MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01

Total Repeats: 3294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015386	AT	3	6	19	24	50 %	50 %	0 %	0 %	328949384
2	NC_015386	T	6	6	63	68	0 %	100 %	0 %	0 %	328949384
3	NC_015386	T	6	6	240	245	0 %	100 %	0 %	0 %	328949384
4	NC_015386	TGA	2	6	385	390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949384
5	NC_015386	CTT	2	6	421	426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949384
6	NC_015386	GAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949385
7	NC_015386	CAG	2	6	655	660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949385
8	NC_015386	A	6	6	664	669	100 %	0 %	0 %	0 %	328949385
9	NC_015386	GAA	2	6	706	711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949385
10	NC_015386	AT	3	6	722	727	50 %	50 %	0 %	0 %	328949385
11	NC_015386	GGCG	2	8	737	744	0 %	0 %	75 %	25 %	328949385
12	NC_015386	GCG	2	6	765	770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949385
13	NC_015386	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	328949385
14	NC_015386	TGA	3	9	816	824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949385
15	NC_015386	ATA	2	6	828	833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949385
16	NC_015386	GAC	2	6	953	958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949386
17	NC_015386	TAT	2	6	1019	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949386
18	NC_015386	TGA	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949386
19	NC_015386	T	6	6	1090	1095	0 %	100 %	0 %	0 %	328949386
20	NC_015386	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949386
21	NC_015386	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949386
22	NC_015386	T	6	6	1263	1268	0 %	100 %	0 %	0 %	328949386
23	NC_015386	AG	4	8	1292	1299	50 %	0 %	50 %	0 %	328949386
24	NC_015386	GAT	2	6	1327	1332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949386
25	NC_015386	TGA	2	6	1341	1346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
26	NC_015386	A	6	6	1350	1355	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
27	NC_015386	CT	3	6	1463	1468	0 %	50 %	0 %	50 %	328949387
28	NC_015386	TC	3	6	1524	1529	0 %	50 %	0 %	50 %	328949387
29	NC_015386	CTC	2	6	1538	1543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949387
30	NC_015386	T	6	6	1567	1572	0 %	100 %	0 %	0 %	328949387
31	NC_015386	TAA	2	6	1601	1606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
32	NC_015386	TAT	2	6	1650	1655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949387
33	NC_015386	ATA	2	6	1696	1701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
34	NC_015386	GT	3	6	1738	1743	0 %	50 %	50 %	0 %	328949387
35	NC_015386	GTT	2	6	1773	1778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949387
36	NC_015386	TA	3	6	1808	1813	50 %	50 %	0 %	0 %	328949387
37	NC_015386	TTC	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949387
38	NC_015386	TGA	2	6	1899	1904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
39	NC_015386	GCA	2	6	1941	1946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949387
40	NC_015386	TCT	2	6	1969	1974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949387
41	NC_015386	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
42	NC_015386	ATTT	2	8	2005	2012	25 %	75 %	0 %	0 %	328949387
43	NC_015386	TAAAA	2	10	2040	2049	80 %	20 %	0 %	0 %	328949387
44	NC_015386	TGA	2	6	2055	2060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
45	NC_015386	CTT	2	6	2109	2114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949387
46	NC_015386	A	8	8	2118	2125	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
47	NC_015386	T	6	6	2143	2148	0 %	100 %	0 %	0 %	328949387
48	NC_015386	TCAAAT	2	12	2179	2190	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	328949387
49	NC_015386	AAT	2	6	2215	2220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
50	NC_015386	TGA	2	6	2277	2282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
51	NC_015386	AAAAAT	2	12	2290	2301	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	328949387
52	NC_015386	TTTC	2	8	2315	2322	0 %	75 %	0 %	25 %	328949387
53	NC_015386	TTTG	2	8	2367	2374	0 %	75 %	25 %	0 %	328949387
54	NC_015386	AAT	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
55	NC_015386	AT	3	6	2492	2497	50 %	50 %	0 %	0 %	328949387
56	NC_015386	TAA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
57	NC_015386	GAA	2	6	2518	2523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949387
58	NC_015386	ATTA	2	8	2544	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	328949387
59	NC_015386	CGG	2	6	2568	2573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949387
60	NC_015386	GCA	2	6	2702	2707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949387
61	NC_015386	AGA	2	6	2775	2780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949387
62	NC_015386	TA	3	6	2798	2803	50 %	50 %	0 %	0 %	328949387
63	NC_015386	TAA	3	9	2811	2819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
64	NC_015386	GTT	2	6	2944	2949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949387
65	NC_015386	A	6	6	2984	2989	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
66	NC_015386	TTA	2	6	3032	3037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949387
67	NC_015386	T	6	6	3073	3078	0 %	100 %	0 %	0 %	328949387
68	NC_015386	TAA	2	6	3306	3311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
69	NC_015386	GAAG	2	8	3327	3334	50 %	0 %	50 %	0 %	328949387
70	NC_015386	TCC	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949387
71	NC_015386	GTG	2	6	3542	3547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949387
72	NC_015386	TAA	2	6	3615	3620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949387
73	NC_015386	GGT	2	6	3637	3642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949387
74	NC_015386	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
75	NC_015386	A	6	6	3780	3785	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
76	NC_015386	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949387
77	NC_015386	GATT	2	8	3828	3835	25 %	50 %	25 %	0 %	328949387
78	NC_015386	AG	3	6	3871	3876	50 %	0 %	50 %	0 %	328949387
79	NC_015386	TGA	2	6	3903	3908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
80	NC_015386	GTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949387
81	NC_015386	TTG	2	6	3932	3937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949387
82	NC_015386	AGA	2	6	4022	4027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949387
83	NC_015386	CTT	2	6	4047	4052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949387
84	NC_015386	TTG	2	6	4061	4066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949387
85	NC_015386	A	6	6	4133	4138	100 %	0 %	0 %	0 %	328949387
86	NC_015386	TGAA	2	8	4157	4164	50 %	25 %	25 %	0 %	328949387
87	NC_015386	TGA	2	6	4200	4205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949387
88	NC_015386	ATT	2	6	4252	4257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949387
89	NC_015386	GAAAG	2	10	4260	4269	60 %	0 %	40 %	0 %	328949387
90	NC_015386	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949388
91	NC_015386	TA	4	8	4301	4308	50 %	50 %	0 %	0 %	328949388
92	NC_015386	AAGAT	2	10	4318	4327	60 %	20 %	20 %	0 %	328949388
93	NC_015386	A	6	6	4337	4342	100 %	0 %	0 %	0 %	328949388
94	NC_015386	ATG	2	6	4348	4353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949388
95	NC_015386	TAAT	2	8	4357	4364	50 %	50 %	0 %	0 %	328949388
96	NC_015386	ATT	2	6	4416	4421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949388
97	NC_015386	AAC	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949388
98	NC_015386	TAA	2	6	4477	4482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949388
99	NC_015386	AT	3	6	4558	4563	50 %	50 %	0 %	0 %	328949388
100	NC_015386	A	6	6	4761	4766	100 %	0 %	0 %	0 %	328949388
101	NC_015386	AGA	2	6	4818	4823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949389
102	NC_015386	TTG	2	6	4868	4873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949389
103	NC_015386	GGA	2	6	4954	4959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949389
104	NC_015386	AAT	2	6	5032	5037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949389
105	NC_015386	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	328949389
106	NC_015386	AGC	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949389
107	NC_015386	CAG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949389
108	NC_015386	ATA	2	6	5132	5137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949389
109	NC_015386	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949389
110	NC_015386	TTG	2	6	5222	5227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949389
111	NC_015386	AGC	2	6	5328	5333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949389
112	NC_015386	ATG	2	6	5368	5373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949389
113	NC_015386	ATT	2	6	5381	5386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949389
114	NC_015386	TATG	2	8	5400	5407	25 %	50 %	25 %	0 %	328949389
115	NC_015386	GTG	2	6	5486	5491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949389
116	NC_015386	GTT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949389
117	NC_015386	TCG	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949389
118	NC_015386	AC	3	6	5747	5752	50 %	0 %	0 %	50 %	328949389
119	NC_015386	A	7	7	5764	5770	100 %	0 %	0 %	0 %	328949389
120	NC_015386	TTTG	2	8	5820	5827	0 %	75 %	25 %	0 %	328949389
121	NC_015386	TGA	3	9	5862	5870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949389
122	NC_015386	CCT	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949389
123	NC_015386	TGT	2	6	5904	5909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949389
124	NC_015386	CTG	2	6	5939	5944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949389
125	NC_015386	TGT	2	6	5949	5954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949389
126	NC_015386	AAT	2	6	5987	5992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949389
127	NC_015386	ATT	2	6	6053	6058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949390
128	NC_015386	CTG	2	6	6143	6148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949390
129	NC_015386	GAT	2	6	6157	6162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949390
130	NC_015386	TGG	2	6	6268	6273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949390
131	NC_015386	GTG	2	6	6410	6415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949390
132	NC_015386	TTA	2	6	6529	6534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949391
133	NC_015386	A	7	7	6534	6540	100 %	0 %	0 %	0 %	328949391
134	NC_015386	T	9	9	6552	6560	0 %	100 %	0 %	0 %	328949391
135	NC_015386	A	6	6	6627	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	328949391
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137	NC_015386	TAA	2	6	6643	6648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949391
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