MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014974	TCC	2	6	25	30	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449107
2	NC_014974	G	7	7	39	45	0 %	0 %	100 %	0 %	320449107
3	NC_014974	CCG	2	6	92	97	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449107
4	NC_014974	CCT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449107
5	NC_014974	CTGGA	2	10	198	207	20 %	20 %	40 %	20 %	320449107
6	NC_014974	AGG	2	6	235	240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
7	NC_014974	GGT	2	6	284	289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449107
8	NC_014974	AGG	2	6	307	312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
9	NC_014974	AGC	2	6	341	346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449107
10	NC_014974	GTG	2	6	387	392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449107
11	NC_014974	CAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449107
12	NC_014974	GCG	3	9	417	425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449107
13	NC_014974	GC	3	6	449	454	0 %	0 %	50 %	50 %	320449107
14	NC_014974	TCA	2	6	592	597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449107
15	NC_014974	TGG	2	6	661	666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449107
16	NC_014974	AGG	2	6	703	708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
17	NC_014974	TTC	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449107
18	NC_014974	ATC	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449107
19	NC_014974	CTC	2	6	761	766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449107
20	NC_014974	C	6	6	774	779	0 %	0 %	0 %	100 %	320449107
21	NC_014974	TCA	2	6	832	837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449107
22	NC_014974	GAG	2	6	918	923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
23	NC_014974	GCC	2	6	1038	1043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449107
24	NC_014974	AGG	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
25	NC_014974	GGA	2	6	1136	1141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
26	NC_014974	TGG	2	6	1144	1149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449107
27	NC_014974	AGG	2	6	1165	1170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449107
28	NC_014974	CTC	2	6	1220	1225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449107
29	NC_014974	ACC	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449107
30	NC_014974	GCT	2	6	1331	1336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449107
31	NC_014974	GTT	2	6	1793	1798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449108
32	NC_014974	GGAG	2	8	1847	1854	25 %	0 %	75 %	0 %	320449108
33	NC_014974	TTC	2	6	1884	1889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449108
34	NC_014974	TTC	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449108
35	NC_014974	CGA	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449108
36	NC_014974	TTTC	2	8	2012	2019	0 %	75 %	0 %	25 %	320449108
37	NC_014974	GGA	2	6	2072	2077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449108
38	NC_014974	CTT	2	6	2079	2084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449108
39	NC_014974	GGGC	2	8	2168	2175	0 %	0 %	75 %	25 %	320449108
40	NC_014974	AAG	2	6	2244	2249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449108
41	NC_014974	GTG	3	9	2250	2258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449108
42	NC_014974	TGGCCC	2	12	2317	2328	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449108
43	NC_014974	GGC	2	6	2447	2452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449108
44	NC_014974	CTT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449108
45	NC_014974	GAG	2	6	2538	2543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449108
46	NC_014974	AGG	2	6	2587	2592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449108
47	NC_014974	CT	3	6	2668	2673	0 %	50 %	0 %	50 %	320449108
48	NC_014974	GTT	2	6	2687	2692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449108
49	NC_014974	CCA	2	6	2704	2709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449108
50	NC_014974	GGC	2	6	2735	2740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449108
51	NC_014974	GGT	3	9	2756	2764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449108
52	NC_014974	CGTGAA	2	12	2845	2856	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320449109
53	NC_014974	GGT	2	6	2918	2923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449109
54	NC_014974	AGG	2	6	3090	3095	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
55	NC_014974	GCTGGA	2	12	3112	3123	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320449109
56	NC_014974	CAA	2	6	3133	3138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320449109
57	NC_014974	GCG	3	9	3191	3199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449109
58	NC_014974	G	6	6	3232	3237	0 %	0 %	100 %	0 %	320449109
59	NC_014974	GAGG	2	8	3443	3450	25 %	0 %	75 %	0 %	320449109
60	NC_014974	GAG	2	6	3476	3481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
61	NC_014974	CTT	3	9	3491	3499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449109
62	NC_014974	GCGG	2	8	3511	3518	0 %	0 %	75 %	25 %	320449109
63	NC_014974	AGG	2	6	3534	3539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
64	NC_014974	CCCTGG	2	12	3543	3554	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320449109
65	NC_014974	AGG	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
66	NC_014974	ACC	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449109
67	NC_014974	GGAAGG	2	12	3598	3609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
68	NC_014974	GGA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
69	NC_014974	TGG	2	6	3633	3638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449109
70	NC_014974	GGA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
71	NC_014974	GGC	2	6	3717	3722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449109
72	NC_014974	TGG	2	6	3756	3761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449109
73	NC_014974	AACC	2	8	3778	3785	50 %	0 %	0 %	50 %	320449109
74	NC_014974	GGTGAA	2	12	3835	3846	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320449109
75	NC_014974	GCGGTG	2	12	3965	3976	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320449109
76	NC_014974	GAG	3	9	4052	4060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449109
77	NC_014974	GCG	2	6	4070	4075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449109
78	NC_014974	GAG	2	6	4218	4223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449110
79	NC_014974	GGCG	2	8	4231	4238	0 %	0 %	75 %	25 %	320449110
80	NC_014974	TCC	2	6	4285	4290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449110
81	NC_014974	AGG	2	6	4330	4335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449110
82	NC_014974	GGCC	2	8	4352	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	320449110
83	NC_014974	CTC	2	6	4458	4463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449110
84	NC_014974	GAC	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449110
85	NC_014974	GCC	2	6	4474	4479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449110
86	NC_014974	GTG	2	6	4524	4529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449110
87	NC_014974	TGGG	2	8	4534	4541	0 %	25 %	75 %	0 %	320449110
88	NC_014974	CT	3	6	4597	4602	0 %	50 %	0 %	50 %	320449110
89	NC_014974	CCG	2	6	4762	4767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449110
90	NC_014974	GAG	2	6	4779	4784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449110
91	NC_014974	CAT	2	6	4805	4810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449110
92	NC_014974	G	6	6	4819	4824	0 %	0 %	100 %	0 %	320449110
93	NC_014974	GGA	2	6	4847	4852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449110
94	NC_014974	CAT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449110
95	NC_014974	GCC	2	6	4893	4898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449110
96	NC_014974	CCA	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449110
97	NC_014974	GTG	2	6	5088	5093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449110
98	NC_014974	TCC	2	6	5097	5102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449110
99	NC_014974	TCC	2	6	5128	5133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449110
100	NC_014974	CCCACC	2	12	5142	5153	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	320449110
101	NC_014974	GGC	2	6	5174	5179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449110
102	NC_014974	GAC	2	6	5181	5186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449110
103	NC_014974	CGA	2	6	5372	5377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449110
104	NC_014974	AAGGCC	2	12	5400	5411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449110
105	NC_014974	GTG	2	6	5439	5444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449110
106	NC_014974	CGC	2	6	5447	5452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449110
107	NC_014974	ACC	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449110
108	NC_014974	CACCC	2	10	5517	5526	20 %	0 %	0 %	80 %	320449111
109	NC_014974	G	6	6	5621	5626	0 %	0 %	100 %	0 %	320449111
110	NC_014974	GAG	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449112
111	NC_014974	GTG	2	6	5798	5803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449112
112	NC_014974	GCC	2	6	5852	5857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449112
113	NC_014974	G	6	6	5859	5864	0 %	0 %	100 %	0 %	320449112
114	NC_014974	G	6	6	5972	5977	0 %	0 %	100 %	0 %	320449112
115	NC_014974	CCT	2	6	6033	6038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449112
116	NC_014974	G	6	6	6078	6083	0 %	0 %	100 %	0 %	320449112
117	NC_014974	CCT	2	6	6126	6131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449112
118	NC_014974	GAA	2	6	6259	6264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320449112
119	NC_014974	ATCC	2	8	6270	6277	25 %	25 %	0 %	50 %	320449112
120	NC_014974	AG	3	6	6282	6287	50 %	0 %	50 %	0 %	320449112
121	NC_014974	C	6	6	6370	6375	0 %	0 %	0 %	100 %	320449112
122	NC_014974	GCCT	2	8	6450	6457	0 %	25 %	25 %	50 %	320449112
123	NC_014974	CCA	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449112
124	NC_014974	TCC	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449112
125	NC_014974	GC	3	6	6583	6588	0 %	0 %	50 %	50 %	320449112
126	NC_014974	AGG	2	6	6737	6742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449112
127	NC_014974	GCCCA	2	10	6947	6956	20 %	0 %	20 %	60 %	320449112
128	NC_014974	CCCCCT	2	12	6981	6992	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320449112
129	NC_014974	CCT	2	6	7011	7016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449112
130	NC_014974	GAAAG	2	10	7020	7029	60 %	0 %	40 %	0 %	320449112
131	NC_014974	AGG	2	6	7082	7087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449112
132	NC_014974	CAC	2	6	7174	7179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449113
133	NC_014974	CTT	2	6	7204	7209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449113
134	NC_014974	CCA	3	9	7236	7244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320449113
135	NC_014974	TGG	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449113
136	NC_014974	TGG	2	6	7370	7375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320449113
137	NC_014974	CTT	2	6	7577	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449113
138	NC_014974	CTC	2	6	7591	7596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320449113
139	NC_014974	GTT	2	6	7606	7611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449113
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141	NC_014974	GGC	4	12	7726	7737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320449113
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163	NC_014974	C	6	6	8805	8810	0 %	0 %	0 %	100 %	320449114
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169	NC_014974	CAG	2	6	9077	9082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320449114
170	NC_014974	TGT	2	6	9153	9158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320449114
171	NC_014974	CTT	2	6	9245	9250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320449114
172	NC_014974	AGCC	2	8	9472	9479	25 %	0 %	25 %	50 %	320449114
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177	NC_014974	GGATG	2	10	9673	9682	20 %	20 %	60 %	0 %	320449115
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251	NC_014974	CAT	2	6	12399	12404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320449119
252	NC_014974	CGGGCA	2	12	12416	12427	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320449119
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256	NC_014974	CGT	2	6	12500	12505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320449119
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264	NC_014974	GCC	2	6	12750	12755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320449119
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391	NC_014974	GCCC	2	8	18705	18712	0 %	0 %	25 %	75 %	320449126
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393	NC_014974	AGG	2	6	18744	18749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320449126
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