MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_015315	CGAT	2	8	546185	546192	25 %	25 %	25 %	25 %	327310534
12002	NC_015315	CTAGAC	2	12	546233	546244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	327310534
12003	NC_015315	CGAAG	2	10	546264	546273	40 %	0 %	40 %	20 %	327310534
12004	NC_015315	GCC	2	6	546291	546296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310534
12005	NC_015315	ACG	2	6	546315	546320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310534
12006	NC_015315	CGT	2	6	546433	546438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310535
12007	NC_015315	AAG	2	6	546504	546509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310535
12008	NC_015315	TCC	2	6	546627	546632	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310535
12009	NC_015315	GAT	2	6	546635	546640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310535
12010	NC_015315	GCC	2	6	546666	546671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310535
12011	NC_015315	ATT	2	6	546740	546745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310535
12012	NC_015315	TCT	2	6	546770	546775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310536
12013	NC_015315	CGG	2	6	546783	546788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310536
12014	NC_015315	GAC	2	6	546798	546803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310536
12015	NC_015315	GCTGGC	2	12	546804	546815	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	327310536
12016	NC_015315	ATA	2	6	546844	546849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310536
12017	NC_015315	GCCG	2	8	546916	546923	0 %	0 %	50 %	50 %	327310536
12018	NC_015315	GGC	2	6	546987	546992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310536
12019	NC_015315	GAG	2	6	547081	547086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310536
12020	NC_015315	TCG	2	6	547109	547114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310536
12021	NC_015315	GGC	2	6	547196	547201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310536
12022	NC_015315	CGA	2	6	547293	547298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310536
12023	NC_015315	GTT	2	6	547495	547500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310537
12024	NC_015315	GTT	2	6	547513	547518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310537
12025	NC_015315	GAC	2	6	547571	547576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12026	NC_015315	GTG	2	6	547586	547591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310537
12027	NC_015315	GCC	2	6	547657	547662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310537
12028	NC_015315	GCTGGC	2	12	547702	547713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	327310537
12029	NC_015315	GCCGA	2	10	547714	547723	20 %	0 %	40 %	40 %	327310537
12030	NC_015315	AG	3	6	547769	547774	50 %	0 %	50 %	0 %	327310537
12031	NC_015315	AG	3	6	547778	547783	50 %	0 %	50 %	0 %	327310537
12032	NC_015315	GCG	2	6	547818	547823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310537
12033	NC_015315	CGG	2	6	547828	547833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310537
12034	NC_015315	CTG	2	6	547868	547873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12035	NC_015315	CAGG	2	8	547908	547915	25 %	0 %	50 %	25 %	327310537
12036	NC_015315	GAGC	2	8	547918	547925	25 %	0 %	50 %	25 %	327310537
12037	NC_015315	GTC	2	6	547997	548002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12038	NC_015315	GTG	3	9	548036	548044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310537
12039	NC_015315	GAA	2	6	548071	548076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310537
12040	NC_015315	GCG	2	6	548147	548152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310537
12041	NC_015315	GAGC	2	8	548188	548195	25 %	0 %	50 %	25 %	327310537
12042	NC_015315	CGC	2	6	548196	548201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310537
12043	NC_015315	GCCG	2	8	548262	548269	0 %	0 %	50 %	50 %	327310537
12044	NC_015315	CCG	2	6	548405	548410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310537
12045	NC_015315	GTC	2	6	548420	548425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310537
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12047	NC_015315	GC	3	6	548439	548444	0 %	0 %	50 %	50 %	327310537
12048	NC_015315	TCC	2	6	548475	548480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310537
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12050	NC_015315	CCAG	2	8	548580	548587	25 %	0 %	25 %	50 %	327310537
12051	NC_015315	CGG	2	6	548626	548631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310537
12052	NC_015315	GAC	2	6	548635	548640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12053	NC_015315	ACG	2	6	548661	548666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12054	NC_015315	CGA	2	6	548875	548880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310537
12055	NC_015315	GC	3	6	548942	548947	0 %	0 %	50 %	50 %	327310537
12056	NC_015315	AG	3	6	548975	548980	50 %	0 %	50 %	0 %	327310537
12057	NC_015315	GGT	2	6	548986	548991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310537
12058	NC_015315	CGA	2	6	548992	548997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310537
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12060	NC_015315	CGA	2	6	549119	549124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310538
12061	NC_015315	G	6	6	549242	549247	0 %	0 %	100 %	0 %	327310538
12062	NC_015315	GA	3	6	549340	549345	50 %	0 %	50 %	0 %	327310539
12063	NC_015315	GCC	2	6	549347	549352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310539
12064	NC_015315	GAG	2	6	549353	549358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310539
12065	NC_015315	GAG	2	6	549415	549420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310539
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12068	NC_015315	AGG	2	6	549471	549476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310539
12069	NC_015315	GGCC	2	8	549535	549542	0 %	0 %	50 %	50 %	327310539
12070	NC_015315	GAG	2	6	549563	549568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310539
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12081	NC_015315	CTC	2	6	549879	549884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310540
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12088	NC_015315	TCT	2	6	550145	550150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310540
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12092	NC_015315	CGGC	2	8	550307	550314	0 %	0 %	50 %	50 %	327310540
12093	NC_015315	GCC	2	6	550369	550374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310540
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12095	NC_015315	GAT	2	6	550476	550481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310540
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12097	NC_015315	GGGCC	2	10	550550	550559	0 %	0 %	60 %	40 %	327310540
12098	NC_015315	GA	3	6	550606	550611	50 %	0 %	50 %	0 %	327310540
12099	NC_015315	TA	4	8	550655	550662	50 %	50 %	0 %	0 %	327310540
12100	NC_015315	CCGTC	2	10	550718	550727	0 %	20 %	20 %	60 %	327310540
12101	NC_015315	GACAG	2	10	550728	550737	40 %	0 %	40 %	20 %	327310540
12102	NC_015315	CGA	2	6	550761	550766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310540
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12104	NC_015315	GGC	2	6	550867	550872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310540
12105	NC_015315	CGT	2	6	550883	550888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310540
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12107	NC_015315	ACG	3	9	550900	550908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310540
12108	NC_015315	TCGC	2	8	550971	550978	0 %	25 %	25 %	50 %	327310541
12109	NC_015315	CTA	2	6	551014	551019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310541
12110	NC_015315	TCC	2	6	551039	551044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310541
12111	NC_015315	GGA	2	6	551139	551144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310541
12112	NC_015315	GTT	2	6	551153	551158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310541
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12114	NC_015315	CTA	2	6	551258	551263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310541
12115	NC_015315	GCG	2	6	551268	551273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310541
12116	NC_015315	GGT	2	6	551300	551305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310541
12117	NC_015315	GTG	2	6	551307	551312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310541
12118	NC_015315	CTAT	2	8	551339	551346	25 %	50 %	0 %	25 %	327310541
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12120	NC_015315	ATA	2	6	551441	551446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310541
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12241	NC_015315	AGC	2	6	557240	557245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310550
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12350	NC_015315	TC	3	6	561566	561571	0 %	50 %	0 %	50 %	327310553
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12357	NC_015315	ACG	2	6	561944	561949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310553
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12480	NC_015315	ATA	2	6	567544	567549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310560
12481	NC_015315	GTG	2	6	567923	567928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310561
12482	NC_015315	GCG	2	6	567954	567959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310561
12483	NC_015315	GC	3	6	568013	568018	0 %	0 %	50 %	50 %	327310561
12484	NC_015315	ACG	2	6	568038	568043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310561
12485	NC_015315	TA	3	6	568078	568083	50 %	50 %	0 %	0 %	327310561
12486	NC_015315	GAC	2	6	568103	568108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310561
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12491	NC_015315	CAGC	2	8	568331	568338	25 %	0 %	25 %	50 %	327310562
12492	NC_015315	CGA	2	6	568425	568430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310562
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