MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015500	GCC	2	6	150093	150098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296792
3002	NC_015500	GAA	2	6	150112	150117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296792
3003	NC_015500	ACGG	2	8	150133	150140	25 %	0 %	50 %	25 %	332296792
3004	NC_015500	ATT	2	6	150246	150251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296792
3005	NC_015500	ATT	2	6	150255	150260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296792
3006	NC_015500	CTG	2	6	150284	150289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296792
3007	NC_015500	AAGG	2	8	150404	150411	50 %	0 %	50 %	0 %	332296792
3008	NC_015500	TGA	2	6	150789	150794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296793
3009	NC_015500	T	6	6	150814	150819	0 %	100 %	0 %	0 %	332296793
3010	NC_015500	CGGA	2	8	150854	150861	25 %	0 %	50 %	25 %	332296793
3011	NC_015500	GCT	2	6	150876	150881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296793
3012	NC_015500	TTC	2	6	150890	150895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296793
3013	NC_015500	TTC	2	6	150921	150926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296793
3014	NC_015500	GAT	2	6	150936	150941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296793
3015	NC_015500	CCG	2	6	151005	151010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296793
3016	NC_015500	CGC	2	6	151022	151027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296793
3017	NC_015500	CGT	2	6	151083	151088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296793
3018	NC_015500	A	6	6	151129	151134	100 %	0 %	0 %	0 %	332296793
3019	NC_015500	CGT	2	6	151137	151142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296793
3020	NC_015500	CCG	2	6	151151	151156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296793
3021	NC_015500	GCA	2	6	151164	151169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296793
3022	NC_015500	GAA	2	6	151361	151366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296794
3023	NC_015500	TGC	2	6	151387	151392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3024	NC_015500	GGCA	2	8	151400	151407	25 %	0 %	50 %	25 %	332296794
3025	NC_015500	GC	3	6	151459	151464	0 %	0 %	50 %	50 %	332296794
3026	NC_015500	TCA	2	6	151465	151470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296794
3027	NC_015500	A	6	6	151515	151520	100 %	0 %	0 %	0 %	332296794
3028	NC_015500	AAC	2	6	151533	151538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296794
3029	NC_015500	CTG	2	6	151551	151556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3030	NC_015500	GCT	2	6	151601	151606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3031	NC_015500	CGG	2	6	151688	151693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296794
3032	NC_015500	GCG	3	9	151695	151703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296794
3033	NC_015500	CCGT	2	8	151719	151726	0 %	25 %	25 %	50 %	332296794
3034	NC_015500	CTT	2	6	151751	151756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296794
3035	NC_015500	CTT	2	6	151762	151767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296794
3036	NC_015500	A	6	6	151821	151826	100 %	0 %	0 %	0 %	332296794
3037	NC_015500	GC	3	6	151918	151923	0 %	0 %	50 %	50 %	332296794
3038	NC_015500	GCC	2	6	151989	151994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296794
3039	NC_015500	GCA	2	6	152000	152005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3040	NC_015500	CGC	2	6	152024	152029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296794
3041	NC_015500	ACG	2	6	152065	152070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3042	NC_015500	CGA	2	6	152117	152122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3043	NC_015500	CAA	2	6	152126	152131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296794
3044	NC_015500	CGACG	2	10	152189	152198	20 %	0 %	40 %	40 %	332296794
3045	NC_015500	TTC	2	6	152245	152250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296794
3046	NC_015500	ACG	2	6	152271	152276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296794
3047	NC_015500	CGTT	2	8	152416	152423	0 %	50 %	25 %	25 %	332296794
3048	NC_015500	GAA	2	6	152597	152602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296795
3049	NC_015500	CCGG	2	8	152677	152684	0 %	0 %	50 %	50 %	332296795
3050	NC_015500	TGA	2	6	152733	152738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296795
3051	NC_015500	ATC	2	6	152757	152762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296795
3052	NC_015500	GAT	2	6	152842	152847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296795
3053	NC_015500	TCA	2	6	152848	152853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296795
3054	NC_015500	CTGG	2	8	152896	152903	0 %	25 %	50 %	25 %	332296795
3055	NC_015500	CGC	2	6	152928	152933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296795
3056	NC_015500	CGG	2	6	152964	152969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296795
3057	NC_015500	CTCGGC	2	12	152984	152995	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	332296795
3058	NC_015500	CAG	2	6	153038	153043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296795
3059	NC_015500	CGG	2	6	153069	153074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296795
3060	NC_015500	GTA	2	6	153083	153088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296795
3061	NC_015500	TCG	2	6	153107	153112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296795
3062	NC_015500	TGAA	2	8	153282	153289	50 %	25 %	25 %	0 %	332296795
3063	NC_015500	TGA	2	6	153306	153311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296795
3064	NC_015500	ACG	2	6	153323	153328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296795
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3067	NC_015500	TGG	2	6	153489	153494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296795
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3069	NC_015500	GGA	2	6	153607	153612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296795
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3071	NC_015500	GCT	2	6	153637	153642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296795
3072	NC_015500	CGG	2	6	153660	153665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296795
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3075	NC_015500	CGG	2	6	153799	153804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296795
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3077	NC_015500	CG	3	6	153876	153881	0 %	0 %	50 %	50 %	332296795
3078	NC_015500	ATC	2	6	153950	153955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296795
3079	NC_015500	GTC	2	6	153961	153966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296795
3080	NC_015500	GGC	2	6	154020	154025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296795
3081	NC_015500	GAAA	2	8	154153	154160	75 %	0 %	25 %	0 %	332296796
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3085	NC_015500	CGC	2	6	154291	154296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296796
3086	NC_015500	CGT	2	6	154351	154356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296796
3087	NC_015500	GT	3	6	154355	154360	0 %	50 %	50 %	0 %	332296796
3088	NC_015500	TTCG	2	8	154381	154388	0 %	50 %	25 %	25 %	332296796
3089	NC_015500	GCC	2	6	154409	154414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296796
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3091	NC_015500	GC	3	6	154566	154571	0 %	0 %	50 %	50 %	332296796
3092	NC_015500	GTC	2	6	154595	154600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296796
3093	NC_015500	CGA	2	6	154612	154617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296796
3094	NC_015500	TCG	2	6	154671	154676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296796
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3099	NC_015500	GC	3	6	154763	154768	0 %	0 %	50 %	50 %	332296796
3100	NC_015500	CTG	2	6	154823	154828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296796
3101	NC_015500	GCG	2	6	154913	154918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296796
3102	NC_015500	CGG	2	6	154927	154932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296796
3103	NC_015500	GGC	2	6	154964	154969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296796
3104	NC_015500	GCT	2	6	155044	155049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296796
3105	NC_015500	ATTATC	2	12	155063	155074	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	332296796
3106	NC_015500	A	6	6	155105	155110	100 %	0 %	0 %	0 %	332296796
3107	NC_015500	TC	3	6	155304	155309	0 %	50 %	0 %	50 %	332296797
3108	NC_015500	TCG	2	6	155329	155334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296797
3109	NC_015500	CAT	2	6	155336	155341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296797
3110	NC_015500	AT	3	6	155384	155389	50 %	50 %	0 %	0 %	332296797
3111	NC_015500	TGC	2	6	155398	155403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296797
3112	NC_015500	AAGG	2	8	155406	155413	50 %	0 %	50 %	0 %	332296797
3113	NC_015500	TCG	2	6	155433	155438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296797
3114	NC_015500	GGAC	2	8	155495	155502	25 %	0 %	50 %	25 %	332296797
3115	NC_015500	CCG	2	6	155515	155520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296797
3116	NC_015500	ACG	2	6	155524	155529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296797
3117	NC_015500	ACG	2	6	155626	155631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296797
3118	NC_015500	GAAG	2	8	155639	155646	50 %	0 %	50 %	0 %	332296797
3119	NC_015500	CGG	2	6	155693	155698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296797
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3121	NC_015500	GGCGT	2	10	155763	155772	0 %	20 %	60 %	20 %	332296797
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3230	NC_015500	CCGT	2	8	160720	160727	0 %	25 %	25 %	50 %	332296801
3231	NC_015500	T	6	6	160755	160760	0 %	100 %	0 %	0 %	332296801
3232	NC_015500	CGA	2	6	160783	160788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296801
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3236	NC_015500	GGCT	2	8	161028	161035	0 %	25 %	50 %	25 %	332296801
3237	NC_015500	GCC	2	6	161061	161066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296801
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3239	NC_015500	T	7	7	161141	161147	0 %	100 %	0 %	0 %	332296801
3240	NC_015500	CGT	2	6	161165	161170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296801
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3242	NC_015500	TCTGT	2	10	161201	161210	0 %	60 %	20 %	20 %	332296801
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3354	NC_015500	TGC	2	6	166921	166926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296806
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3357	NC_015500	CGG	2	6	167150	167155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296806
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3360	NC_015500	CGC	2	6	167291	167296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296806
3361	NC_015500	ATCTGA	2	12	168050	168061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332296807
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3363	NC_015500	TACA	2	8	168115	168122	50 %	25 %	0 %	25 %	332296807
3364	NC_015500	CTG	2	6	168219	168224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296807
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3367	NC_015500	T	6	6	168273	168278	0 %	100 %	0 %	0 %	332296807
3368	NC_015500	AC	3	6	168336	168341	50 %	0 %	0 %	50 %	332296807
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3486	NC_015500	CG	3	6	175620	175625	0 %	0 %	50 %	50 %	332296815
3487	NC_015500	GC	4	8	175654	175661	0 %	0 %	50 %	50 %	332296815
3488	NC_015500	CGT	2	6	175664	175669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296815
3489	NC_015500	ACG	2	6	175699	175704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296815
3490	NC_015500	AAATCG	2	12	175728	175739	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	332296815
3491	NC_015500	GCC	2	6	175755	175760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296815
3492	NC_015500	GTC	2	6	175787	175792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296815
3493	NC_015500	GTTT	2	8	175793	175800	0 %	75 %	25 %	0 %	332296815
3494	NC_015500	GAAA	2	8	175984	175991	75 %	0 %	25 %	0 %	332296816
3495	NC_015500	TCCG	2	8	176022	176029	0 %	25 %	25 %	50 %	332296816
3496	NC_015500	CCG	2	6	176055	176060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296816
3497	NC_015500	T	7	7	176097	176103	0 %	100 %	0 %	0 %	332296816
3498	NC_015500	CTG	2	6	176104	176109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296816
3499	NC_015500	CCGCG	2	10	176113	176122	0 %	0 %	40 %	60 %	332296816
3500	NC_015500	GGCA	2	8	176175	176182	25 %	0 %	50 %	25 %	332296816

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