MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema primitia ZAS-2 chromosome

Total Repeats: 71411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015578	GAA	2	6	355	360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
2	NC_015578	AT	3	6	521	526	50 %	50 %	0 %	0 %	333996463
3	NC_015578	TAT	2	6	537	542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996463
4	NC_015578	TCCTG	2	10	564	573	0 %	40 %	20 %	40 %	333996463
5	NC_015578	A	6	6	694	699	100 %	0 %	0 %	0 %	333996463
6	NC_015578	GGA	2	6	717	722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996463
7	NC_015578	CGA	2	6	750	755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996463
8	NC_015578	CAA	2	6	756	761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333996463
9	NC_015578	GCC	2	6	766	771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996463
10	NC_015578	GCC	2	6	775	780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996463
11	NC_015578	A	6	6	792	797	100 %	0 %	0 %	0 %	333996463
12	NC_015578	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
13	NC_015578	ATC	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996463
14	NC_015578	ATGA	2	8	934	941	50 %	25 %	25 %	0 %	333996463
15	NC_015578	GAA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
16	NC_015578	A	6	6	1099	1104	100 %	0 %	0 %	0 %	333996463
17	NC_015578	TGAC	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	333996463
18	NC_015578	AAG	2	6	1240	1245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
19	NC_015578	GTAA	2	8	1291	1298	50 %	25 %	25 %	0 %	333996463
20	NC_015578	AT	3	6	1301	1306	50 %	50 %	0 %	0 %	333996463
21	NC_015578	CCA	2	6	1307	1312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996463
22	NC_015578	GACCCT	2	12	1374	1385	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	333996463
23	NC_015578	CAG	3	9	1396	1404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996463
24	NC_015578	ATA	2	6	1453	1458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
25	NC_015578	GAA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
26	NC_015578	A	6	6	1512	1517	100 %	0 %	0 %	0 %	333996463
27	NC_015578	TA	3	6	1555	1560	50 %	50 %	0 %	0 %	333996463
28	NC_015578	CTGA	2	8	1570	1577	25 %	25 %	25 %	25 %	333996463
29	NC_015578	A	6	6	1646	1651	100 %	0 %	0 %	0 %	333996463
30	NC_015578	AGA	2	6	1653	1658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996463
31	NC_015578	TAA	2	6	1738	1743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996463
32	NC_015578	ATT	2	6	1773	1778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996464
33	NC_015578	TTTAT	2	10	1844	1853	20 %	80 %	0 %	0 %	333996464
34	NC_015578	CTA	2	6	1890	1895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996464
35	NC_015578	TAC	2	6	1897	1902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996464
36	NC_015578	TA	5	10	1911	1920	50 %	50 %	0 %	0 %	333996464
37	NC_015578	TCC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996465
38	NC_015578	ATC	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996465
39	NC_015578	GA	3	6	2149	2154	50 %	0 %	50 %	0 %	333996465
40	NC_015578	ATC	2	6	2220	2225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333996465
41	NC_015578	ATA	2	6	2305	2310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333996465
42	NC_015578	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
43	NC_015578	GAT	2	6	2348	2353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
44	NC_015578	CAG	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996465
45	NC_015578	TGA	3	9	2378	2386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996465
46	NC_015578	T	6	6	2412	2417	0 %	100 %	0 %	0 %	333996465
47	NC_015578	GATAA	2	10	2595	2604	60 %	20 %	20 %	0 %	333996465
48	NC_015578	TTC	2	6	2633	2638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
49	NC_015578	CGG	2	6	2772	2777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996465
50	NC_015578	TTC	2	6	2813	2818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
51	NC_015578	GGA	2	6	2873	2878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996465
52	NC_015578	CTT	2	6	3005	3010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996465
53	NC_015578	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996466
54	NC_015578	T	6	6	3178	3183	0 %	100 %	0 %	0 %	333996466
55	NC_015578	CTT	2	6	3213	3218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996466
56	NC_015578	GCA	2	6	3272	3277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996466
57	NC_015578	A	7	7	3331	3337	100 %	0 %	0 %	0 %	333996466
58	NC_015578	GGA	2	6	3364	3369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996466
59	NC_015578	TCT	2	6	3379	3384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996466
60	NC_015578	TTG	2	6	3429	3434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996466
61	NC_015578	CGG	2	6	3449	3454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
62	NC_015578	T	6	6	3461	3466	0 %	100 %	0 %	0 %	333996466
63	NC_015578	A	6	6	3648	3653	100 %	0 %	0 %	0 %	333996466
64	NC_015578	TCCT	2	8	3742	3749	0 %	50 %	0 %	50 %	333996466
65	NC_015578	GGA	2	6	3793	3798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996466
66	NC_015578	CGG	2	6	3800	3805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
67	NC_015578	GCGCCG	2	12	3870	3881	0 %	0 %	50 %	50 %	333996466
68	NC_015578	GCG	2	6	3910	3915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
69	NC_015578	CGC	2	6	3950	3955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996466
70	NC_015578	TGC	2	6	3984	3989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996466
71	NC_015578	GAC	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996466
72	NC_015578	GCG	3	9	4027	4035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996466
73	NC_015578	CCT	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996466
74	NC_015578	TAT	2	6	4130	4135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996466
75	NC_015578	CTT	2	6	4189	4194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333996467
76	NC_015578	T	6	6	4201	4206	0 %	100 %	0 %	0 %	333996467
77	NC_015578	TCC	2	6	4252	4257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333996467
78	NC_015578	ACC	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333996467
79	NC_015578	GCC	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996467
80	NC_015578	GAACA	2	10	4414	4423	60 %	0 %	20 %	20 %	333996467
81	NC_015578	GCC	2	6	4455	4460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996467
82	NC_015578	GGGCC	2	10	4462	4471	0 %	0 %	60 %	40 %	333996467
83	NC_015578	GGA	2	6	4569	4574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996467
84	NC_015578	CGG	2	6	4653	4658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996467
85	NC_015578	CGA	2	6	4680	4685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996467
86	NC_015578	GAA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996467
87	NC_015578	ATT	2	6	4723	4728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996467
88	NC_015578	A	6	6	4748	4753	100 %	0 %	0 %	0 %	333996467
89	NC_015578	GAA	2	6	4758	4763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996468
90	NC_015578	TGTTGG	2	12	4790	4801	0 %	50 %	50 %	0 %	333996468
91	NC_015578	TAT	2	6	4809	4814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996468
92	NC_015578	TAAAGA	2	12	5094	5105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	333996468
93	NC_015578	A	7	7	5208	5214	100 %	0 %	0 %	0 %	333996468
94	NC_015578	TGA	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996468
95	NC_015578	AGC	2	6	5461	5466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996468
96	NC_015578	GCC	2	6	5482	5487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996468
97	NC_015578	AAAT	2	8	5489	5496	75 %	25 %	0 %	0 %	333996468
98	NC_015578	GCT	2	6	5533	5538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996468
99	NC_015578	GCAG	2	8	5598	5605	25 %	0 %	50 %	25 %	333996468
100	NC_015578	TGAT	2	8	5681	5688	25 %	50 %	25 %	0 %	333996468
101	NC_015578	TGT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996468
102	NC_015578	ATT	2	6	5716	5721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333996468
103	NC_015578	TGAT	2	8	5765	5772	25 %	50 %	25 %	0 %	333996468
104	NC_015578	AGC	2	6	5777	5782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996468
105	NC_015578	CTG	2	6	5862	5867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996468
106	NC_015578	GGC	2	6	5872	5877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996468
107	NC_015578	GAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996468
108	NC_015578	TTCTCC	2	12	6082	6093	0 %	50 %	0 %	50 %	333996469
109	NC_015578	T	6	6	6123	6128	0 %	100 %	0 %	0 %	333996469
110	NC_015578	CCG	2	6	6182	6187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996469
111	NC_015578	TA	3	6	6321	6326	50 %	50 %	0 %	0 %	333996469
112	NC_015578	AGC	2	6	6376	6381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996469
113	NC_015578	AGG	2	6	6415	6420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333996469
114	NC_015578	AGA	2	6	6511	6516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333996469
115	NC_015578	TGG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996469
116	NC_015578	ATGG	2	8	6606	6613	25 %	25 %	50 %	0 %	333996469
117	NC_015578	GTC	2	6	6633	6638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996469
118	NC_015578	TGT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333996469
119	NC_015578	GAT	3	9	6657	6665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996469
120	NC_015578	T	7	7	6707	6713	0 %	100 %	0 %	0 %	333996469
121	NC_015578	T	6	6	6818	6823	0 %	100 %	0 %	0 %	333996470
122	NC_015578	CAG	2	6	6912	6917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
123	NC_015578	C	6	6	6972	6977	0 %	0 %	0 %	100 %	333996470
124	NC_015578	G	7	7	6980	6986	0 %	0 %	100 %	0 %	333996470
125	NC_015578	CAG	2	6	7032	7037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
126	NC_015578	TGG	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333996470
127	NC_015578	GCC	2	6	7263	7268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	333996470
128	NC_015578	G	7	7	7421	7427	0 %	0 %	100 %	0 %	333996470
129	NC_015578	GTCCAG	2	12	7437	7448	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	333996470
130	NC_015578	T	6	6	7566	7571	0 %	100 %	0 %	0 %	333996470
131	NC_015578	GCA	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333996470
132	NC_015578	GAT	2	6	7650	7655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996470
133	NC_015578	G	6	6	7800	7805	0 %	0 %	100 %	0 %	333996471
134	NC_015578	CTG	2	6	7924	7929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996471
135	NC_015578	TGA	2	6	7958	7963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333996471
136	NC_015578	GATAA	2	10	8017	8026	60 %	20 %	20 %	0 %	333996471
137	NC_015578	T	7	7	8123	8129	0 %	100 %	0 %	0 %	333996471
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143	NC_015578	CTG	2	6	8377	8382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333996471
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259	NC_015578	AT	3	6	14441	14446	50 %	50 %	0 %	0 %	333996476
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265	NC_015578	GGC	2	6	14972	14977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996476
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268	NC_015578	A	6	6	15006	15011	100 %	0 %	0 %	0 %	333996476
269	NC_015578	GAAGC	2	10	15025	15034	40 %	0 %	40 %	20 %	333996476
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288	NC_015578	TCCC	2	8	16187	16194	0 %	25 %	0 %	75 %	333996477
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393	NC_015578	CGG	2	6	21989	21994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333996484
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