MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015315	GCC	2	6	112717	112722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310035
2502	NC_015315	GGAGT	2	10	112806	112815	20 %	20 %	60 %	0 %	327310036
2503	NC_015315	CCG	2	6	112913	112918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310036
2504	NC_015315	CGT	2	6	112931	112936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310036
2505	NC_015315	AGG	3	9	112968	112976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310036
2506	NC_015315	GGT	2	6	112979	112984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310036
2507	NC_015315	CGT	2	6	113009	113014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310036
2508	NC_015315	CTC	2	6	113235	113240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310037
2509	NC_015315	GCC	3	9	113271	113279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310037
2510	NC_015315	CCG	2	6	113329	113334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310037
2511	NC_015315	ACG	2	6	113386	113391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310037
2512	NC_015315	AGC	2	6	113403	113408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310037
2513	NC_015315	CGC	2	6	113426	113431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310037
2514	NC_015315	AGG	2	6	113465	113470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310038
2515	NC_015315	AG	3	6	113594	113599	50 %	0 %	50 %	0 %	327310038
2516	NC_015315	GAC	2	6	113626	113631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310038
2517	NC_015315	TCC	2	6	113645	113650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310038
2518	NC_015315	AGG	2	6	113681	113686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310038
2519	NC_015315	TCC	2	6	113705	113710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310038
2520	NC_015315	TCCTTT	2	12	114115	114126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310039
2521	NC_015315	CGT	2	6	114141	114146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310039
2522	NC_015315	GGC	2	6	114202	114207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310039
2523	NC_015315	CTC	3	9	114239	114247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310039
2524	NC_015315	CCA	2	6	114264	114269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310039
2525	NC_015315	GAG	2	6	114295	114300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310039
2526	NC_015315	GCG	2	6	114331	114336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310039
2527	NC_015315	CT	3	6	114350	114355	0 %	50 %	0 %	50 %	327310039
2528	NC_015315	TCC	2	6	114383	114388	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310039
2529	NC_015315	GA	4	8	114399	114406	50 %	0 %	50 %	0 %	327310039
2530	NC_015315	TG	3	6	114464	114469	0 %	50 %	50 %	0 %	327310039
2531	NC_015315	CTT	2	6	114553	114558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310039
2532	NC_015315	CCT	2	6	114576	114581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310039
2533	NC_015315	CACGGA	2	12	114598	114609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310039
2534	NC_015315	CGGTGT	2	12	115356	115367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	327310040
2535	NC_015315	G	6	6	115418	115423	0 %	0 %	100 %	0 %	327310040
2536	NC_015315	CGTTG	2	10	115424	115433	0 %	40 %	40 %	20 %	327310040
2537	NC_015315	GGA	2	6	115434	115439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310040
2538	NC_015315	ACCT	2	8	115511	115518	25 %	25 %	0 %	50 %	327310040
2539	NC_015315	CGCGG	2	10	115541	115550	0 %	0 %	60 %	40 %	327310040
2540	NC_015315	GGCC	2	8	115582	115589	0 %	0 %	50 %	50 %	327310040
2541	NC_015315	ACGGG	2	10	115596	115605	20 %	0 %	60 %	20 %	327310040
2542	NC_015315	GAG	2	6	115616	115621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310040
2543	NC_015315	CCGTCG	2	12	115695	115706	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327310040
2544	NC_015315	CCG	2	6	115725	115730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310040
2545	NC_015315	GGA	2	6	115774	115779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310040
2546	NC_015315	GGC	2	6	115786	115791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310040
2547	NC_015315	G	6	6	115808	115813	0 %	0 %	100 %	0 %	327310040
2548	NC_015315	CTC	2	6	116047	116052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310041
2549	NC_015315	CCG	2	6	116054	116059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310041
2550	NC_015315	GAG	2	6	116177	116182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310041
2551	NC_015315	GC	3	6	116207	116212	0 %	0 %	50 %	50 %	327310041
2552	NC_015315	GAG	2	6	116242	116247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310041
2553	NC_015315	GCC	2	6	116253	116258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310041
2554	NC_015315	CTC	2	6	116276	116281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310041
2555	NC_015315	CGC	2	6	116289	116294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310041
2556	NC_015315	CGG	2	6	116298	116303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310041
2557	NC_015315	CTCC	2	8	116392	116399	0 %	25 %	0 %	75 %	327310041
2558	NC_015315	GCTC	2	8	116406	116413	0 %	25 %	25 %	50 %	327310041
2559	NC_015315	TG	3	6	116476	116481	0 %	50 %	50 %	0 %	327310041
2560	NC_015315	GCC	2	6	116553	116558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310041
2561	NC_015315	GGA	2	6	116559	116564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310041
2562	NC_015315	CGG	2	6	116592	116597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310041
2563	NC_015315	CTG	2	6	116621	116626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310041
2564	NC_015315	AGG	2	6	116636	116641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310041
2565	NC_015315	GAG	2	6	116674	116679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310041
2566	NC_015315	CG	3	6	116682	116687	0 %	0 %	50 %	50 %	327310041
2567	NC_015315	TGG	2	6	116747	116752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310041
2568	NC_015315	ACT	2	6	116759	116764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310041
2569	NC_015315	ACT	2	6	116769	116774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310041
2570	NC_015315	GAC	2	6	116824	116829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310041
2571	NC_015315	CGG	2	6	116842	116847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310041
2572	NC_015315	CTA	2	6	116851	116856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310041
2573	NC_015315	GGC	3	9	116869	116877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310041
2574	NC_015315	GC	3	6	116887	116892	0 %	0 %	50 %	50 %	327310041
2575	NC_015315	AGGC	2	8	116900	116907	25 %	0 %	50 %	25 %	327310041
2576	NC_015315	GGT	2	6	116911	116916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310041
2577	NC_015315	CGA	2	6	117016	117021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310041
2578	NC_015315	GAC	2	6	117204	117209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2579	NC_015315	AGGACA	2	12	117278	117289	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	327310042
2580	NC_015315	CGG	2	6	117305	117310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310042
2581	NC_015315	AT	3	6	117338	117343	50 %	50 %	0 %	0 %	327310042
2582	NC_015315	GGA	2	6	117366	117371	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2583	NC_015315	CGT	2	6	117384	117389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2584	NC_015315	AGG	2	6	117404	117409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2585	NC_015315	CT	3	6	117414	117419	0 %	50 %	0 %	50 %	327310042
2586	NC_015315	CTG	2	6	117520	117525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2587	NC_015315	GAG	3	9	117532	117540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2588	NC_015315	TA	3	6	117559	117564	50 %	50 %	0 %	0 %	327310042
2589	NC_015315	ACA	2	6	117569	117574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310042
2590	NC_015315	GGCC	2	8	117650	117657	0 %	0 %	50 %	50 %	327310042
2591	NC_015315	TCA	2	6	117662	117667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310042
2592	NC_015315	TCG	2	6	117680	117685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2593	NC_015315	AGG	3	9	117727	117735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2594	NC_015315	GCT	2	6	117774	117779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2595	NC_015315	TCG	2	6	117812	117817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310042
2596	NC_015315	CCA	2	6	117824	117829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310042
2597	NC_015315	GCG	2	6	117859	117864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310042
2598	NC_015315	GCGCG	2	10	117876	117885	0 %	0 %	60 %	40 %	327310042
2599	NC_015315	TGG	2	6	117997	118002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310042
2600	NC_015315	GAG	2	6	118030	118035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2601	NC_015315	TCA	2	6	118052	118057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310042
2602	NC_015315	AGG	2	6	118117	118122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2603	NC_015315	CTT	2	6	118132	118137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310042
2604	NC_015315	GGA	2	6	118173	118178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2605	NC_015315	CGC	2	6	118206	118211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310042
2606	NC_015315	GAG	2	6	118222	118227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310042
2607	NC_015315	GGC	2	6	118228	118233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310042
2608	NC_015315	CGG	2	6	118277	118282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310042
2609	NC_015315	GTC	2	6	118311	118316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310043
2610	NC_015315	G	6	6	118435	118440	0 %	0 %	100 %	0 %	327310043
2611	NC_015315	G	6	6	118456	118461	0 %	0 %	100 %	0 %	327310043
2612	NC_015315	GTC	2	6	118464	118469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310043
2613	NC_015315	CGT	2	6	118529	118534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310043
2614	NC_015315	GGCT	2	8	118619	118626	0 %	25 %	50 %	25 %	327310043
2615	NC_015315	CCT	2	6	118676	118681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310043
2616	NC_015315	CAC	2	6	118721	118726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310043
2617	NC_015315	CGCC	2	8	118742	118749	0 %	0 %	25 %	75 %	327310043
2618	NC_015315	CTAGGG	2	12	118774	118785	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327310043
2619	NC_015315	CG	3	6	118786	118791	0 %	0 %	50 %	50 %	327310043
2620	NC_015315	TGT	2	6	118801	118806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310043
2621	NC_015315	ACG	2	6	118861	118866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310043
2622	NC_015315	CGAGG	2	10	118982	118991	20 %	0 %	60 %	20 %	327310043
2623	NC_015315	TGG	2	6	119004	119009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310043
2624	NC_015315	GAG	3	9	119073	119081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310043
2625	NC_015315	GGC	2	6	119087	119092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310043
2626	NC_015315	GAGGC	2	10	119097	119106	20 %	0 %	60 %	20 %	327310043
2627	NC_015315	CGA	2	6	119120	119125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310043
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2629	NC_015315	GCTC	2	8	119219	119226	0 %	25 %	25 %	50 %	327310044
2630	NC_015315	CCTC	2	8	119229	119236	0 %	25 %	0 %	75 %	327310044
2631	NC_015315	CCTC	2	8	119264	119271	0 %	25 %	0 %	75 %	327310044
2632	NC_015315	TCC	2	6	119389	119394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310044
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2635	NC_015315	GGA	3	9	119522	119530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310044
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2638	NC_015315	CTT	2	6	119778	119783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310044
2639	NC_015315	GTC	2	6	119793	119798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310044
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2641	NC_015315	TA	4	8	119973	119980	50 %	50 %	0 %	0 %	327310045
2642	NC_015315	GTCT	2	8	119988	119995	0 %	50 %	25 %	25 %	327310045
2643	NC_015315	AGG	3	9	120008	120016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310045
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2645	NC_015315	CTC	2	6	120046	120051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310045
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2650	NC_015315	AGG	3	9	120210	120218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310046
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2652	NC_015315	GGC	2	6	120247	120252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310046
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2654	NC_015315	GGGC	2	8	120333	120340	0 %	0 %	75 %	25 %	327310046
2655	NC_015315	GC	3	6	120339	120344	0 %	0 %	50 %	50 %	327310046
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2725	NC_015315	TCCG	2	8	123483	123490	0 %	25 %	25 %	50 %	327310047
2726	NC_015315	CAT	2	6	123612	123617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310048
2727	NC_015315	AC	3	6	123641	123646	50 %	0 %	0 %	50 %	327310048
2728	NC_015315	GAG	2	6	123652	123657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310048
2729	NC_015315	ACG	2	6	123662	123667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310048
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2733	NC_015315	ACACCC	2	12	123767	123778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310048
2734	NC_015315	GCG	2	6	123788	123793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310048
2735	NC_015315	CCT	2	6	123803	123808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310048
2736	NC_015315	AG	3	6	123813	123818	50 %	0 %	50 %	0 %	327310048
2737	NC_015315	CGA	2	6	123872	123877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310048
2738	NC_015315	GCCCC	2	10	123888	123897	0 %	0 %	20 %	80 %	327310048
2739	NC_015315	GCG	2	6	123941	123946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310048
2740	NC_015315	GC	3	6	124001	124006	0 %	0 %	50 %	50 %	327310048
2741	NC_015315	AGG	2	6	124024	124029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310048
2742	NC_015315	GGGC	2	8	124104	124111	0 %	0 %	75 %	25 %	327310048
2743	NC_015315	GTG	2	6	124144	124149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310048
2744	NC_015315	GCC	2	6	124192	124197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310048
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2848	NC_015315	ACG	2	6	129198	129203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310052
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2851	NC_015315	TCGG	2	8	129347	129354	0 %	25 %	50 %	25 %	327310052
2852	NC_015315	CT	3	6	129403	129408	0 %	50 %	0 %	50 %	327310052
2853	NC_015315	CGGGT	2	10	129439	129448	0 %	20 %	60 %	20 %	327310052
2854	NC_015315	CGCGA	2	10	129452	129461	20 %	0 %	40 %	40 %	327310052
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2858	NC_015315	GGGGT	2	10	129892	129901	0 %	20 %	80 %	0 %	327310052
2859	NC_015315	GAC	2	6	129907	129912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310052
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2861	NC_015315	GTC	2	6	129958	129963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310052
2862	NC_015315	GAC	3	9	130140	130148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310053
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2864	NC_015315	CCA	2	6	130253	130258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310053
2865	NC_015315	TC	3	6	130534	130539	0 %	50 %	0 %	50 %	327310054
2866	NC_015315	GAC	2	6	130544	130549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310054
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2868	NC_015315	GGC	2	6	130735	130740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310054
2869	NC_015315	GGC	2	6	130756	130761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310054
2870	NC_015315	CGG	2	6	130821	130826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310054
2871	NC_015315	CGT	2	6	130870	130875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310054
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2874	NC_015315	CCCG	2	8	131029	131036	0 %	0 %	25 %	75 %	327310054
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2885	NC_015315	GGA	2	6	131359	131364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310054
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2893	NC_015315	CG	3	6	131698	131703	0 %	0 %	50 %	50 %	327310054
2894	NC_015315	ACGAC	2	10	131751	131760	40 %	0 %	20 %	40 %	327310054
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2896	NC_015315	AGCGC	2	10	131799	131808	20 %	0 %	40 %	40 %	327310054
2897	NC_015315	TAGAC	2	10	131877	131886	40 %	20 %	20 %	20 %	327310054
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2972	NC_015315	TAA	2	6	135478	135483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310059
2973	NC_015315	A	6	6	135490	135495	100 %	0 %	0 %	0 %	327310059
2974	NC_015315	TAG	2	6	135498	135503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310059
2975	NC_015315	CAATTC	2	12	135510	135521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310059
2976	NC_015315	CTAG	2	8	135524	135531	25 %	25 %	25 %	25 %	327310059
2977	NC_015315	TCC	2	6	135580	135585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310060
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2979	NC_015315	ACT	2	6	135615	135620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310060
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2981	NC_015315	AGT	2	6	135668	135673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310060
2982	NC_015315	GTC	2	6	135687	135692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310060
2983	NC_015315	AGT	2	6	135710	135715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310060
2984	NC_015315	GGT	3	9	135722	135730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310060
2985	NC_015315	GTC	2	6	135750	135755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310060
2986	NC_015315	TGG	2	6	135763	135768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310060
2987	NC_015315	GGC	2	6	135773	135778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
2988	NC_015315	CCA	2	6	135806	135811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310060
2989	NC_015315	TCC	2	6	135818	135823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310060
2990	NC_015315	CGG	2	6	135866	135871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310060
2991	NC_015315	GTT	2	6	135941	135946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310060
2992	NC_015315	GCCA	2	8	135948	135955	25 %	0 %	25 %	50 %	327310060
2993	NC_015315	GC	3	6	136000	136005	0 %	0 %	50 %	50 %	327310060
2994	NC_015315	CCG	2	6	136035	136040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
2995	NC_015315	CAG	2	6	136217	136222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310060
2996	NC_015315	TGT	2	6	136241	136246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310060
2997	NC_015315	CGC	2	6	136262	136267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310060
2998	NC_015315	AT	3	6	136276	136281	50 %	50 %	0 %	0 %	327310060
2999	NC_015315	GCTG	2	8	136312	136319	0 %	25 %	50 %	25 %	327310060
3000	NC_015315	CTT	2	6	136430	136435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310060

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