MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015315	AGG	2	6	203503	203508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310136
4502	NC_015315	TGA	2	6	203620	203625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310136
4503	NC_015315	GCC	2	6	203697	203702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310136
4504	NC_015315	AT	3	6	203709	203714	50 %	50 %	0 %	0 %	327310136
4505	NC_015315	GCG	2	6	203749	203754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310136
4506	NC_015315	CGG	2	6	203761	203766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310136
4507	NC_015315	GGC	2	6	203859	203864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310136
4508	NC_015315	CGC	2	6	203873	203878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310136
4509	NC_015315	GCC	2	6	203901	203906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310136
4510	NC_015315	TA	3	6	203970	203975	50 %	50 %	0 %	0 %	327310136
4511	NC_015315	TTC	2	6	204045	204050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310136
4512	NC_015315	CT	3	6	204070	204075	0 %	50 %	0 %	50 %	327310136
4513	NC_015315	CTT	2	6	204080	204085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310136
4514	NC_015315	CTT	2	6	204113	204118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310136
4515	NC_015315	CAG	2	6	204119	204124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310136
4516	NC_015315	CTATT	2	10	204132	204141	20 %	60 %	0 %	20 %	327310136
4517	NC_015315	GCC	2	6	204183	204188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310136
4518	NC_015315	CTA	3	9	204191	204199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310136
4519	NC_015315	CGC	2	6	204218	204223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310136
4520	NC_015315	TCG	2	6	204249	204254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310136
4521	NC_015315	CTT	2	6	204257	204262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310136
4522	NC_015315	AAC	2	6	204354	204359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310136
4523	NC_015315	GGCT	2	8	204393	204400	0 %	25 %	50 %	25 %	327310136
4524	NC_015315	AGG	2	6	204459	204464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310136
4525	NC_015315	GCG	2	6	204469	204474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310136
4526	NC_015315	AT	3	6	204571	204576	50 %	50 %	0 %	0 %	327310136
4527	NC_015315	GGC	2	6	204584	204589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310136
4528	NC_015315	CGT	2	6	204611	204616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310136
4529	NC_015315	AAT	2	6	204682	204687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310136
4530	NC_015315	GCG	2	6	204720	204725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310137
4531	NC_015315	TCC	2	6	204745	204750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4532	NC_015315	CACCTC	2	12	204928	204939	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	327310137
4533	NC_015315	CCT	2	6	204972	204977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4534	NC_015315	ACC	2	6	205073	205078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310137
4535	NC_015315	CTC	2	6	205093	205098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4536	NC_015315	GCG	2	6	205100	205105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310137
4537	NC_015315	CTC	2	6	205171	205176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4538	NC_015315	AG	3	6	205184	205189	50 %	0 %	50 %	0 %	327310137
4539	NC_015315	GAG	2	6	205216	205221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310137
4540	NC_015315	CTC	2	6	205279	205284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4541	NC_015315	CCT	2	6	205290	205295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4542	NC_015315	GGC	2	6	205375	205380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310137
4543	NC_015315	CTC	2	6	205381	205386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310137
4544	NC_015315	TC	3	6	205514	205519	0 %	50 %	0 %	50 %	327310138
4545	NC_015315	G	6	6	205558	205563	0 %	0 %	100 %	0 %	327310138
4546	NC_015315	TCG	2	6	205565	205570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310138
4547	NC_015315	GCC	2	6	205571	205576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310138
4548	NC_015315	CCT	2	6	205602	205607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310138
4549	NC_015315	CGA	2	6	205668	205673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310138
4550	NC_015315	TCC	2	6	205683	205688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310138
4551	NC_015315	CGG	2	6	205695	205700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310138
4552	NC_015315	CGT	2	6	205728	205733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310138
4553	NC_015315	CTC	2	6	205741	205746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310138
4554	NC_015315	GCC	2	6	206002	206007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310139
4555	NC_015315	TG	3	6	206008	206013	0 %	50 %	50 %	0 %	327310139
4556	NC_015315	GCC	2	6	206015	206020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310139
4557	NC_015315	GCC	2	6	206050	206055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310139
4558	NC_015315	GAC	2	6	206060	206065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310139
4559	NC_015315	TGG	2	6	206069	206074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310139
4560	NC_015315	AGG	2	6	206099	206104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310139
4561	NC_015315	TAC	2	6	206147	206152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310139
4562	NC_015315	GAG	2	6	206182	206187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310139
4563	NC_015315	GGCG	2	8	206203	206210	0 %	0 %	75 %	25 %	327310139
4564	NC_015315	AG	3	6	206271	206276	50 %	0 %	50 %	0 %	327310139
4565	NC_015315	AGGCC	2	10	206349	206358	20 %	0 %	40 %	40 %	327310139
4566	NC_015315	GCC	2	6	206398	206403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310140
4567	NC_015315	GCG	2	6	206408	206413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310140
4568	NC_015315	GAG	2	6	206416	206421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310140
4569	NC_015315	GA	3	6	206435	206440	50 %	0 %	50 %	0 %	327310140
4570	NC_015315	GCAG	2	8	206463	206470	25 %	0 %	50 %	25 %	327310140
4571	NC_015315	GGA	2	6	206477	206482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310140
4572	NC_015315	GAG	2	6	206488	206493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310140
4573	NC_015315	GGC	2	6	206507	206512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310140
4574	NC_015315	CG	3	6	206547	206552	0 %	0 %	50 %	50 %	327310140
4575	NC_015315	TGG	2	6	206585	206590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310140
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4577	NC_015315	GAC	3	9	206653	206661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310140
4578	NC_015315	GAG	2	6	206691	206696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310140
4579	NC_015315	AGGA	2	8	206698	206705	50 %	0 %	50 %	0 %	327310140
4580	NC_015315	GC	3	6	206763	206768	0 %	0 %	50 %	50 %	327310141
4581	NC_015315	CGG	2	6	206800	206805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310141
4582	NC_015315	CGCC	2	8	206872	206879	0 %	0 %	25 %	75 %	327310141
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4584	NC_015315	GGCG	2	8	206893	206900	0 %	0 %	75 %	25 %	327310141
4585	NC_015315	GAG	2	6	206945	206950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310142
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4587	NC_015315	GGC	2	6	207004	207009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310142
4588	NC_015315	AG	3	6	207027	207032	50 %	0 %	50 %	0 %	327310142
4589	NC_015315	ATA	2	6	207041	207046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310142
4590	NC_015315	AG	4	8	207134	207141	50 %	0 %	50 %	0 %	327310142
4591	NC_015315	GCC	2	6	207142	207147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310142
4592	NC_015315	ATGTGG	2	12	207153	207164	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	327310142
4593	NC_015315	GGA	2	6	207178	207183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310142
4594	NC_015315	AAT	2	6	207210	207215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310142
4595	NC_015315	CAA	2	6	207291	207296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310143
4596	NC_015315	CCT	2	6	207315	207320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310143
4597	NC_015315	CGA	2	6	207321	207326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310143
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4601	NC_015315	CGA	2	6	207543	207548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310143
4602	NC_015315	GCC	2	6	207610	207615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310144
4603	NC_015315	AGG	2	6	207632	207637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310144
4604	NC_015315	CGG	2	6	207661	207666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310144
4605	NC_015315	TA	3	6	207719	207724	50 %	50 %	0 %	0 %	327310144
4606	NC_015315	CGG	2	6	207733	207738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310144
4607	NC_015315	TCC	2	6	207764	207769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310144
4608	NC_015315	AT	3	6	207847	207852	50 %	50 %	0 %	0 %	327310144
4609	NC_015315	CGA	2	6	208030	208035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310144
4610	NC_015315	CCT	2	6	208045	208050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310144
4611	NC_015315	GATAT	2	10	208088	208097	40 %	40 %	20 %	0 %	327310144
4612	NC_015315	CGG	2	6	208112	208117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310144
4613	NC_015315	GAA	2	6	208155	208160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327310144
4614	NC_015315	TA	3	6	208232	208237	50 %	50 %	0 %	0 %	327310144
4615	NC_015315	AAT	2	6	208238	208243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310144
4616	NC_015315	ATA	2	6	208245	208250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310144
4617	NC_015315	T	6	6	208253	208258	0 %	100 %	0 %	0 %	327310144
4618	NC_015315	AT	4	8	208275	208282	50 %	50 %	0 %	0 %	327310144
4619	NC_015315	TA	3	6	208298	208303	50 %	50 %	0 %	0 %	327310144
4620	NC_015315	TTA	2	6	208332	208337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310144
4621	NC_015315	TAA	2	6	208369	208374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310144
4622	NC_015315	ATTAT	2	10	208376	208385	40 %	60 %	0 %	0 %	327310144
4623	NC_015315	TTC	2	6	208386	208391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310144
4624	NC_015315	TAA	2	6	208393	208398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327310144
4625	NC_015315	CA	3	6	208470	208475	50 %	0 %	0 %	50 %	327310144
4626	NC_015315	CT	3	6	208502	208507	0 %	50 %	0 %	50 %	327310144
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4629	NC_015315	TCG	2	6	208599	208604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310144
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4631	NC_015315	GGC	2	6	208717	208722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310144
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4636	NC_015315	GA	3	6	208863	208868	50 %	0 %	50 %	0 %	327310145
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4644	NC_015315	AATT	2	8	209108	209115	50 %	50 %	0 %	0 %	327310145
4645	NC_015315	TA	3	6	209156	209161	50 %	50 %	0 %	0 %	327310145
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4653	NC_015315	TA	3	6	209418	209423	50 %	50 %	0 %	0 %	327310145
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4655	NC_015315	ATTAAT	2	12	209463	209474	50 %	50 %	0 %	0 %	327310145
4656	NC_015315	GTT	2	6	209554	209559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310145
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4673	NC_015315	AGGA	2	8	210104	210111	50 %	0 %	50 %	0 %	327310147
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4692	NC_015315	TTAA	2	8	211072	211079	50 %	50 %	0 %	0 %	327310148
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4694	NC_015315	AT	3	6	211094	211099	50 %	50 %	0 %	0 %	327310148
4695	NC_015315	TTTA	2	8	211103	211110	25 %	75 %	0 %	0 %	327310148
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4728	NC_015315	TA	3	6	212538	212543	50 %	50 %	0 %	0 %	327310152
4729	NC_015315	CTC	2	6	212547	212552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310152
4730	NC_015315	TAT	2	6	212556	212561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327310152
4731	NC_015315	TCA	2	6	212603	212608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310152
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4733	NC_015315	TA	3	6	212838	212843	50 %	50 %	0 %	0 %	327310152
4734	NC_015315	AT	4	8	212847	212854	50 %	50 %	0 %	0 %	327310152
4735	NC_015315	CGG	2	6	212982	212987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310152
4736	NC_015315	GTC	2	6	213027	213032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310152
4737	NC_015315	CGG	2	6	213066	213071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310152
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4739	NC_015315	TGG	2	6	213089	213094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310152
4740	NC_015315	CGC	2	6	213098	213103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310152
4741	NC_015315	ACG	2	6	213124	213129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310152
4742	NC_015315	ACC	2	6	213166	213171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327310152
4743	NC_015315	CTC	2	6	213243	213248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310152
4744	NC_015315	CGT	2	6	213263	213268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327310152
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4746	NC_015315	GCGG	2	8	213312	213319	0 %	0 %	75 %	25 %	327310152
4747	NC_015315	CCT	2	6	213484	213489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310153
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4868	NC_015315	AGC	2	6	219036	219041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327310161
4869	NC_015315	TAC	2	6	219051	219056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310161
4870	NC_015315	TA	3	6	219120	219125	50 %	50 %	0 %	0 %	327310161
4871	NC_015315	CCG	2	6	219142	219147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327310161
4872	NC_015315	GTG	2	6	219195	219200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310161
4873	NC_015315	TCT	2	6	219205	219210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327310161
4874	NC_015315	AAC	2	6	219240	219245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327310161
4875	NC_015315	GA	3	6	219263	219268	50 %	0 %	50 %	0 %	327310161
4876	NC_015315	CGCGC	2	10	219287	219296	0 %	0 %	40 %	60 %	327310161
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4880	NC_015315	TAC	2	6	219399	219404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327310161
4881	NC_015315	AGT	2	6	219485	219490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327310162
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4884	NC_015315	TCC	2	6	219658	219663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327310162
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4886	NC_015315	AG	3	6	219761	219766	50 %	0 %	50 %	0 %	327310162
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4890	NC_015315	TTGC	2	8	219879	219886	0 %	50 %	25 %	25 %	327310162
4891	NC_015315	CGG	2	6	219893	219898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310162
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4893	NC_015315	TCGCCG	2	12	220012	220023	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	327310162
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4895	NC_015315	GAG	2	6	220050	220055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327310162
4896	NC_015315	CATA	2	8	220102	220109	50 %	25 %	0 %	25 %	327310162
4897	NC_015315	GCG	2	6	220110	220115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327310162
4898	NC_015315	GTG	3	9	220155	220163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327310162
4899	NC_015315	AGAT	2	8	220177	220184	50 %	25 %	25 %	0 %	327310162
4900	NC_015315	TA	3	6	220212	220217	50 %	50 %	0 %	0 %	327310162
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4983	NC_015315	GTT	2	6	224015	224020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327310166
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