_015714	TTA	2	6	522911	522916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706452
10042	NC_015714	GCG	2	6	522991	522996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706452
10043	NC_015714	T	7	7	523086	523092	0 %	100 %	0 %	0 %	338706452
10044	NC_015714	CG	3	6	523105	523110	0 %	0 %	50 %	50 %	338706452
10045	NC_015714	TGG	2	6	523118	523123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706452
10046	NC_015714	CGT	2	6	523166	523171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706452
10047	NC_015714	GCA	2	6	523252	523257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706452
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10049	NC_015714	TGC	2	6	523470	523475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706452
10050	NC_015714	GCAC	2	8	523532	523539	25 %	0 %	25 %	50 %	338706452
10051	NC_015714	TGC	2	6	523583	523588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706452
10052	NC_015714	TGG	2	6	523676	523681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706453
10053	NC_015714	GCG	2	6	523701	523706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706453
10054	NC_015714	TGG	2	6	523717	523722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706453
10055	NC_015714	TCA	2	6	523737	523742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706453
10056	NC_015714	TGG	2	6	523809	523814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706453
10057	NC_015714	T	6	6	523828	523833	0 %	100 %	0 %	0 %	338706453
10058	NC_015714	TG	3	6	523958	523963	0 %	50 %	50 %	0 %	338706453
10059	NC_015714	GC	4	8	524029	524036	0 %	0 %	50 %	50 %	338706453
10060	NC_015714	GAT	2	6	524062	524067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706453
10061	NC_015714	CCG	2	6	524098	524103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706453
10062	NC_015714	GTT	2	6	524115	524120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706453
10063	NC_015714	GTT	2	6	524172	524177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706453
10064	NC_015714	A	8	8	524181	524188	100 %	0 %	0 %	0 %	338706453
10065	NC_015714	T	6	6	524204	524209	0 %	100 %	0 %	0 %	338706453
10066	NC_015714	GC	4	8	524266	524273	0 %	0 %	50 %	50 %	338706453
10067	NC_015714	CG	4	8	524381	524388	0 %	0 %	50 %	50 %	338706453
10068	NC_015714	TCA	2	6	524427	524432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706453
10069	NC_015714	CGTT	2	8	524500	524507	0 %	50 %	25 %	25 %	338706453
10070	NC_015714	TCGA	2	8	524510	524517	25 %	25 %	25 %	25 %	338706453
10071	NC_015714	AT	4	8	524518	524525	50 %	50 %	0 %	0 %	338706453
10072	NC_015714	GCAG	2	8	524545	524552	25 %	0 %	50 %	25 %	338706453
10073	NC_015714	TGT	2	6	524576	524581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706453
10074	NC_015714	TAG	2	6	524609	524614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706453
10075	NC_015714	ACT	2	6	524695	524700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706453
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10077	NC_015714	ACA	2	6	524923	524928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338706453
10078	NC_015714	TCTG	2	8	524940	524947	0 %	50 %	25 %	25 %	338706453
10079	NC_015714	GGT	2	6	525021	525026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706453
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10081	NC_015714	CGA	2	6	525177	525182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706453
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10083	NC_015714	CTG	2	6	525283	525288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706453
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10085	NC_015714	GAG	2	6	525346	525351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706453
10086	NC_015714	ATG	2	6	525373	525378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706453
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10088	NC_015714	TGA	2	6	525393	525398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706453
10089	NC_015714	ATG	2	6	525429	525434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706453
10090	NC_015714	GAA	2	6	525485	525490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706454
10091	NC_015714	ATG	2	6	525502	525507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706454
10092	NC_015714	AGA	2	6	525545	525550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706454
10093	NC_015714	GCT	2	6	525551	525556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706454
10094	NC_015714	ATG	2	6	525559	525564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706454
10095	NC_015714	TCT	2	6	525598	525603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706454
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10098	NC_015714	CGATGG	2	12	525665	525676	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	338706454
10099	NC_015714	GCGT	2	8	525700	525707	0 %	25 %	50 %	25 %	338706454
10100	NC_015714	CG	3	6	525758	525763	0 %	0 %	50 %	50 %	338706454
10101	NC_015714	CAT	2	6	525878	525883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338706454
10102	NC_015714	ATT	2	6	525891	525896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338706454
10103	NC_015714	CTT	2	6	525912	525917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338706454
10104	NC_015714	A	6	6	525951	525956	100 %	0 %	0 %	0 %	338706454
10105	NC_015714	GAG	2	6	526011	526016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338706454
10106	NC_015714	AGT	2	6	526143	526148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706454
10107	NC_015714	GAA	2	6	526152	526157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706454
10108	NC_015714	GT	3	6	526158	526163	0 %	50 %	50 %	0 %	338706454
10109	NC_015714	AGC	2	6	526165	526170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338706454
10110	NC_015714	CG	3	6	526253	526258	0 %	0 %	50 %	50 %	338706454
10111	NC_015714	GCG	2	6	526277	526282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338706454
10112	NC_015714	TG	3	6	526321	526326	0 %	50 %	50 %	0 %	338706454
10113	NC_015714	GTCAT	2	10	526525	526534	20 %	40 %	20 %	20 %	338706454
10114	NC_015714	AAG	2	6	526539	526544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706454
10115	NC_015714	AAG	2	6	526596	526601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338706454
10116	NC_015714	T	8	8	526621	526628	0 %	100 %	0 %	0 %	338706454
10117	NC_015714	GTG	2	6	526718	526723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338706454
10118	NC_015714	GC	3	6	526761	526766	0 %	0 %	50 %	50 %	338706454
10119	NC_015714	ATAA	2	8	526800	526807	75 %	25 %	0 %	0 %	338706454
10120	NC_015714	GTT	2	6	526829	526834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338706454
10121	NC_015714	TGA	2	6	526859	526864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338706454
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10363	NC_015714	TACG	2	8	539800	539807	25 %	25 %	25 %	25 %	338706466
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10367	NC_015714	TG	3	6	539932	539937	0 %	50 %	50 %	0 %	338706466
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10484	NC_015714	GCC	2	6	546737	546742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338706473
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10488	NC_015714	CGT	2	6	547001	547006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338706473
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