MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015315	AT	3	6	269993	269998	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6002	NC_015315	ATA	2	6	270012	270017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310214
6003	NC_015315	TAG	2	6	270023	270028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310214
6004	NC_015315	TA	3	6	270048	270053	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6005	NC_015315	TAATA	2	10	270062	270071	60 %	40 %	0 %	0 %	327310214
6006	NC_015315	TAA	2	6	270084	270089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310214
6007	NC_015315	TA	3	6	270090	270095	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6008	NC_015315	AGGG	2	8	270110	270117	25 %	0 %	75 %	0 %	327310214
6009	NC_015315	TA	3	6	270225	270230	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6010	NC_015315	T	6	6	270263	270268	0 %	100 %	0 %	0 %	327310214
6011	NC_015315	TAT	2	6	270272	270277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6012	NC_015315	TATT	2	8	270320	270327	25 %	75 %	0 %	0 %	327310214
6013	NC_015315	ATT	2	6	270330	270335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6014	NC_015315	T	6	6	270341	270346	0 %	100 %	0 %	0 %	327310214
6015	NC_015315	ATT	2	6	270352	270357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6016	NC_015315	AT	3	6	270368	270373	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
6017	NC_015315	TAT	2	6	270383	270388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6018	NC_015315	ATT	2	6	270412	270417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310214
6019	NC_015315	ACG	2	6	270445	270450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310214
6020	NC_015315	GGC	2	6	270640	270645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310215
6021	NC_015315	GCG	2	6	270687	270692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310215
6022	NC_015315	GA	3	6	270715	270720	50 %	0 %	50 %	0 %	327310215
6023	NC_015315	TCCC	2	8	270731	270738	0 %	25 %	0 %	75 %	327310215
6024	NC_015315	CCA	2	6	270950	270955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310215
6025	NC_015315	CTC	2	6	270961	270966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310215
6026	NC_015315	AT	3	6	271003	271008	50 %	50 %	0 %	0 %	327310215
6027	NC_015315	CGA	2	6	271011	271016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310215
6028	NC_015315	GGTC	2	8	271022	271029	0 %	25 %	50 %	25 %	327310215
6029	NC_015315	ATA	2	6	271081	271086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310215
6030	NC_015315	CGA	2	6	271110	271115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310215
6031	NC_015315	GTGCC	2	10	271213	271222	0 %	20 %	40 %	40 %	327310215
6032	NC_015315	TA	3	6	271228	271233	50 %	50 %	0 %	0 %	327310215
6033	NC_015315	AG	3	6	271275	271280	50 %	0 %	50 %	0 %	327310215
6034	NC_015315	CAG	2	6	271308	271313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310216
6035	NC_015315	CTC	2	6	271332	271337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310216
6036	NC_015315	TAT	2	6	271404	271409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310216
6037	NC_015315	CTC	2	6	271416	271421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310216
6038	NC_015315	GCCA	2	8	271467	271474	25 %	0 %	25 %	50 %	327310216
6039	NC_015315	CGT	2	6	271475	271480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310216
6040	NC_015315	TACA	2	8	271488	271495	50 %	25 %	0 %	25 %	327310216
6041	NC_015315	CCG	2	6	271522	271527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310216
6042	NC_015315	GGC	2	6	271633	271638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310216
6043	NC_015315	CCT	2	6	271704	271709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310216
6044	NC_015315	TTG	2	6	271726	271731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310216
6045	NC_015315	A	6	6	271739	271744	100 %	0 %	0 %	0 %	327310216
6046	NC_015315	CTG	2	6	271761	271766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310216
6047	NC_015315	CCT	2	6	271776	271781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310216
6048	NC_015315	GCGTC	2	10	271898	271907	0 %	20 %	40 %	40 %	327310216
6049	NC_015315	CAA	2	6	271911	271916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310216
6050	NC_015315	CTG	2	6	271961	271966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310216
6051	NC_015315	GGT	2	6	271980	271985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310216
6052	NC_015315	GCC	2	6	271995	272000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310216
6053	NC_015315	CTC	2	6	272069	272074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310217
6054	NC_015315	GAA	2	6	272092	272097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310217
6055	NC_015315	AAT	2	6	272159	272164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310217
6056	NC_015315	TA	3	6	272188	272193	50 %	50 %	0 %	0 %	327310217
6057	NC_015315	ATGT	2	8	272197	272204	25 %	50 %	25 %	0 %	327310217
6058	NC_015315	CAG	2	6	272237	272242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310217
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6060	NC_015315	AAT	2	6	272304	272309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310218
6061	NC_015315	GCG	2	6	272353	272358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310218
6062	NC_015315	TCT	2	6	272405	272410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310218
6063	NC_015315	ACC	2	6	272495	272500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310218
6064	NC_015315	CCA	2	6	272549	272554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310218
6065	NC_015315	TCG	2	6	272658	272663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310219
6066	NC_015315	GAC	2	6	272668	272673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310219
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6070	NC_015315	CTG	2	6	272784	272789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310219
6071	NC_015315	TA	3	6	272792	272797	50 %	50 %	0 %	0 %	327310219
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6074	NC_015315	CGC	2	6	272860	272865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310219
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6103	NC_015315	AGG	3	9	274869	274877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310222
6104	NC_015315	CTA	2	6	274880	274885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310222
6105	NC_015315	ATACCT	2	12	274917	274928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310222
6106	NC_015315	GGC	2	6	274980	274985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310222
6107	NC_015315	TA	3	6	275013	275018	50 %	50 %	0 %	0 %	327310222
6108	NC_015315	GGT	2	6	275120	275125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310222
6109	NC_015315	TCC	2	6	275137	275142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310222
6110	NC_015315	ATA	2	6	275205	275210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310222
6111	NC_015315	CTG	2	6	275226	275231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310222
6112	NC_015315	ACA	2	6	275245	275250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310222
6113	NC_015315	GGC	2	6	275336	275341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310222
6114	NC_015315	TTG	2	6	275352	275357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310222
6115	NC_015315	C	6	6	275652	275657	0 %	0 %	0 %	100 %	327310223
6116	NC_015315	TCA	2	6	275658	275663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310223
6117	NC_015315	TCG	2	6	275726	275731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310223
6118	NC_015315	CCTCGT	2	12	275736	275747	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	327310223
6119	NC_015315	GAGG	2	8	275836	275843	25 %	0 %	75 %	0 %	327310223
6120	NC_015315	CCCA	2	8	275846	275853	25 %	0 %	0 %	75 %	327310223
6121	NC_015315	CG	3	6	275885	275890	0 %	0 %	50 %	50 %	327310223
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6123	NC_015315	CTC	2	6	275939	275944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310223
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6233	NC_015315	CTCC	2	8	280374	280381	0 %	25 %	0 %	75 %	327310231
6234	NC_015315	CAA	2	6	280410	280415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310231
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6242	NC_015315	CGT	2	6	280696	280701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310232
6243	NC_015315	CCTGC	2	10	280702	280711	0 %	20 %	20 %	60 %	327310232
6244	NC_015315	GCG	2	6	280806	280811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310232
6245	NC_015315	GCC	2	6	280821	280826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310232
6246	NC_015315	AGG	2	6	280839	280844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310232
6247	NC_015315	GAC	2	6	280847	280852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310232
6248	NC_015315	GAG	2	6	280856	280861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310232
6249	NC_015315	TTG	2	6	280865	280870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310232
6250	NC_015315	GAT	2	6	280890	280895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310232
6251	NC_015315	AT	4	8	280894	280901	50 %	50 %	0 %	0 %	327310232
6252	NC_015315	GTC	2	6	280923	280928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310233
6253	NC_015315	AGAT	2	8	280936	280943	50 %	25 %	25 %	0 %	327310233
6254	NC_015315	CGT	2	6	280955	280960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310233
6255	NC_015315	CGA	2	6	281060	281065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310233
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6257	NC_015315	AGA	2	6	281110	281115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310233
6258	NC_015315	AT	3	6	281335	281340	50 %	50 %	0 %	0 %	327310234
6259	NC_015315	CCG	2	6	281427	281432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310234
6260	NC_015315	AGG	2	6	281447	281452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310234
6261	NC_015315	GCC	2	6	281558	281563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310234
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6263	NC_015315	GCC	2	6	281645	281650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310234
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6266	NC_015315	CGT	2	6	281704	281709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310234
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6274	NC_015315	AGCTG	2	10	282103	282112	20 %	20 %	40 %	20 %	327310235
6275	NC_015315	CTC	2	6	282119	282124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310235
6276	NC_015315	CCT	2	6	282134	282139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310235
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6280	NC_015315	CGGCG	2	10	282307	282316	0 %	0 %	60 %	40 %	327310235
6281	NC_015315	ATG	2	6	282332	282337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310235
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6284	NC_015315	GAG	2	6	282497	282502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310235
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6292	NC_015315	ACG	2	6	282933	282938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310235
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6300	NC_015315	CAAGGC	2	12	283177	283188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310235
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6323	NC_015315	AAG	2	6	284111	284116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310235
6324	NC_015315	GGT	2	6	284131	284136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310235
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6328	NC_015315	CTTCAG	2	12	284359	284370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	327310235
6329	NC_015315	GAC	2	6	284375	284380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310235
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6332	NC_015315	AGG	2	6	284499	284504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310235
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6336	NC_015315	CGG	2	6	284634	284639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310235
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6341	NC_015315	ACC	2	6	285257	285262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310236
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6348	NC_015315	CT	3	6	285596	285601	0 %	50 %	0 %	50 %	327310236
6349	NC_015315	CGC	2	6	285618	285623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310236
6350	NC_015315	ACAG	2	8	285642	285649	50 %	0 %	25 %	25 %	327310236
6351	NC_015315	GCC	2	6	285664	285669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310236
6352	NC_015315	TCA	2	6	285678	285683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310236
6353	NC_015315	TCC	3	9	285884	285892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310236
6354	NC_015315	AGACC	2	10	285900	285909	40 %	0 %	20 %	40 %	327310236
6355	NC_015315	C	6	6	285908	285913	0 %	0 %	0 %	100 %	327310236
6356	NC_015315	TA	3	6	286090	286095	50 %	50 %	0 %	0 %	327310237
6357	NC_015315	TA	3	6	286101	286106	50 %	50 %	0 %	0 %	327310237
6358	NC_015315	GAC	2	6	286119	286124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310237
6359	NC_015315	CGT	2	6	286151	286156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310237
6360	NC_015315	GTA	2	6	286166	286171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310237
6361	NC_015315	CGG	2	6	286234	286239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310237
6362	NC_015315	TCC	2	6	286349	286354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310237
6363	NC_015315	GCC	2	6	286373	286378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310237
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6487	NC_015315	GAG	2	6	291481	291486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310241
6488	NC_015315	TGGAGC	2	12	291515	291526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	327310241
6489	NC_015315	CGG	2	6	291528	291533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310241
6490	NC_015315	G	6	6	291555	291560	0 %	0 %	100 %	0 %	327310241
6491	NC_015315	AT	3	6	291640	291645	50 %	50 %	0 %	0 %	327310241
6492	NC_015315	GGC	2	6	291675	291680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310241
6493	NC_015315	TAC	2	6	291787	291792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310241
6494	NC_015315	GCC	2	6	291829	291834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310241
6495	NC_015315	CGGCAC	2	12	291864	291875	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	327310241
6496	NC_015315	GCG	2	6	291899	291904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310241
6497	NC_015315	GCG	2	6	291934	291939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310241
6498	NC_015315	CGG	2	6	292025	292030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310241
6499	NC_015315	CTG	2	6	292084	292089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310241
6500	NC_015315	CTA	2	6	292098	292103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310241

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