MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015315	CCGA	2	8	136440	136447	25 %	0 %	25 %	50 %	327310060
3002	NC_015315	GC	4	8	136533	136540	0 %	0 %	50 %	50 %	327310060
3003	NC_015315	GCG	2	6	136576	136581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3004	NC_015315	CGG	2	6	136586	136591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3005	NC_015315	CGG	2	6	136598	136603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3006	NC_015315	CGC	2	6	136607	136612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
3007	NC_015315	CGG	2	6	136618	136623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3008	NC_015315	TAT	2	6	136643	136648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310060
3009	NC_015315	AAG	2	6	136686	136691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310060
3010	NC_015315	GC	3	6	136714	136719	0 %	0 %	50 %	50 %	327310060
3011	NC_015315	CGA	2	6	136763	136768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310060
3012	NC_015315	CGG	2	6	136775	136780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3013	NC_015315	TACA	2	8	136790	136797	50 %	25 %	0 %	25 %	327310060
3014	NC_015315	CGC	2	6	136886	136891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
3015	NC_015315	AGT	2	6	136894	136899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310060
3016	NC_015315	CGGC	2	8	136924	136931	0 %	0 %	50 %	50 %	327310060
3017	NC_015315	GCG	2	6	136966	136971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3018	NC_015315	CGC	2	6	137072	137077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
3019	NC_015315	AAT	2	6	137092	137097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310060
3020	NC_015315	AT	3	6	137101	137106	50 %	50 %	0 %	0 %	327310060
3021	NC_015315	TCC	2	6	137153	137158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310060
3022	NC_015315	TTA	2	6	137164	137169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310060
3023	NC_015315	TA	3	6	137168	137173	50 %	50 %	0 %	0 %	327310060
3024	NC_015315	ATT	2	6	137178	137183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310060
3025	NC_015315	CGG	2	6	137213	137218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3026	NC_015315	GTT	2	6	137240	137245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310060
3027	NC_015315	GAA	2	6	137273	137278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310060
3028	NC_015315	AGG	2	6	137500	137505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310060
3029	NC_015315	TAGC	2	8	137526	137533	25 %	25 %	25 %	25 %	327310060
3030	NC_015315	TGA	2	6	137557	137562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310060
3031	NC_015315	G	6	6	137584	137589	0 %	0 %	100 %	0 %	327310060
3032	NC_015315	CGG	2	6	137594	137599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
3033	NC_015315	GCC	2	6	137613	137618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
3034	NC_015315	AGG	2	6	137801	137806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310061
3035	NC_015315	G	6	6	137832	137837	0 %	0 %	100 %	0 %	327310061
3036	NC_015315	GAGG	2	8	137865	137872	25 %	0 %	75 %	0 %	327310061
3037	NC_015315	G	6	6	137906	137911	0 %	0 %	100 %	0 %	327310061
3038	NC_015315	CGCGG	2	10	137932	137941	0 %	0 %	60 %	40 %	327310061
3039	NC_015315	CGG	2	6	138018	138023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3040	NC_015315	CTT	2	6	138030	138035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310061
3041	NC_015315	CGG	3	9	138036	138044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3042	NC_015315	ACG	2	6	138119	138124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3043	NC_015315	TAC	3	9	138202	138210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310061
3044	NC_015315	G	6	6	138216	138221	0 %	0 %	100 %	0 %	327310061
3045	NC_015315	CGT	3	9	138270	138278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3046	NC_015315	CGT	2	6	138321	138326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3047	NC_015315	ACG	2	6	138407	138412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3048	NC_015315	GAG	2	6	138417	138422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310061
3049	NC_015315	GGA	2	6	138519	138524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310061
3050	NC_015315	GCG	2	6	138538	138543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3051	NC_015315	CGA	2	6	138555	138560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3052	NC_015315	GACG	2	8	138580	138587	25 %	0 %	50 %	25 %	327310061
3053	NC_015315	AT	3	6	138633	138638	50 %	50 %	0 %	0 %	327310061
3054	NC_015315	GCG	2	6	138646	138651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3055	NC_015315	ACG	2	6	138674	138679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310061
3056	NC_015315	GCG	2	6	138680	138685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3057	NC_015315	GCG	2	6	138746	138751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310061
3058	NC_015315	AT	3	6	138790	138795	50 %	50 %	0 %	0 %	327310061
3059	NC_015315	CCT	2	6	138820	138825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310062
3060	NC_015315	ACT	2	6	138881	138886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310062
3061	NC_015315	CTC	2	6	138901	138906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310062
3062	NC_015315	CGC	2	6	138915	138920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310062
3063	NC_015315	ACC	2	6	138929	138934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310062
3064	NC_015315	TCG	2	6	139085	139090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3065	NC_015315	CCA	2	6	139092	139097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310062
3066	NC_015315	CT	3	6	139137	139142	0 %	50 %	0 %	50 %	327310062
3067	NC_015315	C	6	6	139151	139156	0 %	0 %	0 %	100 %	327310062
3068	NC_015315	GGC	2	6	139193	139198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310062
3069	NC_015315	CGT	2	6	139242	139247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3070	NC_015315	G	6	6	139266	139271	0 %	0 %	100 %	0 %	327310062
3071	NC_015315	CCTC	2	8	139281	139288	0 %	25 %	0 %	75 %	327310062
3072	NC_015315	CGGCG	2	10	139341	139350	0 %	0 %	60 %	40 %	327310062
3073	NC_015315	TCG	2	6	139452	139457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3074	NC_015315	CGA	2	6	139479	139484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3075	NC_015315	CGT	2	6	139500	139505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310062
3076	NC_015315	CTT	2	6	139546	139551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310062
3077	NC_015315	CTC	2	6	139567	139572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310062
3078	NC_015315	TAT	2	6	139634	139639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310063
3079	NC_015315	CTCCCT	2	12	139659	139670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3080	NC_015315	CCT	2	6	139676	139681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3081	NC_015315	TCC	2	6	139723	139728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310063
3082	NC_015315	GGC	2	6	139738	139743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3083	NC_015315	CGACG	2	10	139764	139773	20 %	0 %	40 %	40 %	327310063
3084	NC_015315	AG	3	6	139781	139786	50 %	0 %	50 %	0 %	327310063
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3087	NC_015315	CTT	2	6	139956	139961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310063
3088	NC_015315	CAC	2	6	140001	140006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310063
3089	NC_015315	TCG	2	6	140026	140031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310063
3090	NC_015315	AGG	2	6	140056	140061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310063
3091	NC_015315	CCG	2	6	140092	140097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310063
3092	NC_015315	GAA	2	6	140220	140225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310063
3093	NC_015315	CTGG	2	8	140262	140269	0 %	25 %	50 %	25 %	327310063
3094	NC_015315	GCG	2	6	140289	140294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3095	NC_015315	CGG	2	6	140382	140387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310063
3096	NC_015315	GAC	2	6	140532	140537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310063
3097	NC_015315	ACGCC	2	10	140561	140570	20 %	0 %	20 %	60 %	327310063
3098	NC_015315	ACG	2	6	140665	140670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310064
3099	NC_015315	TCC	2	6	140691	140696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310064
3100	NC_015315	C	6	6	140795	140800	0 %	0 %	0 %	100 %	327310064
3101	NC_015315	TCCT	2	8	140817	140824	0 %	50 %	0 %	50 %	327310064
3102	NC_015315	CGC	2	6	140836	140841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310064
3103	NC_015315	ACC	2	6	140897	140902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310065
3104	NC_015315	CCT	2	6	140919	140924	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3105	NC_015315	CGT	2	6	140940	140945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3106	NC_015315	GCC	2	6	140951	140956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310065
3107	NC_015315	GCGGG	2	10	140998	141007	0 %	0 %	80 %	20 %	327310065
3108	NC_015315	ACG	2	6	141011	141016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3109	NC_015315	CTT	3	9	141043	141051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3110	NC_015315	CCT	2	6	141057	141062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3111	NC_015315	CCT	2	6	141186	141191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3112	NC_015315	CGG	2	6	141199	141204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310065
3113	NC_015315	CCT	2	6	141246	141251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3114	NC_015315	TTG	2	6	141313	141318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310065
3115	NC_015315	GCC	2	6	141338	141343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310065
3116	NC_015315	CTCC	2	8	141370	141377	0 %	25 %	0 %	75 %	327310065
3117	NC_015315	CTT	2	6	141391	141396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3118	NC_015315	CTC	2	6	141419	141424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3119	NC_015315	CCT	2	6	141489	141494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310065
3120	NC_015315	ACC	2	6	141530	141535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310065
3121	NC_015315	TCG	2	6	141569	141574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310065
3122	NC_015315	TCT	2	6	141603	141608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310065
3123	NC_015315	GGT	2	6	141772	141777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310066
3124	NC_015315	GAG	2	6	141827	141832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310066
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3127	NC_015315	GTA	2	6	141889	141894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310066
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3129	NC_015315	GGC	2	6	141937	141942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310066
3130	NC_015315	GTC	2	6	141989	141994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310066
3131	NC_015315	ACG	2	6	142082	142087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310066
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3366	NC_015315	GGA	2	6	152887	152892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310076
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3370	NC_015315	GGC	3	9	153133	153141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310076
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3375	NC_015315	GCA	2	6	153640	153645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310077
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3377	NC_015315	GCC	2	6	153697	153702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310077
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3380	NC_015315	GCG	2	6	153799	153804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310077
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3394	NC_015315	CGA	2	6	154455	154460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310077
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3401	NC_015315	TCG	2	6	154741	154746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310077
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3478	NC_015315	TCC	2	6	158321	158326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310082
3479	NC_015315	TA	3	6	158415	158420	50 %	50 %	0 %	0 %	327310082
3480	NC_015315	CTATC	2	10	158522	158531	20 %	40 %	0 %	40 %	327310082
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3483	NC_015315	CTG	2	6	158904	158909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310082
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3485	NC_015315	TCC	2	6	159070	159075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310083
3486	NC_015315	CTT	3	9	159087	159095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310083
3487	NC_015315	GAC	2	6	159132	159137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310083
3488	NC_015315	CCT	2	6	159194	159199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310083
3489	NC_015315	CGG	2	6	159200	159205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310083
3490	NC_015315	GGC	2	6	159254	159259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310083
3491	NC_015315	CCA	2	6	159266	159271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310083
3492	NC_015315	CCT	2	6	159381	159386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310083
3493	NC_015315	TCG	2	6	159391	159396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310083
3494	NC_015315	CGCC	2	8	159412	159419	0 %	0 %	25 %	75 %	327310083
3495	NC_015315	TCG	2	6	159433	159438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310083
3496	NC_015315	TCG	2	6	159466	159471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310083
3497	NC_015315	GAG	2	6	159486	159491	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310083
3498	NC_015315	TCG	2	6	159508	159513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310083
3499	NC_015315	TCC	3	9	159520	159528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310083
3500	NC_015315	ACT	2	6	159544	159549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310083

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