MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermus scotoductus SA-01 chromosome

Total Repeats: 51004

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_014974	GCA	2	6	2237214	2237219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451434
48502	NC_014974	TCC	2	6	2237252	2237257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451434
48503	NC_014974	G	7	7	2237260	2237266	0 %	0 %	100 %	0 %	320451434
48504	NC_014974	GGC	2	6	2237270	2237275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451434
48505	NC_014974	ACT	2	6	2237432	2237437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451435
48506	NC_014974	GCAG	2	8	2237488	2237495	25 %	0 %	50 %	25 %	320451435
48507	NC_014974	GCC	2	6	2237521	2237526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451435
48508	NC_014974	GGGA	2	8	2237579	2237586	25 %	0 %	75 %	0 %	320451435
48509	NC_014974	GGA	2	6	2237706	2237711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48510	NC_014974	C	6	6	2237716	2237721	0 %	0 %	0 %	100 %	320451435
48511	NC_014974	CCTACA	2	12	2237768	2237779	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	320451435
48512	NC_014974	CCG	2	6	2237786	2237791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451435
48513	NC_014974	AGG	2	6	2237879	2237884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48514	NC_014974	GCC	2	6	2237914	2237919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451435
48515	NC_014974	GAG	2	6	2237944	2237949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48516	NC_014974	ACC	2	6	2238037	2238042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451435
48517	NC_014974	CTC	2	6	2238043	2238048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451435
48518	NC_014974	GGA	2	6	2238072	2238077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48519	NC_014974	CCG	2	6	2238137	2238142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451435
48520	NC_014974	AGG	2	6	2238218	2238223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48521	NC_014974	CCAC	2	8	2238275	2238282	25 %	0 %	0 %	75 %	320451435
48522	NC_014974	CTC	2	6	2238301	2238306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451435
48523	NC_014974	GAG	2	6	2238372	2238377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451435
48524	NC_014974	CGG	2	6	2238409	2238414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451436
48525	NC_014974	AGG	2	6	2238457	2238462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451436
48526	NC_014974	CTT	2	6	2238516	2238521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451436
48527	NC_014974	C	6	6	2238523	2238528	0 %	0 %	0 %	100 %	320451436
48528	NC_014974	GGC	2	6	2238557	2238562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451436
48529	NC_014974	GAG	2	6	2238602	2238607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451436
48530	NC_014974	TCC	3	9	2238610	2238618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451436
48531	NC_014974	CTT	2	6	2238641	2238646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451436
48532	NC_014974	GAG	2	6	2238759	2238764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451436
48533	NC_014974	GGA	2	6	2238773	2238778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451436
48534	NC_014974	TCC	2	6	2238793	2238798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451436
48535	NC_014974	TCC	2	6	2238805	2238810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451436
48536	NC_014974	CTC	2	6	2238843	2238848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451436
48537	NC_014974	TGT	2	6	2238886	2238891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320451436
48538	NC_014974	TGG	3	9	2238913	2238921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451436
48539	NC_014974	GGCCCT	2	12	2238992	2239003	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320451436
48540	NC_014974	GGAG	2	8	2239010	2239017	25 %	0 %	75 %	0 %	320451436
48541	NC_014974	CCA	2	6	2239111	2239116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451436
48542	NC_014974	GTG	2	6	2239146	2239151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451436
48543	NC_014974	CGC	2	6	2239157	2239162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451436
48544	NC_014974	GGA	2	6	2239236	2239241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451437
48545	NC_014974	CCT	2	6	2239266	2239271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451437
48546	NC_014974	GAC	2	6	2239279	2239284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451437
48547	NC_014974	GCC	2	6	2239334	2239339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451437
48548	NC_014974	GCC	3	9	2239342	2239350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451437
48549	NC_014974	GCG	2	6	2239353	2239358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451437
48550	NC_014974	CGC	2	6	2239363	2239368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451437
48551	NC_014974	AGG	2	6	2239493	2239498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451437
48552	NC_014974	TCC	3	9	2239520	2239528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451437
48553	NC_014974	TGG	2	6	2239529	2239534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451437
48554	NC_014974	CCT	2	6	2239547	2239552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451437
48555	NC_014974	ACGC	2	8	2239586	2239593	25 %	0 %	25 %	50 %	320451437
48556	NC_014974	CTCCCC	2	12	2239653	2239664	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320451437
48557	NC_014974	ACC	2	6	2239703	2239708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451437
48558	NC_014974	TC	3	6	2239735	2239740	0 %	50 %	0 %	50 %	320451437
48559	NC_014974	GCCAGG	2	12	2239810	2239821	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320451438
48560	NC_014974	C	7	7	2239899	2239905	0 %	0 %	0 %	100 %	320451438
48561	NC_014974	AG	3	6	2239985	2239990	50 %	0 %	50 %	0 %	320451438
48562	NC_014974	CAG	2	6	2240004	2240009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451438
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48564	NC_014974	A	6	6	2240047	2240052	100 %	0 %	0 %	0 %	320451438
48565	NC_014974	CTT	2	6	2240057	2240062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451438
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48567	NC_014974	CCAC	2	8	2240315	2240322	25 %	0 %	0 %	75 %	320451439
48568	NC_014974	CCG	2	6	2240336	2240341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451439
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48571	NC_014974	CGA	2	6	2240510	2240515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451439
48572	NC_014974	GAG	2	6	2240550	2240555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451439
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48574	NC_014974	GCG	2	6	2240622	2240627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320451439
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48584	NC_014974	GAA	2	6	2241130	2241135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320451440
48585	NC_014974	TCC	2	6	2241149	2241154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451440
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48588	NC_014974	TCT	2	6	2241397	2241402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451441
48589	NC_014974	CCA	2	6	2241410	2241415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451441
48590	NC_014974	GAG	2	6	2241462	2241467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451441
48591	NC_014974	GCC	2	6	2241497	2241502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451441
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48596	NC_014974	AGG	3	9	2241626	2241634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451441
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48598	NC_014974	C	6	6	2241715	2241720	0 %	0 %	0 %	100 %	320451441
48599	NC_014974	C	6	6	2241731	2241736	0 %	0 %	0 %	100 %	320451441
48600	NC_014974	TCCC	2	8	2241752	2241759	0 %	25 %	0 %	75 %	320451441
48601	NC_014974	CAGGC	2	10	2241772	2241781	20 %	0 %	40 %	40 %	320451441
48602	NC_014974	CTC	2	6	2241789	2241794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451441
48603	NC_014974	GGCG	2	8	2241821	2241828	0 %	0 %	75 %	25 %	320451441
48604	NC_014974	TAA	2	6	2241872	2241877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320451441
48605	NC_014974	GCACC	2	10	2241933	2241942	20 %	0 %	20 %	60 %	320451442
48606	NC_014974	AGG	2	6	2242039	2242044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451442
48607	NC_014974	GCC	2	6	2242057	2242062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451442
48608	NC_014974	TGG	2	6	2242070	2242075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451442
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48611	NC_014974	TCC	2	6	2242177	2242182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451442
48612	NC_014974	TCCG	2	8	2242329	2242336	0 %	25 %	25 %	50 %	320451442
48613	NC_014974	GGAA	2	8	2242420	2242427	50 %	0 %	50 %	0 %	320451443
48614	NC_014974	AGG	2	6	2242448	2242453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320451443
48615	NC_014974	TGG	2	6	2242472	2242477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320451443
48616	NC_014974	G	6	6	2242481	2242486	0 %	0 %	100 %	0 %	320451443
48617	NC_014974	CCT	2	6	2242563	2242568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451443
48618	NC_014974	CACC	2	8	2242575	2242582	25 %	0 %	0 %	75 %	320451443
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48736	NC_014974	TCC	2	6	2247466	2247471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451448
48737	NC_014974	ACC	2	6	2247501	2247506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320451448
48738	NC_014974	CCT	2	6	2247538	2247543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320451448
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48748	NC_014974	GAC	2	6	2248056	2248061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451448
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48767	NC_014974	TCT	2	6	2249251	2249256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320451450
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48850	NC_014974	ACG	2	6	2253512	2253517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320451452
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48852	NC_014974	CCAG	2	8	2253560	2253567	25 %	0 %	25 %	50 %	320451452
48853	NC_014974	CTA	2	6	2253609	2253614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320451452
48854	NC_014974	CGC	2	6	2253636	2253641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320451452
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