MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermodesulfobium narugense DSM 14796 chromosome

Total Repeats: 40647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015499	AAT	2	6	55	60	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294862
2	NC_015499	GTA	2	6	82	87	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294862
3	NC_015499	GAA	2	6	88	93	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
4	NC_015499	A	6	6	92	97	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
5	NC_015499	AAT	2	6	141	146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294862
6	NC_015499	AGA	2	6	153	158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
7	NC_015499	TA	3	6	202	207	50 %	50 %	0 %	0 %	332294862
8	NC_015499	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
9	NC_015499	GAA	2	6	313	318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
10	NC_015499	AAT	2	6	331	336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294862
11	NC_015499	A	7	7	344	350	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
12	NC_015499	T	6	6	363	368	0 %	100 %	0 %	0 %	332294862
13	NC_015499	GCT	2	6	424	429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332294862
14	NC_015499	TTTA	2	8	475	482	25 %	75 %	0 %	0 %	332294862
15	NC_015499	AC	3	6	505	510	50 %	0 %	0 %	50 %	332294862
16	NC_015499	ACA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294862
17	NC_015499	AAG	2	6	537	542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
18	NC_015499	A	6	6	544	549	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
19	NC_015499	TA	3	6	557	562	50 %	50 %	0 %	0 %	332294862
20	NC_015499	TA	4	8	566	573	50 %	50 %	0 %	0 %	332294862
21	NC_015499	TAC	2	6	662	667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294862
22	NC_015499	TAG	2	6	668	673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294862
23	NC_015499	GGAAA	2	10	694	703	60 %	0 %	40 %	0 %	332294862
24	NC_015499	AAG	2	6	710	715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
25	NC_015499	CAAA	2	8	753	760	75 %	0 %	0 %	25 %	332294862
26	NC_015499	ATC	2	6	768	773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294862
27	NC_015499	AGA	2	6	804	809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
28	NC_015499	A	8	8	890	897	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
29	NC_015499	AAG	2	6	1052	1057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
30	NC_015499	ACCA	2	8	1095	1102	50 %	0 %	0 %	50 %	332294862
31	NC_015499	CAAAT	2	10	1138	1147	60 %	20 %	0 %	20 %	332294862
32	NC_015499	AGA	2	6	1149	1154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
33	NC_015499	GAA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
34	NC_015499	TCA	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294862
35	NC_015499	A	6	6	1230	1235	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
36	NC_015499	AGA	2	6	1308	1313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294862
37	NC_015499	TAA	2	6	1317	1322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294862
38	NC_015499	AAT	2	6	1341	1346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294862
39	NC_015499	T	6	6	1362	1367	0 %	100 %	0 %	0 %	332294862
40	NC_015499	A	6	6	1380	1385	100 %	0 %	0 %	0 %	332294862
41	NC_015499	GA	3	6	1612	1617	50 %	0 %	50 %	0 %	332294863
42	NC_015499	TAA	2	6	1633	1638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
43	NC_015499	A	6	6	1653	1658	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
44	NC_015499	CAAA	2	8	1673	1680	75 %	0 %	0 %	25 %	332294863
45	NC_015499	A	6	6	1711	1716	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
46	NC_015499	A	7	7	1720	1726	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
47	NC_015499	ATA	2	6	1778	1783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
48	NC_015499	T	7	7	1819	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	332294863
49	NC_015499	AGAT	2	8	1845	1852	50 %	25 %	25 %	0 %	332294863
50	NC_015499	TAA	2	6	1887	1892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
51	NC_015499	A	6	6	1891	1896	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
52	NC_015499	A	6	6	1908	1913	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
53	NC_015499	ATA	2	6	1943	1948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
54	NC_015499	CAA	2	6	1968	1973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294863
55	NC_015499	TTTAA	2	10	2045	2054	40 %	60 %	0 %	0 %	332294863
56	NC_015499	AAGTTC	2	12	2080	2091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	332294863
57	NC_015499	A	6	6	2139	2144	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
58	NC_015499	AGC	2	6	2155	2160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332294863
59	NC_015499	AAAT	2	8	2190	2197	75 %	25 %	0 %	0 %	332294863
60	NC_015499	AGAT	2	8	2208	2215	50 %	25 %	25 %	0 %	332294863
61	NC_015499	A	7	7	2233	2239	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
62	NC_015499	AAG	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294863
63	NC_015499	TATCA	2	10	2280	2289	40 %	40 %	0 %	20 %	332294863
64	NC_015499	AACACA	2	12	2290	2301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294863
65	NC_015499	A	6	6	2322	2327	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
66	NC_015499	A	6	6	2338	2343	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
67	NC_015499	AATA	2	8	2390	2397	75 %	25 %	0 %	0 %	332294863
68	NC_015499	AGA	2	6	2416	2421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294863
69	NC_015499	A	7	7	2428	2434	100 %	0 %	0 %	0 %	332294863
70	NC_015499	TCA	2	6	2447	2452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294863
71	NC_015499	ACA	2	6	2484	2489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294863
72	NC_015499	ATC	2	6	2503	2508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294863
73	NC_015499	TAA	2	6	2535	2540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
74	NC_015499	AGA	2	6	2548	2553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294863
75	NC_015499	ATC	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294863
76	NC_015499	TAT	2	6	2628	2633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332294863
77	NC_015499	TACA	2	8	2635	2642	50 %	25 %	0 %	25 %	332294863
78	NC_015499	ATA	2	6	2673	2678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294863
79	NC_015499	TA	3	6	2690	2695	50 %	50 %	0 %	0 %	332294863
80	NC_015499	CAT	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294864
81	NC_015499	ATA	2	6	2769	2774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294864
82	NC_015499	A	8	8	2789	2796	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
83	NC_015499	GA	3	6	2808	2813	50 %	0 %	50 %	0 %	332294864
84	NC_015499	TCT	2	6	2833	2838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332294864
85	NC_015499	A	6	6	2872	2877	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
86	NC_015499	ACCAA	2	10	2884	2893	60 %	0 %	0 %	40 %	332294864
87	NC_015499	GC	3	6	2919	2924	0 %	0 %	50 %	50 %	332294864
88	NC_015499	ATG	2	6	2963	2968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294864
89	NC_015499	AAAAT	2	10	2976	2985	80 %	20 %	0 %	0 %	332294864
90	NC_015499	A	6	6	3002	3007	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
91	NC_015499	TA	3	6	3050	3055	50 %	50 %	0 %	0 %	332294864
92	NC_015499	A	6	6	3091	3096	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
93	NC_015499	AGA	2	6	3141	3146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294864
94	NC_015499	AC	3	6	3177	3182	50 %	0 %	0 %	50 %	332294864
95	NC_015499	A	7	7	3183	3189	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
96	NC_015499	A	6	6	3199	3204	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
97	NC_015499	TTA	2	6	3222	3227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332294864
98	NC_015499	AGA	2	6	3280	3285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294864
99	NC_015499	A	6	6	3314	3319	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
100	NC_015499	AGA	2	6	3328	3333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294864
101	NC_015499	A	6	6	3379	3384	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
102	NC_015499	ATT	2	6	3392	3397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332294864
103	NC_015499	ATA	2	6	3419	3424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294864
104	NC_015499	A	6	6	3497	3502	100 %	0 %	0 %	0 %	332294864
105	NC_015499	TGA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294864
106	NC_015499	GTTAT	2	10	3639	3648	20 %	60 %	20 %	0 %	332294864
107	NC_015499	CACATC	2	12	3652	3663	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	332294864
108	NC_015499	T	7	7	3693	3699	0 %	100 %	0 %	0 %	332294864
109	NC_015499	A	6	6	3750	3755	100 %	0 %	0 %	0 %	332294865
110	NC_015499	TAT	2	6	3771	3776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332294865
111	NC_015499	A	7	7	3779	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	332294865
112	NC_015499	TAG	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294865
113	NC_015499	TAA	2	6	3878	3883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294865
114	NC_015499	AG	3	6	3886	3891	50 %	0 %	50 %	0 %	332294865
115	NC_015499	TAGA	2	8	3917	3924	50 %	25 %	25 %	0 %	332294865
116	NC_015499	A	9	9	3928	3936	100 %	0 %	0 %	0 %	332294865
117	NC_015499	AAAC	2	8	3983	3990	75 %	0 %	0 %	25 %	332294865
118	NC_015499	GAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332294865
119	NC_015499	AAAAG	2	10	4005	4014	80 %	0 %	20 %	0 %	332294865
120	NC_015499	A	6	6	4016	4021	100 %	0 %	0 %	0 %	332294865
121	NC_015499	T	7	7	4050	4056	0 %	100 %	0 %	0 %	332294865
122	NC_015499	A	7	7	4083	4089	100 %	0 %	0 %	0 %	332294865
123	NC_015499	AT	4	8	4097	4104	50 %	50 %	0 %	0 %	332294865
124	NC_015499	CAA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332294865
125	NC_015499	AGT	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294866
126	NC_015499	A	7	7	4316	4322	100 %	0 %	0 %	0 %	332294866
127	NC_015499	AGA	2	6	4360	4365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294866
128	NC_015499	AACA	3	12	4398	4409	75 %	0 %	0 %	25 %	332294866
129	NC_015499	ACTA	2	8	4429	4436	50 %	25 %	0 %	25 %	332294866
130	NC_015499	TGG	2	6	4447	4452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332294866
131	NC_015499	TGG	2	6	4483	4488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332294866
132	NC_015499	TA	3	6	4548	4553	50 %	50 %	0 %	0 %	332294866
133	NC_015499	ATA	2	6	4613	4618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332294866
134	NC_015499	AAAAT	2	10	4643	4652	80 %	20 %	0 %	0 %	332294866
135	NC_015499	ATG	2	6	4794	4799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332294866
136	NC_015499	CTA	2	6	4965	4970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332294866
137	NC_015499	AAG	2	6	4971	4976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294866
138	NC_015499	AGA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332294866
139	NC_015499	CAG	2	6	5100	5105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332294866
140	NC_015499	ATT	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332294866
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