MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermodesulfobacterium sp. OPB45 chromosome

Total Repeats: 39920

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015682	TCTA	2	8	39	46	25 %	50 %	0 %	25 %	337287574
2	NC_015682	CT	3	6	123	128	0 %	50 %	0 %	50 %	337287574
3	NC_015682	TTA	2	6	215	220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287574
4	NC_015682	TGAA	2	8	266	273	50 %	25 %	25 %	0 %	337287574
5	NC_015682	A	7	7	272	278	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
6	NC_015682	AATT	2	8	290	297	50 %	50 %	0 %	0 %	337287574
7	NC_015682	GTT	2	6	319	324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337287574
8	NC_015682	GAA	2	6	326	331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287574
9	NC_015682	GAA	2	6	415	420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287574
10	NC_015682	TAT	2	6	529	534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287574
11	NC_015682	ATG	2	6	562	567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287574
12	NC_015682	AAAGA	2	10	601	610	80 %	0 %	20 %	0 %	337287574
13	NC_015682	A	6	6	612	617	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
14	NC_015682	TTA	2	6	634	639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287574
15	NC_015682	CTTT	2	8	690	697	0 %	75 %	0 %	25 %	337287574
16	NC_015682	TCT	2	6	705	710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287574
17	NC_015682	CTT	2	6	737	742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287574
18	NC_015682	A	6	6	764	769	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
19	NC_015682	TCT	2	6	796	801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287574
20	NC_015682	ATT	2	6	804	809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287574
21	NC_015682	A	8	8	843	850	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
22	NC_015682	A	7	7	867	873	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
23	NC_015682	CTTA	2	8	981	988	25 %	50 %	0 %	25 %	337287574
24	NC_015682	TAG	2	6	1022	1027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287574
25	NC_015682	AAAG	2	8	1042	1049	75 %	0 %	25 %	0 %	337287574
26	NC_015682	T	6	6	1090	1095	0 %	100 %	0 %	0 %	337287574
27	NC_015682	AG	3	6	1105	1110	50 %	0 %	50 %	0 %	337287574
28	NC_015682	T	6	6	1115	1120	0 %	100 %	0 %	0 %	337287574
29	NC_015682	CTT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287574
30	NC_015682	A	7	7	1131	1137	100 %	0 %	0 %	0 %	337287574
31	NC_015682	TATT	2	8	1164	1171	25 %	75 %	0 %	0 %	337287574
32	NC_015682	T	6	6	1170	1175	0 %	100 %	0 %	0 %	337287574
33	NC_015682	TTA	2	6	1183	1188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287574
34	NC_015682	ATC	2	6	1209	1214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287574
35	NC_015682	TTAT	2	8	1241	1248	25 %	75 %	0 %	0 %	337287574
36	NC_015682	AAAT	2	8	1266	1273	75 %	25 %	0 %	0 %	337287574
37	NC_015682	GAA	2	6	1345	1350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287574
38	NC_015682	AAATA	2	10	1355	1364	80 %	20 %	0 %	0 %	337287574
39	NC_015682	ATGA	2	8	1373	1380	50 %	25 %	25 %	0 %	337287574
40	NC_015682	AAAG	2	8	1427	1434	75 %	0 %	25 %	0 %	337287575
41	NC_015682	AAAAGA	2	12	1441	1452	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337287575
42	NC_015682	TTC	3	9	1477	1485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287575
43	NC_015682	CTG	2	6	1503	1508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337287575
44	NC_015682	GAAAG	2	10	1520	1529	60 %	0 %	40 %	0 %	337287575
45	NC_015682	GAA	2	6	1685	1690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287575
46	NC_015682	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
47	NC_015682	A	7	7	1744	1750	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
48	NC_015682	T	7	7	1757	1763	0 %	100 %	0 %	0 %	337287575
49	NC_015682	TCC	2	6	1765	1770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337287575
50	NC_015682	AGG	2	6	1801	1806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287575
51	NC_015682	AGG	2	6	1825	1830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287575
52	NC_015682	AGT	2	6	1882	1887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287575
53	NC_015682	GGA	2	6	1895	1900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287575
54	NC_015682	TTG	2	6	1965	1970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337287575
55	NC_015682	TTCCTC	2	12	2019	2030	0 %	50 %	0 %	50 %	337287575
56	NC_015682	AG	3	6	2063	2068	50 %	0 %	50 %	0 %	337287575
57	NC_015682	GAA	2	6	2069	2074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287575
58	NC_015682	A	6	6	2105	2110	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
59	NC_015682	ACA	2	6	2144	2149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337287575
60	NC_015682	GAAAAA	2	12	2252	2263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	337287575
61	NC_015682	AAG	2	6	2350	2355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287575
62	NC_015682	CTT	2	6	2367	2372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287575
63	NC_015682	A	7	7	2387	2393	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
64	NC_015682	TCT	2	6	2437	2442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287575
65	NC_015682	TGT	2	6	2486	2491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337287575
66	NC_015682	GAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287575
67	NC_015682	GA	4	8	2569	2576	50 %	0 %	50 %	0 %	337287575
68	NC_015682	TA	3	6	2636	2641	50 %	50 %	0 %	0 %	337287575
69	NC_015682	A	6	6	2693	2698	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
70	NC_015682	A	6	6	2702	2707	100 %	0 %	0 %	0 %	337287575
71	NC_015682	TAA	2	6	2784	2789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287576
72	NC_015682	AAAGAT	2	12	2836	2847	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	337287576
73	NC_015682	T	6	6	2898	2903	0 %	100 %	0 %	0 %	337287576
74	NC_015682	ATTG	2	8	2929	2936	25 %	50 %	25 %	0 %	337287576
75	NC_015682	AAAT	2	8	2982	2989	75 %	25 %	0 %	0 %	337287576
76	NC_015682	GAA	2	6	3013	3018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287576
77	NC_015682	GATT	2	8	3036	3043	25 %	50 %	25 %	0 %	337287576
78	NC_015682	TTGTT	2	10	3111	3120	0 %	80 %	20 %	0 %	337287576
79	NC_015682	AGA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287576
80	NC_015682	ATTT	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	337287576
81	NC_015682	G	6	6	3167	3172	0 %	0 %	100 %	0 %	337287576
82	NC_015682	TAA	2	6	3174	3179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287576
83	NC_015682	CAT	2	6	3193	3198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287576
84	NC_015682	GAT	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287576
85	NC_015682	T	7	7	3219	3225	0 %	100 %	0 %	0 %	337287576
86	NC_015682	CT	3	6	3250	3255	0 %	50 %	0 %	50 %	337287576
87	NC_015682	TTC	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287576
88	NC_015682	TAT	2	6	3297	3302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287576
89	NC_015682	AGAAA	2	10	3406	3415	80 %	0 %	20 %	0 %	337287576
90	NC_015682	GTA	2	6	3622	3627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287577
91	NC_015682	CGTA	2	8	3641	3648	25 %	25 %	25 %	25 %	337287577
92	NC_015682	G	6	6	3668	3673	0 %	0 %	100 %	0 %	337287577
93	NC_015682	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337287577
94	NC_015682	AAG	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287577
95	NC_015682	T	7	7	3757	3763	0 %	100 %	0 %	0 %	337287577
96	NC_015682	TTAC	2	8	3809	3816	25 %	50 %	0 %	25 %	337287577
97	NC_015682	GTA	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287577
98	NC_015682	AGA	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287577
99	NC_015682	TAT	2	6	3981	3986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287577
100	NC_015682	GAA	2	6	3995	4000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287577
101	NC_015682	AAAT	2	8	4014	4021	75 %	25 %	0 %	0 %	337287577
102	NC_015682	T	6	6	4053	4058	0 %	100 %	0 %	0 %	337287577
103	NC_015682	TAA	2	6	4156	4161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287577
104	NC_015682	CTAT	2	8	4303	4310	25 %	50 %	0 %	25 %	337287578
105	NC_015682	ATC	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287578
106	NC_015682	TTA	2	6	4353	4358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287578
107	NC_015682	ATTTA	2	10	4399	4408	40 %	60 %	0 %	0 %	337287578
108	NC_015682	CTTT	2	8	4412	4419	0 %	75 %	0 %	25 %	337287578
109	NC_015682	T	7	7	4433	4439	0 %	100 %	0 %	0 %	337287578
110	NC_015682	T	7	7	4451	4457	0 %	100 %	0 %	0 %	337287578
111	NC_015682	ATT	2	6	4460	4465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287578
112	NC_015682	TAAT	2	8	4524	4531	50 %	50 %	0 %	0 %	337287578
113	NC_015682	TAAA	2	8	4536	4543	75 %	25 %	0 %	0 %	337287578
114	NC_015682	TTG	2	6	4593	4598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337287578
115	NC_015682	GA	3	6	4621	4626	50 %	0 %	50 %	0 %	337287578
116	NC_015682	A	6	6	4626	4631	100 %	0 %	0 %	0 %	337287578
117	NC_015682	TCC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337287578
118	NC_015682	TAT	2	6	4654	4659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287578
119	NC_015682	TTTTA	2	10	4696	4705	20 %	80 %	0 %	0 %	337287578
120	NC_015682	T	6	6	4805	4810	0 %	100 %	0 %	0 %	337287578
121	NC_015682	GAGG	2	8	4868	4875	25 %	0 %	75 %	0 %	337287578
122	NC_015682	AGA	2	6	4891	4896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287578
123	NC_015682	TAC	2	6	4912	4917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337287578
124	NC_015682	TAA	2	6	4933	4938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287578
125	NC_015682	ATT	2	6	4946	4951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337287578
126	NC_015682	CTT	2	6	4968	4973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287578
127	NC_015682	TTC	2	6	4992	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287578
128	NC_015682	AAG	2	6	5088	5093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287578
129	NC_015682	AGG	2	6	5110	5115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337287578
130	NC_015682	AGT	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287578
131	NC_015682	AGAT	2	8	5206	5213	50 %	25 %	25 %	0 %	337287578
132	NC_015682	AAAATT	2	12	5313	5324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337287578
133	NC_015682	TAATAT	2	12	5374	5385	50 %	50 %	0 %	0 %	337287579
134	NC_015682	AAG	2	6	5566	5571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337287579
135	NC_015682	GAAAT	2	10	5598	5607	60 %	20 %	20 %	0 %	337287579
136	NC_015682	ATG	2	6	5616	5621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337287579
137	NC_015682	CTT	2	6	5640	5645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337287579
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139	NC_015682	AAAT	2	8	5673	5680	75 %	25 %	0 %	0 %	337287579
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