MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema succinifaciens DSM 2489 plasmid pTRESU01

Total Repeats: 3294

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015386	T	7	7	146842	146848	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3002	NC_015386	T	6	6	146898	146903	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3003	NC_015386	CAA	2	6	147011	147016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949528
3004	NC_015386	TGAA	2	8	147019	147026	50 %	25 %	25 %	0 %	328949528
3005	NC_015386	TCA	2	6	147043	147048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949528
3006	NC_015386	GCAA	2	8	147157	147164	50 %	0 %	25 %	25 %	328949528
3007	NC_015386	CTT	2	6	147173	147178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949528
3008	NC_015386	CTG	2	6	147182	147187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949528
3009	NC_015386	T	6	6	147190	147195	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3010	NC_015386	TAT	2	6	147212	147217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949528
3011	NC_015386	T	6	6	147289	147294	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3012	NC_015386	AACTG	2	10	147300	147309	40 %	20 %	20 %	20 %	328949528
3013	NC_015386	TCCGC	2	10	147326	147335	0 %	20 %	20 %	60 %	328949528
3014	NC_015386	CTT	2	6	147358	147363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949528
3015	NC_015386	TAA	2	6	147370	147375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949528
3016	NC_015386	T	6	6	147409	147414	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3017	NC_015386	CTTT	2	8	147423	147430	0 %	75 %	0 %	25 %	328949528
3018	NC_015386	T	6	6	147438	147443	0 %	100 %	0 %	0 %	328949528
3019	NC_015386	GAA	2	6	147510	147515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949528
3020	NC_015386	T	6	6	147646	147651	0 %	100 %	0 %	0 %	328949529
3021	NC_015386	CTA	2	6	147665	147670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949529
3022	NC_015386	TCA	2	6	147680	147685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949529
3023	NC_015386	AGC	2	6	147762	147767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949529
3024	NC_015386	ACA	2	6	147775	147780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949529
3025	NC_015386	CAA	2	6	147810	147815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949529
3026	NC_015386	ACAT	2	8	147872	147879	50 %	25 %	0 %	25 %	328949529
3027	NC_015386	T	6	6	147989	147994	0 %	100 %	0 %	0 %	328949530
3028	NC_015386	ATC	2	6	148093	148098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949530
3029	NC_015386	T	6	6	148214	148219	0 %	100 %	0 %	0 %	328949531
3030	NC_015386	TTCT	2	8	148221	148228	0 %	75 %	0 %	25 %	328949531
3031	NC_015386	ATGA	2	8	148276	148283	50 %	25 %	25 %	0 %	328949531
3032	NC_015386	TTC	2	6	148355	148360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949531
3033	NC_015386	TCCG	2	8	148379	148386	0 %	25 %	25 %	50 %	328949531
3034	NC_015386	TGT	2	6	148401	148406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949531
3035	NC_015386	AAG	2	6	148447	148452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949531
3036	NC_015386	ATC	2	6	148456	148461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3037	NC_015386	CT	3	6	148485	148490	0 %	50 %	0 %	50 %	328949531
3038	NC_015386	ATC	2	6	148526	148531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3039	NC_015386	TCA	2	6	148562	148567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3040	NC_015386	TTC	2	6	148589	148594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949531
3041	NC_015386	ATC	2	6	148666	148671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3042	NC_015386	T	6	6	148714	148719	0 %	100 %	0 %	0 %	328949531
3043	NC_015386	TCA	2	6	148862	148867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3044	NC_015386	T	6	6	148905	148910	0 %	100 %	0 %	0 %	328949531
3045	NC_015386	GCC	2	6	148939	148944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949531
3046	NC_015386	AGAA	2	8	148972	148979	75 %	0 %	25 %	0 %	328949531
3047	NC_015386	TCA	2	6	148992	148997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949531
3048	NC_015386	GTC	2	6	149085	149090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949532
3049	NC_015386	TCA	2	6	149104	149109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949532
3050	NC_015386	TTCT	2	8	149173	149180	0 %	75 %	0 %	25 %	328949532
3051	NC_015386	GTT	2	6	149208	149213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949532
3052	NC_015386	AT	3	6	149254	149259	50 %	50 %	0 %	0 %	328949532
3053	NC_015386	T	6	6	149270	149275	0 %	100 %	0 %	0 %	328949532
3054	NC_015386	TGA	2	6	149351	149356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949532
3055	NC_015386	ATCA	2	8	149412	149419	50 %	25 %	0 %	25 %	328949532
3056	NC_015386	AGA	2	6	149461	149466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949532
3057	NC_015386	TGAA	2	8	149538	149545	50 %	25 %	25 %	0 %	328949532
3058	NC_015386	TAA	2	6	149635	149640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949532
3059	NC_015386	ATC	2	6	149641	149646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949532
3060	NC_015386	TGT	2	6	149651	149656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949532
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3062	NC_015386	A	7	7	150340	150346	100 %	0 %	0 %	0 %	328949533
3063	NC_015386	ACA	2	6	150382	150387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949533
3064	NC_015386	A	7	7	150426	150432	100 %	0 %	0 %	0 %	328949533
3065	NC_015386	GTT	2	6	150541	150546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	328949533
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3067	NC_015386	CAA	2	6	150581	150586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949533
3068	NC_015386	GCGA	2	8	150631	150638	25 %	0 %	50 %	25 %	328949533
3069	NC_015386	GAA	2	6	150676	150681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949533
3070	NC_015386	ATT	2	6	150701	150706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949533
3071	NC_015386	GAA	2	6	150742	150747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	328949533
3072	NC_015386	A	6	6	150847	150852	100 %	0 %	0 %	0 %	328949533
3073	NC_015386	AATC	2	8	150900	150907	50 %	25 %	0 %	25 %	328949533
3074	NC_015386	CAT	2	6	150927	150932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949533
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3078	NC_015386	TAAAA	2	10	151082	151091	80 %	20 %	0 %	0 %	328949533
3079	NC_015386	T	6	6	151138	151143	0 %	100 %	0 %	0 %	328949534
3080	NC_015386	TGA	2	6	151177	151182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949534
3081	NC_015386	AAAG	2	8	151199	151206	75 %	0 %	25 %	0 %	328949534
3082	NC_015386	CTG	2	6	151230	151235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949534
3083	NC_015386	CAA	2	6	151268	151273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949534
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3086	NC_015386	AATG	2	8	151309	151316	50 %	25 %	25 %	0 %	328949534
3087	NC_015386	AT	3	6	151387	151392	50 %	50 %	0 %	0 %	328949534
3088	NC_015386	TCT	2	6	151397	151402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949534
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3090	NC_015386	A	6	6	151476	151481	100 %	0 %	0 %	0 %	328949534
3091	NC_015386	A	8	8	151486	151493	100 %	0 %	0 %	0 %	328949535
3092	NC_015386	AAAAC	2	10	151497	151506	80 %	0 %	0 %	20 %	328949535
3093	NC_015386	A	6	6	151579	151584	100 %	0 %	0 %	0 %	328949535
3094	NC_015386	TA	3	6	151595	151600	50 %	50 %	0 %	0 %	328949535
3095	NC_015386	T	7	7	151606	151612	0 %	100 %	0 %	0 %	328949535
3096	NC_015386	ACA	2	6	151613	151618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	328949535
3097	NC_015386	CCTT	2	8	151624	151631	0 %	50 %	0 %	50 %	328949535
3098	NC_015386	CTT	2	6	151733	151738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949535
3099	NC_015386	AGAA	2	8	151774	151781	75 %	0 %	25 %	0 %	328949535
3100	NC_015386	TTA	2	6	151791	151796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949535
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3103	NC_015386	TTAT	2	8	151936	151943	25 %	75 %	0 %	0 %	328949535
3104	NC_015386	ATT	2	6	152051	152056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949535
3105	NC_015386	A	6	6	152068	152073	100 %	0 %	0 %	0 %	328949535
3106	NC_015386	CAG	2	6	152129	152134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949535
3107	NC_015386	ATT	2	6	152151	152156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949535
3108	NC_015386	TAA	2	6	152218	152223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	328949535
3109	NC_015386	GTTG	2	8	152266	152273	0 %	50 %	50 %	0 %	328949535
3110	NC_015386	ATT	2	6	152325	152330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949535
3111	NC_015386	TAT	2	6	152369	152374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949535
3112	NC_015386	GAT	2	6	152450	152455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949535
3113	NC_015386	TCA	2	6	152474	152479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949535
3114	NC_015386	AC	3	6	153001	153006	50 %	0 %	0 %	50 %	328949536
3115	NC_015386	TC	3	6	153009	153014	0 %	50 %	0 %	50 %	328949536
3116	NC_015386	CTG	2	6	153036	153041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949536
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3118	NC_015386	GAG	2	6	153138	153143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949536
3119	NC_015386	CTT	2	6	153155	153160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949536
3120	NC_015386	GCTG	2	8	153162	153169	0 %	25 %	50 %	25 %	328949536
3121	NC_015386	GGGC	2	8	153319	153326	0 %	0 %	75 %	25 %	328949536
3122	NC_015386	TCT	2	6	153332	153337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949536
3123	NC_015386	CTT	2	6	153377	153382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949536
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3125	NC_015386	T	8	8	153500	153507	0 %	100 %	0 %	0 %	328949536
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.