MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_015315	GAG	2	6	568948	568953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310562
12502	NC_015315	TCT	2	6	569064	569069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310563
12503	NC_015315	GAG	2	6	569083	569088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310563
12504	NC_015315	CCT	2	6	569097	569102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310563
12505	NC_015315	CCT	2	6	569133	569138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310563
12506	NC_015315	GGC	2	6	569152	569157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310563
12507	NC_015315	CGC	2	6	569190	569195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310563
12508	NC_015315	CGC	2	6	569277	569282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310563
12509	NC_015315	AGT	2	6	569450	569455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310563
12510	NC_015315	TAT	2	6	569494	569499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310563
12511	NC_015315	TC	3	6	569513	569518	0 %	50 %	0 %	50 %	327310563
12512	NC_015315	AAT	2	6	569533	569538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310564
12513	NC_015315	TCAAA	2	10	569544	569553	60 %	20 %	0 %	20 %	327310564
12514	NC_015315	GCA	2	6	569609	569614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310564
12515	NC_015315	CGC	2	6	569661	569666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310564
12516	NC_015315	CGA	2	6	569727	569732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310564
12517	NC_015315	TC	3	6	569743	569748	0 %	50 %	0 %	50 %	327310564
12518	NC_015315	CT	3	6	569765	569770	0 %	50 %	0 %	50 %	327310564
12519	NC_015315	GTA	3	9	569868	569876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310565
12520	NC_015315	CA	3	6	569895	569900	50 %	0 %	0 %	50 %	327310565
12521	NC_015315	CAG	2	6	569975	569980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310565
12522	NC_015315	CGG	2	6	569997	570002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310565
12523	NC_015315	TA	3	6	570030	570035	50 %	50 %	0 %	0 %	327310565
12524	NC_015315	AAT	2	6	570062	570067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310565
12525	NC_015315	GA	3	6	570150	570155	50 %	0 %	50 %	0 %	327310565
12526	NC_015315	CG	3	6	570190	570195	0 %	0 %	50 %	50 %	327310565
12527	NC_015315	AGA	2	6	570219	570224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310565
12528	NC_015315	ATA	2	6	570245	570250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310565
12529	NC_015315	TAT	2	6	570287	570292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310566
12530	NC_015315	T	6	6	570298	570303	0 %	100 %	0 %	0 %	327310566
12531	NC_015315	AGGATC	2	12	570311	570322	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	327310566
12532	NC_015315	TA	4	8	570323	570330	50 %	50 %	0 %	0 %	327310566
12533	NC_015315	GTA	2	6	570450	570455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310567
12534	NC_015315	AGG	2	6	570514	570519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310567
12535	NC_015315	AT	4	8	570648	570655	50 %	50 %	0 %	0 %	327310568
12536	NC_015315	TA	3	6	570702	570707	50 %	50 %	0 %	0 %	327310568
12537	NC_015315	TCG	2	6	570767	570772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310568
12538	NC_015315	TGG	2	6	570810	570815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310568
12539	NC_015315	GC	3	6	570857	570862	0 %	0 %	50 %	50 %	327310568
12540	NC_015315	CG	3	6	570889	570894	0 %	0 %	50 %	50 %	327310568
12541	NC_015315	ACT	2	6	570947	570952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310568
12542	NC_015315	CAA	2	6	570994	570999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310568
12543	NC_015315	GGC	2	6	571012	571017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310568
12544	NC_015315	CGCC	2	8	571029	571036	0 %	0 %	25 %	75 %	327310568
12545	NC_015315	TGA	2	6	571098	571103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310568
12546	NC_015315	TCC	2	6	571131	571136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310568
12547	NC_015315	TCT	2	6	571188	571193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310568
12548	NC_015315	GGCAG	2	10	571258	571267	20 %	0 %	60 %	20 %	327310568
12549	NC_015315	TTG	2	6	571307	571312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310568
12550	NC_015315	GGA	2	6	571326	571331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310568
12551	NC_015315	G	6	6	571371	571376	0 %	0 %	100 %	0 %	327310568
12552	NC_015315	CCA	2	6	571377	571382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310568
12553	NC_015315	GAG	2	6	571409	571414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310568
12554	NC_015315	CCG	2	6	571446	571451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310568
12555	NC_015315	ATG	2	6	571472	571477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310568
12556	NC_015315	CGG	2	6	571558	571563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310568
12557	NC_015315	CGCC	2	8	571596	571603	0 %	0 %	25 %	75 %	327310568
12558	NC_015315	CCT	2	6	571641	571646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310568
12559	NC_015315	CCA	2	6	571737	571742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310568
12560	NC_015315	CCCG	2	8	571753	571760	0 %	0 %	25 %	75 %	327310568
12561	NC_015315	ACC	2	6	571769	571774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310568
12562	NC_015315	CCT	2	6	571821	571826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310568
12563	NC_015315	CT	3	6	571835	571840	0 %	50 %	0 %	50 %	327310568
12564	NC_015315	CCTCC	2	10	571885	571894	0 %	20 %	0 %	80 %	327310568
12565	NC_015315	CGTG	2	8	571998	572005	0 %	25 %	50 %	25 %	327310568
12566	NC_015315	GCG	2	6	572008	572013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310568
12567	NC_015315	GA	3	6	572020	572025	50 %	0 %	50 %	0 %	327310568
12568	NC_015315	TATG	2	8	572046	572053	25 %	50 %	25 %	0 %	327310568
12569	NC_015315	CGA	2	6	572082	572087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310568
12570	NC_015315	CAC	2	6	572093	572098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310568
12571	NC_015315	TCT	2	6	572104	572109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310568
12572	NC_015315	TCC	2	6	572193	572198	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310568
12573	NC_015315	TCG	2	6	572213	572218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310568
12574	NC_015315	TTG	2	6	572243	572248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310568
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12577	NC_015315	TC	3	6	572279	572284	0 %	50 %	0 %	50 %	327310568
12578	NC_015315	AG	3	6	572285	572290	50 %	0 %	50 %	0 %	327310568
12579	NC_015315	C	6	6	572316	572321	0 %	0 %	0 %	100 %	327310568
12580	NC_015315	TGT	2	6	572391	572396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310568
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12583	NC_015315	TCTG	2	8	572583	572590	0 %	50 %	25 %	25 %	327310569
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12591	NC_015315	GTT	2	6	573033	573038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310569
12592	NC_015315	GAG	2	6	573058	573063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310569
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12599	NC_015315	GAG	2	6	573371	573376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310570
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12603	NC_015315	GC	3	6	573546	573551	0 %	0 %	50 %	50 %	327310570
12604	NC_015315	TCC	2	6	573603	573608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310570
12605	NC_015315	AAG	2	6	573635	573640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310570
12606	NC_015315	CGA	2	6	573652	573657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310570
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12608	NC_015315	GAG	2	6	573716	573721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310570
12609	NC_015315	GTC	2	6	573730	573735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310570
12610	NC_015315	CTA	2	6	573748	573753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310570
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12613	NC_015315	GGA	2	6	573811	573816	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310570
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12615	NC_015315	GACC	2	8	573946	573953	25 %	0 %	25 %	50 %	327310570
12616	NC_015315	ATA	2	6	573998	574003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310570
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12618	NC_015315	GAC	2	6	574082	574087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310570
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12853	NC_015315	GCATCG	2	12	584733	584744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327310582
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12979	NC_015315	GAG	2	6	592211	592216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310595
12980	NC_015315	GCG	2	6	592240	592245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310595
12981	NC_015315	GCCG	2	8	592253	592260	0 %	0 %	50 %	50 %	327310595
12982	NC_015315	G	6	6	592286	592291	0 %	0 %	100 %	0 %	327310595
12983	NC_015315	CCA	2	6	592345	592350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310595
12984	NC_015315	TCC	2	6	592357	592362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310595
12985	NC_015315	CCT	2	6	592363	592368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310595
12986	NC_015315	CTCCAC	2	12	592370	592381	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	327310595
12987	NC_015315	TAT	2	6	592385	592390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310595
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12991	NC_015315	CCT	2	6	592483	592488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310595
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