MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 71411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_015578	CCCT	2	8	552615	552622	0 %	25 %	0 %	75 %	333996951
10003	NC_015578	CAT	2	6	552704	552709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996951
10004	NC_015578	GCC	2	6	552721	552726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
10005	NC_015578	CAT	2	6	552728	552733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996951
10006	NC_015578	CGC	2	6	552743	552748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
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10008	NC_015578	GGA	2	6	552759	552764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996951
10009	NC_015578	C	6	6	552774	552779	0 %	0 %	0 %	100 %	333996951
10010	NC_015578	GCC	2	6	552798	552803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
10011	NC_015578	TTC	2	6	552813	552818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996951
10012	NC_015578	CTC	2	6	552869	552874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996951
10013	NC_015578	GGC	2	6	552882	552887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996951
10014	NC_015578	CGC	2	6	552926	552931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
10015	NC_015578	CCG	2	6	552949	552954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
10016	NC_015578	GCC	2	6	552987	552992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996951
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10018	NC_015578	TCC	2	6	553092	553097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996951
10019	NC_015578	GCCGTT	2	12	553119	553130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996951
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10021	NC_015578	C	6	6	553250	553255	0 %	0 %	0 %	100 %	333996951
10022	NC_015578	CGG	2	6	553266	553271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996951
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10026	NC_015578	TCAT	2	8	553474	553481	25 %	50 %	0 %	25 %	333996951
10027	NC_015578	TA	3	6	554027	554032	50 %	50 %	0 %	0 %	333996952
10028	NC_015578	GCA	2	6	554076	554081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996952
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10033	NC_015578	A	6	6	554308	554313	100 %	0 %	0 %	0 %	333996952
10034	NC_015578	TTG	2	6	554319	554324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996952
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10040	NC_015578	GGTC	2	8	554908	554915	0 %	25 %	50 %	25 %	333996953
10041	NC_015578	TTCCGC	2	12	554936	554947	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	333996953
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10052	NC_015578	GCT	2	6	555943	555948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996954
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10055	NC_015578	TG	3	6	556319	556324	0 %	50 %	50 %	0 %	333996955
10056	NC_015578	CGC	2	6	556448	556453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996955
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10060	NC_015578	TGG	2	6	556543	556548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996955
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10088	NC_015578	CCG	2	6	557722	557727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996955
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10103	NC_015578	GCG	3	9	558268	558276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996955
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10120	NC_015578	CAT	2	6	559250	559255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996955
10121	NC_015578	AGA	2	6	559273	559278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996955
10122	NC_015578	TGC	2	6	559417	559422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996955
10123	NC_015578	TG	3	6	559557	559562	0 %	50 %	50 %	0 %	333996955
10124	NC_015578	GGC	2	6	559581	559586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996955
10125	NC_015578	TTC	3	9	559596	559604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996955
10126	NC_015578	CCT	2	6	559634	559639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996955
10127	NC_015578	CAC	2	6	559652	559657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996955
10128	NC_015578	TAT	2	6	559680	559685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996955
10129	NC_015578	TAC	2	6	559689	559694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996955
10130	NC_015578	GTG	2	6	559728	559733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996955
10131	NC_015578	GCGGTG	2	12	559851	559862	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	333996955
10132	NC_015578	CAA	2	6	559934	559939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996955
10133	NC_015578	GTT	2	6	560001	560006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996955
10134	NC_015578	GAC	2	6	560052	560057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996955
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10136	NC_015578	GTA	2	6	560103	560108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996955
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10139	NC_015578	GAG	2	6	560247	560252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996955
10140	NC_015578	TGG	2	6	560253	560258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996955
10141	NC_015578	AGA	3	9	560272	560280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996955
10142	NC_015578	C	6	6	560320	560325	0 %	0 %	0 %	100 %	333996955
10143	NC_015578	TTC	2	6	560399	560404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996955
10144	NC_015578	GCG	2	6	560415	560420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996955
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10148	NC_015578	CCT	2	6	560558	560563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996955
10149	NC_015578	GCA	2	6	560623	560628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996955
10150	NC_015578	TGG	2	6	560644	560649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996955
10151	NC_015578	CAA	2	6	560666	560671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996955
10152	NC_015578	ACG	2	6	560698	560703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996955
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10155	NC_015578	GAC	2	6	560960	560965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996956
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10157	NC_015578	GCG	2	6	560985	560990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996956
10158	NC_015578	CA	3	6	561057	561062	50 %	0 %	0 %	50 %	333996956
10159	NC_015578	GGT	2	6	561065	561070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996956
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10195	NC_015578	CTG	2	6	562252	562257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996956
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10210	NC_015578	GCA	2	6	562832	562837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996957
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10215	NC_015578	CCGC	2	8	562950	562957	0 %	0 %	25 %	75 %	333996957
10216	NC_015578	AGGGTG	2	12	562961	562972	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	333996957
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10218	NC_015578	GCT	2	6	563390	563395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996957
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10220	NC_015578	AAAG	2	8	563538	563545	75 %	0 %	25 %	0 %	333996958
10221	NC_015578	TGG	2	6	563571	563576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996958
10222	NC_015578	CT	3	6	563617	563622	0 %	50 %	0 %	50 %	333996958
10223	NC_015578	TGG	3	9	563648	563656	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996958
10224	NC_015578	C	6	6	563706	563711	0 %	0 %	0 %	100 %	333996958
10225	NC_015578	GAT	2	6	563715	563720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996958
10226	NC_015578	CGGG	2	8	563839	563846	0 %	0 %	75 %	25 %	333996958
10227	NC_015578	GCT	2	6	563874	563879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996958
10228	NC_015578	GGA	2	6	563880	563885	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996958
10229	NC_015578	G	6	6	563893	563898	0 %	0 %	100 %	0 %	333996958
10230	NC_015578	ATA	2	6	563965	563970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996958
10231	NC_015578	T	7	7	564024	564030	0 %	100 %	0 %	0 %	333996958
10232	NC_015578	ATT	2	6	564050	564055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996958
10233	NC_015578	G	6	6	564067	564072	0 %	0 %	100 %	0 %	333996958
10234	NC_015578	C	6	6	564158	564163	0 %	0 %	0 %	100 %	333996958
10235	NC_015578	AAG	2	6	564232	564237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996958
10236	NC_015578	GGC	2	6	564246	564251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996958
10237	NC_015578	GCAG	2	8	564327	564334	25 %	0 %	50 %	25 %	333996958
10238	NC_015578	AGC	2	6	564357	564362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996958
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