MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoanaerobacterium xylanolyticum LX-11 chromosome

Total Repeats: 50453

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015555	GAT	2	6	267275	267280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896105
5003	NC_015555	TAT	2	6	267311	267316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333896105
5004	NC_015555	AAG	2	6	267382	267387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896106
5005	NC_015555	AAG	2	6	267424	267429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896106
5006	NC_015555	TAG	2	6	267457	267462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896106
5007	NC_015555	A	6	6	267485	267490	100 %	0 %	0 %	0 %	333896106
5008	NC_015555	ATG	2	6	267507	267512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896106
5009	NC_015555	TGC	2	6	267589	267594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896106
5010	NC_015555	A	6	6	267616	267621	100 %	0 %	0 %	0 %	333896106
5011	NC_015555	ATG	2	6	267676	267681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896106
5012	NC_015555	AGA	2	6	267701	267706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896106
5013	NC_015555	A	6	6	267723	267728	100 %	0 %	0 %	0 %	333896106
5014	NC_015555	ATG	2	6	267893	267898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896107
5015	NC_015555	A	7	7	267930	267936	100 %	0 %	0 %	0 %	333896107
5016	NC_015555	TTGT	2	8	267979	267986	0 %	75 %	25 %	0 %	333896107
5017	NC_015555	TGA	2	6	268017	268022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896107
5018	NC_015555	CAATG	2	10	268047	268056	40 %	20 %	20 %	20 %	333896107
5019	NC_015555	CAC	2	6	268057	268062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333896107
5020	NC_015555	TGA	2	6	268086	268091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896107
5021	NC_015555	GGC	2	6	268114	268119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333896107
5022	NC_015555	CAT	2	6	268192	268197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896107
5023	NC_015555	GTA	2	6	268222	268227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896107
5024	NC_015555	AAAT	2	8	268303	268310	75 %	25 %	0 %	0 %	333896107
5025	NC_015555	TTC	2	6	268615	268620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896108
5026	NC_015555	GAA	2	6	268636	268641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896108
5027	NC_015555	AAT	2	6	268736	268741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896108
5028	NC_015555	TC	3	6	268779	268784	0 %	50 %	0 %	50 %	333896108
5029	NC_015555	GTTTTG	2	12	268878	268889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333896108
5030	NC_015555	GCT	2	6	268964	268969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896108
5031	NC_015555	TAG	2	6	268972	268977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896108
5032	NC_015555	GAA	2	6	269124	269129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896108
5033	NC_015555	ATCAT	2	10	269130	269139	40 %	40 %	0 %	20 %	333896108
5034	NC_015555	ATA	2	6	269176	269181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896108
5035	NC_015555	TACT	2	8	269221	269228	25 %	50 %	0 %	25 %	333896108
5036	NC_015555	TGA	2	6	269233	269238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896108
5037	NC_015555	GGT	2	6	269250	269255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896108
5038	NC_015555	A	6	6	269373	269378	100 %	0 %	0 %	0 %	333896108
5039	NC_015555	T	6	6	269406	269411	0 %	100 %	0 %	0 %	333896108
5040	NC_015555	CTG	3	9	269413	269421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333896108
5041	NC_015555	CTT	2	6	269488	269493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896108
5042	NC_015555	A	7	7	269514	269520	100 %	0 %	0 %	0 %	333896108
5043	NC_015555	ATC	2	6	269527	269532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896108
5044	NC_015555	GTG	2	6	269598	269603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896108
5045	NC_015555	CGA	2	6	269636	269641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896108
5046	NC_015555	AT	3	6	269692	269697	50 %	50 %	0 %	0 %	333896108
5047	NC_015555	GAA	2	6	269709	269714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896108
5048	NC_015555	TTTTA	2	10	269772	269781	20 %	80 %	0 %	0 %	333896108
5049	NC_015555	TAG	2	6	269803	269808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896108
5050	NC_015555	GGAA	2	8	269816	269823	50 %	0 %	50 %	0 %	333896108
5051	NC_015555	CAA	2	6	269840	269845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896108
5052	NC_015555	CTT	2	6	269877	269882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896108
5053	NC_015555	GAT	2	6	270039	270044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896108
5054	NC_015555	GAC	2	6	270093	270098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896108
5055	NC_015555	A	7	7	270180	270186	100 %	0 %	0 %	0 %	333896108
5056	NC_015555	ATA	2	6	270253	270258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896108
5057	NC_015555	GGC	2	6	270395	270400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333896108
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5059	NC_015555	ATTCT	2	10	270520	270529	20 %	60 %	0 %	20 %	333896108
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5061	NC_015555	A	6	6	270647	270652	100 %	0 %	0 %	0 %	333896108
5062	NC_015555	GAC	2	6	270755	270760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896108
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5069	NC_015555	CAG	2	6	271076	271081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896109
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5071	NC_015555	GAC	2	6	271138	271143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896109
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5074	NC_015555	TGA	2	6	271295	271300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896109
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5077	NC_015555	TCT	2	6	271467	271472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896109
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5080	NC_015555	ACG	2	6	271804	271809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896110
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5088	NC_015555	GATT	2	8	271999	272006	25 %	50 %	25 %	0 %	333896110
5089	NC_015555	CATA	2	8	272035	272042	50 %	25 %	0 %	25 %	333896110
5090	NC_015555	T	6	6	272089	272094	0 %	100 %	0 %	0 %	333896110
5091	NC_015555	A	6	6	272135	272140	100 %	0 %	0 %	0 %	333896110
5092	NC_015555	GAT	2	6	272181	272186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896110
5093	NC_015555	ATAA	2	8	272418	272425	75 %	25 %	0 %	0 %	333896110
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5096	NC_015555	GATA	2	8	272552	272559	50 %	25 %	25 %	0 %	333896111
5097	NC_015555	CTT	2	6	272649	272654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333896111
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5100	NC_015555	AATA	2	8	272777	272784	75 %	25 %	0 %	0 %	333896111
5101	NC_015555	T	8	8	272790	272797	0 %	100 %	0 %	0 %	333896111
5102	NC_015555	GAA	2	6	272826	272831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
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5105	NC_015555	TGG	2	6	272903	272908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896111
5106	NC_015555	ATTGCC	2	12	272916	272927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	333896111
5107	NC_015555	CAA	2	6	272930	272935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333896111
5108	NC_015555	CAT	2	6	273023	273028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896111
5109	NC_015555	GAA	2	6	273080	273085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5110	NC_015555	AGA	2	6	273098	273103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5111	NC_015555	AGA	2	6	273116	273121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5112	NC_015555	AGA	2	6	273129	273134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5113	NC_015555	GAA	2	6	273168	273173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5114	NC_015555	TGA	3	9	273227	273235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896111
5115	NC_015555	A	6	6	273259	273264	100 %	0 %	0 %	0 %	333896111
5116	NC_015555	A	7	7	273323	273329	100 %	0 %	0 %	0 %	333896111
5117	NC_015555	AGA	2	6	273348	273353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333896111
5118	NC_015555	TAA	2	6	273497	273502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896111
5119	NC_015555	TGG	2	6	273581	273586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333896111
5120	NC_015555	TA	3	6	273598	273603	50 %	50 %	0 %	0 %	333896111
5121	NC_015555	ATA	2	6	273612	273617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333896111
5122	NC_015555	TGATT	2	10	273674	273683	20 %	60 %	20 %	0 %	333896111
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5246	NC_015555	ACG	2	6	280132	280137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896116
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5250	NC_015555	A	6	6	280259	280264	100 %	0 %	0 %	0 %	333896116
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5253	NC_015555	CAT	2	6	280340	280345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333896116
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5343	NC_015555	ATCAC	2	10	285087	285096	40 %	20 %	0 %	40 %	333896121
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5347	NC_015555	ACG	2	6	285421	285426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333896122
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5351	NC_015555	GACA	2	8	285944	285951	50 %	0 %	25 %	25 %	333896123
5352	NC_015555	TGA	2	6	285965	285970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896123
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5497	NC_015555	GAT	2	6	293182	293187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333896130
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