MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermodesulfatator indicus DSM 15286 chromosome

Total Repeats: 43508

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5502	NC_015681	GCT	2	6	296378	296383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285650
5503	NC_015681	ACC	2	6	296409	296414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285650
5504	NC_015681	TTC	2	6	296462	296467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285650
5505	NC_015681	GGT	2	6	296486	296491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285650
5506	NC_015681	CTT	2	6	296509	296514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285650
5507	NC_015681	TCT	2	6	296544	296549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285650
5508	NC_015681	AAG	2	6	296768	296773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285651
5509	NC_015681	CTG	2	6	296782	296787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285651
5510	NC_015681	TAG	3	9	296815	296823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285651
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5512	NC_015681	AT	3	6	296841	296846	50 %	50 %	0 %	0 %	337285651
5513	NC_015681	A	6	6	296888	296893	100 %	0 %	0 %	0 %	337285651
5514	NC_015681	TCT	2	6	296914	296919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285651
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5516	NC_015681	TACC	2	8	296938	296945	25 %	25 %	0 %	50 %	337285651
5517	NC_015681	CAT	2	6	297104	297109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285651
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5519	NC_015681	TCA	2	6	297348	297353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285651
5520	NC_015681	CTT	2	6	297391	297396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285651
5521	NC_015681	T	6	6	297447	297452	0 %	100 %	0 %	0 %	337285651
5522	NC_015681	TAC	2	6	297493	297498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285652
5523	NC_015681	GCT	2	6	297525	297530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285652
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5527	NC_015681	GCT	2	6	297648	297653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285652
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5529	NC_015681	TGG	2	6	297674	297679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285652
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5532	NC_015681	TTCC	2	8	297742	297749	0 %	50 %	0 %	50 %	337285652
5533	NC_015681	AGG	2	6	297827	297832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337285652
5534	NC_015681	GAAGCT	2	12	297856	297867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	337285652
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5537	NC_015681	TAC	2	6	297895	297900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285652
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5539	NC_015681	ACCTT	2	10	297985	297994	20 %	40 %	0 %	40 %	337285653
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5542	NC_015681	AAT	2	6	298302	298307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285653
5543	NC_015681	T	6	6	298307	298312	0 %	100 %	0 %	0 %	337285653
5544	NC_015681	GGC	2	6	298315	298320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	337285653
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5548	NC_015681	ACAA	2	8	298505	298512	75 %	0 %	0 %	25 %	337285654
5549	NC_015681	AAC	2	6	298522	298527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285654
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5557	NC_015681	GT	3	6	298866	298871	0 %	50 %	50 %	0 %	337285655
5558	NC_015681	T	7	7	298892	298898	0 %	100 %	0 %	0 %	337285655
5559	NC_015681	TAG	2	6	298933	298938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337285655
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5563	NC_015681	TAAAA	2	10	299205	299214	80 %	20 %	0 %	0 %	337285656
5564	NC_015681	GCC	2	6	299247	299252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337285656
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5578	NC_015681	TA	3	6	299605	299610	50 %	50 %	0 %	0 %	337285656
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5589	NC_015681	A	6	6	300936	300941	100 %	0 %	0 %	0 %	337285657
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5617	NC_015681	AT	3	6	302729	302734	50 %	50 %	0 %	0 %	337285658
5618	NC_015681	AGTTCA	2	12	302761	302772	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	337285658
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5622	NC_015681	ATC	2	6	302877	302882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285658
5623	NC_015681	CAA	2	6	302886	302891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337285658
5624	NC_015681	ACC	2	6	302908	302913	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285658
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5631	NC_015681	TAC	2	6	303246	303251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337285658
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5642	NC_015681	CGT	2	6	303902	303907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285658
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5650	NC_015681	CTT	3	9	304458	304466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285659
5651	NC_015681	AAG	2	6	304520	304525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285659
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5725	NC_015681	AT	3	6	309281	309286	50 %	50 %	0 %	0 %	337285663
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5729	NC_015681	ATA	2	6	309455	309460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285663
5730	NC_015681	TA	3	6	309493	309498	50 %	50 %	0 %	0 %	337285663
5731	NC_015681	ATA	2	6	309512	309517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337285663
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5735	NC_015681	GAAT	2	8	309793	309800	50 %	25 %	25 %	0 %	337285664
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5740	NC_015681	CGTC	2	8	309943	309950	0 %	25 %	25 %	50 %	337285664
5741	NC_015681	ACC	2	6	309958	309963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285664
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5990	NC_015681	TTC	2	6	323426	323431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285678
5991	NC_015681	CTG	2	6	323479	323484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337285678
5992	NC_015681	GTG	2	6	323556	323561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337285678
5993	NC_015681	ACC	2	6	323567	323572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337285678
5994	NC_015681	TAT	2	6	323624	323629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337285678
5995	NC_015681	TCT	2	6	323652	323657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285678
5996	NC_015681	GTCT	2	8	323708	323715	0 %	50 %	25 %	25 %	337285678
5997	NC_015681	AAG	2	6	323735	323740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285678
5998	NC_015681	AGA	2	6	323789	323794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337285678
5999	NC_015681	TTC	2	6	323843	323848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337285678
6000	NC_015681	GCCA	2	8	323888	323895	25 %	0 %	25 %	50 %	337285678

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