MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015500	ATA	2	6	176799	176804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296817
3502	NC_015500	CGG	2	6	176828	176833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296817
3503	NC_015500	CTG	3	9	176850	176858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296817
3504	NC_015500	GGC	2	6	176958	176963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296817
3505	NC_015500	GAAC	2	8	176983	176990	50 %	0 %	25 %	25 %	332296817
3506	NC_015500	GAC	2	6	177089	177094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296817
3507	NC_015500	GCT	2	6	177101	177106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296817
3508	NC_015500	CGT	3	9	177170	177178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296817
3509	NC_015500	A	6	6	177257	177262	100 %	0 %	0 %	0 %	332296817
3510	NC_015500	GCT	2	6	177338	177343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296817
3511	NC_015500	GTCA	2	8	177345	177352	25 %	25 %	25 %	25 %	332296817
3512	NC_015500	CTT	2	6	177546	177551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296818
3513	NC_015500	GTT	2	6	177599	177604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296818
3514	NC_015500	GCA	2	6	177629	177634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296818
3515	NC_015500	GGT	2	6	177655	177660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296818
3516	NC_015500	T	6	6	177684	177689	0 %	100 %	0 %	0 %	332296818
3517	NC_015500	GCC	2	6	177732	177737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296818
3518	NC_015500	TCCG	2	8	177743	177750	0 %	25 %	25 %	50 %	332296818
3519	NC_015500	AGA	2	6	177758	177763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296818
3520	NC_015500	CAT	2	6	177774	177779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296818
3521	NC_015500	GTAT	2	8	177821	177828	25 %	50 %	25 %	0 %	332296818
3522	NC_015500	GCC	2	6	177829	177834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296818
3523	NC_015500	TTG	2	6	177841	177846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296818
3524	NC_015500	TCA	2	6	177919	177924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296819
3525	NC_015500	CGT	2	6	177967	177972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296819
3526	NC_015500	CG	3	6	177989	177994	0 %	0 %	50 %	50 %	332296819
3527	NC_015500	GCAG	2	8	178027	178034	25 %	0 %	50 %	25 %	332296819
3528	NC_015500	CGG	2	6	178057	178062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296819
3529	NC_015500	GTA	2	6	178118	178123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296819
3530	NC_015500	CTG	2	6	178146	178151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296819
3531	NC_015500	T	6	6	178172	178177	0 %	100 %	0 %	0 %	332296819
3532	NC_015500	TGC	2	6	178198	178203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296819
3533	NC_015500	ATA	2	6	178540	178545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296820
3534	NC_015500	ATCG	2	8	178550	178557	25 %	25 %	25 %	25 %	332296820
3535	NC_015500	ACG	2	6	178590	178595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296820
3536	NC_015500	CGT	2	6	178646	178651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296820
3537	NC_015500	T	6	6	178845	178850	0 %	100 %	0 %	0 %	332296821
3538	NC_015500	CAA	2	6	178854	178859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296821
3539	NC_015500	CGG	2	6	178969	178974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296821
3540	NC_015500	ACA	2	6	179013	179018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296821
3541	NC_015500	TA	3	6	179024	179029	50 %	50 %	0 %	0 %	332296821
3542	NC_015500	TTC	2	6	179105	179110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296821
3543	NC_015500	AACG	2	8	179136	179143	50 %	0 %	25 %	25 %	332296821
3544	NC_015500	CGT	2	6	179164	179169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296821
3545	NC_015500	TATCGA	2	12	179209	179220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332296821
3546	NC_015500	TTC	2	6	179297	179302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296821
3547	NC_015500	T	6	6	179310	179315	0 %	100 %	0 %	0 %	332296821
3548	NC_015500	TCG	2	6	179382	179387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296821
3549	NC_015500	TAA	2	6	179417	179422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296821
3550	NC_015500	TTC	2	6	179423	179428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296821
3551	NC_015500	ATC	2	6	179429	179434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296821
3552	NC_015500	ATG	2	6	179467	179472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296821
3553	NC_015500	T	6	6	179497	179502	0 %	100 %	0 %	0 %	332296821
3554	NC_015500	TCA	2	6	179544	179549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296821
3555	NC_015500	TCA	2	6	179563	179568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296821
3556	NC_015500	AT	3	6	179636	179641	50 %	50 %	0 %	0 %	332296821
3557	NC_015500	TTC	2	6	179642	179647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296821
3558	NC_015500	CTT	2	6	179698	179703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296821
3559	NC_015500	TGG	2	6	179810	179815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296822
3560	NC_015500	GGAT	2	8	179818	179825	25 %	25 %	50 %	0 %	332296822
3561	NC_015500	CGTG	2	8	179843	179850	0 %	25 %	50 %	25 %	332296822
3562	NC_015500	ACG	2	6	179939	179944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296822
3563	NC_015500	CGT	2	6	179975	179980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296822
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3565	NC_015500	GCA	2	6	180050	180055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296822
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3568	NC_015500	ACGC	2	8	180250	180257	25 %	0 %	25 %	50 %	332296822
3569	NC_015500	GC	3	6	180307	180312	0 %	0 %	50 %	50 %	332296822
3570	NC_015500	GCC	2	6	180345	180350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296822
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3578	NC_015500	CGC	2	6	181091	181096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296823
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3580	NC_015500	TCG	2	6	181228	181233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296823
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3583	NC_015500	AGC	2	6	181306	181311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296823
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3585	NC_015500	CAG	2	6	181389	181394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296823
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3587	NC_015500	ATG	2	6	181477	181482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296823
3588	NC_015500	GCG	2	6	181523	181528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296823
3589	NC_015500	CTG	2	6	181563	181568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296823
3590	NC_015500	GCA	2	6	181604	181609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296823
3591	NC_015500	CAGT	2	8	181625	181632	25 %	25 %	25 %	25 %	332296823
3592	NC_015500	ATG	2	6	181633	181638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296823
3593	NC_015500	GAAA	2	8	181647	181654	75 %	0 %	25 %	0 %	332296823
3594	NC_015500	GCC	3	9	181669	181677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296823
3595	NC_015500	GAACC	2	10	181694	181703	40 %	0 %	20 %	40 %	332296823
3596	NC_015500	TCG	2	6	181765	181770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296823
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3600	NC_015500	A	6	6	182031	182036	100 %	0 %	0 %	0 %	332296823
3601	NC_015500	GAA	2	6	182065	182070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296823
3602	NC_015500	CGT	2	6	182118	182123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296823
3603	NC_015500	GCTT	2	8	182189	182196	0 %	50 %	25 %	25 %	332296823
3604	NC_015500	CGG	2	6	182241	182246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296823
3605	NC_015500	T	6	6	182311	182316	0 %	100 %	0 %	0 %	332296823
3606	NC_015500	AT	3	6	182325	182330	50 %	50 %	0 %	0 %	332296823
3607	NC_015500	GCA	2	6	182459	182464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296823
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3609	NC_015500	CGT	2	6	182499	182504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296823
3610	NC_015500	GTCA	2	8	182520	182527	25 %	25 %	25 %	25 %	332296823
3611	NC_015500	ATG	2	6	182575	182580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296823
3612	NC_015500	ACG	3	9	182587	182595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296823
3613	NC_015500	TAT	2	6	182821	182826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296824
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3615	NC_015500	TGG	3	9	182964	182972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296824
3616	NC_015500	CCGC	2	8	182975	182982	0 %	0 %	25 %	75 %	332296824
3617	NC_015500	ACG	2	6	183035	183040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296824
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3619	NC_015500	GCC	3	9	183119	183127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296824
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3621	NC_015500	AAG	2	6	183213	183218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296824
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3861	NC_015500	GC	3	6	192957	192962	0 %	0 %	50 %	50 %	332296834
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