MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_015315	CGC	2	6	501581	501586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310482
11002	NC_015315	CGG	2	6	501589	501594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310482
11003	NC_015315	CGG	2	6	501640	501645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310482
11004	NC_015315	GCC	2	6	501649	501654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310482
11005	NC_015315	CGG	2	6	501754	501759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310482
11006	NC_015315	CGC	2	6	501827	501832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310482
11007	NC_015315	CG	3	6	501913	501918	0 %	0 %	50 %	50 %	327310482
11008	NC_015315	CTAT	2	8	501950	501957	25 %	50 %	0 %	25 %	327310483
11009	NC_015315	CGC	2	6	502010	502015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310483
11010	NC_015315	CGG	2	6	502033	502038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310483
11011	NC_015315	AT	3	6	502102	502107	50 %	50 %	0 %	0 %	327310483
11012	NC_015315	TA	3	6	502269	502274	50 %	50 %	0 %	0 %	327310483
11013	NC_015315	AAG	2	6	502300	502305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310483
11014	NC_015315	CGA	2	6	502330	502335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310483
11015	NC_015315	CCT	2	6	502484	502489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310484
11016	NC_015315	ACG	2	6	502614	502619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310484
11017	NC_015315	TCC	2	6	502656	502661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310484
11018	NC_015315	CTC	2	6	502664	502669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310484
11019	NC_015315	GCC	2	6	502672	502677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310484
11020	NC_015315	GCC	2	6	502719	502724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310484
11021	NC_015315	GC	3	6	502732	502737	0 %	0 %	50 %	50 %	327310484
11022	NC_015315	CGA	2	6	502840	502845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310484
11023	NC_015315	GCC	2	6	502880	502885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310484
11024	NC_015315	TAGA	2	8	502916	502923	50 %	25 %	25 %	0 %	327310484
11025	NC_015315	TTTAT	2	10	502994	503003	20 %	80 %	0 %	0 %	327310485
11026	NC_015315	CTAT	2	8	503033	503040	25 %	50 %	0 %	25 %	327310485
11027	NC_015315	AT	3	6	503039	503044	50 %	50 %	0 %	0 %	327310485
11028	NC_015315	CCT	2	6	503252	503257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310486
11029	NC_015315	CCA	2	6	503342	503347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310486
11030	NC_015315	CTC	3	9	503355	503363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310486
11031	NC_015315	CTTTAT	2	12	503364	503375	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	327310486
11032	NC_015315	ACC	2	6	503413	503418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310486
11033	NC_015315	CTT	2	6	503454	503459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310486
11034	NC_015315	GCC	2	6	503571	503576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310486
11035	NC_015315	CGCGGC	2	12	503615	503626	0 %	0 %	50 %	50 %	327310486
11036	NC_015315	AGG	2	6	503662	503667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310486
11037	NC_015315	AT	3	6	503688	503693	50 %	50 %	0 %	0 %	327310486
11038	NC_015315	TTC	2	6	503716	503721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310486
11039	NC_015315	AG	3	6	503732	503737	50 %	0 %	50 %	0 %	327310486
11040	NC_015315	AGG	2	6	503749	503754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310486
11041	NC_015315	GAG	2	6	503847	503852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310486
11042	NC_015315	CGT	2	6	503853	503858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310486
11043	NC_015315	GCC	2	6	503874	503879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310486
11044	NC_015315	TAT	2	6	503880	503885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310486
11045	NC_015315	TGG	2	6	503966	503971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310486
11046	NC_015315	GGC	2	6	503986	503991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310486
11047	NC_015315	AAG	2	6	504057	504062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310486
11048	NC_015315	AGGT	2	8	504082	504089	25 %	25 %	50 %	0 %	327310486
11049	NC_015315	GTTC	2	8	504107	504114	0 %	50 %	25 %	25 %	327310486
11050	NC_015315	CTG	2	6	504142	504147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310486
11051	NC_015315	CCT	2	6	504164	504169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310486
11052	NC_015315	GTCG	2	8	504171	504178	0 %	25 %	50 %	25 %	327310486
11053	NC_015315	TGT	2	6	504197	504202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310486
11054	NC_015315	CGT	2	6	504272	504277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310486
11055	NC_015315	AGG	2	6	504280	504285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310486
11056	NC_015315	G	6	6	504284	504289	0 %	0 %	100 %	0 %	327310486
11057	NC_015315	AGT	2	6	504299	504304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310486
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11059	NC_015315	AACG	2	8	504329	504336	50 %	0 %	25 %	25 %	327310486
11060	NC_015315	CTC	2	6	504399	504404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310486
11061	NC_015315	AGT	2	6	504497	504502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310486
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11063	NC_015315	CG	3	6	504614	504619	0 %	0 %	50 %	50 %	327310486
11064	NC_015315	GAG	2	6	504642	504647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310487
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11067	NC_015315	TA	3	6	504726	504731	50 %	50 %	0 %	0 %	327310487
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11072	NC_015315	CGC	2	6	504862	504867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310487
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11085	NC_015315	CT	3	6	505309	505314	0 %	50 %	0 %	50 %	327310487
11086	NC_015315	GGC	3	9	505346	505354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310487
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11089	NC_015315	TGA	2	6	505474	505479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310487
11090	NC_015315	TGAC	2	8	505570	505577	25 %	25 %	25 %	25 %	327310487
11091	NC_015315	TCG	2	6	505597	505602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310487
11092	NC_015315	TCC	2	6	505630	505635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310487
11093	NC_015315	CCA	2	6	505657	505662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310487
11094	NC_015315	TGTCCA	2	12	505663	505674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327310487
11095	NC_015315	TAT	2	6	505694	505699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310487
11096	NC_015315	AGCT	2	8	505760	505767	25 %	25 %	25 %	25 %	327310487
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11098	NC_015315	GTT	2	6	505820	505825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310487
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11101	NC_015315	GAA	2	6	506075	506080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310487
11102	NC_015315	GGC	2	6	506090	506095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310487
11103	NC_015315	CGC	2	6	506104	506109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310487
11104	NC_015315	GTCT	2	8	506130	506137	0 %	50 %	25 %	25 %	327310487
11105	NC_015315	TA	3	6	506188	506193	50 %	50 %	0 %	0 %	327310487
11106	NC_015315	GTG	2	6	506469	506474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310488
11107	NC_015315	CT	3	6	506494	506499	0 %	50 %	0 %	50 %	327310488
11108	NC_015315	CCG	2	6	506649	506654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310488
11109	NC_015315	TCGT	2	8	506754	506761	0 %	50 %	25 %	25 %	327310488
11110	NC_015315	GAG	2	6	506817	506822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310488
11111	NC_015315	ACG	2	6	506835	506840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310488
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11113	NC_015315	ACG	2	6	506899	506904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310488
11114	NC_015315	CGA	2	6	506960	506965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310488
11115	NC_015315	CA	3	6	507011	507016	50 %	0 %	0 %	50 %	327310488
11116	NC_015315	ATA	2	6	507066	507071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310488
11117	NC_015315	AGA	2	6	507178	507183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310488
11118	NC_015315	CG	3	6	507199	507204	0 %	0 %	50 %	50 %	327310488
11119	NC_015315	GGA	2	6	507224	507229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310488
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11121	NC_015315	GTT	2	6	507245	507250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310488
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11233	NC_015315	AGGC	2	8	511714	511721	25 %	0 %	50 %	25 %	327310494
11234	NC_015315	GCCTAC	2	12	511762	511773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	327310494
11235	NC_015315	AAG	2	6	511778	511783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310494
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11237	NC_015315	ACG	2	6	511859	511864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310494
11238	NC_015315	GAG	2	6	511929	511934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310494
11239	NC_015315	GGC	2	6	511988	511993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310494
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11241	NC_015315	CGC	2	6	512056	512061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310495
11242	NC_015315	GGT	2	6	512101	512106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310495
11243	NC_015315	TGG	2	6	512136	512141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310495
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11260	NC_015315	AT	3	6	512619	512624	50 %	50 %	0 %	0 %	327310496
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11354	NC_015315	ATG	2	6	516788	516793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310500
11355	NC_015315	CCTC	2	8	516812	516819	0 %	25 %	0 %	75 %	327310500
11356	NC_015315	GCCTA	2	10	516883	516892	20 %	20 %	20 %	40 %	327310500
11357	NC_015315	AAC	3	9	516893	516901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310500
11358	NC_015315	CTT	2	6	516937	516942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310500
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11362	NC_015315	CCT	3	9	517075	517083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310500
11363	NC_015315	CGG	2	6	517098	517103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310500
11364	NC_015315	ACG	2	6	517110	517115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310500
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11367	NC_015315	TCT	2	6	517362	517367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310500
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11383	NC_015315	CCTT	2	8	518064	518071	0 %	50 %	0 %	50 %	327310500
11384	NC_015315	CGT	2	6	518095	518100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310500
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11468	NC_015315	CCTCT	2	10	521765	521774	0 %	40 %	0 %	60 %	327310505
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11476	NC_015315	AGG	2	6	522014	522019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310506
11477	NC_015315	CTC	2	6	522038	522043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310506
11478	NC_015315	GTC	2	6	522049	522054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11479	NC_015315	GCC	2	6	522075	522080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310506
11480	NC_015315	CCT	2	6	522084	522089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310506
11481	NC_015315	CGG	2	6	522099	522104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310506
11482	NC_015315	CTC	2	6	522135	522140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310506
11483	NC_015315	AAG	2	6	522164	522169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310506
11484	NC_015315	CGT	2	6	522198	522203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11485	NC_015315	GCG	2	6	522216	522221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310506
11486	NC_015315	AT	3	6	522294	522299	50 %	50 %	0 %	0 %	327310506
11487	NC_015315	GGGT	2	8	522302	522309	0 %	25 %	75 %	0 %	327310506
11488	NC_015315	CGT	2	6	522340	522345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11489	NC_015315	ACC	2	6	522371	522376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310506
11490	NC_015315	TCC	2	6	522494	522499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310506
11491	NC_015315	GAG	2	6	522589	522594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310506
11492	NC_015315	ACG	2	6	522701	522706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11493	NC_015315	CCG	2	6	522729	522734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310506
11494	NC_015315	AGG	2	6	522756	522761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310506
11495	NC_015315	CGA	2	6	522768	522773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11496	NC_015315	G	6	6	522774	522779	0 %	0 %	100 %	0 %	327310506
11497	NC_015315	CGA	2	6	522780	522785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310506
11498	NC_015315	GTG	2	6	522824	522829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310506
11499	NC_015315	CGGC	2	8	522879	522886	0 %	0 %	50 %	50 %	327310506
11500	NC_015315	TCC	2	6	522936	522941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310506

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