MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_015500	GGA	2	6	23772	23777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296689
503	NC_015500	CTG	2	6	23800	23805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
504	NC_015500	ACG	2	6	23855	23860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
505	NC_015500	CG	3	6	23872	23877	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
506	NC_015500	CGGA	2	8	23944	23951	25 %	0 %	50 %	25 %	332296689
507	NC_015500	A	6	6	23951	23956	100 %	0 %	0 %	0 %	332296689
508	NC_015500	ATCG	2	8	24027	24034	25 %	25 %	25 %	25 %	332296689
509	NC_015500	GAA	2	6	24103	24108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296689
510	NC_015500	TGC	2	6	24164	24169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296689
511	NC_015500	GAA	2	6	24187	24192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296689
512	NC_015500	TG	3	6	24206	24211	0 %	50 %	50 %	0 %	332296689
513	NC_015500	GCC	2	6	24306	24311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
514	NC_015500	GC	3	6	24320	24325	0 %	0 %	50 %	50 %	332296689
515	NC_015500	CGC	2	6	24360	24365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
516	NC_015500	CGA	2	6	24494	24499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
517	NC_015500	CGA	2	6	24521	24526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296689
518	NC_015500	CCG	2	6	24604	24609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296689
519	NC_015500	ACAA	2	8	24805	24812	75 %	0 %	0 %	25 %	332296690
520	NC_015500	TGC	2	6	24815	24820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
521	NC_015500	A	6	6	24837	24842	100 %	0 %	0 %	0 %	332296690
522	NC_015500	TAC	2	6	24894	24899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
523	NC_015500	ATT	2	6	24900	24905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296690
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525	NC_015500	CTG	2	6	25038	25043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
526	NC_015500	T	6	6	25054	25059	0 %	100 %	0 %	0 %	332296690
527	NC_015500	GCT	2	6	25073	25078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296690
528	NC_015500	CCCG	2	8	25129	25136	0 %	0 %	25 %	75 %	332296690
529	NC_015500	CGG	2	6	25265	25270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296690
530	NC_015500	GGAA	2	8	25336	25343	50 %	0 %	50 %	0 %	332296690
531	NC_015500	ATC	2	6	25359	25364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
532	NC_015500	CGC	2	6	25370	25375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296690
533	NC_015500	CGAT	2	8	25384	25391	25 %	25 %	25 %	25 %	332296690
534	NC_015500	TGG	2	6	25414	25419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296690
535	NC_015500	TCCG	2	8	25468	25475	0 %	25 %	25 %	50 %	332296690
536	NC_015500	TGT	2	6	25543	25548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296690
537	NC_015500	ATC	2	6	25578	25583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
538	NC_015500	TAT	2	6	25658	25663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296690
539	NC_015500	CAA	2	6	25688	25693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296690
540	NC_015500	TCA	2	6	25716	25721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296690
541	NC_015500	TCG	3	9	25837	25845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
542	NC_015500	ACG	2	6	25872	25877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296691
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544	NC_015500	GCT	2	6	25964	25969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
545	NC_015500	ACG	2	6	25975	25980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296691
546	NC_015500	TCG	2	6	26017	26022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296691
547	NC_015500	TTA	2	6	26029	26034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296691
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549	NC_015500	GTTC	2	8	26111	26118	0 %	50 %	25 %	25 %	332296691
550	NC_015500	T	6	6	26253	26258	0 %	100 %	0 %	0 %	332296691
551	NC_015500	TGA	2	6	26326	26331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296691
552	NC_015500	ATC	2	6	26355	26360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296691
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556	NC_015500	CTG	2	6	26761	26766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296692
557	NC_015500	TGC	2	6	26780	26785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296692
558	NC_015500	CCG	2	6	26882	26887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
559	NC_015500	CGAA	2	8	26954	26961	50 %	0 %	25 %	25 %	332296692
560	NC_015500	CGC	2	6	26985	26990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
561	NC_015500	CGC	2	6	27028	27033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
562	NC_015500	GAT	2	6	27093	27098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296692
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564	NC_015500	ACG	2	6	27145	27150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296692
565	NC_015500	CGTTCA	2	12	27290	27301	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	332296692
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573	NC_015500	CGC	2	6	27567	27572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296692
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597	NC_015500	CAG	2	6	30907	30912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296693
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599	NC_015500	TTC	2	6	31043	31048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296693
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609	NC_015500	TAC	2	6	31431	31436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296693
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611	NC_015500	GC	3	6	31496	31501	0 %	0 %	50 %	50 %	332296693
612	NC_015500	CCG	3	9	31509	31517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296693
613	NC_015500	CGC	2	6	31519	31524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296693
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616	NC_015500	GC	4	8	31782	31789	0 %	0 %	50 %	50 %	332296693
617	NC_015500	AC	3	6	31944	31949	50 %	0 %	0 %	50 %	332296693
618	NC_015500	CTA	2	6	32012	32017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296693
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621	NC_015500	GGC	2	6	32282	32287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296693
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625	NC_015500	TGA	2	6	32554	32559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296693
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