MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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49002	NC_014974	GGAG	2	8	2260795	2260802	25 %	0 %	75 %	0 %	320451461
49003	NC_014974	TGG	2	6	2260803	2260808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
49004	NC_014974	CCT	2	6	2260816	2260821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451461
49005	NC_014974	TGGCCC	2	12	2260887	2260898	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451461
49006	NC_014974	C	6	6	2260923	2260928	0 %	0 %	0 %	100 %	320451461
49007	NC_014974	CTA	2	6	2260960	2260965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451461
49008	NC_014974	CCG	2	6	2260980	2260985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451461
49009	NC_014974	GAA	2	6	2260997	2261002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451461
49010	NC_014974	TGG	2	6	2261007	2261012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
49011	NC_014974	GGA	2	6	2261032	2261037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451461
49012	NC_014974	GAA	2	6	2261054	2261059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451461
49013	NC_014974	C	6	6	2261069	2261074	0 %	0 %	0 %	100 %	320451461
49014	NC_014974	AGG	2	6	2261124	2261129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451461
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49016	NC_014974	TGA	2	6	2261208	2261213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320451461
49017	NC_014974	CTT	2	6	2261231	2261236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451461
49018	NC_014974	TGG	2	6	2261292	2261297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
49019	NC_014974	C	6	6	2261396	2261401	0 %	0 %	0 %	100 %	320451461
49020	NC_014974	TGG	2	6	2261481	2261486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
49021	NC_014974	CTG	2	6	2261492	2261497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451461
49022	NC_014974	GCC	2	6	2261498	2261503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451461
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49026	NC_014974	TGG	2	6	2261643	2261648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
49027	NC_014974	TGGGCC	2	12	2261655	2261666	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320451461
49028	NC_014974	TGGCCA	2	12	2261682	2261693	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320451461
49029	NC_014974	TGG	2	6	2261898	2261903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451461
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49031	NC_014974	CAT	2	6	2261974	2261979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451461
49032	NC_014974	CATCGT	2	12	2261983	2261994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320451461
49033	NC_014974	GCTG	2	8	2262021	2262028	0 %	25 %	50 %	25 %	320451461
49034	NC_014974	GCC	2	6	2262033	2262038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451461
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49036	NC_014974	TAAGGG	2	12	2262183	2262194	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	320451462
49037	NC_014974	C	6	6	2262334	2262339	0 %	0 %	0 %	100 %	320451463
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49039	NC_014974	C	6	6	2262470	2262475	0 %	0 %	0 %	100 %	320451463
49040	NC_014974	GAG	2	6	2262503	2262508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451463
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49045	NC_014974	C	6	6	2262709	2262714	0 %	0 %	0 %	100 %	320451463
49046	NC_014974	AGG	2	6	2262760	2262765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451463
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49048	NC_014974	CGC	3	9	2262831	2262839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451463
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49050	NC_014974	GAA	2	6	2262911	2262916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451463
49051	NC_014974	AAAAGG	2	12	2262922	2262933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451463
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49053	NC_014974	C	6	6	2263150	2263155	0 %	0 %	0 %	100 %	320451464
49054	NC_014974	ACC	2	6	2263169	2263174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451464
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49084	NC_014974	CCCG	2	8	2264562	2264569	0 %	0 %	25 %	75 %	320451465
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49088	NC_014974	AAG	2	6	2264706	2264711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451465
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49095	NC_014974	GA	3	6	2264917	2264922	50 %	0 %	50 %	0 %	320451466
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49100	NC_014974	CTC	2	6	2265177	2265182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451466
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49106	NC_014974	GCC	2	6	2265660	2265665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451467
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49109	NC_014974	CCGC	2	8	2265763	2265770	0 %	0 %	25 %	75 %	320451467
49110	NC_014974	GGC	2	6	2265806	2265811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451467
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49117	NC_014974	CAC	2	6	2265989	2265994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451467
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49148	NC_014974	CGC	2	6	2267178	2267183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451468
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49232	NC_014974	TCCC	2	8	2270818	2270825	0 %	25 %	0 %	75 %	320451472
49233	NC_014974	GGA	2	6	2270832	2270837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49234	NC_014974	CTC	2	6	2270848	2270853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451472
49235	NC_014974	GGA	3	9	2270865	2270873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49236	NC_014974	GAG	2	6	2270878	2270883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49237	NC_014974	CTC	3	9	2270884	2270892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451472
49238	NC_014974	GAG	2	6	2270899	2270904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49239	NC_014974	GGA	2	6	2270925	2270930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49240	NC_014974	GCTGGA	2	12	2270931	2270942	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	320451472
49241	NC_014974	GGA	2	6	2271003	2271008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
49242	NC_014974	CAC	2	6	2271078	2271083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451472
49243	NC_014974	GCTCCT	2	12	2271091	2271102	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320451472
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49246	NC_014974	GGC	2	6	2271216	2271221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451472
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49252	NC_014974	CTT	2	6	2271361	2271366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451472
49253	NC_014974	GAG	2	6	2271379	2271384	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451472
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49304	NC_014974	GGT	2	6	2273772	2273777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451474
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49333	NC_014974	GCT	2	6	2275710	2275715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451474
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49342	NC_014974	CAGC	2	8	2275923	2275930	25 %	0 %	25 %	50 %	320451474
49343	NC_014974	CGG	2	6	2275932	2275937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451474
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49347	NC_014974	TCC	2	6	2276024	2276029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451474
49348	NC_014974	CTG	2	6	2276035	2276040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320451474
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49351	NC_014974	GCC	2	6	2276063	2276068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451474
49352	NC_014974	GCC	2	6	2276135	2276140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451474
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49472	NC_014974	TTG	2	6	2281787	2281792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451479
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49481	NC_014974	CTGC	2	8	2282121	2282128	0 %	25 %	25 %	50 %	320451479
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49495	NC_014974	CGC	2	6	2283061	2283066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451480
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