MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015315	CTAC	2	8	247155	247162	25 %	25 %	0 %	50 %	327310185
5502	NC_015315	CGG	2	6	247218	247223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310185
5503	NC_015315	GCT	2	6	247257	247262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310185
5504	NC_015315	GGA	3	9	247272	247280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310185
5505	NC_015315	GAG	2	6	247297	247302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310185
5506	NC_015315	AAG	2	6	247315	247320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310185
5507	NC_015315	GAA	2	6	247323	247328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310185
5508	NC_015315	CGA	2	6	247344	247349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310185
5509	NC_015315	CAAC	2	8	247392	247399	50 %	0 %	0 %	50 %	327310185
5510	NC_015315	GAG	2	6	247426	247431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310185
5511	NC_015315	GGA	2	6	247458	247463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310185
5512	NC_015315	CGA	2	6	247488	247493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310185
5513	NC_015315	GAG	2	6	247522	247527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310185
5514	NC_015315	TGGCCT	2	12	247651	247662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5515	NC_015315	GCC	2	6	247703	247708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5516	NC_015315	TA	3	6	247722	247727	50 %	50 %	0 %	0 %	327310186
5517	NC_015315	GTA	2	6	247773	247778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310186
5518	NC_015315	CGT	2	6	247787	247792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5519	NC_015315	CCG	2	6	247804	247809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5520	NC_015315	GGC	2	6	247863	247868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5521	NC_015315	ACC	2	6	247873	247878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310186
5522	NC_015315	CGG	2	6	247915	247920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5523	NC_015315	CTAC	2	8	248011	248018	25 %	25 %	0 %	50 %	327310186
5524	NC_015315	CGC	2	6	248032	248037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5525	NC_015315	ACG	2	6	248044	248049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5526	NC_015315	GGT	2	6	248093	248098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310186
5527	NC_015315	CGT	2	6	248135	248140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5528	NC_015315	GCC	2	6	248216	248221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5529	NC_015315	CGT	2	6	248252	248257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5530	NC_015315	CCG	2	6	248287	248292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5531	NC_015315	CAA	2	6	248321	248326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310186
5532	NC_015315	CGA	2	6	248428	248433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5533	NC_015315	CGTGAC	2	12	248480	248491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5534	NC_015315	CCT	2	6	248605	248610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310186
5535	NC_015315	CTA	2	6	248621	248626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310186
5536	NC_015315	AT	3	6	248632	248637	50 %	50 %	0 %	0 %	327310186
5537	NC_015315	CGT	2	6	248690	248695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5538	NC_015315	CGA	2	6	248752	248757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5539	NC_015315	GCG	2	6	248818	248823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5540	NC_015315	TGG	2	6	248875	248880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310186
5541	NC_015315	GGC	2	6	248931	248936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5542	NC_015315	GCG	2	6	248963	248968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5543	NC_015315	GTC	2	6	248985	248990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5544	NC_015315	CCG	2	6	249000	249005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5545	NC_015315	TCA	2	6	249043	249048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310186
5546	NC_015315	CGT	2	6	249115	249120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5547	NC_015315	CGC	2	6	249188	249193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5548	NC_015315	GCCG	2	8	249260	249267	0 %	0 %	50 %	50 %	327310186
5549	NC_015315	CCT	2	6	249297	249302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310186
5550	NC_015315	CGG	2	6	249314	249319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5551	NC_015315	TCA	2	6	249352	249357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310186
5552	NC_015315	GC	3	6	249375	249380	0 %	0 %	50 %	50 %	327310186
5553	NC_015315	TATC	2	8	249391	249398	25 %	50 %	0 %	25 %	327310186
5554	NC_015315	CGT	2	6	249410	249415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5555	NC_015315	GCC	2	6	249446	249451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5556	NC_015315	GGC	2	6	249540	249545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310186
5557	NC_015315	CCG	2	6	249556	249561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5558	NC_015315	TAC	2	6	249600	249605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310186
5559	NC_015315	CCG	2	6	249634	249639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5560	NC_015315	ATAC	2	8	249723	249730	50 %	25 %	0 %	25 %	327310186
5561	NC_015315	CTC	2	6	249780	249785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310186
5562	NC_015315	AT	4	8	249790	249797	50 %	50 %	0 %	0 %	327310186
5563	NC_015315	CAC	2	6	249812	249817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310186
5564	NC_015315	CTA	2	6	249860	249865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310186
5565	NC_015315	CGT	2	6	249911	249916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5566	NC_015315	CTG	2	6	249960	249965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310186
5567	NC_015315	GCC	3	9	249981	249989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5568	NC_015315	CGC	2	6	250048	250053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310186
5569	NC_015315	GGC	2	6	250280	250285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310187
5570	NC_015315	CAA	2	6	250328	250333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310187
5571	NC_015315	GTG	2	6	250394	250399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310187
5572	NC_015315	ACG	2	6	250410	250415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310187
5573	NC_015315	AG	3	6	250416	250421	50 %	0 %	50 %	0 %	327310187
5574	NC_015315	TGT	2	6	250454	250459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310187
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5579	NC_015315	CGAG	2	8	250610	250617	25 %	0 %	50 %	25 %	327310188
5580	NC_015315	ACA	2	6	250646	250651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310188
5581	NC_015315	GAG	2	6	250699	250704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310188
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5583	NC_015315	TAC	2	6	250747	250752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310188
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5585	NC_015315	CGA	2	6	250854	250859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310188
5586	NC_015315	AT	3	6	250880	250885	50 %	50 %	0 %	0 %	327310188
5587	NC_015315	GAA	2	6	250890	250895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310188
5588	NC_015315	ACG	2	6	250919	250924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310188
5589	NC_015315	TA	3	6	250946	250951	50 %	50 %	0 %	0 %	327310188
5590	NC_015315	CAA	2	6	250998	251003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310188
5591	NC_015315	TTC	2	6	251005	251010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310188
5592	NC_015315	AGG	2	6	251011	251016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310188
5593	NC_015315	GAG	2	6	251047	251052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310188
5594	NC_015315	GGACA	2	10	251068	251077	40 %	0 %	40 %	20 %	327310188
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5596	NC_015315	GC	3	6	251255	251260	0 %	0 %	50 %	50 %	327310189
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5599	NC_015315	GCCAT	2	10	251480	251489	20 %	20 %	20 %	40 %	327310190
5600	NC_015315	GAG	2	6	251497	251502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310190
5601	NC_015315	TCC	2	6	251552	251557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310190
5602	NC_015315	TCT	2	6	251591	251596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310190
5603	NC_015315	CGGC	2	8	251636	251643	0 %	0 %	50 %	50 %	327310190
5604	NC_015315	GCA	2	6	251647	251652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310190
5605	NC_015315	TAA	2	6	251675	251680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310190
5606	NC_015315	CAG	2	6	251682	251687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310190
5607	NC_015315	CGG	2	6	251729	251734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310190
5608	NC_015315	GCG	2	6	251740	251745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310190
5609	NC_015315	CCT	2	6	251826	251831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310190
5610	NC_015315	AG	3	6	251858	251863	50 %	0 %	50 %	0 %	327310190
5611	NC_015315	ACA	2	6	251919	251924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310190
5612	NC_015315	TGTCG	2	10	251952	251961	0 %	40 %	40 %	20 %	327310191
5613	NC_015315	CTC	2	6	252010	252015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310191
5614	NC_015315	CGT	2	6	252117	252122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310191
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5616	NC_015315	TGT	2	6	252159	252164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310191
5617	NC_015315	CTAGG	2	10	252241	252250	20 %	20 %	40 %	20 %	327310191
5618	NC_015315	TA	3	6	252342	252347	50 %	50 %	0 %	0 %	327310192
5619	NC_015315	GGC	2	6	252388	252393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310192
5620	NC_015315	CGT	2	6	252420	252425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310192
5621	NC_015315	CGC	2	6	252498	252503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310192
5622	NC_015315	AAGG	2	8	252520	252527	50 %	0 %	50 %	0 %	327310192
5623	NC_015315	AT	3	6	252536	252541	50 %	50 %	0 %	0 %	327310192
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5625	NC_015315	CGT	2	6	252585	252590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310192
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5742	NC_015315	AGA	2	6	258285	258290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310200
5743	NC_015315	TCC	2	6	258322	258327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310200
5744	NC_015315	ATGT	2	8	258336	258343	25 %	50 %	25 %	0 %	327310200
5745	NC_015315	GTC	2	6	258366	258371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310200
5746	NC_015315	AG	3	6	258406	258411	50 %	0 %	50 %	0 %	327310200
5747	NC_015315	TGA	2	6	258442	258447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310200
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5751	NC_015315	TCG	2	6	258911	258916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310201
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5764	NC_015315	GAG	2	6	259533	259538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310202
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5773	NC_015315	GCG	2	6	260033	260038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310203
5774	NC_015315	CTC	2	6	260073	260078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310203
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5824	NC_015315	TACG	2	8	262238	262245	25 %	25 %	25 %	25 %	327310206
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5841	NC_015315	AGGCT	2	10	263055	263064	20 %	20 %	40 %	20 %	327310207
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5843	NC_015315	TCG	2	6	263180	263185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310207
5844	NC_015315	GAC	2	6	263228	263233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310207
5845	NC_015315	TAAGAC	2	12	263333	263344	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	327310208
5846	NC_015315	GAG	2	6	263370	263375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310208
5847	NC_015315	GCTC	2	8	263419	263426	0 %	25 %	25 %	50 %	327310208
5848	NC_015315	GCG	2	6	263449	263454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310208
5849	NC_015315	CAC	2	6	263456	263461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310208
5850	NC_015315	AGG	2	6	263473	263478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310208
5851	NC_015315	TA	4	8	263501	263508	50 %	50 %	0 %	0 %	327310208
5852	NC_015315	GCC	2	6	263513	263518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310208
5853	NC_015315	CTG	2	6	263529	263534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310208
5854	NC_015315	TAT	2	6	263574	263579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310208
5855	NC_015315	GCG	2	6	263710	263715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310209
5856	NC_015315	CG	3	6	263731	263736	0 %	0 %	50 %	50 %	327310209
5857	NC_015315	GAG	2	6	263798	263803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310209
5858	NC_015315	GTT	2	6	263903	263908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310209
5859	NC_015315	GGC	2	6	263928	263933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310209
5860	NC_015315	GGC	2	6	264048	264053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310209
5861	NC_015315	GAA	2	6	264101	264106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310209
5862	NC_015315	AGGATA	2	12	264246	264257	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	327310209
5863	NC_015315	CGA	2	6	264368	264373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310209
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5973	NC_015315	TAGA	2	8	268906	268913	50 %	25 %	25 %	0 %	327310214
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5981	NC_015315	CCT	2	6	269315	269320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310214
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5985	NC_015315	GACTT	2	10	269505	269514	20 %	40 %	20 %	20 %	327310214
5986	NC_015315	GCG	2	6	269516	269521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310214
5987	NC_015315	GTAC	2	8	269631	269638	25 %	25 %	25 %	25 %	327310214
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5989	NC_015315	TAA	2	6	269728	269733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310214
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5991	NC_015315	AT	3	6	269739	269744	50 %	50 %	0 %	0 %	327310214
5992	NC_015315	GTAT	2	8	269745	269752	25 %	50 %	25 %	0 %	327310214
5993	NC_015315	TTATA	2	10	269753	269762	40 %	60 %	0 %	0 %	327310214
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5999	NC_015315	CGG	2	6	269963	269968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310214
6000	NC_015315	GCG	2	6	269978	269983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310214

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