MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema brennaborense DSM 12168 chromosome

Total Repeats: 63779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015500	GAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
2	NC_015500	AGA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
3	NC_015500	AAG	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
4	NC_015500	CGT	2	6	203	208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
5	NC_015500	GAT	2	6	225	230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296670
6	NC_015500	GCG	2	6	244	249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
7	NC_015500	GAA	2	6	268	273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
8	NC_015500	A	6	6	315	320	100 %	0 %	0 %	0 %	332296670
9	NC_015500	CGG	3	9	342	350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
10	NC_015500	CGG	2	6	374	379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
11	NC_015500	CGT	2	6	413	418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
12	NC_015500	GGCC	2	8	421	428	0 %	0 %	50 %	50 %	332296670
13	NC_015500	GGC	2	6	429	434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
14	NC_015500	CCG	2	6	552	557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296670
15	NC_015500	TTCG	2	8	615	622	0 %	50 %	25 %	25 %	332296670
16	NC_015500	A	6	6	648	653	100 %	0 %	0 %	0 %	332296670
17	NC_015500	ACGT	2	8	660	667	25 %	25 %	25 %	25 %	332296670
18	NC_015500	CGG	2	6	687	692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
19	NC_015500	CGG	2	6	753	758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
20	NC_015500	CCG	2	6	776	781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296670
21	NC_015500	ACGA	2	8	790	797	50 %	0 %	25 %	25 %	332296670
22	NC_015500	ATTC	2	8	798	805	25 %	50 %	0 %	25 %	332296670
23	NC_015500	GAC	2	6	874	879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
24	NC_015500	T	6	6	886	891	0 %	100 %	0 %	0 %	332296670
25	NC_015500	AAG	2	6	911	916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
26	NC_015500	GC	3	6	1077	1082	0 %	0 %	50 %	50 %	332296670
27	NC_015500	A	6	6	1114	1119	100 %	0 %	0 %	0 %	332296670
28	NC_015500	AACG	2	8	1161	1168	50 %	0 %	25 %	25 %	332296670
29	NC_015500	TA	3	6	1207	1212	50 %	50 %	0 %	0 %	332296670
30	NC_015500	GC	3	6	1246	1251	0 %	0 %	50 %	50 %	332296670
31	NC_015500	GTC	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296670
32	NC_015500	ATT	2	6	1328	1333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296670
33	NC_015500	A	6	6	1363	1368	100 %	0 %	0 %	0 %	332296670
34	NC_015500	TA	3	6	1406	1411	50 %	50 %	0 %	0 %	332296670
35	NC_015500	CGA	2	6	1436	1441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
36	NC_015500	GGAAT	2	10	1450	1459	40 %	20 %	40 %	0 %	332296670
37	NC_015500	CGG	2	6	1461	1466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296670
38	NC_015500	TAC	2	6	1476	1481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296670
39	NC_015500	AGA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296670
40	NC_015500	GCA	2	6	1562	1567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296670
41	NC_015500	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	332296670
42	NC_015500	AAT	2	6	1897	1902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296671
43	NC_015500	ACA	2	6	1956	1961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296671
44	NC_015500	CGT	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296671
45	NC_015500	GAA	3	9	2024	2032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296671
46	NC_015500	ACC	3	9	2036	2044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332296671
47	NC_015500	TCC	2	6	2083	2088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296671
48	NC_015500	ATTC	2	8	2101	2108	25 %	50 %	0 %	25 %	332296671
49	NC_015500	A	7	7	2143	2149	100 %	0 %	0 %	0 %	332296671
50	NC_015500	CCG	2	6	2232	2237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
51	NC_015500	CGA	2	6	2281	2286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
52	NC_015500	A	8	8	2322	2329	100 %	0 %	0 %	0 %	332296671
53	NC_015500	GAC	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
54	NC_015500	AACCTC	2	12	2336	2347	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332296671
55	NC_015500	CGAC	2	8	2352	2359	25 %	0 %	25 %	50 %	332296671
56	NC_015500	GCC	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
57	NC_015500	TTC	2	6	2377	2382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296671
58	NC_015500	CTT	2	6	2463	2468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296671
59	NC_015500	TCG	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296671
60	NC_015500	CGC	2	6	2675	2680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296671
61	NC_015500	AGA	2	6	2749	2754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296671
62	NC_015500	CGA	2	6	2812	2817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296671
63	NC_015500	GC	3	6	2872	2877	0 %	0 %	50 %	50 %	332296671
64	NC_015500	ACT	2	6	2907	2912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296671
65	NC_015500	CAT	2	6	2917	2922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296671
66	NC_015500	TTTC	2	8	2960	2967	0 %	75 %	0 %	25 %	332296672
67	NC_015500	CTT	2	6	3014	3019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296672
68	NC_015500	AGG	2	6	3024	3029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296672
69	NC_015500	GAA	2	6	3179	3184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296672
70	NC_015500	A	8	8	3226	3233	100 %	0 %	0 %	0 %	332296672
71	NC_015500	T	6	6	3300	3305	0 %	100 %	0 %	0 %	332296672
72	NC_015500	ACG	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
73	NC_015500	T	6	6	3352	3357	0 %	100 %	0 %	0 %	332296672
74	NC_015500	ACG	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
75	NC_015500	TA	3	6	3392	3397	50 %	50 %	0 %	0 %	332296672
76	NC_015500	A	6	6	3416	3421	100 %	0 %	0 %	0 %	332296672
77	NC_015500	A	7	7	3527	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	332296672
78	NC_015500	GAAA	2	8	3622	3629	75 %	0 %	25 %	0 %	332296672
79	NC_015500	CCG	2	6	3687	3692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
80	NC_015500	ATG	3	9	3695	3703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296672
81	NC_015500	GAC	2	6	3706	3711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
82	NC_015500	CGG	2	6	3751	3756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296672
83	NC_015500	GCG	2	6	3790	3795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296672
84	NC_015500	GCTT	2	8	3796	3803	0 %	50 %	25 %	25 %	332296672
85	NC_015500	TAT	2	6	3833	3838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296672
86	NC_015500	CTG	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296672
87	NC_015500	GAC	2	6	3875	3880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296672
88	NC_015500	CCG	2	6	3932	3937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
89	NC_015500	CGC	2	6	3989	3994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296672
90	NC_015500	CG	3	6	4002	4007	0 %	0 %	50 %	50 %	332296672
91	NC_015500	GCA	2	6	4115	4120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296673
92	NC_015500	CG	3	6	4127	4132	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
93	NC_015500	ATC	2	6	4194	4199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296673
94	NC_015500	TGC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296673
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96	NC_015500	GGAT	2	8	4242	4249	25 %	25 %	50 %	0 %	332296673
97	NC_015500	CG	3	6	4269	4274	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
98	NC_015500	GC	4	8	4345	4352	0 %	0 %	50 %	50 %	332296673
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100	NC_015500	AGA	2	6	4388	4393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296673
101	NC_015500	A	8	8	4456	4463	100 %	0 %	0 %	0 %	332296673
102	NC_015500	TCGA	2	8	4516	4523	25 %	25 %	25 %	25 %	332296673
103	NC_015500	A	6	6	4527	4532	100 %	0 %	0 %	0 %	332296673
104	NC_015500	TAA	2	6	4544	4549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296673
105	NC_015500	AGTAA	2	10	4672	4681	60 %	20 %	20 %	0 %	332296674
106	NC_015500	GGA	2	6	4726	4731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296674
107	NC_015500	AAG	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296674
108	NC_015500	TGTT	2	8	4944	4951	0 %	75 %	25 %	0 %	332296675
109	NC_015500	AAT	2	6	4958	4963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296675
110	NC_015500	TCC	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332296676
111	NC_015500	CTG	2	6	5262	5267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296676
112	NC_015500	GCG	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296676
113	NC_015500	CGG	2	6	5382	5387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296676
114	NC_015500	A	7	7	5450	5456	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
115	NC_015500	GTTC	2	8	5505	5512	0 %	50 %	25 %	25 %	332296677
116	NC_015500	T	7	7	5520	5526	0 %	100 %	0 %	0 %	332296677
117	NC_015500	CGG	2	6	5537	5542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
118	NC_015500	TTC	2	6	5580	5585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296677
119	NC_015500	GAA	2	6	5632	5637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
120	NC_015500	CCG	2	6	5663	5668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296677
121	NC_015500	GCA	2	6	5677	5682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
122	NC_015500	GAA	2	6	5692	5697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
123	NC_015500	GTAAA	2	10	5717	5726	60 %	20 %	20 %	0 %	332296677
124	NC_015500	GGC	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
125	NC_015500	A	6	6	5826	5831	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
126	NC_015500	CGA	2	6	5877	5882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
127	NC_015500	A	8	8	5895	5902	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
128	NC_015500	A	6	6	5943	5948	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
129	NC_015500	ACG	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
130	NC_015500	CGG	2	6	6002	6007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332296677
131	NC_015500	AT	3	6	6009	6014	50 %	50 %	0 %	0 %	332296677
132	NC_015500	TCGA	2	8	6031	6038	25 %	25 %	25 %	25 %	332296677
133	NC_015500	CGA	2	6	6042	6047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
134	NC_015500	AAC	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296677
135	NC_015500	GCA	2	6	6170	6175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
136	NC_015500	A	7	7	6181	6187	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
137	NC_015500	ACG	3	9	6218	6226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
138	NC_015500	ATG	2	6	6355	6360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332296677
139	NC_015500	TAT	2	6	6400	6405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296677
140	NC_015500	GAA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296677
141	NC_015500	ACA	2	6	6446	6451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332296677
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145	NC_015500	A	7	7	6643	6649	100 %	0 %	0 %	0 %	332296677
146	NC_015500	AATG	2	8	6732	6739	50 %	25 %	25 %	0 %	332296677
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152	NC_015500	TCT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296677
153	NC_015500	T	6	6	7094	7099	0 %	100 %	0 %	0 %	332296677
154	NC_015500	GCA	2	6	7158	7163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296677
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158	NC_015500	TA	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	332296678
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163	NC_015500	TTC	2	6	7665	7670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332296678
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250	NC_015500	AAAAG	2	10	11718	11727	80 %	0 %	20 %	0 %	332296682
251	NC_015500	AAAG	2	8	11730	11737	75 %	0 %	25 %	0 %	332296682
252	NC_015500	CAGG	2	8	11751	11758	25 %	0 %	50 %	25 %	332296682
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258	NC_015500	A	7	7	11893	11899	100 %	0 %	0 %	0 %	332296682
259	NC_015500	A	6	6	11976	11981	100 %	0 %	0 %	0 %	332296682
260	NC_015500	GAA	2	6	12048	12053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296682
261	NC_015500	A	6	6	12057	12062	100 %	0 %	0 %	0 %	332296682
262	NC_015500	AATGA	2	10	12128	12137	60 %	20 %	20 %	0 %	332296682
263	NC_015500	A	6	6	12348	12353	100 %	0 %	0 %	0 %	332296683
264	NC_015500	CGAC	2	8	12442	12449	25 %	0 %	25 %	50 %	332296683
265	NC_015500	CAG	2	6	12473	12478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296683
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267	NC_015500	AGA	2	6	12499	12504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332296683
268	NC_015500	TGG	2	6	12510	12515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332296683
269	NC_015500	GGA	2	6	12546	12551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332296683
270	NC_015500	CAGG	2	8	12590	12597	25 %	0 %	50 %	25 %	332296683
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272	NC_015500	TGGG	2	8	12617	12624	0 %	25 %	75 %	0 %	332296683
273	NC_015500	TAA	2	6	12650	12655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332296683
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276	NC_015500	ATC	2	6	12806	12811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332296683
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289	NC_015500	A	6	6	13394	13399	100 %	0 %	0 %	0 %	332296683
290	NC_015500	TA	3	6	13403	13408	50 %	50 %	0 %	0 %	332296684
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305	NC_015500	TAT	2	6	13790	13795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332296684
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394	NC_015500	CG	3	6	18678	18683	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
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396	NC_015500	CCG	2	6	18727	18732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296687
397	NC_015500	CGA	2	6	18743	18748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296687
398	NC_015500	TCGC	2	8	18754	18761	0 %	25 %	25 %	50 %	332296687
399	NC_015500	GC	3	6	18795	18800	0 %	0 %	50 %	50 %	332296687
400	NC_015500	TCG	2	6	18835	18840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296687
401	NC_015500	GTT	2	6	18918	18923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332296687
402	NC_015500	T	6	6	18998	19003	0 %	100 %	0 %	0 %	332296687
403	NC_015500	GCC	2	6	19065	19070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332296687
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430	NC_015500	GCA	2	6	20496	20501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332296688
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435	NC_015500	CGT	2	6	20757	20762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332296688
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445	NC_015500	GC	3	6	21078	21083	0 %	0 %	50 %	50 %	332296688
446	NC_015500	CTGT	2	8	21086	21093	0 %	50 %	25 %	25 %	332296688
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471	NC_015500	A	7	7	22593	22599	100 %	0 %	0 %	0 %	332296689
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