MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 50453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015555	GAA	3	9	161847	161855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3002	NC_015555	AAG	2	6	161897	161902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3003	NC_015555	AGTTG	2	10	161945	161954	20 %	40 %	40 %	0 %	333896011
3004	NC_015555	AG	3	6	161964	161969	50 %	0 %	50 %	0 %	333896011
3005	NC_015555	TAAAA	2	10	162041	162050	80 %	20 %	0 %	0 %	333896011
3006	NC_015555	GCAGA	2	10	162064	162073	40 %	0 %	40 %	20 %	333896011
3007	NC_015555	AAG	2	6	162081	162086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3008	NC_015555	TGA	2	6	162092	162097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896011
3009	NC_015555	CTT	2	6	162155	162160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896011
3010	NC_015555	ATT	2	6	162187	162192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896011
3011	NC_015555	TGA	2	6	162194	162199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896011
3012	NC_015555	GAAA	2	8	162233	162240	75 %	0 %	25 %	0 %	333896011
3013	NC_015555	ATG	2	6	162337	162342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896011
3014	NC_015555	TGA	2	6	162401	162406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896011
3015	NC_015555	AG	4	8	162545	162552	50 %	0 %	50 %	0 %	333896011
3016	NC_015555	ATT	2	6	162557	162562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896011
3017	NC_015555	GT	3	6	162637	162642	0 %	50 %	50 %	0 %	333896011
3018	NC_015555	AT	3	6	162645	162650	50 %	50 %	0 %	0 %	333896011
3019	NC_015555	TAA	2	6	162700	162705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3020	NC_015555	GTTAAA	2	12	162750	162761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	333896011
3021	NC_015555	GAT	2	6	162909	162914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896011
3022	NC_015555	GCA	2	6	163000	163005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896011
3023	NC_015555	A	6	6	163035	163040	100 %	0 %	0 %	0 %	333896011
3024	NC_015555	GAA	2	6	163143	163148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3025	NC_015555	AGA	2	6	163169	163174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3026	NC_015555	AGA	2	6	163190	163195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3027	NC_015555	AAAG	2	8	163199	163206	75 %	0 %	25 %	0 %	333896011
3028	NC_015555	T	6	6	163322	163327	0 %	100 %	0 %	0 %	333896011
3029	NC_015555	ACG	2	6	163335	163340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896011
3030	NC_015555	AAT	2	6	163362	163367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3031	NC_015555	CAA	2	6	163427	163432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896011
3032	NC_015555	AAT	2	6	163445	163450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3033	NC_015555	TGG	2	6	163483	163488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896011
3034	NC_015555	AC	3	6	163491	163496	50 %	0 %	0 %	50 %	333896011
3035	NC_015555	A	6	6	163590	163595	100 %	0 %	0 %	0 %	333896011
3036	NC_015555	TAT	2	6	163615	163620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896011
3037	NC_015555	TCC	2	6	163697	163702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333896011
3038	NC_015555	AGA	2	6	163703	163708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3039	NC_015555	GGA	2	6	163788	163793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896011
3040	NC_015555	ACA	2	6	163810	163815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896011
3041	NC_015555	GATG	2	8	163895	163902	25 %	25 %	50 %	0 %	333896011
3042	NC_015555	GT	3	6	163959	163964	0 %	50 %	50 %	0 %	333896011
3043	NC_015555	AAT	2	6	163970	163975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3044	NC_015555	ATA	2	6	164010	164015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3045	NC_015555	TTAC	2	8	164104	164111	25 %	50 %	0 %	25 %	333896011
3046	NC_015555	GA	3	6	164204	164209	50 %	0 %	50 %	0 %	333896011
3047	NC_015555	GAA	2	6	164334	164339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896011
3048	NC_015555	TA	3	6	164379	164384	50 %	50 %	0 %	0 %	333896011
3049	NC_015555	TCT	2	6	164439	164444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896011
3050	NC_015555	CGAAAA	2	12	164447	164458	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896011
3051	NC_015555	AAT	2	6	164678	164683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896011
3052	NC_015555	TAC	2	6	164892	164897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896012
3053	NC_015555	CTT	2	6	164903	164908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896012
3054	NC_015555	TTG	2	6	164927	164932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896012
3055	NC_015555	AAG	2	6	165122	165127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896012
3056	NC_015555	GTT	2	6	165331	165336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896012
3057	NC_015555	AGCC	2	8	165339	165346	25 %	0 %	25 %	50 %	333896012
3058	NC_015555	AT	3	6	165347	165352	50 %	50 %	0 %	0 %	333896012
3059	NC_015555	GATA	2	8	165438	165445	50 %	25 %	25 %	0 %	333896012
3060	NC_015555	TGC	2	6	165516	165521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896012
3061	NC_015555	ATA	2	6	165580	165585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896012
3062	NC_015555	TGA	2	6	165615	165620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896012
3063	NC_015555	AGC	2	6	165628	165633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896012
3064	NC_015555	ATA	2	6	165634	165639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896012
3065	NC_015555	ACA	2	6	165653	165658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896012
3066	NC_015555	AAAG	2	8	165696	165703	75 %	0 %	25 %	0 %	333896012
3067	NC_015555	AGA	2	6	165869	165874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896013
3068	NC_015555	AAG	2	6	165913	165918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896013
3069	NC_015555	ATA	2	6	165977	165982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896013
3070	NC_015555	AAG	2	6	165986	165991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896013
3071	NC_015555	AT	3	6	166043	166048	50 %	50 %	0 %	0 %	333896013
3072	NC_015555	CAA	2	6	166053	166058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896013
3073	NC_015555	AAC	2	6	166059	166064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896013
3074	NC_015555	A	6	6	166115	166120	100 %	0 %	0 %	0 %	333896013
3075	NC_015555	ATTG	2	8	166123	166130	25 %	50 %	25 %	0 %	333896013
3076	NC_015555	GGA	2	6	166165	166170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896013
3077	NC_015555	ATT	2	6	166268	166273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896013
3078	NC_015555	TAA	2	6	166299	166304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896013
3079	NC_015555	GA	3	6	166312	166317	50 %	0 %	50 %	0 %	333896013
3080	NC_015555	GCG	2	6	166320	166325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333896013
3081	NC_015555	CTG	2	6	166362	166367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896013
3082	NC_015555	GAA	2	6	166391	166396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896013
3083	NC_015555	AT	3	6	166399	166404	50 %	50 %	0 %	0 %	333896013
3084	NC_015555	TAG	2	6	166494	166499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896014
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3086	NC_015555	GAT	2	6	166619	166624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896014
3087	NC_015555	A	6	6	166676	166681	100 %	0 %	0 %	0 %	333896014
3088	NC_015555	TCAA	2	8	166708	166715	50 %	25 %	0 %	25 %	333896014
3089	NC_015555	AAG	2	6	166835	166840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896014
3090	NC_015555	ATA	2	6	166847	166852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896014
3091	NC_015555	TAG	2	6	166866	166871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896014
3092	NC_015555	AGC	2	6	166881	166886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896014
3093	NC_015555	GTG	2	6	166895	166900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896014
3094	NC_015555	TAAA	2	8	166908	166915	75 %	25 %	0 %	0 %	333896014
3095	NC_015555	AT	3	6	166926	166931	50 %	50 %	0 %	0 %	333896014
3096	NC_015555	ATG	2	6	166947	166952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896014
3097	NC_015555	AAC	2	6	166985	166990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896014
3098	NC_015555	A	7	7	167023	167029	100 %	0 %	0 %	0 %	333896014
3099	NC_015555	GAT	2	6	167054	167059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896014
3100	NC_015555	ATC	2	6	167107	167112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896014
3101	NC_015555	GT	3	6	167174	167179	0 %	50 %	50 %	0 %	333896014
3102	NC_015555	GAA	2	6	167222	167227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896014
3103	NC_015555	AAG	2	6	167549	167554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896015
3104	NC_015555	GGT	2	6	167597	167602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896015
3105	NC_015555	AGAA	2	8	167603	167610	75 %	0 %	25 %	0 %	333896015
3106	NC_015555	AAT	2	6	167614	167619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896015
3107	NC_015555	A	6	6	167637	167642	100 %	0 %	0 %	0 %	333896015
3108	NC_015555	TAT	2	6	167659	167664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896015
3109	NC_015555	AAC	2	6	167683	167688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896015
3110	NC_015555	A	7	7	167897	167903	100 %	0 %	0 %	0 %	333896016
3111	NC_015555	AGG	2	6	167950	167955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333896016
3112	NC_015555	TAA	2	6	168048	168053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896016
3113	NC_015555	ATG	2	6	168054	168059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896016
3114	NC_015555	TTG	2	6	168060	168065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896016
3115	NC_015555	ATA	2	6	168110	168115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896016
3116	NC_015555	GACAAA	2	12	168125	168136	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	333896016
3117	NC_015555	A	6	6	168134	168139	100 %	0 %	0 %	0 %	333896016
3118	NC_015555	T	6	6	168175	168180	0 %	100 %	0 %	0 %	333896016
3119	NC_015555	AATG	2	8	168268	168275	50 %	25 %	25 %	0 %	333896016
3120	NC_015555	AAAAG	2	10	168313	168322	80 %	0 %	20 %	0 %	333896016
3121	NC_015555	AAG	2	6	168324	168329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896016
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3123	NC_015555	ATA	2	6	168533	168538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896016
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3243	NC_015555	CTAC	2	8	174342	174349	25 %	25 %	0 %	50 %	333896022
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3245	NC_015555	A	8	8	174412	174419	100 %	0 %	0 %	0 %	333896022
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3486	NC_015555	AAAGAG	2	12	186716	186727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896033
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3492	NC_015555	TAAA	2	8	187049	187056	75 %	25 %	0 %	0 %	333896034
3493	NC_015555	GAT	2	6	187143	187148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896034
3494	NC_015555	GGT	3	9	187191	187199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896034
3495	NC_015555	GAT	2	6	187207	187212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896034
3496	NC_015555	TTC	2	6	187249	187254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896034
3497	NC_015555	GAA	2	6	187258	187263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896034
3498	NC_015555	A	6	6	187270	187275	100 %	0 %	0 %	0 %	333896034
3499	NC_015555	AGA	2	6	187305	187310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896034
3500	NC_015555	GGT	2	6	187423	187428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896034

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