MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoproteus uzoniensis 768-20 chromosome

Total Repeats: 42700

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015315	GAC	2	6	165	170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
2	NC_015315	ACG	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309923
3	NC_015315	CGG	2	6	224	229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
4	NC_015315	GAG	2	6	248	253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309923
5	NC_015315	GGAG	2	8	263	270	25 %	0 %	75 %	0 %	327309923
6	NC_015315	CG	3	6	293	298	0 %	0 %	50 %	50 %	327309923
7	NC_015315	CGG	2	6	301	306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309923
8	NC_015315	TGG	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309924
9	NC_015315	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
10	NC_015315	ACAGC	2	10	662	671	40 %	0 %	20 %	40 %	327309924
11	NC_015315	GA	3	6	674	679	50 %	0 %	50 %	0 %	327309924
12	NC_015315	CTG	2	6	791	796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
13	NC_015315	AGG	2	6	834	839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
14	NC_015315	AGG	3	9	921	929	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
15	NC_015315	A	6	6	941	946	100 %	0 %	0 %	0 %	327309924
16	NC_015315	CGA	2	6	952	957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309924
17	NC_015315	GAG	2	6	961	966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
18	NC_015315	GTC	2	6	968	973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309924
19	NC_015315	AGA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309924
20	NC_015315	AGG	2	6	1002	1007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	327309924
21	NC_015315	AAC	2	6	1020	1025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309924
22	NC_015315	CGC	2	6	1166	1171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309925
23	NC_015315	CGT	2	6	1226	1231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309925
24	NC_015315	TCG	2	6	1494	1499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
25	NC_015315	GACGAG	2	12	1570	1581	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	327309926
26	NC_015315	CTC	2	6	1597	1602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
27	NC_015315	GTC	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
28	NC_015315	GAA	2	6	1717	1722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
29	NC_015315	CCT	3	9	1728	1736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
30	NC_015315	GA	3	6	1776	1781	50 %	0 %	50 %	0 %	327309926
31	NC_015315	GAC	3	9	1795	1803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309926
32	NC_015315	GC	3	6	1822	1827	0 %	0 %	50 %	50 %	327309926
33	NC_015315	CGC	2	6	1834	1839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
34	NC_015315	AGA	2	6	1844	1849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309926
35	NC_015315	GGC	2	6	1851	1856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309926
36	NC_015315	TCC	2	6	1862	1867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309926
37	NC_015315	CCTC	2	8	1941	1948	0 %	25 %	0 %	75 %	327309926
38	NC_015315	CGC	3	9	1954	1962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
39	NC_015315	TCG	2	6	1974	1979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309926
40	NC_015315	GCC	2	6	1988	1993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309926
41	NC_015315	C	6	6	2099	2104	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
42	NC_015315	GGC	2	6	2109	2114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
43	NC_015315	GTC	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
44	NC_015315	CCGG	2	8	2201	2208	0 %	0 %	50 %	50 %	327309927
45	NC_015315	C	6	6	2249	2254	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
46	NC_015315	ACCG	2	8	2257	2264	25 %	0 %	25 %	50 %	327309927
47	NC_015315	GA	3	6	2319	2324	50 %	0 %	50 %	0 %	327309927
48	NC_015315	CCT	3	9	2331	2339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
49	NC_015315	ATC	2	6	2355	2360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309927
50	NC_015315	CCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
51	NC_015315	GAC	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
52	NC_015315	CG	3	6	2416	2421	0 %	0 %	50 %	50 %	327309927
53	NC_015315	TAG	2	6	2422	2427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309927
54	NC_015315	CCA	2	6	2438	2443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
55	NC_015315	CGA	2	6	2462	2467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
56	NC_015315	C	6	6	2483	2488	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
57	NC_015315	AGGAG	2	10	2507	2516	40 %	0 %	60 %	0 %	327309927
58	NC_015315	TCG	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	327309927
59	NC_015315	GTG	2	6	2733	2738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	327309927
60	NC_015315	CCCAC	2	10	2777	2786	20 %	0 %	0 %	80 %	327309927
61	NC_015315	CCA	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
62	NC_015315	CCA	2	6	2834	2839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
63	NC_015315	CCT	3	9	2852	2860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309927
64	NC_015315	CGG	2	6	2919	2924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
65	NC_015315	GCC	2	6	2936	2941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
66	NC_015315	AAG	2	6	2953	2958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309927
67	NC_015315	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
68	NC_015315	CGG	2	6	2997	3002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309927
69	NC_015315	CAC	2	6	3009	3014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309927
70	NC_015315	ACG	2	6	3073	3078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	327309927
71	NC_015315	CGC	2	6	3097	3102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309927
72	NC_015315	C	6	6	3203	3208	0 %	0 %	0 %	100 %	327309927
73	NC_015315	GTT	2	6	3642	3647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309928
74	NC_015315	GCG	2	6	3665	3670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	327309928
75	NC_015315	C	6	6	3674	3679	0 %	0 %	0 %	100 %	327309928
76	NC_015315	GAA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309928
77	NC_015315	CCG	2	6	3747	3752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309928
78	NC_015315	AGA	2	6	3814	3819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
79	NC_015315	AGA	2	6	3959	3964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309929
80	NC_015315	ACC	2	6	4058	4063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
81	NC_015315	TC	3	6	4089	4094	0 %	50 %	0 %	50 %	327309929
82	NC_015315	ACA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
83	NC_015315	TGT	2	6	4159	4164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309929
84	NC_015315	GA	3	6	4231	4236	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
85	NC_015315	GCC	2	6	4262	4267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
86	NC_015315	TC	3	6	4318	4323	0 %	50 %	0 %	50 %	327309929
87	NC_015315	GA	3	6	4325	4330	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
88	NC_015315	TGA	2	6	4335	4340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309929
89	NC_015315	CAT	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
90	NC_015315	ACC	2	6	4374	4379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
91	NC_015315	CTA	2	6	4560	4565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
92	NC_015315	CCA	2	6	4585	4590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
93	NC_015315	ACA	2	6	4614	4619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
94	NC_015315	ATC	2	6	4628	4633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
95	NC_015315	CTC	2	6	4652	4657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
96	NC_015315	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	327309929
97	NC_015315	CTC	2	6	4688	4693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309929
98	NC_015315	AG	3	6	4749	4754	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
99	NC_015315	ACT	2	6	4756	4761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309929
100	NC_015315	AAT	2	6	4783	4788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309929
101	NC_015315	GCC	2	6	4890	4895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	327309929
102	NC_015315	ACC	2	6	4899	4904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	327309929
103	NC_015315	ACA	2	6	4944	4949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309929
104	NC_015315	AG	3	6	4979	4984	50 %	0 %	50 %	0 %	327309929
105	NC_015315	AC	3	6	6691	6696	50 %	0 %	0 %	50 %	327309930
106	NC_015315	CAGG	2	8	6705	6712	25 %	0 %	50 %	25 %	327309930
107	NC_015315	CTT	2	6	6716	6721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309930
108	NC_015315	TCT	2	6	6734	6739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309930
109	NC_015315	TAGG	2	8	6796	6803	25 %	25 %	50 %	0 %	327309930
110	NC_015315	AAT	2	6	6897	6902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309930
111	NC_015315	TTA	2	6	6984	6989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309930
112	NC_015315	TAAA	2	8	7035	7042	75 %	25 %	0 %	0 %	327309930
113	NC_015315	GA	3	6	7167	7172	50 %	0 %	50 %	0 %	327309930
114	NC_015315	AG	3	6	7280	7285	50 %	0 %	50 %	0 %	327309930
115	NC_015315	ACA	2	6	7313	7318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309930
116	NC_015315	TTG	2	6	7362	7367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309930
117	NC_015315	CT	4	8	7394	7401	0 %	50 %	0 %	50 %	327309930
118	NC_015315	CAT	2	6	7408	7413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309930
119	NC_015315	GAA	2	6	7424	7429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	327309930
120	NC_015315	ATC	2	6	7577	7582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309930
121	NC_015315	TAT	2	6	7586	7591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309930
122	NC_015315	CCT	2	6	7603	7608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309930
123	NC_015315	TGT	2	6	7648	7653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309930
124	NC_015315	AT	3	6	8801	8806	50 %	50 %	0 %	0 %	327309931
125	NC_015315	ATT	2	6	8816	8821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309931
126	NC_015315	TAA	2	6	8836	8841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309931
127	NC_015315	TAC	2	6	8858	8863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309931
128	NC_015315	TTA	2	6	8902	8907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309931
129	NC_015315	ATT	2	6	8933	8938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309931
130	NC_015315	TAT	2	6	8966	8971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309931
131	NC_015315	AT	4	8	9155	9162	50 %	50 %	0 %	0 %	327309931
132	NC_015315	TAT	2	6	9217	9222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	327309931
133	NC_015315	ATG	2	6	9267	9272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309931
134	NC_015315	TCT	2	6	9284	9289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	327309931
135	NC_015315	GTT	2	6	9301	9306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	327309931
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267	NC_015315	ATC	2	6	15631	15636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	327309937
268	NC_015315	AAT	2	6	15652	15657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	327309937
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273	NC_015315	TA	4	8	15962	15969	50 %	50 %	0 %	0 %	327309937
274	NC_015315	CATC	2	8	16058	16065	25 %	25 %	0 %	50 %	327309937
275	NC_015315	CAA	2	6	16217	16222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	327309937
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279	NC_015315	CTCTC	2	10	16425	16434	0 %	40 %	0 %	60 %	327309938
280	NC_015315	GTA	2	6	16444	16449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	327309938
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283	NC_015315	CTC	2	6	16597	16602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	327309938
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392	NC_015315	GC	4	8	22250	22257	0 %	0 %	50 %	50 %	327309944
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