MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Tepidanaerobacter sp. Re1 chromosome

Total Repeats: 50906

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_015519	GTTT	2	8	2320864	2320871	0 %	75 %	25 %	0 %	332800148
43002	NC_015519	T	6	6	2320869	2320874	0 %	100 %	0 %	0 %	332800148
43003	NC_015519	ATA	2	6	2320876	2320881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800148
43004	NC_015519	GCA	2	6	2321197	2321202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800149
43005	NC_015519	TGC	2	6	2321278	2321283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800149
43006	NC_015519	TCGGAT	2	12	2321379	2321390	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	332800149
43007	NC_015519	A	6	6	2321416	2321421	100 %	0 %	0 %	0 %	332800149
43008	NC_015519	TGC	2	6	2321459	2321464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800149
43009	NC_015519	TTA	2	6	2321491	2321496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800149
43010	NC_015519	CTGTG	2	10	2321557	2321566	0 %	40 %	40 %	20 %	332800149
43011	NC_015519	CAA	2	6	2321701	2321706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800149
43012	NC_015519	A	6	6	2321736	2321741	100 %	0 %	0 %	0 %	332800149
43013	NC_015519	CTA	2	6	2321776	2321781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800149
43014	NC_015519	AAGT	2	8	2321831	2321838	50 %	25 %	25 %	0 %	332800149
43015	NC_015519	TGAA	2	8	2321872	2321879	50 %	25 %	25 %	0 %	332800149
43016	NC_015519	AGA	2	6	2321933	2321938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800149
43017	NC_015519	TTTC	2	8	2322030	2322037	0 %	75 %	0 %	25 %	332800150
43018	NC_015519	TGA	2	6	2322079	2322084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800150
43019	NC_015519	T	7	7	2322142	2322148	0 %	100 %	0 %	0 %	332800150
43020	NC_015519	T	6	6	2322285	2322290	0 %	100 %	0 %	0 %	332800150
43021	NC_015519	TTC	2	6	2322355	2322360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800150
43022	NC_015519	TCC	2	6	2322371	2322376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800150
43023	NC_015519	GAA	2	6	2322406	2322411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800150
43024	NC_015519	A	6	6	2322475	2322480	100 %	0 %	0 %	0 %	332800150
43025	NC_015519	TATCTT	2	12	2322489	2322500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332800150
43026	NC_015519	T	7	7	2322513	2322519	0 %	100 %	0 %	0 %	332800150
43027	NC_015519	TTAAA	2	10	2322543	2322552	60 %	40 %	0 %	0 %	332800150
43028	NC_015519	AGC	2	6	2322574	2322579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800150
43029	NC_015519	AAT	2	6	2322594	2322599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800150
43030	NC_015519	CAA	2	6	2322612	2322617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800150
43031	NC_015519	T	6	6	2322627	2322632	0 %	100 %	0 %	0 %	332800150
43032	NC_015519	A	7	7	2322643	2322649	100 %	0 %	0 %	0 %	332800150
43033	NC_015519	T	6	6	2322739	2322744	0 %	100 %	0 %	0 %	332800151
43034	NC_015519	ATA	2	6	2322748	2322753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800151
43035	NC_015519	TCA	2	6	2322791	2322796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800151
43036	NC_015519	TCA	2	6	2322804	2322809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800151
43037	NC_015519	TAG	2	6	2322837	2322842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800151
43038	NC_015519	TATCTT	2	12	2322871	2322882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332800151
43039	NC_015519	ATC	2	6	2322886	2322891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800151
43040	NC_015519	TCT	2	6	2322977	2322982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800151
43041	NC_015519	CTT	2	6	2323058	2323063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800151
43042	NC_015519	GGGT	2	8	2323142	2323149	0 %	25 %	75 %	0 %	332800151
43043	NC_015519	TAT	2	6	2323182	2323187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800151
43044	NC_015519	GCA	2	6	2323205	2323210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43045	NC_015519	GCT	2	6	2323238	2323243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43046	NC_015519	GCA	2	6	2323250	2323255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43047	NC_015519	GAA	2	6	2323267	2323272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800151
43048	NC_015519	TCG	2	6	2323322	2323327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43049	NC_015519	GCA	2	6	2323364	2323369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43050	NC_015519	TCA	2	6	2323392	2323397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800151
43051	NC_015519	GCA	2	6	2323511	2323516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800151
43052	NC_015519	ACC	3	9	2323567	2323575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332800151
43053	NC_015519	TAA	2	6	2323578	2323583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800151
43054	NC_015519	ACA	3	9	2323619	2323627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800151
43055	NC_015519	TCT	2	6	2323691	2323696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800151
43056	NC_015519	ACA	2	6	2323697	2323702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800151
43057	NC_015519	TTA	2	6	2323716	2323721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800151
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43060	NC_015519	GTAATA	2	12	2324038	2324049	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	332800152
43061	NC_015519	T	6	6	2324172	2324177	0 %	100 %	0 %	0 %	332800152
43062	NC_015519	AAG	2	6	2324228	2324233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800152
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43064	NC_015519	ATT	2	6	2324296	2324301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800152
43065	NC_015519	TGT	2	6	2324310	2324315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332800152
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43067	NC_015519	TA	3	6	2324374	2324379	50 %	50 %	0 %	0 %	332800152
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43072	NC_015519	TTAT	2	8	2324656	2324663	25 %	75 %	0 %	0 %	332800153
43073	NC_015519	ATC	2	6	2324691	2324696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800153
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43077	NC_015519	CTTC	2	8	2324923	2324930	0 %	50 %	0 %	50 %	332800153
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43085	NC_015519	T	7	7	2325214	2325220	0 %	100 %	0 %	0 %	332800153
43086	NC_015519	AT	4	8	2325234	2325241	50 %	50 %	0 %	0 %	332800153
43087	NC_015519	TTC	2	6	2325258	2325263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800153
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43091	NC_015519	TCT	2	6	2325415	2325420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800153
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43099	NC_015519	TCT	2	6	2325910	2325915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800153
43100	NC_015519	T	6	6	2325919	2325924	0 %	100 %	0 %	0 %	332800153
43101	NC_015519	A	6	6	2326095	2326100	100 %	0 %	0 %	0 %	332800153
43102	NC_015519	TCT	2	6	2326147	2326152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800153
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43105	NC_015519	TTC	2	6	2326200	2326205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800153
43106	NC_015519	GCT	2	6	2326209	2326214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800153
43107	NC_015519	AAG	2	6	2326235	2326240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800153
43108	NC_015519	TAA	2	6	2326280	2326285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800153
43109	NC_015519	CAAC	2	8	2326385	2326392	50 %	0 %	0 %	50 %	332800153
43110	NC_015519	T	6	6	2326412	2326417	0 %	100 %	0 %	0 %	332800153
43111	NC_015519	AAC	2	6	2326419	2326424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800153
43112	NC_015519	GCT	2	6	2326463	2326468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800153
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43114	NC_015519	TAA	2	6	2326490	2326495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800153
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43116	NC_015519	ATC	3	9	2326521	2326529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800153
43117	NC_015519	TGC	2	6	2326597	2326602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800153
43118	NC_015519	TAC	2	6	2326656	2326661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800153
43119	NC_015519	T	6	6	2326725	2326730	0 %	100 %	0 %	0 %	332800153
43120	NC_015519	AATA	2	8	2326743	2326750	75 %	25 %	0 %	0 %	332800153
43121	NC_015519	TTA	2	6	2326864	2326869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800153
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43123	NC_015519	GTC	2	6	2326906	2326911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800153
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43125	NC_015519	T	7	7	2326955	2326961	0 %	100 %	0 %	0 %	332800153
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43132	NC_015519	AT	3	6	2327467	2327472	50 %	50 %	0 %	0 %	332800153
43133	NC_015519	TCACC	2	10	2327604	2327613	20 %	20 %	0 %	60 %	332800154
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43136	NC_015519	CT	3	6	2327778	2327783	0 %	50 %	0 %	50 %	332800154
43137	NC_015519	TAAA	2	8	2327895	2327902	75 %	25 %	0 %	0 %	332800154
43138	NC_015519	AC	3	6	2327958	2327963	50 %	0 %	0 %	50 %	332800154
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43144	NC_015519	CTGC	2	8	2328314	2328321	0 %	25 %	25 %	50 %	332800154
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43151	NC_015519	AGAA	2	8	2328642	2328649	75 %	0 %	25 %	0 %	332800154
43152	NC_015519	TTA	2	6	2328673	2328678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800154
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43155	NC_015519	AT	4	8	2328809	2328816	50 %	50 %	0 %	0 %	332800154
43156	NC_015519	T	6	6	2328943	2328948	0 %	100 %	0 %	0 %	332800155
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43231	NC_015519	TA	3	6	2332538	2332543	50 %	50 %	0 %	0 %	332800157
43232	NC_015519	TCC	2	6	2332592	2332597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800157
43233	NC_015519	ACA	2	6	2332713	2332718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800157
43234	NC_015519	AAGAT	2	10	2332751	2332760	60 %	20 %	20 %	0 %	332800157
43235	NC_015519	CCT	2	6	2332767	2332772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800157
43236	NC_015519	AT	3	6	2332819	2332824	50 %	50 %	0 %	0 %	332800157
43237	NC_015519	CT	3	6	2332855	2332860	0 %	50 %	0 %	50 %	332800157
43238	NC_015519	CGG	2	6	2332882	2332887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332800157
43239	NC_015519	TCC	3	9	2332934	2332942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800157
43240	NC_015519	TAC	2	6	2332949	2332954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800157
43241	NC_015519	T	7	7	2332983	2332989	0 %	100 %	0 %	0 %	332800157
43242	NC_015519	TCT	2	6	2333000	2333005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800157
43243	NC_015519	TTTCTA	2	12	2333043	2333054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	332800157
43244	NC_015519	AT	5	10	2333111	2333120	50 %	50 %	0 %	0 %	332800157
43245	NC_015519	GTAGC	2	10	2333198	2333207	20 %	20 %	40 %	20 %	332800157
43246	NC_015519	TGAA	2	8	2333243	2333250	50 %	25 %	25 %	0 %	332800157
43247	NC_015519	TCC	2	6	2333264	2333269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800157
43248	NC_015519	TAC	2	6	2333327	2333332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800157
43249	NC_015519	AT	3	6	2333435	2333440	50 %	50 %	0 %	0 %	332800157
43250	NC_015519	CCT	2	6	2333494	2333499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800158
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43252	NC_015519	AAG	2	6	2333672	2333677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800158
43253	NC_015519	CTG	2	6	2333860	2333865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800158
43254	NC_015519	TCA	2	6	2333886	2333891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800158
43255	NC_015519	CTT	2	6	2333900	2333905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800158
43256	NC_015519	CTT	2	6	2334058	2334063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800158
43257	NC_015519	AAC	2	6	2334068	2334073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800158
43258	NC_015519	TGC	2	6	2334158	2334163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800158
43259	NC_015519	AT	3	6	2334185	2334190	50 %	50 %	0 %	0 %	332800158
43260	NC_015519	T	6	6	2334200	2334205	0 %	100 %	0 %	0 %	332800158
43261	NC_015519	TCT	2	6	2334239	2334244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800158
43262	NC_015519	CTG	2	6	2334316	2334321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800158
43263	NC_015519	TCA	2	6	2334375	2334380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800158
43264	NC_015519	T	6	6	2334384	2334389	0 %	100 %	0 %	0 %	332800158
43265	NC_015519	TTA	2	6	2334448	2334453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800159
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43267	NC_015519	AAT	2	6	2334636	2334641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800159
43268	NC_015519	CAT	2	6	2334695	2334700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800159
43269	NC_015519	AAT	2	6	2334771	2334776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800159
43270	NC_015519	ATATC	2	10	2334886	2334895	40 %	40 %	0 %	20 %	332800159
43271	NC_015519	CTCCAA	2	12	2334950	2334961	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332800159
43272	NC_015519	CA	4	8	2335036	2335043	50 %	0 %	0 %	50 %	332800160
43273	NC_015519	TGT	2	6	2335084	2335089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332800160
43274	NC_015519	TTC	2	6	2335151	2335156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800160
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43276	NC_015519	AAT	2	6	2335241	2335246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800160
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43281	NC_015519	CTG	2	6	2335456	2335461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800160
43282	NC_015519	TA	3	6	2335480	2335485	50 %	50 %	0 %	0 %	332800160
43283	NC_015519	AAAG	2	8	2335517	2335524	75 %	0 %	25 %	0 %	332800160
43284	NC_015519	ACT	2	6	2335545	2335550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800160
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43287	NC_015519	TCC	2	6	2335610	2335615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800160
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43292	NC_015519	GCC	2	6	2335893	2335898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332800160
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43294	NC_015519	T	7	7	2335975	2335981	0 %	100 %	0 %	0 %	332800160
43295	NC_015519	TTA	2	6	2336025	2336030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800160
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43299	NC_015519	CTT	2	6	2336208	2336213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800160
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43302	NC_015519	ATT	2	6	2336310	2336315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800160
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43310	NC_015519	A	8	8	2337369	2337376	100 %	0 %	0 %	0 %	332800161
43311	NC_015519	ATTA	2	8	2337441	2337448	50 %	50 %	0 %	0 %	332800161
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43316	NC_015519	A	7	7	2337590	2337596	100 %	0 %	0 %	0 %	332800161
43317	NC_015519	ATCGC	2	10	2337622	2337631	20 %	20 %	20 %	40 %	332800161
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43319	NC_015519	TA	3	6	2337724	2337729	50 %	50 %	0 %	0 %	332800161
43320	NC_015519	AGA	2	6	2337767	2337772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800161
43321	NC_015519	AGA	2	6	2337776	2337781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332800161
43322	NC_015519	TAAACA	2	12	2337789	2337800	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332800161
43323	NC_015519	TGTTTA	2	12	2337816	2337827	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	332800162
43324	NC_015519	GCT	2	6	2337856	2337861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800162
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43326	NC_015519	TA	3	6	2337885	2337890	50 %	50 %	0 %	0 %	332800162
43327	NC_015519	TA	4	8	2337909	2337916	50 %	50 %	0 %	0 %	332800162
43328	NC_015519	ATA	2	6	2337982	2337987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800162
43329	NC_015519	AAT	2	6	2338096	2338101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800162
43330	NC_015519	AATT	2	8	2338157	2338164	50 %	50 %	0 %	0 %	332800162
43331	NC_015519	CCT	2	6	2338171	2338176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332800162
43332	NC_015519	ATG	2	6	2338198	2338203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800162
43333	NC_015519	TGA	2	6	2338223	2338228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332800162
43334	NC_015519	A	6	6	2338242	2338247	100 %	0 %	0 %	0 %	332800162
43335	NC_015519	TTC	2	6	2338263	2338268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800162
43336	NC_015519	TCAC	2	8	2338273	2338280	25 %	25 %	0 %	50 %	332800163
43337	NC_015519	CTTTT	2	10	2338282	2338291	0 %	80 %	0 %	20 %	332800163
43338	NC_015519	AT	3	6	2338328	2338333	50 %	50 %	0 %	0 %	332800163
43339	NC_015519	ATC	2	6	2338339	2338344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800163
43340	NC_015519	AGGA	2	8	2338381	2338388	50 %	0 %	50 %	0 %	332800163
43341	NC_015519	TTA	2	6	2338400	2338405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800163
43342	NC_015519	GGC	2	6	2338430	2338435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332800163
43343	NC_015519	CAT	2	6	2338476	2338481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800163
43344	NC_015519	AGC	2	6	2338506	2338511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332800163
43345	NC_015519	TCT	2	6	2338731	2338736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332800163
43346	NC_015519	AAAC	2	8	2338738	2338745	75 %	0 %	0 %	25 %	332800163
43347	NC_015519	AAC	2	6	2338795	2338800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800163
43348	NC_015519	CTG	2	6	2338848	2338853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332800163
43349	NC_015519	GCC	2	6	2338855	2338860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332800163
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43351	NC_015519	AT	3	6	2338962	2338967	50 %	50 %	0 %	0 %	332800163
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43469	NC_015519	TAC	2	6	2344466	2344471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332800171
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43493	NC_015519	TAT	2	6	2345917	2345922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332800172
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43495	NC_015519	CAA	2	6	2346009	2346014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332800172
43496	NC_015519	T	7	7	2346032	2346038	0 %	100 %	0 %	0 %	332800172
43497	NC_015519	TATCTA	2	12	2346114	2346125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332800172
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43499	NC_015519	T	6	6	2346247	2346252	0 %	100 %	0 %	0 %	332800172
43500	NC_015519	ATA	2	6	2346278	2346283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332800172

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